scholarly journals S-Cluster++: a fast program for solving the cluster containment problem for phylogenetic networks

2018 ◽  
Vol 34 (17) ◽  
pp. i680-i686 ◽  
Author(s):  
Hongwei Yan ◽  
Andreas D M Gunawan ◽  
Louxin Zhang
Keyword(s):  
Phylogenetic Networks ◽  
Containment Problem ◽  
Cluster A

scholarly journals Compression of Phylogenetic Networks and Algorithm for the Tree Containment Problem

2019 ◽  
Vol 26 (3) ◽  
pp. 285-294 ◽  
Author(s):  
Andreas D.M. Gunawan ◽  
Hongwei Yan ◽  
Louxin Zhang
Keyword(s):  
Phylogenetic Networks ◽  
Containment Problem

scholarly journals Solving the tree containment problem in linear time for nearly stable phylogenetic networks

2018 ◽  
Vol 246 ◽  
pp. 62-79 ◽  
Author(s):  
Philippe Gambette ◽  
Andreas D.M. Gunawan ◽  
Anthony Labarre ◽  
Stéphane Vialette ◽  
Louxin Zhang
Keyword(s):  
Linear Time ◽  
Phylogenetic Networks ◽  
Containment Problem

Qualificando o caráter ‘regressivo’ da especialização industrial do Brasil

2014 ◽  
Vol 15 (1) ◽  
Author(s):  
Ana Urraca Ruiz ◽  
Jorge Nogueira de Paiva Britto ◽  
Karla Sarmento Gonçalves de Souza
Keyword(s):  
Cluster A

Este trabalho tem como objetivo revisar a forma como é observada a estrutura industrial brasileira e avaliar se esta pode ser qualificada como de ‘regressiva’. Para isto será utilizado: (i) uma classificação industrial específica construída a partir de um conjunto de indicadores relativos aos resultados de inovação; (ii) a evolução do crescimento das exportações mundiais para cada cluster contemplado; (iii) os efeitos de encadeamento (up e downstream) de cada cluster. A partir desta caracterização, o trabalho revisa a evolução da produção industrial, a estrutura de exportações e o desempenho industrial do Brasil entre 1996 e 2011. O artigo conclui que não é possível qualificar a estrutura produtiva brasileira como regressiva por diversas razões. Primeiro, porque uma parte significativa de sua especialização em industrias tradicionais que exploram recursos naturais tem representativos efeitos encadeamento e um nível de conteúdo tecnológico médio-alto (petróleo).  Segundo, porque não ha diferenças significativas na agregação de valor entre as atividades com alto e baixo grau de inovatividade, ou seja, entre atividades onde o Brasil se especializa e não se especializa. Terceiro, porque o crescimento da produtividade real está positiva e significativamente relacionado com a evolução da estrutura industrial em termos de valor agregado, ou seja, a diversificação industrial contribuiu positivamente ao crescimento da produtividade industrial.

scholarly journals Biochemical and phylogenetic networks-II: X-trees and phylogenetic trees

2021 ◽  
Vol 59 (3) ◽  
pp. 699-718
Author(s):  
R. Sundara Rajan ◽  
A. Arul Shantrinal ◽  
K. Jagadeesh Kumar ◽  
T. M. Rajalaxmi ◽  
Indra Rajasingh ◽  
...  
Keyword(s):  
Phylogenetic Trees ◽  
Phylogenetic Networks

scholarly journals A CLASS OF GENES AFFECTING B FACTOR-REGULATED DEVELOPMENT IN SCHIZOPHYLLUM COMMUNE

Genetics ◽  
1976 ◽  
Vol 82 (3) ◽  
pp. 423-428
Author(s):  
Celia Dubovoy
Keyword(s):  
Genetic Factor ◽  
Schizophyllum Commune ◽  
Nuclear Migration ◽  
Complex Pattern ◽  
Developmental Phase ◽  
Linear Map ◽  
Incompatibility Factor ◽  
Complementation Groups ◽  
Cluster A ◽  
Specific Phase

ABSTRACT Twelve mutations affecting nuclear migration, a major developmental phase in Schizophyllum commune, display a complex pattern of complementation and recombination. They are expressed only when a genetic factor controlling this phase of development, the B incompatibility factor, is operative. All twelve mutations are linked to the B factor, nine in a cluster and three in distinct loci outside the cluster. A linear map cannot be constructed from the frequency of recombination. Complementation maps are not linear. There is little correlation between the complementation groups and the groups based on recombination. Many pairs of mutations that do not complement recombine with frequencies of 1.1% to 26.9%. The genes represented by the twelve mutations are located in a linked group of about 18 known genes involved in the specific phase of development controlled by the B factor.

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