A functional strategy to characterize expression Quantitative Trait Loci

2017 ◽  
Vol 136 (11-12) ◽  
pp. 1477-1487 ◽  
Author(s):  
Elena Grassi ◽  
Elisa Mariella ◽  
Mattia Forneris ◽  
Federico Marotta ◽  
Marika Catapano ◽  
...  
Keyword(s):  
Quantitative Trait Loci ◽  
Quantitative Trait ◽  
Expression Quantitative Trait Loci ◽  
Functional Strategy ◽  
Trait Loci

scholarly journals Delineamento de experimentos em genética genômica

2007 ◽  
Vol 36 (suppl) ◽  
pp. 211-218 ◽  
Author(s):  
Guilherme Jordão de Magalhães Rosa
Keyword(s):  
Quantitative Trait Loci ◽  
Quantitative Trait ◽  
Expression Quantitative Trait Loci ◽  
Trait Loci

Genética genômica é um termo utilizado para representar o estudo de processos genéticos controladores de caracteres fenotípicos de herança complexa, a partir da análise conjunta de informação relativa a fenótipos, estruturas de parentesco, marcadores moleculares e expressão gênica. Estudos de genética genômica são utilizados, por exemplo, para a estimação da herdabilidade de níveis de transcrição, para o mapeamento de locos controladores da expressao gênica (eQTL, do inglês expression Quantitative Trait Loci), e para o estudo de redes regulatórias. Genética genômica geralmente envolve experimentos com microarrays, os quais são ainda bastante caros e trabalhosos, limitando o tamanho amostral e conseqüentemente o poder estatístico de tais estudos. Desta maneira, é essencial que tais experimentos sejam otimizados do ponto de vista do delineamento, a partir de criteriosa escolha das amostras (indivíduos) a serem utilizadas, e do controle rigoroso dos vários fatores que podem afetar as variáveis-resposta de interesse. Outro ponto fundamental na condução de tais experimentos refere-se à marcação das amostras de mRNA com os fluoróforos e ao pareamento das mesmas em cada lâmina de microarray, os quais devem ser cuidadosamente planejados para que não haja confundimento entre estes efeitos e os fatores biológicos de interesse. Nesta apresentação serão discutidas algumas estratégias para o planejamento de estudos de genética genômica, incluindo a seleção de indivíduos objetivando-se a maximização da dissimilaridade genética ou do número de eventos de recombinação, bem como a condução eficiente dos ensaios com microarrays para diferentes objetivos experimentais.

scholarly journals Expression Quantitative Trait Loci for Extreme Host Response to Influenza A in Pre-Collaborative Cross Mice

2012 ◽  
Vol 2 (2) ◽  
pp. 213-221 ◽  
Author(s):  
Daniel Bottomly ◽  
Martin T. Ferris ◽  
Lauri D. Aicher ◽  
Elizabeth Rosenzweig ◽  
Alan Whitmore ◽  
...  
Keyword(s):  
Quantitative Trait Loci ◽  
Quantitative Trait ◽  
Host Response ◽  
Influenza A ◽  
Collaborative Cross ◽  
Expression Quantitative Trait Loci ◽  
Trait Loci

scholarly journals Expression Quantitative Trait Loci Acting Across Multiple Tissues Are Enriched in Inherited Risk for Coronary Artery Disease

2015 ◽  
Vol 8 (2) ◽  
pp. 305-315 ◽  
Author(s):  
Hassan Foroughi Asl ◽  
Husain A. Talukdar ◽  
Alida S.D. Kindt ◽  
Rajeev K. Jain ◽  
Raili Ermel ◽  
...  
Keyword(s):  
Coronary Artery Disease ◽  
Coronary Artery ◽  
Quantitative Trait Loci ◽  
Quantitative Trait ◽  
Expression Quantitative Trait Loci ◽  
Trait Loci ◽  
Artery Disease ◽  
Inherited Risk

scholarly journals Rapid and robust association mapping of expression quantitative trait loci

2007 ◽  
Vol 1 (S1) ◽  
Author(s):  
Alex C Lam ◽  
Michael Schouten ◽  
Yurii S Aulchenko ◽  
Chris S Haley ◽  
Dirk-Jan de Koning
Keyword(s):  
Quantitative Trait Loci ◽  
Association Mapping ◽  
Quantitative Trait ◽  
Expression Quantitative Trait Loci ◽  
Trait Loci
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document