scholarly journals Malware family classification via efficient Huffman features

2021 ◽  
Vol 37 ◽  
pp. 301192
Author(s):  
Stephen O’Shaughnessy ◽  
Frank Breitinger
2019 ◽  
Vol 20 (5) ◽  
pp. 540-550 ◽  
Author(s):  
Jiu-Xin Tan ◽  
Hao Lv ◽  
Fang Wang ◽  
Fu-Ying Dao ◽  
Wei Chen ◽  
...  

Enzymes are proteins that act as biological catalysts to speed up cellular biochemical processes. According to their main Enzyme Commission (EC) numbers, enzymes are divided into six categories: EC-1: oxidoreductase; EC-2: transferase; EC-3: hydrolase; EC-4: lyase; EC-5: isomerase and EC-6: synthetase. Different enzymes have different biological functions and acting objects. Therefore, knowing which family an enzyme belongs to can help infer its catalytic mechanism and provide information about the relevant biological function. With the large amount of protein sequences influxing into databanks in the post-genomics age, the annotation of the family for an enzyme is very important. Since the experimental methods are cost ineffective, bioinformatics tool will be a great help for accurately classifying the family of the enzymes. In this review, we summarized the application of machine learning methods in the prediction of enzyme family from different aspects. We hope that this review will provide insights and inspirations for the researches on enzyme family classification.


2007 ◽  
Vol 648 (1) ◽  
pp. 84-89 ◽  
Author(s):  
Alon E. Faraggi ◽  
Costas Kounnas ◽  
John Rizos

Author(s):  
Mathias Jaschhof

Eine Publikation zur Phylogenie der Sciaroidea von D. Amorim und E. Rindal aus dem Jahr 2007 wird besprochen. Die phylogenetische Hypothese, die die Autoren aus ihrer quantitativen morphologischen Analyse abgeleitet haben, wird von ihnen benutzt, um eine Neuklassifikation der Sciaroidea vorzuschlagen. Diese unterscheidet sich grundlegend von bisherigen Klassifikationen. In der vorliegenden Besprechung wird an Beispielen aufgezeigt, dass die von Amorim und Rindal benutzte Merkmalsmatrix auf verheerende Weise fehlerhaft ist, sowohl was die eingesetzten Taxa als auch die verwendeten Merkmale betrifft. Im Ergebnis muss festgestellt werden, dass diese Verwandtschaftsanalyse nicht wiederholbar und die daraus resultierende Verwandtschaftshypothese weder nachprüfbar noch widerlegbar ist. Deshalb wird nahegelegt, die in Rede stehende Publikation nicht zur Begründung etwaiger Änderungen an der bestehenden Sciaroidea-Klassifikation heranzuziehen.StichwörterDiptera, Sciaroidea, phylogeny, family classification, review.


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