Peroxidase Activity During Susceptible and Resistant Interactions Between Cassava (Manihot esculenta) and Xanthomonas axonopodis pv. manihotis and Xanthomonas cassavae

2000 ◽  
Vol 148 (11-12) ◽  
pp. 575-577 ◽  
Author(s):  
L. F. Pereira ◽  
P. H. Goodwin ◽  
L. Erickson
Keyword(s):  
Peroxidase Activity ◽  
Manihot Esculenta ◽  
Xanthomonas Axonopodis

Xanthomonas axonopodis pv. poinsettiicola. [Distribution map].

2007 ◽  
Author(s):  
Keyword(s):  
New Zealand ◽  
North America ◽  
South America ◽  
Manihot Esculenta ◽  
Euphorbia Pulcherrima ◽  
Distribution Map ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Euphorbia Milii ◽  
New Distribution ◽  
Distribution In Europe

Abstract A new distribution map is provided for Xanthomonas axonopodis pv. poinsettiicola (Patel, Bhatt and Kulkarni) Vauterin et al. Bacteria. Hosts: croton (Codiaeum variagatum), poinsettia (Euphorbia heterophylla and Euphorbia pulcherrima), Crown-of-thorns (Euphorbia milii) and cassava (Manihot esculenta). Information is given on the geographical distribution in Europe (Germany, Italy), Asia (China (Zhejiang), Cocos Islands, India (Maharashtra), Philippines, Taiwan), North America (USA (Florida)), South America (Venezuela) and Oceana (Australia (Queensland), New Zealand).

scholarly journals El dominio STK de la proteína de resistencia a la bacteriosis vascular de yuca RXAM1 interactúa con una E3 Ubiquitin Ligasa

2019 ◽  
Vol 24 (1) ◽  
pp. 139-149
Author(s):  
Juliana Gil ◽  
Camilo Ernesto López Carrascal
Keyword(s):  
Manihot Esculenta ◽  
Ring Finger ◽  
E3 Ligase ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Leucine Rich Repeats ◽  
Zinc Ribbon

La yuca (Manihot esculenta) representa el pilar de la seguridad alimentaria para cerca de mil millones de personas, principalmente en las zonas tropicales. Uno de los factores limitantes de la producción de yuca es la bacteriosis vascular causada por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se identificó el gen RXam1 el cual confiere resistencia parcial de yuca a cepas de Xam. RXam1 codifica una proteína con un dominio LRR (Leucine Rich Repeats) extracelular y un dominio STK (Serina Treonina Kinasa) citoplasmático; estas proteínas son conocidas como RLKs (Receptor Like Kinases). En este estudio se realizó el tamizaje de una librería de ADNc de yuca mediante doble híbrido de levadura para identificar las posibles proteínas que interactúan con el dominio STK de RXam1. El tamizaje de 3x108 clones permitió identificar y confirmar cinco clones de ellos los cuales corresponden al mismo gen, el cual codifica para una proteína que presenta un dominio central de dedos de zinc CHY, seguido por un dominio C-terminal “RING finger” y un “Zinc ribbon” el cual fue denominado CRFE3-1 (Cassava RING Finger E3 ligase). La interacción entre STK y CRFE3-1 fue altamente especifica ya que se demostró también por doble híbrido que STK no interactúa con una E3 ligasa de Arabidopsis, altamente similar a CRFE3-1, así como tampoco CRFE3-1 interactúa con el dominio STK de un RLK de lechuga similar a RXam1. La identificación de CRFE3-1 sugiere que mecanismos de degradación proteica son importantes para regular la actividad de RXam1.

AFLP assessment of genetic variability in cassava accessions (Manihot esculenta) resistant and susceptible to the cassava bacterial blight (CBB)

Genome ◽  
1999 ◽  
Vol 42 (2) ◽  
pp. 163-172 ◽  
Author(s):  
Gilda Sanchez ◽  
Silvia Restrepo ◽  
Myriam-Cristina Duque ◽  
Martin Fregene ◽  
Merideth Bonierbale ◽  
...  
Keyword(s):  
Genetic Diversity ◽  
Manihot Esculenta ◽  
Bacterial Blight ◽  
Multiple Correspondence Analysis ◽  
Aflp Analysis ◽  
Resistance Screening ◽  
Base Resistance ◽  
Cassava Bacterial Blight ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Cassava Varieties

Cassava bacterial blight (CBB) is caused by Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Resistance is found in Manihot esculenta and, in addition, has been introgressed from a wild relative, M. glaziovii. The resistance is thought to be polygenic and additively inherited. Ninety-three varieties of M. esculenta (Crantz) were assessed by AFLPs for genetic diversity and for resistance to CBB. AFLP analysis was performed using two primer combinations and a 79.2% level of polymorphism was found. The phenogram obtained showed between 74% and 96% genetic similarity among all cassava accessions analysed. The analysis permitted the unique identification of each individual. Two Xam strains were used for resistance screening. Variation in the reaction of cassava varieties to Xam strains was observed for all plant accessions. The correlation of resistance to both strains, had a coefficient of 0.53, suggesting the independence of resistance to each strain. Multiple correspondence analysis showed a random distribution of the resistance/susceptibility response with respect to overall genetic diversity as measured by AFLP analysis. A total heterozygosity index was calculated to determine the diversity within clusters as well as among them. Our results demonstrate that resistance to CBB is broadly distributed in cassava germplasm and that AFLP analysis is an effective and efficient means of providing quantitative estimates of genetic similarities among cassava accessions.Key words: amplified fragment length polymorphism, genetic base, resistance screening, Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.

scholarly journals QTL identification for cassava bacterial blight resistance under natural infection conditions

2017 ◽  
Vol 22 (1) ◽  
pp. 19 ◽  
Author(s):  
Carolina Soto Sedano ◽  
Rubén Eduardo Mora Moreno ◽  
Fernando Calle ◽  
Camilo Ernesto López Carrascal
Keyword(s):  
Manihot Esculenta ◽  
Bacterial Blight ◽  
Natural Infection ◽  
Blight Resistance ◽  
Bacterial Blight Resistance ◽  
Manihot Esculenta Crantz ◽  
Cassava Bacterial Blight ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Qtl Identification

La yuca, Manihot esculenta Crantz, representa la principal fuente de alimento para cerca de 1000 millones de personas. La producción de yuca se ve afectada por diversas enfermedades, una de las más serias es la bacteriosis vascular (CBB) causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). En este estudio se realizó un análisis de loci de rasgos cuantitativos (QTL) para la resistencia a CBB en condiciones naturales de infección, usando una población de mapeo constituida por 99 genotipos de hermanos completos segregantes y un mapa genético altamente denso basado en SNPs. La evaluación fenotípica se llevó a cabo en Puerto López (Meta), Colombia, durante la época de lluvias durante el segundo semestre de 2015. En la población de mapeo fueron detectados individuos con una segregación transgresiva tanto resistentes como susceptibles. A través de un análisis no paramétrico de intervalo simple, se detectaron dos QTL que explican el 10,9 y el 12,6 % de la varianza fenotípica de la resistencia en campo a CBB. Mediante análisis bioinformáticos se identificaron cuatro genes candidatos presentes en los intervalos de los QTL. Este trabajo representa un esfuerzo por dilucidar los mecanismos moleculares implicados en la resistencia de yuca a CBB.

scholarly journals Identificación de polimorfismos en el gen RXAM1 de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascular

2020 ◽  
Vol 25 (2) ◽  
pp. 185-193
Author(s):  
Andrea del Pilar Barrera ◽  
Johana Soto-Sedano ◽  
Camilo Ernesto López Carrascal
Keyword(s):  
Single Nucleotide Polymorphism ◽  
Manihot Esculenta ◽  
Leucine Rich Repeat ◽  
Nucleotide Polymorphism ◽  
Serine Threonine Kinase ◽  
Manihot Esculenta Crantz ◽  
Single Nucleotide ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Threonine Kinase

La yuca (Manihot esculenta Crantz) es un cultivo importante en regiones del trópico que proporciona alimento para cerca de 1000 millones de personas en todo el mundo. La enfermedad bacteriana más importante es la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Recientemente se logró identificar un gen de resistencia denominado RXAM1, el cual codifica para una proteína que posee un dominio LRR (Leucine-Rich Repeat) extracelular y un dominio STK (Serine Threonine Kinase) citoplasmático. RXAM1 colocaliza con un QTL que explica el 13 % de la resistencia a la cepa CIO136 de Xam. En este trabajo se evaluó la respuesta a la infección con la cepa XamCIO136 en diez diferentes variedades de yuca lo cual permitió identificar que las variedades TMS60444, SG10735, MCOL1522, MCOL1505 y MCOL2215 fueron susceptibles, mientras que CM6438-14, CM523-7 y MBRA902 se comportaron como resistentes. Así mismo se identificaron polimorfismos tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) en el gen RXAM1 en el mismo grupo de variedades. Las variedades SG10735, CM6438-14, TMS6044 y MBRA685 presentaron el mayor nivel de polimorfismos, mientras que las variedades CM523-7, CM2177-2 y MCOL1522 fueron menos polimórficas para este gen. Los análisis estadísticos no permitieron identificar una asociación significativa entre el fenotipo y los polimorfismos identificados. Este estudio representa un primer esfuerzo con miras a asociar variantes alélicas con el fenotipo de respuesta a la bacteriosis vascular.

scholarly journals Microscopic Characteristics, Chromatographic Profiles and Inhibition of Peroxidase Activity of the Leaves of <i>Manihot esculenta</i> and <i>Manihot glaziovii</i>, Consumed as Traditional Vegetables

2021 ◽  
Vol 09 (09) ◽  
pp. 59-73
Author(s):  
Paulin Mutwale Kapepula ◽  
Patricia Mbombo Mungitshi ◽  
Dieudonné Tshitenge Tshitenge ◽  
Thierry Franck ◽  
Dieudonné Mumba Ngoyi ◽  
...  
Keyword(s):  
Peroxidase Activity ◽  
Manihot Esculenta ◽  
Manihot Glaziovii ◽  
Chromatographic Profiles

scholarly journals Caracterización de la respuesta morfológica de variedades susceptibles y resistentes de yuca (Manihot esculenta Crantz) a la bacteriosis vascular causada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis

2015 ◽  
Vol 41 (2) ◽  
pp. 94-100 ◽  
Author(s):  
Tamara Sandino ◽  
Liliana López-Kleine ◽  
Camilo López ◽  
Xavier Marquínez
Keyword(s):  
Manihot Esculenta ◽  
Manihot Esculenta Crantz ◽  
Xanthomonas Axonopodis

Xanthomonas axonopodis pv. manihotis es una de las principales limitaciones del cultivo de yuca. En esta investigación, mediante microscopía óptica, se realizó un análisis comparativo de los cambios morfológicos e histoquímicos en tallos de una variedad de yuca susceptible (TMS60444) y una resistente (CM6438-14), 7 y 14 días después de ser inoculadas con la cepa patogénica CIO151. Se pudo detectar que la variedad resistente genera barreras de calosa en las paredes celulares del parénquima cortical y del floema, manteniendo funcional este tejido. En tanto que los tejidos vasculares de la variedad susceptible colapsan, el floema por obstrucción total con tapones de calosa y por formación de compuestos fenólicos, y el xilema por formación de tílides y/o acumulación de compuestos fenólicos, sin poder frenar el avance sistémico de la enfermedad.

scholarly journals Prevalence and Distribution of Cassava Bacterial Blight in the Kenyan Coast

2021 ◽  
Vol 3 (1) ◽  
pp. p7
Author(s):  
ANTONY Livoi ◽  
A. W. Mwang' ombe ◽  
E. Nyaboga ◽  
D. Kilalo ◽  
E. Obutho
Keyword(s):  
Manihot Esculenta ◽  
Bacterial Blight ◽  
Coastal Region ◽  
Management Program ◽  
Manihot Esculenta Crantz ◽  
Cassava Bacterial Blight ◽  
Xanthomonas Axonopodis ◽  
Major Constraint ◽  
Kenyan Coast ◽  
Cassava Production

Cassava (Manihot esculenta Crantz) is one of the staple food crops grown in Kenya. Diseases remain one of the major constraints for cassava production. Apart from other major viral diseaes Cassava mosaic and Cassava brown streak, Cassava bacterial blight (CBB) caused by Xanthomonas axonopodis pv manihotis and Xanthomonas axonopodis pv cassavae are a major constraint in cassava production in Kenya. This study was done to identify the prevalence, distribution, and farmers' knowledge of cassava bacterial blight in the coastal region of Kenya. A survey was conducted involving 250 farmers who were randomly selected from two regions of Kilifi and Taita Taveta counties. Among the 250 farmers interviewed, 61.6 % identified cassava bacterial blight symptoms in their farms. The main varieties found growing in the region were Tajirika, Karembo, Kibandameno, and Shibe which were all confirmed by farmers as susceptible to cassava bacterial blight. During the survey, plant samples were randomly collected in the field. Out of the 70 samples collected, 40 of them were confirmed positive with X.pv manihotis and X.pv cassavae which cause cassava bacterial blight. The study concluded that there is a widespread of cassava bacterial blight in Kilifi and Taita taveta counties. Kilifi County had the highest incidence of 22% with Taita Taveta having the lowest incidence of 13%. Kilifi County had a higher severity of 8% as compared to Taita Taveta which had 5% Severity. Therefore there is a need for a proper management program to be deployed in managing the disease to enhance cassava production in the region.

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