scholarly journals DNA Damage Response in Neonatal and Adult Stromal Cells Compared With Induced Pluripotent Stem Cells

2015 ◽  
Vol 4 (6) ◽  
pp. 576-589 ◽  
Author(s):  
Stefanie Liedtke ◽  
Sophie Biebernick ◽  
Teja Falk Radke ◽  
Daniela Stapelkamp ◽  
Carolin Coenen ◽  
...  
2016 ◽  
Vol 25 (9) ◽  
pp. 740-747 ◽  
Author(s):  
Junjie Lu ◽  
Hu Li ◽  
Anna Baccei ◽  
Takayo Sasaki ◽  
David M. Gilbert ◽  
...  

2019 ◽  
Vol 60 (6) ◽  
pp. 719-728 ◽  
Author(s):  
Mikio Shimada ◽  
Kaima Tsukada ◽  
Nozomi Kagawa ◽  
Yoshihisa Matsumoto

Abstract Pluripotent stem cells (PSCs), such as embryonic stem cells (ESCs) and induced pluripotent stem cells (iPSCs), have a dual capability to self-renew and differentiate into all cell types necessary to develop an entire organism. Differentiation is associated with dynamic epigenetic alteration and transcriptional change, while self-renewal depends on maintaining the genome DNA accurately. Genome stability of PSCs is strictly regulated to maintain pluripotency. However, the DNA damage response (DDR) mechanism in PSCs is still unclear. There is accumulating evidence that genome stability and pluripotency are regulated by a transcriptional change in undifferentiated and differentiated states. iPSCs are ideal for analyzing transcriptional regulation during reprogramming and differentiation. This study aimed to elucidate the transcriptional alteration surrounding genome stability maintenance, including DNA repair, cell cycle checkpoints and apoptosis in fibroblasts, iPSCs and neural progenitor cells (NPCs) derived from iPSCs as differentiated cells. After ionizing radiation exposure, foci for the DNA double-stranded break marker γ-H2AX increased, peaking at 0.5 h in all cells (>90%), decreasing after 4 h in fibroblasts (32.3%) and NPCs (22.3%), but still remaining at 52.5% (NB1RGB C2 clone) and 54.7% (201B7 cells) in iPSCs. Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling (TUNEL)-positive cells were detected, indicating that iPSCs’ apoptosis increases. In addition, RNA sequencing (RNA-Seq) analysis showed high expression of apoptosis genes (TP53, CASP3 and BID) in iPSCs. Results suggested that increased apoptosis activity maintains accurate, undifferentiated genome DNA in the cell population.


2016 ◽  
Author(s):  
Ιωάννα Βαρελά

Η ανακάλυψη της μεθόδου του κυτταρικού επαναπρογραμματισμού ανθρώπινων δερματικών ινοβλαστών σε επαγόμενα πολυδύναμα βλαστοκύτταρα (induced pluripotent stem cells, iPSCs) το 2007 άνοιξε το δρόμο για τη μελέτη και την εξατομικευμένη θεραπεία πολλών χρόνιων νόσων. Επιδιώξαμε να δημιουργήσουμε iPS - κυτταρικές σειρές επαναπρογραμματίζοντας μεσεγχυματικά στρωματικά κύτταρα (mesenchymal stromal cells, MSCs) μυελού των οστών, μέσω μιας μεθόδου επαναπρογραμματισμού χωρίς ενσωμάτωση γονιδίων στο γενετικό υλικό των κυττάρων. Δερματικοί ινοβλάστες από φυσιολογικούς δότες και μεσεγχυματικά στρωματικά κύτταρα μυελού των οστών από φυσιολογικό δότη μεταμόσχευσης μυελού των οστών και από ασθενή με β-Μεσογειακή αναιμία (β-ΜΑ) διαμολύνθηκαν, μέσω λιποσωματικών φορέων, με συνθετικά mRNA που κωδικοποιούν τους μεταγραφικούς παράγοντες Oct4, Klf4, Sox2, Lin28, c-Myc. Στη συνέχεια, τα κύτταρα ελέγχθηκαν σε καλλιέργειες για τον σχηματισμό αποικιών πολυδύναμων βλαστοκυττάρων. Οι αποικίες απομονώθηκαν και με συνεχείς ανακαλλιέργειες δημιουργήθηκαν κυτταρικές σειρές, οι οποίες εξετάστηκαν για την πολυδυναμία τους με μεθόδους ανίχνευσης της έκφρασης των μεταγραφικών παραγόντων πολυδυναμίας (κυτταρομετρία ροής, RT-PCR, μελέτη του μεταγραφώματος με RNA μικροσυστοιχίες). Ως θετικός μάρτυρας και μέτρο σύγκρισης χρησιμοποιήθηκε πολύ καλά χαρακτηρισμένη εμβρυονική σειρά πολυδύναμων βλαστοκυττάρων. Οι iPS-κυτταρικές σειρές μελετήθηκαν, επίσης, ως προς τη λειτουργική τους πολυδυναμία με τον έλεγχο της ικανότητας τους να δημιουργούν in vitro εμβρυϊκά σωματίδια και in vivo τερατώματα μετά από υποδόρια εμφύτευση τους σε ανοσοανεπαρκείς ποντικούς, και ως προς τη δυνατότητα διαφοροποίησής τους σε αιμοποιητικά προγονικά κύτταρα. Η γενετική σταθερότητα των κυτταρικών σειρών ελέγχθηκε με DNA μικροσυστοιχίες συγκριτικού γονιδιωματικού υβριδισμού (aCGH). Απομονώθηκαν 3 iPS κυτταρικές σειρές από κάθε δείγμα κυττάρων, οι οποίες εμφανίζουν μεταγράφωμα πανομοιότυπο με εκείνο των πολυδύναμων εμβρυονικών βλαστοκυττάρων και. δημιουργούν εμβρυϊκά σωματίδια in vitro και τερατώματα in vivo, τα οποία αποτελούνται από ιστούς καταγωγής και από τα τρία βλαστικά δέρματα. Τα iPSCs των κυτταρικών σειρών πολλαπλασιάζονται για μεγάλο χρονικό διάστημα χωρίς μορφολογικές ενδείξες διαφοροποίησης. Με τη μέθοδο aCGH, στις iPS κυτταρικές σειρές μετά την 10η ανακαλλιέργεια ανιχνεύθηκαν πολυμορφισμοί στον αριθμό αντιγράφων (CNVs), τα οποία ήταν ελλείμματα μεγέθους περίπου 3 Mb. Η διαφοροποίηση των iPSCs σε αιμοποιητικά προγονικά κύτταρα οδήγησε στην παραγωγή CD34+ κυττάρων σε ποσοστό 8-10% των παραχθέντων κυττάρων με ασθενούς έντασης συνέκφραση του CD45, προσομοιάζοντας στο αιμαγγειακό στελεχιαίο κύτταρο. Στην παρούσα διατριβή παρουσιάζεται, για πρώτη φορά στην Ελλάδα, εξ όσων γνωρίζουμε, η τεχνολογία παραγωγής ανθρώπινων iPSCs με μια ασφαλή και αξιόπιστη μέθοδο. Οι iPSCs-κυτταρικές σειρές μπορεί να χρησιμοποιηθούν στη μελέτη ασθενειών, στον έλεγχο φαρμάκων και στην ανάπτυξη πρωτοκόλλων ιστικής μηχανικής και κυτταρικής θεραπείας.


2016 ◽  
Vol 186 (1) ◽  
pp. 17-26 ◽  
Author(s):  
Kalpana Mujoo ◽  
E. Brian Butler ◽  
Raj K. Pandita ◽  
Clayton R. Hunt ◽  
Tej K. Pandita

2013 ◽  
Vol 11 (5) ◽  
pp. 320-326 ◽  
Author(s):  
Minjie Zhang ◽  
Caiyun Yang ◽  
Huixian Liu ◽  
Yingli Sun

2014 ◽  
Vol 3 (3) ◽  
pp. 414-422 ◽  
Author(s):  
Joana Frobel ◽  
Hatim Hemeda ◽  
Michael Lenz ◽  
Giulio Abagnale ◽  
Sylvia Joussen ◽  
...  

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document