О происхождении отцовских линий популяции саха: сравнительный анализ данных популяционной генетики / древней ДНК, археологических и исторических исследований

10.33384/26587270.2019.01.010 ◽

2019 ◽

pp. 32-52

Keyword(s):

Саха (якуты) являются самым северным и многочисленным тюркоязычным народом Северо-Восточной Сибири. Согласно широко распространенным среди саха легендам, прародителями народа являются Эллэй и Омогой, прибывшие на Среднюю Лену из азиатской степи. Археологические находки и исследования древних ДНК позволяют констатировать: персонажи Эллэя и Омогоя – реальные исторические личности, тесно связанные с этногенезом саха. Цель настоящего исследования – определение генетической «подписи» (биомаркеров) родовых линий популяции саха, в том числе легендарных Эллэя и Омогоя по их отцовским линиям. В данном исследовании впервые определены гаплогруппа и гаплотип STR-локусов Y-хромосомы родовой линии Эллэя на основе исследования его вероятного прямого потомка, генеалогия которого установлена по достоверным архивным документам и опубликованным источникам научных исследований. Анализ 367 гаплотипов STR-локусов Y-хромосомы популяции саха, собранные из литературных и других источников с использованием поисковых инструментов Y-chromosome STR Haplotype Reference Database (YHRD), показал, что отцовские линии саха состоят из 6 основных кластеров расширения, каждый из которых соответствует древнему клану. Среди современной популяции саха наиболее распространенный гаплотип действительно был представлен линией вероятного потомка легендарного Эллэя. В настоящей работе представлены данные, подтверждающие его киданьское происхождение. Как было показано ранее, отцовские линии саха оказались очень гомогенными и демонстрировали признаки сильного узкого места в популяции. Генетические и археологические данные хорошо согласуются с историческими повествованиями саха, в которых, по крайней мере, с точки зрения отцовской линии, только несколько человек, возможно, прибыли из степей Азии и имели репродуктивный успех среди автохтонного населения, что привело к сегодняшнему разнообразию Y-хромосомы популяции.

Download Full-text

The Y-Chromosome Haplotype Reference Database (YHRD) — Publicly Available Reference and Research Datasets for the Forensic Interpretation of Y-Chromosome STR Profiles

Security Science and Technology - Handbook of Forensic Genetics ◽

10.1142/9781786340788_0012 ◽

2016 ◽

pp. 231-248 ◽

Cited By ~ 5

Author(s):

Lutz Roewer

Keyword(s):

Y Chromosome ◽

Reference Database ◽

Y Chromosome Str ◽

Chromosome Haplotype

Download Full-text

Genetic analysis of autosomic and Y-chromosome STR-PCR polymorphisms of the Huaoranis, the last nomad tribe in Ecuador

International Congress Series ◽

10.1016/j.ics.2005.12.045 ◽

2006 ◽

Vol 1288 ◽

pp. 331-333 ◽

Cited By ~ 3

Author(s):

Fabricio González-Andrade ◽

Miguel Bolea ◽

Begoña Martínez-Jarreta ◽

Dora Sánchez

Keyword(s):

Genetic Analysis ◽

Y Chromosome ◽

Y Chromosome Str

Download Full-text

Genetic Structure Analysis of Three Hispanic Populations from Costa Rica, Mexico, and the Southwestern United States Using Y-Chromosome STR Markers and mtDNA Sequences

Human Biology ◽

10.1353/hub.2007.0002 ◽

2006 ◽

Vol 78 (5) ◽

pp. 551-563 ◽

Cited By ~ 21

Author(s):

Rebeca. Campos-SÃ¡nchez ◽

Ramiro. Barrantes ◽

Sandra Honorato da. Silva ◽

Michael. Escamilla ◽

Alfonso. Ontiveros ◽

...

Keyword(s):

United States ◽

Costa Rica ◽

Genetic Structure ◽

Y Chromosome ◽

Structure Analysis ◽

Southwestern United States ◽

Mtdna Sequences ◽

Str Markers ◽

Hispanic Populations ◽

Y Chromosome Str

Download Full-text

Nine-locus Y-chromosome STR profiling of Caucasian and Xhosa populations from Cape Town, South Africa

Forensic Science International ◽

10.1016/j.forsciint.2004.02.022 ◽

2004 ◽

Vol 144 (1) ◽

pp. 73-75 ◽

Cited By ~ 17

Author(s):

Neil Leat ◽

Mongi Benjeddou ◽

Sean Davison

Keyword(s):

South Africa ◽

Y Chromosome ◽

Cape Town ◽

Str Profiling ◽

Y Chromosome Str

Download Full-text

Forensic application of Y-chromosomal STR analysis in Lithuanian population

Biologija ◽

10.6001/biologija.v61i2.3140 ◽

2015 ◽

Vol 61 (2) ◽

Author(s):

Giedrė Ruzgaitė ◽

Marija Čaplinskienė ◽

Rima Baranovienė ◽

Jūratė Jankauskienė ◽

Jolanta Kukienė ◽

...

Keyword(s):

Y Chromosome ◽

Gene Pool ◽

Haplotype Diversity ◽

Haplotype Frequency ◽

Reference Database ◽

Match Probability ◽

Str Analysis ◽

Str Markers ◽

Forensic Casework ◽

Chromosome Gene

This paper presents a comprehensive Y-chromosomal STR haplotype analysis in the Lithuanian population in order to evaluate Lithuanians’ Y chromosome diversity, to infer genetic relations between Lithuanian and other European neighbouring populations and to introduce population reference data for generation of reliable Y-STR haplotype frequency estimates to be used in the quantitative assessment of Y-STR haplotype match in the forensic casework. Data were collected from the peripheral blood samples of 194 unrelated males throughout various regions of Lithuania. The amplification of 17 Y-STRs was carried out in one multiplex PCR using an AmpFlSTR® Yfiler<sup>TM</sup> PCR Amplication Kit according to the supplier’s protocol. The results indicated that the Y-chromosomal haplotype diversity in the Lithuanian population rises as the number of the analyzed Y-STRs is increased. However, all additional Y-STR loci are not hypervariable and only their whole makes a large diversity of Y-STR haplotypes in Lithuanian males. The analysis of molecular variance revealed low but significant interpopulation differences except the pair of Lithuanian and Latvian populations. The phylogenetic analysis showed that the clustered Y chromosome gene pool of Lithuanians and Latvians has a closer phylogenetic relation to Russian and Estonian populations and is less genetically related to other neighbouring populations of Belarus and Poland. Yet Y-STRs alleles and haplotypes differentiate effectively inside the Lithuanian population and between Lithuanians and its geographical neighbours excluding the Latvian population. Comparison of the Y-STR data suggests that Lithuanian and Latvian populations are closely related not only by geography and language but also by the Y chromosome gene pool represented by forensic Y-STR markers. Consequently, more forensic Y-STR markers should be included in the Y-STR haplotype in order to achieve a resolution between the Y chromosomes of Lithuanian and Latvian males. Lithuanian Y-STR haplotype data were submitted to the 34th release of the Y-STR Haplotype Reference Database 3.0 for match probability calculations in the forensic casework.

Download Full-text

Y-chromosome STR variation in Ukrainian populations

Bulletin of Taras Shevchenko National University of Kyiv Series Biology ◽

10.17721/1728_2748.2015.70.55-61 ◽

2015 ◽

Vol 70 (2) ◽

pp. 55-61

Author(s):

O. Utevska ◽

L. Atramentova ◽

E. Balanovska ◽

O. Balanovsky

Keyword(s):

Y Chromosome ◽

Haplotype Diversity ◽

Allele Frequencies ◽

Forest Steppe ◽

Population Differences ◽

Match Probability ◽

Str Loci ◽

Carpathian Region ◽

Y Chromosome Str ◽

Forensic Parameters

The haplotype and allele frequencies for 17 STR loci of Y-chromosome were obtained for 1151 indigenous Ukrainians from 13 regional populations representing the major territorial subdivisions of Ukraine. There were no significant inter-population differences. The genetic subdivisions within Ukraine was revealed between Polesie, western and eastern forest-steppe populations. The highest microsatellite variability was observed along the edges of Ukrainian area – in the Carpathian region, Bukovina, Sloboda Ukraine; the lowest – in Polesie. The average haplotype diversity values are higher in the steppe and forest-steppe zones, than in Polesie and the Carpathians. Forensic parameters were calculated: total haplotype diversity HD = 0,998855, match probability MP = 0.00114508, the discrimination capacity DC = 0,89400521.

Download Full-text