Deep Learning Based Scalable Inference of Uncertain Opinions

Author(s):  
Xujiang Zhao ◽  
Feng Chen ◽  
Jin-Hee Cho
2020 ◽  
Vol 36 (Supplement_1) ◽  
pp. i560-i568 ◽  
Author(s):  
Amirali Aghazadeh ◽  
Orhan Ocal ◽  
Kannan Ramchandran

Abstract Summary We propose a new spectral framework for reliable training, scalable inference and interpretable explanation of the DNA repair outcome following a Cas9 cutting. Our framework, dubbed CRISPRL and, relies on an unexploited observation about the nature of the repair process: the landscape of the DNA repair is highly sparse in the (Walsh–Hadamard) spectral domain. This observation enables our framework to address key shortcomings that limit the interpretability and scaling of current deep-learning-based DNA repair models. In particular, CRISPRL and reduces the time to compute the full DNA repair landscape from a striking 5230 years to 1 week and the sampling complexity from 1012 to 3 million guide RNAs with only a small loss in accuracy (R2R2 ∼ 0.9). Our proposed framework is based on a divide-and-conquer strategy that uses a fast peeling algorithm to learn the DNA repair models. CRISPRL and captures lower-degree features around the cut site, which enrich for short insertions and deletions as well as higher-degree microhomology patterns that enrich for longer deletions. Availability and implementation The CRISPRL and software is publicly available at https://github.com/UCBASiCS/CRISPRLand.


Author(s):  
Stellan Ohlsson
Keyword(s):  

2019 ◽  
Vol 53 (3) ◽  
pp. 281-294
Author(s):  
Jean-Michel Foucart ◽  
Augustin Chavanne ◽  
Jérôme Bourriau

Nombreux sont les apports envisagés de l’Intelligence Artificielle (IA) en médecine. En orthodontie, plusieurs solutions automatisées sont disponibles depuis quelques années en imagerie par rayons X (analyse céphalométrique automatisée, analyse automatisée des voies aériennes) ou depuis quelques mois (analyse automatique des modèles numériques, set-up automatisé; CS Model +, Carestream Dental™). L’objectif de cette étude, en deux parties, est d’évaluer la fiabilité de l’analyse automatisée des modèles tant au niveau de leur numérisation que de leur segmentation. La comparaison des résultats d’analyse des modèles obtenus automatiquement et par l’intermédiaire de plusieurs orthodontistes démontre la fiabilité de l’analyse automatique; l’erreur de mesure oscillant, in fine, entre 0,08 et 1,04 mm, ce qui est non significatif et comparable avec les erreurs de mesures inter-observateurs rapportées dans la littérature. Ces résultats ouvrent ainsi de nouvelles perspectives quand à l’apport de l’IA en Orthodontie qui, basée sur le deep learning et le big data, devrait permettre, à moyen terme, d’évoluer vers une orthodontie plus préventive et plus prédictive.


2020 ◽  
Author(s):  
L Pennig ◽  
L Lourenco Caldeira ◽  
C Hoyer ◽  
L Görtz ◽  
R Shahzad ◽  
...  
Keyword(s):  

2020 ◽  
Author(s):  
A Heinrich ◽  
M Engler ◽  
D Dachoua ◽  
U Teichgräber ◽  
F Güttler
Keyword(s):  

2020 ◽  
Author(s):  
J Suykens ◽  
T Eelbode ◽  
J Daenen ◽  
P Suetens ◽  
F Maes ◽  
...  

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document