Matrix-assisted ultraviolet laser desorption/ionization time-of-flight (UV-MALDI-TOF) mass spectra of N-acylated and N,O-acylated glycosylamines

2007 ◽  
Vol 342 (17) ◽  
pp. 2567-2574 ◽  
Author(s):  
Yasuto Sato ◽  
Yuko Fukuyama ◽  
Hiroshi Nonami ◽  
Rosa Erra-Balsells ◽  
Carlos A. Stortz ◽  
...  
2016 ◽  
Vol 55 (1) ◽  
pp. 90-96 ◽  
Author(s):  
Julie Denis ◽  
Marie Machouart ◽  
Florent Morio ◽  
Marcela Sabou ◽  
Catherine Kauffmann-LaCroix ◽  
...  

ABSTRACT The genus Malassezia comprises commensal yeasts on human skin. These yeasts are involved in superficial infections but are also isolated in deeper infections, such as fungemia, particularly in certain at-risk patients, such as neonates or patients with parenteral nutrition catheters. Very little is known about Malassezia epidemiology and virulence. This is due mainly to the difficulty of distinguishing species. Currently, species identification is based on morphological and biochemical characteristics. Only molecular biology techniques identify species with certainty, but they are time-consuming and expensive. The aim of this study was to develop and evaluate a matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight (MALDI-TOF) database for identifying Malassezia species by mass spectrometry. Eighty-five Malassezia isolates from patients in three French university hospitals were investigated. Each strain was identified by internal transcribed spacer sequencing. Forty-five strains of the six species Malassezia furfur , M. sympodialis , M. slooffiae , M. globosa , M. restricta , and M. pachydermatis allowed the creation of a MALDI-TOF database. Forty other strains were used to test this database. All strains were identified by our Malassezia database with log scores of >2.0, according to the manufacturer's criteria. Repeatability and reproducibility tests showed a coefficient of variation of the log score values of <10%. In conclusion, our new Malassezia database allows easy, fast, and reliable identification of Malassezia species. Implementation of this database will contribute to a better, more rapid identification of Malassezia species and will be helpful in gaining a better understanding of their epidemiology.


2021 ◽  
Vol 30 (3) ◽  
pp. 65-69
Author(s):  
Marwa N. Mohamed ◽  
Ahmed F. Azmy ◽  
Ehab M. Fahmy ◽  
Mervat G. Elanany ◽  
Nesreen M. Kamel

Background: Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI-TOF) is a novel technique for identification of microbes. This new method led to a new era in microbial identification because of its rapid, accurate, valid, simple and relatively decreased cost. Objectives: The aim of this study was identification of predominant pathogens by MALDI-TOF technique. Methodology: Pathogens were identified by both conventional methods and MALDI-TOF. Results: From July till December 2018, predominant pathogens were Klebsiella pneumoniae (21%), Pseudomonas aeroguinosa and Candida each constitutes (17%), E-coli (10%), Staph. aureus (9%), Acinetobacter (9%). Identification of isolates (from September to December 2018) by MALDI-TOF revealed a total agreement of (94.1%) with conventional method at genus level, (88.2%) at level of species. Kappa agreement revealed almost perfect correlation between both techniques. Conclusion: The MALDI-TOF results might suggest that its’ usage may be dependable for microbiological identification.


Author(s):  
Diego Rabello Iglesias ◽  
Kevin Haley Barbosa ◽  
Fabíola Fernandes dos Santos Castro

A sepse é um quadro dinâmico que rapidamente pode evoluir para estágios graves e cuja a intervenção precoce tem um importante impacto no prognóstico do paciente. Tendo em vista que um tratamento eficaz depende da rápida identificação do patógeno causador do quadro, métodos diagnósticos rápidos ganham importante papel dentro do protocolo. Dentre as várias formas de identificar o agente causador da sepse, o Matrix Associated Laser Desorption-Ionization – Time of Flight (MALDI-TOF) tem grande potencial por sua velocidade nos resultados e confiabilidade. O MALDI-TOF é um método diagnóstico que consiste em colocar o material biológico em placa de matriz polimérica, sendo o material vaporizado por um lazer e coletado por um tubo que possui um detector no final, que avalia o tempo de chegada das moléculas evaporadas da substância. Esses dados são, então, colocados em um gráfico, com picos para cada fungo e bactéria, e então interpretados com um banco de dados já conhecido, concedendo o resultado diagnóstico . Esse trabalho teve como objetivo verificar a utilidade do Maldi-TOF como ferramenta diagnóstica nos protocolos de sepse em comparação com a cultura. Como objetivos específicos, esse trabalho se propôs a verificar se houve uma redução no tempo de diagnóstico microbiológico, internamento, tratamento e uma melhora na evolução do paciente, assim como avaliar se houve concordância entre os resultados apresentados pelo MALDI-TOF e o método convencional. Como metodologia, foi realizado uma revisão integrativa nas bases de dados: SciELO, BVS Salus, Scopus, Web of Science, PUBMED e google academico. A seleção de artigos foi feita por dois pesquisadores, individualmente, resultando em 16 artigos finais, dos quais foram extraídos seus dados e realizada a discussão. Foi obtido como resultados que o uso do Maldi-TOF no protocolo de sepse reduz o tempo até identificação do patógeno permitindo, consequentemente, uma redução no tempo até terapia efetiva, tempo até terapia optima, tempo de estadia hospitalar e na mortalidade. Observou-se que a redução no tempo de estadia, assim como, na melhora no tratamento, tem importante impacto econômico no hospital, causando redução de diversos custos quando comparado ao método convencional. No entanto, o MALDI-TOF tem importantes limitações como a dificuldade na identificação de amostras polimicrobianas, sua dependência dos agentes registrados nos bancos de dados, sua ausência de um protocolo único estabelecido para processamento de amostras diretamente de hemocultura positiva e sua limitação na identificação de bactérias gram positivas. Conclui-se que a inclusão do MALDI-TOF no protocolo de sepse traz importantes benefícios tanto em relação ao tempo ate identificação do agente, quanto em relação à melhora no prognóstico do paciente. No entanto, ainda são necessárias algumas melhorias de forma a contornar as limitações atualmente presentes.


2003 ◽  
Vol 32 (6 suppl 2) ◽  
pp. 1890-1900 ◽  
Author(s):  
Antonio Emidio D. Feliciano Silva ◽  
André Lima Dias ◽  
Maria Marina Unanian ◽  
Alfredo Ribeiro de Freitas ◽  
Carlos Bloch Junior

Objetivou-se com este estudo a identificação de alguns fatores protéicos envolvidos na qualidade funcional dos espermatozóides epididimais (SPZEP) e ejaculados (SPZEJ) de bovinos. Foram avaliadas as características morfofisiológicas e analisado o conteúdo peptídico destas estruturas de 11 animais mestiços Nelore, de 24 a 30 meses de idade. As avaliações morfofisiológicas foram motilidade progressiva (MOT, %), vigor, patologias espermáticas, integridade acrossômica e da cromatina. Foi observado que, os SPZEJ, na média, apresentaram MOT maior do que os SPZEP, 72,3 e 46,4%, respectivamente. Considerando as patologias espermáticas, taxas de defeitos maiores (DEFMAI), menores (DEFMEN) e totais (DEFTOT), houve diferença significativa entre as taxas dos DEFMEN e DEFTOT dos SPZEP e SPZEJ, sendo, em média, 91,1 e 8,5% e 95,4 e 11,8%, respectivamente. As taxas dos DEFMEN e DEFTOT dos SPZEP foram maiores em função da presença de espermatozóides com gotas citoplasmáticas distais. A análise das protéinas dos SPZEP e SPZEJ foi realizada por espectrometria de massa, método MALDI-TOF (matrix -assisted laser desorption/ionization - time of flight), e revelou presença de peptídeos de massa molecular variando de 1,1 a 26,3 kDa nos SPZEJ e de 1,1 a 11,6 kDa nos SPZEP. Foram identificados peptídeos de 10,6 e 13,4 kDa somente nos SPZEJ e de 6,8 kDa somente nos SPZEP. Foi observada relação do peptídeo de massa molecular de 7,4 kDa dos SPZEP e de 4,7 kDa dos SPZEJ, com a MOT Ê 80%, destas estruturas. Os resultados sugerem o envolvimento destes peptídeos nos processos funcionais das células espermáticas do epidídimo e ejaculado. O estudo utilizou o método MALDI/TOF para espectrômetro de massa, para identificar peptídeos em espermatozóides do epidídimo de bovinos, pela primeira vez no País.


2013 ◽  
Vol 34 (9) ◽  
pp. 990-995 ◽  
Author(s):  
Pranita D. Tamma ◽  
Kennard Tan ◽  
Veronique R. Nussenblatt ◽  
Alison E. Turnbull ◽  
Karen C. Carroll ◽  
...  

We evaluated 222 hospitalized patients whose clinical isolates were tested using standard methods and matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF). MALDI-TOF could have reduced time to appropriate therapy for 28.8% and 44.6% patients based on the treating physician's choices and stewardship team recommendations, respectively. Clinicians should be aware of scenarios in which MALDI-TOF can optimize antibiotic therapy.


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