Analisi di accessioni di vite con marcatori molecolari associati a geni di resistenza a filossera, antracnosi e tumore batterico

Laimburg Journal ◽

10.23796/lj/2019.002 ◽

2019 ◽

Vol 1 ◽

Author(s):

Margot Raffeiner ◽

Elena Zini ◽

Thomas Letschka

Keyword(s):

Agrobacterium Vitis ◽

Elsinoe Ampelina

Il Centro di Sperimentazione Laimburg nel 2012 ha avviato un progetto denominato RebSelect, in collaborazione con la Provincia Autonoma di Bolzano e con la piattaforma privata Innovitis di Marlengo. Tale progetto ha lo scopo di caratterizzare una collezione che consiste di ca. 150 accessioni di vite di particolare interesse per la presenza di geni di resistenza noti contro malattie fungine e non. Il progetto ha come obiettivo la realizzazione di una banca genetica di varietà di vite e l’utilizzo di una metodica molecolare (MAS, selezione assistita da marcatori) per l’individuazione di geni di resistenza a varie malattie nella collezione; in seguito, l’identificazione di piante resistenti da utilizzare come genitori di incrocio potrà essere utile per la costituzione di nuove varietà resistenti e di alta qualità. In questo lavoro di tesi ci si è concentrati sulle regioni genomiche deputate alla resistenza per fillossera (Viteus vitifoliae), tumore batterico (Agrobacterium vitis) e antracnosi (Elsinoë ampelina), prendendo in considerazione marcatori di tipo microsatellite o di tipo SCAR già pubblicati in letteratura. Dalle analisi eseguite, viene mostrato che i marcatori adatti per la MAS e utilizzabili per l’identificazione di varietà resistenti, impiegate successivamente per ulteriori incroci ai fini di un miglioramento genetico, sono quelli per Rdv1, cioè i marcatori associati alla resistenza a fillossera. Per la resistenza a tumore batterico, Rcg1, i risultati sono discordanti, rendendo questi marcatori inutilizzabili per la MAS: per questa regione, probabilmente, è necessario un mappaggio più fine della zona deputata e una ricerca di marcatori più vicini al gene o ai geni di resistenza al tumore batterico. Infine, per quanto riguarda la resistenza ad antracnosi, l’unico marcatore che sembra essere associato è da scartare completamente poiché da risultati falsi positivi per tutte le accessioni utilizzate nelle analisi.

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Exemplar Abstract for Agrobacterium vitis Ophel and Kerr 1990.

The NamesforLife Abstracts ◽

10.1601/ex.15184 ◽

2003 ◽

Author(s):

Charles Thomas Parker ◽

Dorothea Taylor ◽

George M Garrity

Keyword(s):

Agrobacterium Vitis

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Nomenclature Abstract for Agrobacterium vitis Ophel and Kerr 1990.

The NamesforLife Abstracts ◽

10.1601/nm.1321 ◽

2003 ◽

Author(s):

Charles Thomas Parker ◽

George M Garrity

Keyword(s):

Agrobacterium Vitis

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Isolation of a Gene Responsible for the Oxidation oftrans-Anethole topara-Anisaldehyde by Pseudomonas putida JYR-1 and Its Expression in Escherichia coli

Applied and Environmental Microbiology ◽

10.1128/aem.00781-12 ◽

2012 ◽

Vol 78 (15) ◽

pp. 5238-5246 ◽

Cited By ~ 9

Author(s):

Dongfei Han ◽

Ji-Young Ryu ◽

Robert A. Kanaly ◽

Hor-Gil Hur

Keyword(s):

Escherichia Coli ◽

Pseudomonas Putida ◽

Hypothetical Protein ◽

Aldehyde Group ◽

Agrobacterium Vitis ◽

T7 Promoter ◽

Content Type ◽

E Coli ◽

Cell Extracts ◽

Isoeugenol Monooxygenase

ABSTRACTA plasmid, pTA163, inEscherichia colicontained an approximately 34-kb gene fragment fromPseudomonas putidaJYR-1 that included the genes responsible for the metabolism oftrans-anethole to protocatechuic acid. Three Tn5-disrupted open reading frame 10 (ORF 10) mutants of plasmid pTA163 lost their abilities to catalyzetrans-anethole. Heterologously expressed ORF 10 (1,047 nucleotides [nt]) under a T7 promoter inE. colicatalyzed oxidative cleavage of a propenyl group oftrans-anethole to an aldehyde group, resulting in the production ofpara-anisaldehyde, and this gene was designatedtao(trans-anetholeoxygenase). The deduced amino acid sequence of TAO had the highest identity (34%) to a hypothetical protein ofAgrobacterium vitisS4 and likely contained a flavin-binding site. Preferred incorporation of an oxygen molecule from water intop-anisaldehyde using18O-labeling experiments indicated stereo preference of TAO for hydrolysis of the epoxide group. Interestingly, unlike the narrow substrate range of isoeugenol monooxygenase fromPseudomonas putidaIE27 andPseudomonas nitroreducensJin1, TAO fromP. putidaJYR-1 catalyzed isoeugenol,O-methyl isoeugenol, and isosafrole, all of which contain the 2-propenyl functional group on the aromatic ring structure. Addition of NAD(P)H to the ultrafiltered cell extracts ofE. coli(pTA163) increased the activity of TAO. Due to the relaxed substrate range of TAO, it may be utilized for the production of various fragrance compounds from plant phenylpropanoids in the future.

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LhnR and upstream operon LhnABC in Agrobacterium vitis regulate the induction of tobacco hypersensitive responses, grape necrosis and swarming motility

Molecular Plant Pathology ◽

10.1111/j.1364-3703.2011.00774.x ◽

2012 ◽

Vol 13 (7) ◽

pp. 641-652 ◽

Cited By ~ 4

Author(s):

DESEN ZHENG ◽

GUIXIA HAO ◽

LUCIANA CURSINO ◽

HONGSHENG ZHANG ◽

THOMAS J. BURR

Keyword(s):

Agrobacterium Vitis ◽

Swarming Motility

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The Presence and Characterization of a virF Gene on Agrobacterium vitis Ti Plasmids

Molecular Plant-Microbe Interactions ◽

10.1094/mpmi.1998.11.5.429 ◽

1998 ◽

Vol 11 (5) ◽

pp. 429-433 ◽

Cited By ~ 14

Author(s):

B. Schrammeijer ◽

J. Hemelaar ◽

P. J. J. Hooykaas

Keyword(s):

Amino Acids ◽

Agrobacterium Tumefaciens ◽

Molecular Mass ◽

Promoter Region ◽

Consensus Sequence ◽

Tumor Formation ◽

Nicotiana Glauca ◽

Agrobacterium Vitis ◽

Ti Plasmids

Octopine and nopaline strains of Agrobacterium tumefaciens differ in their ability to induce tumors on Nicotiana glauca. The presence of a virF locus on the octopine Ti plasmid makes N. glauca a host plant for these strains, indicating that the VirF protein is a host-range determinant. Here we show the presence of a virF locus not only on the Agrobacterium vitis octopine/cucumopine plasmids pTiAg57 and pTiTm4, but also on the nopaline Ti plas-mids pTiAT1, pTiAT66a, and pTiAT66b. On the octopine Ti plasmids from A. tumefaciens the virF gene is located between the virE locus and the left border of the T-region. In contrast, the virF gene on Ti plasmids of A. vitis is located at the very left end of the vir-region near the virA locus. The virF gene of pTiAg57 has been sequenced and codes for a protein of 202 amino acids with a molecular mass of 22,280 Da. Comparison showed that the virF gene from A. vitis strain Ag57 is almost identical to that from A. tumefaciens octopine strains. The transcription of the pTiAg57 virF is inducible by the plant phenolic compound acetosyringone through the presence of a vir-box consensus sequence in its promoter region. The VirF protein from pTiAg57 can complement octopine A. tumefaciens strains deleted for virF as shown by tumor formation on N. glauca.

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Efeito do extrato de alho na quebra de dormência de gemas de videiras e no controle in vitro do agente causal da antracnose (Elsinoe ampelina Shear)

Revista Brasileira de Fruticultura ◽

10.1590/s0100-29452009000100015 ◽

2009 ◽

Vol 31 (1) ◽

pp. 96-102 ◽

Cited By ~ 7

Author(s):

Renato Vasconcelos Botelho ◽

Aline José Maia ◽

Erasmo José Paioli Pires ◽

Maurilo Monteiro Terra

Keyword(s):

Elsinoe Ampelina

Considerando a redução ou eliminação do uso de substâncias sintéticas que preconizam os sistemas sustentáveis de produção de frutas, este trabalho teve como objetivo a busca de novas alternativas para a quebra de dormência e o controle de doenças em videiras. Estacas de videira contendo uma gema foram pulverizadas com os seguintes tratamentos: 1) testemunha; 2) OV (óleo vegetal) 1%; 3) extrato de alho (EA) 3%; 4) EA 3% + OV 1%. Posteriormente, as estacas foram mantidas em câmara de crescimento (25±2.5ºC) por 56 dias. O único tratamento que estimulou a brotação das estacas de videira cv. Isabel Precoce foi o EA 3% + OV 1%, que atingiu 35% de brotação, diferindo estatisticamente dos tratamentos- testemunha (12,5%), OV 1% (17,5%) e EA 3% (15,0%). Provavelmente, o estádio de endodormência profunda das gemas, após apenas 90 horas de frio ( < 7,0ºC), impediu melhores resultados dos tratamentos para quebra de dormência. Três experimentos, foram conduzidos in vitro, com diferentes doses de extrato de alho, com o objetivo de avaliar o controle do fungo Elsinoe ampelina. Em todos os experimentos, houve efeito quadrático no crescimento micelial, sem ter havido diferenças entre os tratamentos com extrato de alho, evidenciando o seu efeito fungicida, mesmo na dose mais baixa de EA (0,0615%).

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Bazı Üzüm Çeşit ve Amerikan Asma Anaçlarında Sıcak Su Uygulamasının Aşılı Çeliklerde Kallus Oluşumu Üzerine Etkileri

ISPEC Journal of Agricultural Sciences ◽

10.46291/ispecjasvol4iss2pp1-10 ◽

2020 ◽

Vol 4 (2) ◽

pp. 1-10

Author(s):

Özlem ÇALKAN SAĞLAM ◽

Hayri SAĞLAM

Keyword(s):

Agrobacterium Vitis

Bu çalışmada, sağlıklı asma fidanı üretiminde Agrobacterium vitis eleminasyonu amacıyla yapılan sıcak su uygulamasının aşılı çeliklerde kallus oluşumuna etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmada 99R ve Ramsey anaçlarına ait aşılık çelikler ile Sultani Çekirdeksiz ve Yalova İncisi çeşitlerine ait kalemler materyal olarak kullanılmıştır. Aşılık çelik ve kalemler 50 oC de 15, 30 ve 45 dakikalık sıcak su uygulamaların ardından masabaşı omega aşılama yöntemi ile aşılanmıştır. Ramsey anacına Sultani Çekirdeksiz çeşidi, 99R anacına ise Sultani Çekirdeksiz ve Yalova İncisi çeşitleri aşılanmıştır. Bunun ardından aşılı çelikler standart aşılı fidan üretim programına alınarak kallus oluşumu durumu değerlendirilmiştir. Sıcak su uygulaması yapıldıktan sonra 21 gün gelişmeye bırakılmış aşılı çeliklerde kallus oluşumları değerlendirilmiştir. Kombinasyonlar arasında önemli farklar olduğu belirlenmiştir. Sıcak su uygulamasında kallus oluşturma durumu uygulama süresinden çok anaç ve çeşide bağlı görünmektedir.

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Efeito antifúngico de extratos alcoólicos de própolis sobre patógenos da videira

Arquivos do Instituto Biológico ◽

10.1590/s1808-16572012000200023 ◽

2012 ◽

Vol 79 (2) ◽

pp. 305-308 ◽

Cited By ~ 5

Author(s):

D. Marini ◽

R. Mensch ◽

M.B. Freiberger ◽

J. Dartora ◽

G. Franzener ◽

...

Keyword(s):

Elsinoe Ampelina ◽

Phakopsora Euvitis

Objetivou-se com este trabalho verificar a fungitoxicidade in vitro de extratos alcoólicos de própolis (EAP) sobre a germinação de esporos de Phakopsora euvitis e Pseudocercospora vitis e também sobre o crescimento micelial e esporulação de esporos de Elsinoe ampelina. Para o ensaio de inibição de germinação o EAP foi utilizado nas concentrações de 0,025; 0,05; 0,1; 0,2; 0,25 e 0,5%. Como testemunhas utilizaram-se água destilada, etanol 0,35% e fungicida azoxystrobin. No ensaio de crescimento micelial e esporulação foram utilizadas as concentrações de 0,05; 0,1; 0,2; 0,4; 0,5 e 1,0% de EAP. As testemunhas foram o meio de cultura batata-dextrose-ágar (BDA), BDA + 0,7% de etanol e o fungicida azoxystrobin. Os resultados obtidos permitiram concluir que o EAP possui baixa atividade antifúngica in vitro contra P. euvitis, P. vitis e E. ampelina, para as concentrações testadas.

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