Profilage in silico des inhibiteurs de protéine kinases

Les protéine kinases ont été rapidement identifiées comme favorisant l’apparition de cancers, à travers leur implication dans la régulation du développement et du cycle cellulaire. Il y a une vingtaine d’années, la mise sur le marché des premiers traitements par inhibiteur de protéine kinase, ouvrait la voie vers de nouvelles solutions médicamenteuses plus ciblées contre le cancer. Depuis, nombreuses sont les données structurales et fonctionnelles acquises sur ces cibles thérapeutiques. Les techniques informatiques ont elles aussi évolué, notamment les méthodes d’apprentissage automatique. En tirant parti de la grande quantité d’informations disponibles aujourd’hui, ces méthodes devraient permettre prochainement la prédiction fine de l’interaction d’un inhibiteur donné avec chaque protéine kinase humaine et donc, à terme, la construction d’outils de profilage de leurs inhibiteurs spécifiques. Cette approche intégrative devrait aider la découverte de solutions thérapeutiques anti-cancéreuses plus efficaces et plus sûres.

Etude de l’implication du polymorphisme fonctionnel Arg72Pro du gène TP53 dans la survenue du cancer colorectal et du carcinome Basocellulaire dans la population de l’Ouest Algérien

Introduction - Le gène TP53 a fait l’objet de très nombreux travaux. Sa nature polymorphe et son rôle central dans la régulation du cycle cellulaire ont mis en évidence son potentiel de gène candidat dans la susceptibilité et la survenue de différents cancers. Bien que plusieurs polymorphismes du gène TP53 aient été étudiés comme facteurs de risque pour différents cancers, le plus largement étudié est le polymorphisme Arg72Pro (rs1042522), à l’origine d’une substitution d’une Arginie (Arg) en Proline (Pro) ou inversement, connu pour ses différentes fonctions biologiques.Notre objectif est d’explorer la participation du polymorphisme (SNP) Arg72Pro du gène TP53, dans l’expressivité du cancer colorectal (CCR) et du carcinome basocellulaire (CBC) dans une population de l’Ouest Algérien.Matériels et Méthodes - Le déséquilibre de transmission allélique de ce SNP a été réalisé sur une population constituée de 116 individus atteints de CCR, 50 sujets atteints de CBC et enfin une population contrôle constituée de 121 individus sains,par la technique de Biologie Moléculaire PCR/RFLP (Polymerase Chain Reaction/Restriction Fragment LengthPolymorphism).Résultats - L’association du marqueur Arg72Pro avec le CBC a montré une augmentation significative de l’allèle Pro chez les cas par rapport aux contrôles (54% vs 46%, OR=8,85 [4,98-16,03], p<10-7). Cet allèle semble conférer un risque important dedévelopper le CBC. Par ailleurs, les résultats n’ont montré aucune différence significative entre les sujets atteints de CCR et les contrôles, ce qui pourrait exclure son implication dans la survenue du CCR dans notre population (p>0.05).Conclusion - Le polymorphisme Arg72Pro du gène TP53 peut être considéré comme marqueur de risque pour le CBC mais pas pour le CCR.