Metabolitos secundarios, actividad biológica y etnobotánica de plantas de Santa Marta

2021 ◽  
Author(s):  
Víctor Enrique Macías-Villamizar ◽  
Roxana Badran-Padilla ◽  
Jessica Mercedes Rodríguez-Ochoa ◽  
Heber Luis Silva-Román
Keyword(s):  
Pass Online

Metabolitos secundarios, actividad biológica y etnobotánica de plantas de Santa Marta es una obra que reúne aspectos relacionados con la química de productos naturales vegetales de especies de la ciudad de Santa Marta (Magdalena). Se resaltan el tipo y la diversidad estructural de los metabolitos secundarios y la actividad biológica, producto del análisis de resultados reportados de los diferentes bioensayos. También se incluye la predicción de actividad biológica utilizando la herramienta PASS (predicción de espectros de actividad para sustancias biológicamente activa) de algunos de los metabolitos comunes. Se menciona igualmente el uso en medicina folclórica, a nivel mundial, de algunas especies de Santa Marta, relacionado en algunos casos con la actividad biológica reportada en la literatura científica. Las especies se presentan en el libro en orden alfabético por familia y se muestran resultados de ensayos biológicos de fracciones o extractos totales. Asimismo, se podrán encontrar esquemas y actividades de aprendizaje, además de una guía general para el uso del software PASS Online-Way2Drug, con la finalidad de motivar el desarrollo del aprendizaje autónomo o de competencias académicas.

scholarly journals Synthesis and Transformation of Novel Dibenzothipodand Derivatives

2020 ◽  
Vol 36 (4) ◽  
Author(s):  
Pham Thi Thanh Tam ◽  
Nguyen Manh Linh ◽  
Do Thao Thuyen ◽  
Nguyen Tien Dat ◽  
Tran Thach Van ◽  
...  
Keyword(s):  
1H Nmr ◽  
Condensation Reaction ◽  
Antibiotic Activity ◽  
Acidic Condition ◽  
New Method ◽  
Pass Online

This study develops a new method of synthesizing podands containing thioether fragments 1.10-bis(2-formylphenyl)-1.10-dithia-4.7-dioxadecane and 1.10-bis(2-acetophenyl)-1.10-dithia-4.7-dioxadecane. The synthesized podands’ transformations were studied in acidic condition to obtain products of the croton condensation reaction having arylenone fragment. All the synthesized compounds’ bioactivities were predicted by PASS online programme in which podand (9) was evaluated for its antibiotic activity. The structure of the new podand was determined by IR, 1H NMR, MS spectrums.

scholarly journals IN SILICO STUDY OF THE ANTIMICROBIAL PROFILE OF β-CITRONELLOL: POTENTIAL AS AN ANTIFUNGAL

2019 ◽  
Vol 16 (32) ◽  
pp. 894-898
Author(s):  
D. F. SILVA ◽  
H. D. NETO ◽  
M. D. L. FERREIRA ◽  
A. A. O. FILHO ◽  
E. O. LIMA
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Fungal Infections ◽  
In Silico Analysis ◽  
Fungal Species ◽  
In Silico Study ◽  
Pass Online ◽  
Therapeutic Alternatives ◽  
Bioactivity Profile ◽  
Silico Analysis

β-citronellol (3,7-dimethyl-6-octen-1-ol) has been exhibiting a number of pharmacological effects that creates interest about its antimicrobial potential, since several substances of the monoterpene class have already demonstrated to possess activity in this profile. In addition, the emergence of fungal species resistant to current pharmacotherapy poses a serious challenge to health systems, making it necessary to search for new effective therapeutic alternatives to deal with this problem. In this study, the antimicrobial profile of β-citronellol was analyzed. The Prediction of Activity Spectra for Substances (PASS) online software was used to study the antimicrobial activity of the β-citronellol molecule by the use of in silico analysis. In contrast, an in vitro antifungal study of this monoterpene was carried out. For this purpose, the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) was determined by the microdilution technique in 96-well plates in Saboraud Dextrose Broth/RPMI against sensitive strains of Candida albicans, and this assay was performed in duplicate. In the in silico analysis of the antimicrobial profile, it was revealed that the monoterpene β-citronellol had a diverse antimicrobial bioactivity profile. For the antifungal activity, it presented a percentage value with Pa: 58.4% (predominant) and its MIC of 128 μg/mL, which was equivalent for all strains tested. The in silico study of the β-citronellol molecule allowed us to consider that the monoterpenoid is very likely to be bioactive against agents that cause fungal infections.

scholarly journals Estudo in silico das atividades de triterpenos e iridoides isolados de Himatanthus articulatus (Vahl) Woodson

Revista Fitos ◽  
2018 ◽  
Vol 12 (3) ◽  
pp. 227 ◽  
Author(s):  
Maria Fâni Dolabela ◽  
Amanda Roberta Palheta Da Silva ◽  
Letícia Hiromi Ohashi ◽  
Mírian Letícia Carmo Bastos ◽  
Milena Cristina Martins Da Silva ◽  
...  
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Pass Online

O presente trabalho realizou estudos in silico para predição das atividades farmacocinética, toxicológica e biológica de triterpenos e iridoides isolados de Himatanthus articulatus, utilizada popularmente contra malária, afecções na pele, helmintíases, úlceras gástricas, gastrites, tumores e sífilis. As comparações foram realizadas através dos programas: ChemSketch, PreADMET e PASS online. As características físico-químicas dos compostos foram estimadas pelos servidores online Mcule property calculator e Chemicalize.org. Os resultados revelaram que os triterpenos e os iridoides não glicosilados (plumericina e isoplumericina) apresentaram absorção intestinal acima de 90%. Apenas a plumericina e a isoplumericina seguem a regra de Lipinsk, além de apresentarem atividade antineoplásica, antibacteriana e antifúngica.  O cinamato de lupeol, cinamato de α-amirina e acetato de lupeol provavelmente atuam nos sinais e sintomas da malária, porém, o acetato de lupeol apresentou maior número de reações adversas. Todas as substâncias mostraram carcinogenicidade, mas apenas os triterpenos demonstraram mutagenicidade. Em termos farmacocinético, toxicológico e biológico, apenas a plumericina e a isoplumericina apresentaram resultados satisfatórios.

scholarly journals Student Railway Pass online Process

2018 ◽  
Vol Volume-2 (Issue-4) ◽  
pp. 2883-2886
Author(s):  
Mokshad Bharat Lokhande ◽  
Prof. Shubhangi Mahadik ◽  
Keyword(s):  
Pass Online ◽  
Online Process

scholarly journals Identification of Potential Inhibitors from Pyriproxyfen with Insecticidal Activity by Virtual Screening

2019 ◽  
Vol 12 (1) ◽  
pp. 20 ◽  
Author(s):  
Ryan Ramos ◽  
Josivan Costa ◽  
Rai Silva ◽  
Glauber da Costa ◽  
Alex Rodrigues ◽  
...  
Keyword(s):  
Virtual Screening ◽  
Binding Free Energy ◽  
Structural Similarity ◽  
Docking Study ◽  
Molecular Docking Study ◽  
Chemical Structures ◽  
Biological Insecticide ◽  
Pass Online ◽  
Acetylcholinesterase Enzyme ◽  
Potential Inhibitors

Aedes aegypti is the main vector of dengue fever transmission, yellow fever, Zika, and chikungunya in tropical and subtropical regions and it is considered to cause health risks to millions of people in the world. In this study, we search to obtain new molecules with insecticidal potential against Ae. aegypti via virtual screening. Pyriproxyfen was chosen as a template compound to search molecules in the database Zinc_Natural_Stock (ZNSt) with structural similarity using ROCS (rapid overlay of chemical structures) and EON (electrostatic similarity) software, and in the final search, the top 100 were selected. Subsequently, in silico pharmacokinetic and toxicological properties were determined resulting in a total of 14 molecules, and these were submitted to the PASS online server for the prediction of biological insecticide and acetylcholinesterase activities, and only two selected molecules followed for the molecular docking study to evaluate the binding free energy and interaction mode. After these procedures were performed, toxicity risk assessment such as LD50 values in mg/kg and toxicity class using the PROTOX online server, were undertaken. Molecule ZINC00001624 presented potential for inhibition for the acetylcholinesterase enzyme (insect and human) with a binding affinity value of −10.5 and −10.3 kcal/mol, respectively. The interaction with the juvenile hormone was −11.4 kcal/mol for the molecule ZINC00001021. Molecules ZINC00001021 and ZINC00001624 had excellent predictions in all the steps of the study and may be indicated as the most promising molecules resulting from the virtual screening of new insecticidal agents.

scholarly journals Investigação in silico de compostos bioativos de Croton linearifolius Müll.Arg com atividade antidepressiva

2020 ◽  
Vol 6 (16) ◽  
Author(s):  
Gabriel Guimarães Tavares ◽  
Suzana Ferreira Alves ◽  
Leonardo Luiz Borges
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Pass Online

A depressão está entre as maiores causas de incapacidade em todo o mundo. Portanto, a busca de inovações terapêuticas é necessária e, neste contexto, os estudos in silico constituem uma ferramenta fundamental para o desenvolvimento de novos medicamentos de maneira mais rápida e ampla. No presente trabalho investigou-se moléculas selecionadas nas bases de dados PubMed, ScienceDirect e SciELO. Os servidores PASS online e SwissADME foram usados para análise de biodisponibilidade oral e Pred-HERG e ToxTree para prever toxicidades cardíacas e sistêmicas. As atividades biológicas foram analisadas no PASS online e os alvos moleculares no SwissTargetPrediction. Em acréscimo foram realizadas, foram realizadas análises farmacofóricas e acoplamento molecular. Para corroborar o modelo empregado no acoplamento molecular, foi realizado um redocking. Dentre as moléculas avaliadas o α-pineno, derivado de monoterpenos naturais, pode ser encontrado na região sul brasileira, extraído de Croton linearifolius Müll.Arg. A atividade biológica no PASS online e SwissADME mostra efeitos corroboradores como antidepressivo. A verificação desse efeito foi analisada por acoplamento do α-pineno com a estrutura cristalográfica transportador de serotonina (SERT) que foi selecionado do (PDB ID: 5I6X). A análise de redocking feita com o complexo do transportador com a paroxetina estabeleceu os parâmetros do modelo de interação. O α-pineno é competidor pelo receptor do transportador de serotonina promissor, demonstrado pelo modelo farmacofórico e pela análise de acoplamento molecular. Esse estudo contribui como fundamento de perspectiva dessa molécula como um futuro fármaco antidepressivo.

scholarly journals Avaliação in silico da atividade anti-helmíntica do monoterpeno Ascaridol

2020 ◽  
Vol 9 (7) ◽  
pp. e757974944
Author(s):  
Ana Beatriz Bomfim Gomes Ribeiro ◽  
Viton Dyrk Guimarães Fernandes ◽  
Josilanny Araújo de Souza Alencar ◽  
Jessika Paiva Medeiros ◽  
Lara Danúbia Galvão de Souza ◽  
...  
Keyword(s):  
In Silico ◽  
Pass Online

As enteroparasitoses constituem um grave problema de saúde pública no Brasil e no mundo, sendo causadas por parasitas como os helmintos que provocam danos nutricionais e podem levar o hospedeiro ao óbito. Os fármacos utilizados no tratamento de helmintoses podem agir de diversas maneiras, contudo, as opções desses medicamentos no mercado ainda encontram-se limitadas. Sabe-se que o Ascaridol tem demonstrado grande potencial farmacológico em terapias anti-bacterianas, anti-fúngicas, anti-viral e anti-neoplásica. Assim, este trabalho tem como objetivo avaliar a atividade anti-helmítica do Ascaridol através de um estudo in silico. Como metodologia utilizou-se o software gratuito Pass Online® para análise da probabilidade de atividade da molécula. O Ascaridol demonstrou um bom resultado para probabilidade de ativação (Pa) em relação aos valores da probabilidade de inativação (Pi) nas atividades anti-helmíntica nematoide e anti-helmíntica fasciola. Conclui-se que esse monoterpeno apresentou um elevado potencial como anti-helmítico, entretanto, ainda são necessários estudos in vitro e in vivo em maior diversidade de espécies helmínticas e em testes toxicológicos com intuito de elucidar sua segurança e índice terapêutico.

scholarly journals Исследования влияния спиртов на изменение биологической активности олигомеров на основе ε-капролактама

2021 ◽  
Vol 79 (6) ◽  
pp. 141-143
Author(s):  
Е.Г. Ханжина ◽  
А.В. Захаров
Keyword(s):  
Pass Online

Доказано увеличение биологической активности олигомеров на основе εкапролактама и спиртов по сравнению с исходным ε-капролактамом. Активность оценена с помощью сервиса «PASS online». Определено, что наибольшую потенциальную биологичесую акивность ε-капролактам проявляет в качестве антагониста альфа2бета2 никотиновых рецепторов, сополимер с деканолом потенциально активен при лечении мукозитов, а сополимер с пропанолом в качестве ингибитора протеин-дисульфидредуктазы (глутатиона).

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