Caracterização molecular através da técnica fAFLP de isolados de Diaporthe citri

A citricultura é um mercado em expansão, principalmente no Estado de São Paulo, cuja importância na balança comercial já é reconhecida. Como em qualquer espécie cultivada, o crescimento das áreas de cultivo favorecem também o crescimento de problemas fitossanitários. Desta forma, as espécies de citros são afetadas por diversas doenças destacando-se entre elas a melanose, causada por Diaporthe citri (Wolf.), à qual a grande maioria das variedades comerciais são suscetíveis. O conhecimento da diversidade intra-específica é de grande importância, já que esta poderá auxiliar na seleção de variedades com resistência. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética em isolados de Diaporthe citri, originários de diferentes locais, variedades e partes da planta, utilizando marcadores moleculares. Marcadores do tipo AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) foram utilizados para caracterização de dez isolados do patógeno. Os DNAs genômicos extraídos da massa micelial foram utilizados nas reações de amplificação. A técnica fluorescent AFLP permitiu a distinção dos isolados estudados, tendo sido classificados em quatro grupos distintos. Contudo, estes grupos não foram formados em razão da região geográfica, parte da planta ou variedade.

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Molecular characterization by amplified fragment length polymorphism and aflatoxin production of Aspergillus flavus isolated from freshly harvested peanut in Brazil

World Mycotoxin Journal ◽

10.3920/wmj2011.1350 ◽

2012 ◽

Vol 5 (2) ◽

pp. 187-194 ◽

Cited By ~ 1

Author(s):

G. Martins Reis ◽

L. de Oliveira Rocha ◽

D. Diniz Atayde ◽

M.J. Moreira Batatinha ◽

B. Corrêa

Keyword(s):

Genetic Variability ◽

Aspergillus Flavus ◽

Length Polymorphism ◽

Fragment Length ◽

Fragment Length Polymorphism ◽

Molecular Genetic ◽

Amplified Fragment Length Polymorphism ◽

Aflatoxin Production ◽

Sao Paulo ◽

The State

Brazil contributes substantially to the global peanut production, and the state of São Paulo is the largest producer in the country. Peanut crops can be contaminated by Aspergillus flavus strains producing aflatoxins, which are highly toxic and carcinogenic. Thus, the production of high-quality peanuts is crucial both for the commercial peanut industry and as a matter of public health. In this study, we used amplified fragment length polymorphism analysis (AFLP) to investigate the genetic variability among A. flavus strains isolated from fresh peanuts harvested in four different regions in the state of São Paulo, and to determine whether the molecular genetic profiles correlated with aflatoxin production or sclerotia formation. AFLP analysis generated 78 fragments ranging from 27 to 365 base pairs in length. Thirteen percent were not polymorphic. Genotyping identified twelve groups of A. flavus. On the basis of the polymorphisms identified, similarity between the isolates ranged from 37% to 100%. Of all isolates collected, 91.7% produced aflatoxins and 83.9% produced small sclerotia. Statistical analysis failed to suggest any relationship between the presence of sclerotia and mean levels of aflatoxins B1 and B2. Furthermore, a dendrogram based on AFLP data revealed substantial genetic variability among the A. flavus strains, but showed no correlation between dendrogram groups separated by molecular genetic features and production of aflatoxins B1 or B2 or the formation of sclerotia.

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