Introducing Hierarchical Clustering with Real Time Stream Reasoning into Semantic-Enabled IoT

2018 ◽  
Author(s):  
Jingyu Sun ◽  
Masato Kamiya ◽  
Susumu Takeuchi
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Hierarchical Clustering ◽  
Stream Reasoning

Hierarchical Clustering for Real-Time Stream Data with Noise

2011 ◽  
pp. 405-413 ◽  
Author(s):  
Philipp Kranen ◽  
Felix Reidl ◽  
Fernando Sanchez Villaamil ◽  
Thomas Seidl
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Hierarchical Clustering ◽  
Stream Data

scholarly journals Κυτταρική σηματοδότηση στο μυελοδυσπλαστικό σύνδρομο

2016 ◽  
Author(s):  
Παρασκευή Μιλτιάδη
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Hierarchical Clustering ◽  
Real Time Pcr ◽  
Gm Csf

Η έκτοπη μεθυλίωση και η απορρύθμιση της κυτταρικής σηματοδότησης συμβάλουν στην παθογένεση των ΜΔΣ, ενώ παράλληλα, επιγενετικές τροποποιήσεις σε γονίδια που συμμετέχουν στην κυτταρική σηματοδότηση συναντώνται συχνά σε ασθενείς με ΜΔΣ, ιδιαίτερα στα όψιμα στάδια της νόσου. Εκτός από την αμοιβαία αλληλεπίδραση μεταξύ των μηχανισμών επιγενετικής τροποποίησης και της σηματοδότησης, οι υπομεθυλιωτικοί παράγοντες μπορούν να επηρεάζουν έμμεσα την μεταγωγή σήματος. Παρά τα δεδομένα στην ΟΜΛ, δεν υπάρχει κάποια έρευνα που να μελετά τις μεταβολές των σηματοδοτικών μορίων Stat3/5 στα όψιμου σταδίου ΜΔΣ, καθώς και την επίδραση της υπομεθυλιωτικής θεραπείας σε αυτή την λευχαιμική σηματοδότηση.Στην παρούσα εργασία μελετήθηκαν τα Stat3/Stat5 σηματοδοτικά προφίλ στα αιμοποιητικά στελεχιαία/προγονικά κύτταρα (ΑΣΠΚ) 74 ασθενών με ΜΔΣ και ΟΜΛ με χαμηλό ποσοστό βλαστών, κατά τη διάρκεια θεραπείας με τον υπομεθυλιωτικό παράγοντα αζακυτιδίνη. Ταυτοποιήθηκαν τα βασικά και επαγόμενα από G-CSF και GM-CSF επίπεδα των μορίων Stat3 και Stat5 στα CD34+ κύτταρα μυελού των οστών των ασθενών με πολυπαραμετρική, φωσφοειδική κυτταρομετρία ροής. Για την ομαδοποίηση των Stat3/5 σηματοδοτικών προφίλ των CD34+ κυττάρων των ασθενών, χρησιμοποιήθηκε η ανιούσα ιεραρχική ταξινόμηση χωρίς επίβλεψη (unsupervised hierarchical clustering). Το στάδιο διαφοροποίησης και οι μοριακές ιδιότητες του GCSF-επαγόμενου διπλά θετικού Stat3/5 υποπληθυσμού στα CD34+ κύτταρα μελετήθηκαν με κυτταρομετρία ροής και ποσοτική real-time PCR στα απομονωμένα προγονικά κύτταρα.Τα δεδομένα της εργασίας έδειξαν ότι το προθεραπευτικό Stat3/5 προφίλ των ΑΣΠΚ στο ΜΔΣ συσχετίζεται σημαντικά με την απάντηση στη θεραπεία και την έκβαση των ασθενών. Ταυτοποιήθηκε, επίσης, ένας G-CSF-επαγόμενος phospho-Stat3/5 διπλά θετικός υποπληθυσμός στο διαμέρισμα των CD34+ κυττάρων (ΔΘ υποπληθυσμός), τα προθεραπευτικά επίπεδα του οποίου ήταν αντιστρόφως ανάλογα της απάντησης στην αζακυτιδίνη. Η κυτταρική ιεραρχία και οι μοριακές ιδιότητες του ΔΘ υποπληθυσμού εμφάνιζαν ομοιότητες με τον φαινότυπο λευχαιμικού στελεχιαίου κυττάρου, ενώ η κινητική του ακολουθούσε την πορεία της νόσου και την απάντηση στη θεραπεία.Τα δεδομένα μας προσφέρουν μια νέα συσχέτιση μεταξύ της Stat3/5 σηματοδότησης και της παθοβιολογίας του ΜΔΣ, ενώ, επίσης, υποδεικνύουν ότι το Stat3/5 σηματοδοτικό προφίλ μπορεί να αποτελέσει προβλεπτικό βιοδείκτη για την απάντηση στην αζακυτιδίνη, καθώς και θεραπευτικό στόχο για το ΜΔΣ.

scholarly journals A Hierarchical Clustering Method Based on SVM for Real-time Gas Mixture Classification

2010 ◽  
Vol 20 (5) ◽  
pp. 716-721 ◽  
Author(s):  
Guk-Hee Kim ◽  
Young-Wung Kim ◽  
Sang-Jin Lee ◽  
Gi-Joon Jeon
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Hierarchical Clustering ◽  
Gas Mixture ◽  
Clustering Method

scholarly journals Transcriptome Temporal and Functional Analysis of Liver Regeneration Termination

2012 ◽  
pp. S77-S92 ◽  
Author(s):  
D. RYCHTRMOC ◽  
L. HUBÁLKOVÁ ◽  
A. VÍŠKOVÁ ◽  
A. LIBRA ◽  
M. BUNČEK ◽  
...  
Keyword(s):  
Principal Component Analysis ◽  
Liver Regeneration ◽  
Real Time ◽  
Hierarchical Clustering ◽  
Microarray Data ◽  
Late Phase ◽  
Principal Component ◽  
Component Analysis ◽  
Rt Pcr ◽  
Termination Phase

Decades of liver regeneration studies still left the termination phase least elucidated. However regeneration ending mechanisms are clinicaly relevant. We aimed to analyse the timing and transcriptional control of the latest phase of liver regeneration, both controversial. Male Wistar rats were subjected to 2/3 partial hepatectomy with recovery lasting from 1 to 14 days. Time-series microarray data were assessed by innovative combination of hierarchical clustering and principal component analysis and validated by real-time RT-PCR. Hierarchical clustering and principal component analysis in agreement distinguished three temporal phases of liver regeneration. We found 359 genes specifically altered during late phase regeneration. Gene enrichment analysis and manual review of microarray data suggested five pathways worth further study: PPAR signalling pathway; lipid metabolism; complement, coagulation and fibrinolytic cascades; ECM remodelling and xenobiotic biotransformation. Microarray findings pertinent for termination phase were substantiated by real-time RT-PCR. In conclusion, transcriptional profiling mapped late phase of liver regeneration beyond 5th day of recovery and revealed 5 pathways specifically acting at this time. Inclusion of longer post-surgery intervals brought improved coverage of regeneration time dynamics and is advisable for further works. Investigation into the workings of suggested pathways might prove helpful in preventing and managing liver tumours.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document