scholarly journals Simultaneous Folding of Alternative RNA Structures with Mutual Constraints: An Application to Next-Generation Sequencing-based RNA Structure Probing

2014 ◽  
Vol 21 (8) ◽  
pp. 609-621 ◽  
Author(s):  
Cuncong Zhong ◽  
Shaojie Zhang
Keyword(s):  
Next Generation Sequencing ◽  
Rna Structure ◽  
Next Generation ◽  
Rna Structures ◽  
Structure Probing ◽  
Generation Sequencing

The RNA structurome: transcriptome-wide structure probing with next-generation sequencing

2015 ◽  
Vol 40 (4) ◽  
pp. 221-232 ◽  
Author(s):  
Chun Kit Kwok ◽  
Yin Tang ◽  
Sarah M. Assmann ◽  
Philip C. Bevilacqua
Keyword(s):  
Next Generation Sequencing ◽  
Next Generation ◽  
Structure Probing ◽  
Generation Sequencing

Labordiagnostik bei gastrointestinalen Tumoren

2020 ◽  
Vol 11 (05) ◽  
pp. 232-238
Author(s):  
Marcus Kleber
Keyword(s):  
Next Generation Sequencing ◽  
Kolorektales Karzinom ◽  
Next Generation ◽  
Generation Sequencing

ZUSAMMENFASSUNGDas kolorektale Karzinom (KRK) ist einer der häufigsten malignen Tumoren in Deutschland. Einer frühzeitigen Diagnostik kommt große Bedeutung zu. Goldstandard ist hier die Koloskopie. Die aktuelle S3-Leitlinie Kolorektales Karzinom empfiehlt zum KRK-Screening den fäkalen okkulten Bluttest. Für das Monitoring von Patienten vor und nach Tumorresektion werden die Messung des Carcinoembryonalen Antigens (CEA) und der Mikrosatellitenstabilität empfohlen. Für die Auswahl der korrekten Chemotherapie scheint derzeit eine Überprüfung des Mutationsstatus, mindestens des KRAS-Gens und des BRAF-Gens, sinnvoll zu sein. Eine Reihe an neuartigen Tumormarkern befindet sich momentan in der Entwicklung, hat jedoch noch nicht die Reife für eine mögliche Anwendung in der Routinediagnostik erreicht. Den schnellsten Weg in die breite Anwendung können Next-Generation-Sequencing-basierte genetische Tests finden.

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