Sequence of mitochondrial DNA cytochrome oxidase II inCryptopygus nanjiensis and Phylogeny of Apterygota

2000 ◽  
Vol 43 (6) ◽  
pp. 589-596 ◽  
Author(s):  
Hongguang Shao ◽  
Yaping Zhang ◽  
Xin Ke ◽  
Qiaoyun Yue ◽  
Wenying Yin
Keyword(s):  
Mitochondrial Dna ◽  
Cytochrome Oxidase ◽  
Cytochrome Oxidase Ii

scholarly journals Phylogenetic Relationships of Macaques (Cercopithecidae: Macaca) Inferred from Partial Mitochondrial DNA (mtDNA) Cytochrome Oxidase II (COII) gene

1970 ◽  
Vol 4 (1) ◽  
pp. 42-51
Author(s):  
Noor Aisyah Rahim ◽  
Millawati Gani ◽  
Mohd Tajuddin Abdullah
Keyword(s):  
Mitochondrial Dna ◽  
Cytochrome Oxidase ◽  
Phylogenetic Relationships ◽  
Phylogenetic Trees ◽  
Phylogenetic Analyses ◽  
Neighbor Joining ◽  
Sister Clade ◽  
Molecular Phylogenetic ◽  
Coii Gene ◽  
Cytochrome Oxidase Ii

The molecular phylogenetic relationships among ten species of macaques were assessed using mitochondrialDNA (mtDNA) cytochrome oxidase II (COII) gene. The 27 individuals comprising of ten species within genusMacaca, namely, M. sylvanus, M. mulatta, M. cyclopis, M. arctoides, M. fascicularis, M. assamensis, M.thibetana, M. nemestrina, M. leonina and M. silenus were used in this study. The phylogenetic trees werereconstructed using neighbor-joining (NJ), maximum parsimony (MP) and maximum likelihood (ML) methods.Based on our constructed tree, it is suggested that the results from phylogenetic analyses demonstrated fourgroups of macaques. In addition, the trees showed topology of M. sylvanus as a sister clade to all Asianmacaques. The silenus group, which diverged first after M. sylvanus formed their own clade, consisted ofmacaque species M. silenus, M. nemestrina and M. leonina. Meanwhile, the sinica group consisted of M.assamensis and M. thibetana, and the fascicularis group comprised of M. fascicularis, M. arctoides, M. mulattaand M. cyclopis. Our ML tree also showed that M. arctoides is a member of fascicularis group. Our study, alsoindicated that our results neglect the classification based on outer appearances and supports the proposedmolecular work view.

scholarly journals Identification of Diatraea spp. (Lepidoptera: Crambidae) based on cytochrome oxidase II

PLoS ONE ◽  
2017 ◽  
Vol 12 (9) ◽  
pp. e0184053 ◽  
Author(s):  
Gloria Patricia Barrera ◽  
Laura Fernanda Villamizar ◽  
Carlos Espinel ◽  
Edgar Mauricio Quintero ◽  
Mariano Nicolás Belaich ◽  
...  
Keyword(s):  
Cytochrome Oxidase ◽  
Cytochrome Oxidase Ii

scholarly journals A phylogenetic framework for the bumblebee species of the subgenus Bombus sensu stricto based on mitochondrial DNA markers, with a short description of the neglected taxon B. minshanicola Bischoff, 1936 n. status. (Hymenoptera: Apidae: Bombus).

2010 ◽  
Vol 60 (2) ◽  
pp. 471-487
Author(s):  
Andreas Bertsch
Keyword(s):  
Mitochondrial Dna ◽  
Cytochrome Oxidase ◽  
Dna Markers ◽  
Sensu Stricto ◽  
Short Description ◽  
Bumblebee Species ◽  
Neue Art ◽  
Phylogenetic Framework ◽  
Bombus Affinis ◽  
N Status

Königinnen von 12 Taxa der Untergattung Bombus sensu stricto (Bombus affinis, B. albocinctus, B. cryptarum, B. lucorum, B. magnus, B. moderatus, B. occidentalis, B. patagiatus, B. sporadicus, B. terrestris, B. terricola and B. tunicatus) wurden im Frühjahr gefangen, um künstliche Kolonien zu züchten. Zusätzlich wurden Männchen von B. franklini und B. lucorum/China gefangen. Mitochondriale Cytochrome Oxidase Untereinheit I (COI) von 53 Proben wurde sequenziert (Teilsequenzen der Länge 1257 bp). GenBank Sequenzen der Ostasiatischen Arten B. hypocrita, B. ignitus und B. lucorum/China wurden einbezogen. Der Unterschied zwischen den Arten beträgt 30 – 92 Basen-Substitutionen und die Tamura-Nei genetische Distanz 0.030-0.103, während der Unterschied innerhalb der Arten nur 1 – 3 Basensubstitution beträgt und die Tamura-Nei genetische Distanz nur 0.001-0.003. Dreizehn Taxa mit Artrang sowie eine neue Art B. minshanicola Bischoff 1936 (= B. terrestris ssp. minshanicola = B. lucorum/China) wurden nachgewiesen. In der Topologie des phylogenetischen Stammbaums gibt es 4 Cluster: ein Artenpaar B. sporadicus – B. ignitus und ein Artenpaar B. terricola – B. occidentalis, ein Cluster für B. magnus, B. patagiatus and B. cryptarum mit den Subspecies B. cryptarum albocinctus und B. cryptarum moderatus sowie ein Cluster für B. hypocrita, B. lucorum, B. minshanicola, B. franklini and B. affinis. Die Arten B. terrestris mit den Subspecies B. terrestris canariensis und B. terrestris sassaricus sowie B. tunicatus sind einzeln abgetrennt. Da sich im Alignment der COI Sequenzen keine Lücken finden, können die einzelnen Nucleotid-Positionen als homolog betrachtet werden. Jede Art besitzt eine Reihe einzigartiger (‘privater’) Positionen, die als diagnostische Merkmale benutzt werden können um die Art zu definieren und zu identifizieren.

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