Structural characterization by nuclear magnetic resonance of the impact of phosphorylation in the proline-rich region of the disordered Tau protein

2011 ◽  
Vol 80 (2) ◽  
pp. 454-462 ◽  
Author(s):  
Nathalie Sibille ◽  
Isabelle Huvent ◽  
Caroline Fauquant ◽  
Dries Verdegem ◽  
Laziza Amniai ◽  
...  
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Structural Characterization ◽  
Tau Protein ◽  
Rich Region ◽  
The Impact ◽  
Proline Rich Region ◽  
Nuclear Magnetic

Frequency cycling for compensation of undesired off-resonance effects in surface nuclear magnetic resonance

Geophysics ◽  
2016 ◽  
Vol 81 (4) ◽  
pp. WB33-WB48 ◽  
Author(s):  
Denys Grombacher ◽  
Mike Müller-Petke ◽  
Rosemary Knight
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Larmor Frequency ◽  
Forward Model ◽  
Resonance Excitation ◽  
Entire Volume ◽  
Resonance Effects ◽  
Aquifer Properties ◽  
The Impact ◽  
Nuclear Magnetic

To produce reliable estimates of aquifer properties using surface nuclear magnetic resonance (NMR), an accurate forward model is required. The standard surface NMR forward model assumes that excitation occurs through a process called on-resonance excitation, which occurs when the transmit frequency is set to the Larmor frequency. However, this condition is often difficult to satisfy in practice due to the challenge of accurately determining the Larmor frequency within the entire volume of investigation. As such, in situations where an undesired offset is present between the assumed and true Larmor frequency, the accuracy of the forward model is degraded. This is because the undesired offset leads to a condition called off-resonance excitation, which impacts the signal amplitude, phase, and spatial distribution in the subsurface, subsequently reducing the accuracy of surface NMR estimated aquifer properties. Our aim was to reduce the impact of an undesired offset between the assumed and true Larmor frequency to ensure an accurate forward model in the presence of an uncertain Larmor frequency estimate. We have developed a methodology where data are collected using two different transmit frequencies, each an equal magnitude above and below the assumed Larmor frequency. These data are combined, through a method we refer to as frequency cycling, in a manner that allow the component well-described by our estimate of the Larmor frequency to be stacked coherently, whereas the component related to the presence of an undesired offset is combined destructively. In synthetic and field studies, we have determined that frequency cycling is able to mitigate the influence of an undesired offset providing more accurate estimates of aquifer properties. Furthermore, the frequency-cycling method stabilized the complex inversion of surface NMR data, allowing advantages associated with complex inversion to be exploited.

scholarly journals Structural Characterization of Amadori Rearrangement Product of Glucosylated Nα-Acetyl-Lysine by Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy

2014 ◽  
Vol 2014 ◽  
pp. 1-6 ◽  
Author(s):  
Chuanjiang Li ◽  
Hui Wang ◽  
Manuel Juárez ◽  
Eric Dongliang Ruan
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Maillard Reaction ◽  
Structural Characterization ◽  
Resonance Spectroscopy ◽  
H Nmr ◽  
Amadori Rearrangement ◽  
C Nmr ◽  
Nuclear Magnetic

Maillard reaction is a nonenzymatic reaction between reducing sugars and free amino acid moieties, which is known as one of the most important modifications in food science. It is essential to characterize the structure of Amadori rearrangement products (ARPs) formed in the early stage of Maillard reaction. In the present study, the Nα-acetyl-lysine-glucose model had been successfully set up to produce ARP, Nα-acetyl-lysine-glucose. After HPLC purification, ARP had been identified by ESI-MS with intense [M+H]+ ion at 351 m/z and the purity of ARP was confirmed to be over 90% by the relative intensity of [M+H]+ ion. Further structural characterization of the ARP was accomplished by using nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, including 1D 1H NMR and 13C NMR, the distortionless enhancement by polarization transfer (DEPT-135) and 2D 1H-1H and 13C-1H correlation spectroscopy (COSY) and 2D nuclear overhauser enhancement spectroscopy (NOESY). The complexity of 1D 1H NMR and 13C NMR was observed due to the presence of isomers in glucose moiety of ARP. However, DEPT-135 and 2D NMR techniques provided more structural information to assign the 1H and 13C resonances of ARP. 2D NOESY had successfully confirmed the glycosylated site between 10-N in Nα-acetyl-lysine and 7′-C in glucose.

Structural Characterization of Ca2+-ATPase-Bound Phospholamban in Lipid Bilayers by Solid-State Nuclear Magnetic Resonance (NMR) Spectroscopy†,‡

Biochemistry ◽  
2008 ◽  
Vol 47 (15) ◽  
pp. 4369-4376 ◽  
Author(s):  
Karsten Seidel ◽  
Ovidiu C. Andronesi ◽  
Joachim Krebs ◽  
Christian Griesinger ◽  
Howard S. Young ◽  
...  
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Solid State ◽  
Nmr Spectroscopy ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Lipid Bilayers ◽  
Structural Characterization ◽  
Nuclear Magnetic

Structural characterization of coal-hydrogenation products by proton and carbon-13 nuclear magnetic resonance

Fuel ◽  
1979 ◽  
Vol 58 (3) ◽  
pp. 162-170 ◽  
Author(s):  
Susumu Yokoyama ◽  
David M. Bodily ◽  
Wendell H. Wiser
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Structural Characterization ◽  
Nuclear Magnetic

scholarly journals Exploring the impact of maternal nutritional status on the compositional profile of mid-trimester biofluids

2017 ◽  
Author(s):  
Μαρία Φωτίου
Keyword(s):  
Nuclear Magnetic Resonance ◽  
Magnetic Resonance ◽  
Nutritional Status ◽  
Compositional Profile ◽  
Maternal Nutritional Status ◽  
The Impact ◽  
Nuclear Magnetic

Μελέτες υποδεικνύουν ότι ακόμη και ήπιες αποκλίσεις από ένα θρεπτικά-ισορροπημένο ενδομήτριο περιβάλλον, οι οποίες οφείλονται στη διατροφική κατάσταση και το μεταβολισμό της μητέρας, μπορεί να προκαλούν σοβαρές επιπτώσεις στην υγεία του απογόνου κατά την ενήλικη ζωή. Ο προσδιορισμός/ταυτοποίηση μεταβολιτών στο αμνιακό υγρό (ΑΥ) θα συνέβαλε στη διαλεύκανση των μηχανισμών, μέσω των οποίων η μητρική διατροφή επηρεάζει το ενδομήτριο περιβάλλον. Πράγματι, μελέτες σε ζώα έχουν δείξει ότι παρεμβάσεις στη μητρική διατροφή μεταβάλουν τη σύσταση του ΑΥ. Ωστόσο, τα δεδομένα που αφορούν στη συσχέτιση της διατροφής έγκυων γυναικών με τη συγκέντρωση μεταβολιτών στο ΑΥ είναι περιορισμένα. Σκοπός της διατριβής ήταν η διερεύνηση της επίδρασης της μητρικής διατροφικής κατάστασης στη σύσταση του ΑΥ έγκυων γυναικών. Το δείγμα αποτέλεσαν έγκυες που υποβλήθηκαν σε αμνιοπαρακέντηση για προγεννητικό έλεγχο. Η συλλογή δημογραφικών/ανθρωπομετρικών χαρακτηριστικών πραγματοποιήθηκε με χρήση ερωτηματολογίων, η καταγραφή της μητρικής διατροφικής πρόσληψης με ημιποσοτικό-ερωτηματολόγιο-συχνότητας-κατανάλωσης-τροφίμων, ενώ δεδομένα για την εξέλιξη/έκβαση της κύησης ελήφθησαν από ιατρικά αρχεία. Για την ανάλυση του ΑΥ χρησιμοποιήθηκαν συμβατικά αναλυτικά εργαλεία και πυρηνικός μαγνητικός συντονισμός (Nuclear Magnetic Resonance, NMR). Η διατριβή αποτελείται από 3 μελέτες. Στην 1η μελέτη διερευνήθηκε η συσχέτιση των συγκεντρώσεων γλυκόζης, ουρικού οξέος, και ιόντων φωσφόρου, καλίου και νατρίου στο ΑΥ με α. την ηλικία κύησης, β. δημογραφικά/ανθρωπομετρικά χαρακτηριστικά των εγκύων και γ. παραμέτρους νεογνικής ανάπτυξης. Από τα σημαντικότερα ευρήματα ήταν η συσχέτιση μεταξύ εβδομάδας κύησης και ιόντων φωσφόρου, η οποία αναδεικνύει το ρόλο του φωσφόρου στην εμβρυική ανάπτυξη/ωρίμανση. Επίσης, ο δείκτης-σωματικής-μάζας των εγκύων πριν την εγκυμοσύνη παρουσίασε στατιστικά σημαντική συσχέτιση με τη συγκέντρωση του ουρικού οξέος, ενώ η εκατοστιαία-θέση-βάρους των νεογνών με τη συγκέντρωση του ουρικού οξέος και των ιόντων φωσφόρου. Η 2η μελέτη περιγράφει την περίπτωση εγκύου της οποίας το ΑΥ κατά την 222/7 εβδομάδα κύησης παρουσίασε υπερβολικά υψηλή συγκέντρωση ουρικού οξέoς και καλίου, και υψηλή αναλογία κυστεΐνης/μεθειονίνη, σε σχέση με τις μέσες τιμές που αναφέρονται στη βιβλιογραφία για τη συγκεκριμένη εβδομάδα κύησης. Τη χρονική στιγμή της αμνιοπαρακέντησης, η έγκυος ήταν κλινικά υγιής. Ωστόσο, την 280/7 εβδομάδα, διαγνώστηκε προεκλαμψία. Το σημαντικότερο εύρημα αφορά στον υψηλό λόγο κυστεΐνης/μεθειονίνη που πιθανότατα απορρέει από τη μη κάλυψη των συστάσεων σε συγκεκριμένα μη-ενεργοφόρα θρεπτικά συστατικά που δρουν ως ρυθμιστές του μεταβολισμού στον κύκλο της μεθειονίνης (π.χ. φυλλικό οξύ). Στην 3η μελέτη διερευνήθηκε η υπόθεση ότι οι διατροφικές συνήθειες της μητέρας αντικατοπτρίζονται στο μεταβολομικό αποτύπωμα του ΑΥ. Μελετήθηκαν 2 διατροφικά-πρότυπα εγκύων, τα οποία διέφεραν στατιστικά σημαντικά ως προς το %ποσοστό της συνολικής ημερήσιας ενεργειακής πρόσληψης 10 ομάδων τροφίμων. Οι διατροφικές προτιμήσεις αποτυπώθηκαν και στην πρόσληψη ενεργοφόρων και μη-ενεργοφόρων θρεπτικών συστατικών. Με την εφαρμογή της μεταβολομικής (NMR) φάνηκε ότι οι διατροφικές συνήθειες της μητέρας αντικατοπτρίζονται στο ΑΥ, καθώς τα δύο διατροφικά πρότυπα διέφεραν στις συγκεντρώσεις γλυκόζης, αμινοξέων, ενδιάμεσων μεταβολιτών του κύκλου του κιτρικού οξέος, και μυρμηκικού οξέος. Η μελέτη ανέδειξε τη δυνατότητα εφαρμογής της μεταβολομικής-ανάλυσης σε συνδυασμό με τα διατροφικά-πρότυπα με στόχο τη διερεύνηση της επίδρασης της μητρικής διατροφής στην εξέλιξη της κύησης. Τα αποτελέσματα της διατριβής θα μπορούσαν να συμβάλουν στην αποσαφήνιση των μηχανισμών μέσω των οποίων η μητρική διατροφική κατάσταση επηρεάζει την έκβαση της κύησης, καθώς και στη διαμόρφωση διατροφικών συστάσεων.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document