Molecular characterization of novel isolates of Rhizoctonia solani, Trichoderma atroviride and Fusarium spp. isolated from different plants and cutting woods in Iraq

2019 ◽  
Vol 52 (3) ◽  
Author(s):  
Aqeel N. Al-Abedy ◽  
R.G. Al-Janabi ◽  
Z.A. Al-Tmeme ◽  
Alaa T. Salim ◽  
Muhammad Ashfaq
Keyword(s):  
Rhizoctonia Solani ◽  
Molecular Characterization ◽  
Trichoderma Atroviride ◽  
Fusarium Spp

Molecular characterization of a novel mycovirus isolated from Rhizoctonia solani AG-1 IA strain 9-11

2021 ◽  
Author(s):  
Yang Sun ◽  
Yanqiong Li ◽  
Wenhan Dong ◽  
Aili Sun ◽  
Ningwei Chen ◽  
...  
Keyword(s):  
Rhizoctonia Solani ◽  
Molecular Characterization

scholarly journals Aggressiveness and molecular characterization of Fusarium spp. associated with foot rot and wilt in Tomato in Sinaloa, Mexico

3 Biotech ◽  
2019 ◽  
Vol 9 (7) ◽  
Author(s):  
Tomás Aarón Vega-Gutiérrez ◽  
Guadalupe Alfonso López-Urquídez ◽  
Raúl Allende-Molar ◽  
Luis Alfonso Amarillas-Bueno ◽  
Sergio de Jesús Romero-Gómez ◽  
...  
Keyword(s):  
Molecular Characterization ◽  
Foot Rot ◽  
Fusarium Spp

scholarly journals Morphological and molecular characterization of Fusarium spp. associated to the regional occurrence of wilt and dry bud rot in Agave tequilana

2019 ◽  
Vol 38 (1) ◽  
Author(s):  
Viridiana López-Bautista ◽  
Gustavo Mora-Aguilera ◽  
María Alejandra Gutiérrez-Espinosa ◽  
Coral Mendoza-Ramos ◽  
Verónica Inés Martínez-Bustamante ◽  
...  
Keyword(s):  
Fusarium Oxysporum ◽  
Molecular Characterization ◽  
Fusarium Solani ◽  
Fusarium Fujikuroi ◽  
Agave Tequilana ◽  
Fusarium Spp ◽  
Impacto Económico ◽  
Morphological And Molecular Characterization

<p>La marchitez y pudrición seca del cogollo del agave (<em>Agave tequilana</em> var. azul) son enfermedades de alto impacto económico para este cultivo. En este trabajo se planteó determinar la implicación de <em>Fusarium</em> spp. en ambas enfermedades bajo un enfoque regional. Se colectaron muestras de raíz y suelo en 40 plantaciones comerciales ubicadas en 13 municipios de Los Altos Jalisco, importante región de cultivo de agave azul en México. De cada plantación de colecta se estimó carga de inóculo mediante un índice de <em>Fusarium</em> obtenido de unidades formadoras de colonias (<em>Fusarium</em> vs hongos totales) y se analizó su relación con pH y materia orgánica. Se obtuvieron 109 aislados caracterizados morfológicamente como <em>Fusarium</em> spp. de los cuales se seleccionaron 25 para identificación molecular con ITS y EF-1a. La selección consideró sintomatología, caracteres macro y microscópicos y prevalencia de tipologías de colonia observadas <em>in vitro</em> en medios Komada, Sabouraud, SNA y CLA. Los caracteres culturales y morfológicos evaluados fueron: coloración micelial, tamaño, forma y septación de macro y microconidios, y longitud y número de fiálides. Se asociaron cinco especies con marchitez y/o pudrición seca ubicadas en tres complejos filogenéticos: <em>F. oxysporum</em> del complejo de especies <em>Fusarium oxysporum</em> (FOSC) con 56% (46.2% suelo y 66.7% raíz) de representatividad regional; <em>F. solani, F. falciforme</em> y <em>Fusarium</em> sp. del complejo <em>Fusarium solani</em> (FSSC) (40%); y <em>Fusarium</em> sp. del complejo <em>Fusarium fujikuroi</em> (FFSC) (4%). MO y pH tuvieron correlación inversamente proporcional con Índice de <em>Fusarium</em> (<em>r2</em> = 0.68-0.70). Se postula que la marchitez y pudrición seca del cogollo de agave azul constituyen un síndrome en el cual se asocian y especializan parasíticamente diversas especies de <em>Fusarium</em>. Se encontró un aislado de los tres complejos de <em>Fusarium</em> asociados específicamente a cada tipo de síntoma y la combinación de ellos. La mayoría se asociaron a marchitez con predominancia de<em> F. oxysporum. </em>  </p><p> </p>

scholarly journals Morphological and molecular characterization of pathogenic isolates of Fusarium spp. obtained from gladiolus corms and their sensitivity to Jatropha curcas L. oil

2014 ◽  
Vol 8 (8) ◽  
pp. 724-733 ◽  
Author(s):  
Crdova Albores Liliana ◽  
Bautista Baos Silvia ◽  
Martnez Herrera Jorge ◽  
Barrera Necha Laura ◽  
Hernndez Lpez Mnica ◽  
...  
Keyword(s):  
Molecular Characterization ◽  
Jatropha Curcas ◽  
Fusarium Spp ◽  
Jatropha Curcas L ◽  
Morphological And Molecular Characterization

scholarly journals Morphological and molecular characterization of Fusarium spp. associated with olive trees dieback in Tunisia

3 Biotech ◽  
2017 ◽  
Vol 7 (1) ◽  
Author(s):  
Rahma Trabelsi ◽  
Hanen Sellami ◽  
Yâakoub Gharbi ◽  
Samira Krid ◽  
Manel Cheffi ◽  
...  
Keyword(s):  
Molecular Characterization ◽  
Fusarium Spp ◽  
Olive Trees ◽  
Morphological And Molecular Characterization

Phenotypic and molecular characterization of rhizobacterium Burkholderia sp. strain R456 antagonistic to Rhizoctonia solani, sheath blight of rice

2011 ◽  
Vol 27 (10) ◽  
pp. 2305-2313 ◽  
Author(s):  
Bin Li ◽  
Bao-Ping Liu ◽  
Rong-Rong Yu ◽  
Miao-Miao Lou ◽  
Yan-Li Wang ◽  
...  
Keyword(s):  
Rhizoctonia Solani ◽  
Molecular Characterization ◽  
Sheath Blight

scholarly journals Molecular characterization of the pathogenic plant fungus Rhizoctonia solani (Ceratobasidiaceae) isolated from Egypt based on protein and PCR-RAPD profiles

2012 ◽  
Vol 11 (4) ◽  
pp. 3585-3600 ◽  
Author(s):  
M.A. Mahmoud ◽  
S.A. Al-Sohaibani ◽  
A.M.M. Abdelbacki ◽  
M.R. Al-Othman ◽  
A.R.M. Abd El- Aziz ◽  
...  
Keyword(s):  
Rhizoctonia Solani ◽  
Molecular Characterization

scholarly journals Morphological and Molecular Characterization of Rhizoctonia solani Isolates from Two Different Rice Varieties

2018 ◽  
Vol 21 (2) ◽  
pp. 72 ◽  
Author(s):  
Aisyah Surya Bintang ◽  
Arif Wibowo ◽  
Achmadi Priyatmojo ◽  
Siti Subandiyah
Keyword(s):  
Maximum Likelihood ◽  
Rhizoctonia Solani ◽  
Molecular Characterization ◽  
Morphological Characters ◽  
Group Method ◽  
Rice Varieties ◽  
Pair Group ◽  
Maximum Likelihood Tree ◽  
Morphological And Molecular Characterization

Six isolates of Rhizoctonia solani, i.e. two isolates collected from infected rice plants and four isolates from laboratory collection were studied by using morphological characters and molecular analysis. Un-weighted pair group method with arithmetic mean dendogram constructed based on cluster analysis showed that these isolates were grouped into three clusters at the 0.77 similarity coefficient. Cluster I consisted of BA, BNJ, and NBR isolates with 100% similarity and indicated that those were from AG 1 IA sub group, cluster II consisted of BND, and cluster III consisted of SL1 and SL2. Mycelium was very light brown or whitish with few and moderate sclerotia except SL1 and SL2. Molecular characterization showed that BA, BNJ, and NBR were amplified at 140 bp using Rs1F/Rs2R specific primer for R. solani AG1 IA. All isolates were amplified between 350−400 bp using Rhsp1 primer, meanwhile SL1 and SL2 were not amplified using AG2sp and AG22sp2 primers. Based on Maximum Likelihood tree analysis showed that SL1 and SL2 had high similarity based on ITS sequence data.IntisariEnam isolat Rhizoctonia solani yang berasal dari tanaman padi bergejala dan koleksi laboratorium diuji secara morfologi dan molekuler. Analisis UPGMA dengan koefisien persamaan 0,77 menunjukkan bahwa enam isolat tersebut terbagi atas tiga klaster. Klaster I terdiri atas isolat BA, BNJ, dan NBR dengan kesamaan 100% dan menunjukkan bahwa isolat tersebut berasal dari subgrup AG 1 IA , klaster II yakni isolat BND, dan klaster III terdiri atas isolat SL1 dan SL2. Miselium berwarna putih hingga cokelat muda dengan jumlah sklerotia sedang, kecuali isolat SL1 dan SL2. Uji keragaman secara molekuler menunjukkan bahwa isolat BA, BNJ, dan NBR teramplifikasi pada kisaran 140 bp dengan menggunakan  primer Rs1F/Rs2R yang merupakan primer spesifik dari R. solani AG1 IA. Seluruh isolat teramplifikasi pada kisaran 350−400 bp dengan menggunakan primer Rhsp1, sedangkan isolat SL1 dan SL2 keduanya tidak teramplifikasi oleh primer AG2sp dan AG22sp2. Analisis Maximum Likelihood tree berdasar data sekuen ITS menunjukkan bahwa isolat SL1 dan SL2 memiliki tingkat kesamaan yang tinggi.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document