Structural basis for specific calcium binding by the polycystic-kidney-disease domain of Vibrio anguillarum protease Epp

2018 ◽  
Vol 505 (2) ◽  
pp. 471-477
Author(s):  
Peihai Li ◽  
Kun Zang ◽  
Yingjie Li ◽  
Changshui Liu ◽  
Qingjun Ma
1998 ◽  
Vol 9 (10) ◽  
pp. 1853-1860 ◽  
Author(s):  
Y Pei ◽  
N He ◽  
K Wang ◽  
M Kasenda ◽  
A D Paterson ◽  
...  

Autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) is a common Mendelian disorder that affects approximately 1 in 1000 live births. Linkage studies have shown that the majority (approximately 85%) of cases are due to mutations in PKD1 on chromosome 16p, while mutations in PKD2 on chromosome 4q account for most of the remaining cases. Locus heterogeneity in ADPKD is known to contribute to differences in disease severity, with PKD1-linked families having earlier onset of end-stage renal disease (ESRD) than PKD2-linked families (mean age at ESRD: 56 versus 70, respectively). In this study, 11 Canadian families with ADPKD were screened for PKD2 mutations. In four families, linkage to PKD2 was previously documented. In the remaining seven smaller families, one or more affected members had late-onset ESRD at age 70 or older. Using single-stranded conformational polymorphism analysis, one affected member from each family was screened for mutations in all 15 exons of PKD2, which were PCR-amplified from genomic templates. A spectrum of mutations was found in approximately 73% (8 of 11) of the families screened, with no difference in the detection rate between the PKD2-linked families and the families with late-onset ESRD. In three unrelated families, insertion or deletion of an adenosine in a polyadenosine tract (i.e., (A)8 at nt 2152-2159) was found on exon 11, suggesting that this mononucleotide repeat tract is prone to mutations from "slipped strand mispairing." All mutations, scattered between exons 1 and 11, are predicted to result in a truncated polycystin 2 that lacks both the calcium-binding EF-hand domain and the two cytoplasmic domains required for the interaction of polycystin 2 with polycystin 1 and with itself. Furthermore, no correlation was found between the location of the mutations in the PKD2 coding sequence and disease severity. Thus, these findings are consistent with other recently published reports and suggest that most PKD2 mutations are inactivating.


2001 ◽  
Vol 21 (5) ◽  
pp. 430-440 ◽  
Author(s):  
Ira D. Davis ◽  
Katherine MacRae Dell ◽  
William E. Sweeney ◽  
Ellis D. Avner

2005 ◽  
Vol 33 (06) ◽  
pp. 413-418 ◽  
Author(s):  
W. Hecht ◽  
M. Gerwing ◽  
U. Michele ◽  
M. Reinacher ◽  
Eva Kappe

Zusammenfassung Gegenstand und Ziel: Diese Studie untersuchte das Auftreten einer kürzlich beschriebenen Punktmutation in Form einer C→A-Transversion im Exon 29 des felinen PKD1-Gens in einer Stichprobe der deutschen Perserkatzenpopulation und bei einigen Katzen der Rasse Exotic Shorthair. Diese Mutation führt über ein zusätzliches Stopcodon zum frühzeitigen Abbruch der Proteinkette des Proteins Polycystin. Damit ist sie vermutlicher Auslöser der meisten Fälle des polyzystischen Syndroms (Polycystic Kidney Disease, PKD) bei Perserkatzen. Material und Methoden: Die Untersuchung erfolgte an DNA-Proben von 116 zum Teil miteinander verwandten Perser- und sieben Exotic-Shorthair-Katzen, die im Vorfeld mittels Ultraschall auf die Erkrankung PKD untersucht wurden. Infolge der Punktmutation entsteht eine neue Schnittstellen für das Restriktionsenzym Mly I. Durch eine Restriktionsfragmentanalyse kann das Wildtypallel vom mutierten Allel unterschieden werden. Ergebnisse: Keine der 58 sonographisch zystenfreien Katzen erwies sich als Träger der Mutation. Bei 95% der Perserkatzen mit Nierenzysten und bei allen zystenpositiven Exotic-Shorthair-Tieren war die untersuchte Mutation vorhanden. Damit stimmen die Ergebnisse der Ultraschalluntersuchung und des Gentests zu 97,4% überein. Alle Träger der Mutation waren heterozygot für dieses Merkmal. Schlussfolgerungen: Die Ergebnisse weisen darauf hin, dass es sich bei der untersuchten Mutation um den tatsächlichen Auslöser des polyzystischen Syndroms handelt. Die homozygot vererbte Mutation scheint ein Letalfaktor zu sein, denn homozygote Merkmalsträger wurden nicht beobachtet. Bei 5% der untersuchten Perserkatzen mit Nierenzysten lag keine Mutation in Exon 29 des PKD1-Gens vor. In solchen Fällen kann jedoch eine Mutation an anderer Stelle nicht mit Sicherheit ausgeschlossen werden.


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