scholarly journals Circular RNA sequencing indicates circ-IQGAP2 and circ-ZC3H6 as noninvasive biomarkers of primary Sjögren’s syndrome

Rheumatology ◽  
2020 ◽  
Vol 59 (9) ◽  
pp. 2603-2615 ◽  
Author(s):  
Fengxia Li ◽  
Zhenwei Liu ◽  
Bing Zhang ◽  
Shan Jiang ◽  
Qiongdan Wang ◽  
...  
Keyword(s):  
Receiver Operating Characteristic ◽  
Real Time ◽  
Rna Sequencing ◽  
Clinical Features ◽  
Real Time Pcr ◽  
Operating Characteristic ◽  
Receiver Operating Characteristic Analysis ◽  
Quantitative Real Time Pcr ◽  
Characteristic Analysis ◽  
Noninvasive Biomarkers

Abstract Objectives This study aims to characterize the expression profiles of circRNAs in primary Sjogren’s Syndrome (pSS) and examine the potential of noninvasive circular RNAs (circRNAs) as biomarkers of pSS. Methods We performed RNA sequencing of minor salivary gland (MSG) biopsies from four pSS and four non-pSS individuals (subjects undergoing MSG biopsies but not meeting 2012 or 2016 ACR classification criteria for SS). Differentially expressed circRNAs were identified by DESeq2, and confirmed by quantitative real-time PCR in the MSGs as well as in plasma exosomes in 37 pSS and 14 non-pSS subjects. Discriminatory capacity testing using receiver operating characteristic analysis was used to evaluate the performance of circRNAs as diagnostic biomarkers for pSS. Results Circ-IQGAP2 and circ-ZC3H6 had significantly upregulated expression in the MSGs of pSS patients, and this elevated expression was confirmed by quantitative real-time PCR of plasma exosome RNA. The expression of these circRNAs also showed significant correlation with both clinical features, serum IgG level and MSG focus scores. Receiver operating characteristic analysis showed that the indices comprised of both the two circRNAs and clinical features were better able to distinguish pSS from non-pSS subjects with high mean areas under the curve of 0.93 in the MSGs and 0.92 in the plasma exosomes. Conclusion This study indicated the potential roles of circ-IQGAP2 and circ-ZC3H6 as noninvasive biomarkers for the diagnosis of pSS.

scholarly journals 419. Diagnostic Utility of a Ferritin to Procalcitonin Ratio to Differentiate Patients with COVID-19 from Those with Bacterial Pneumonia

2020 ◽  
Vol 7 (Supplement_1) ◽  
pp. S277-S277
Author(s):  
Katherine C Jankousky ◽  
Peter Hyson ◽  
Jin Huang ◽  
Daniel B Chastain ◽  
Carlos Franco-Paredes ◽  
...  
Keyword(s):  
Receiver Operating Characteristic ◽  
Host Response ◽  
Bacterial Pneumonia ◽  
Operating Characteristic ◽  
Receiver Operating Characteristic Analysis ◽  
University Hospital ◽  
Characteristic Analysis ◽  
The Us ◽  
Test Probability ◽  
Receiver Operating

Abstract Background Accurate, rapid, inexpensive biomarkers are needed to differentiate COVID-19 from bacterial pneumonia, allowing effective treatment and antibiotic stewardship. We hypothesized that the ratio of ferritin to procalcitonin (F/P) reflects greater viral activity and host response with COVID-19 pneumonia, while bacterial pneumonia would be associated with less cytolysis (lower ferritin) and more inflammation (higher procalcitonin), thus a lower F/P ratio. Methods We conducted a retrospective study of adult patients admitted to a single University hospital in the US through May 2020, during the COVID-19 pandemic. We compared F/P ratio of patients diagnosed with COVID-19 or bacterial pneumonia, excluding patients with COVID-19 and bacterial co-infections. In a logistic regression, we controlled for age, sex, body mass index (BMI), diabetes (DM), and hypertension (HTN). We used a receiver operating characteristic analysis to calculate the sensitivity and specificity of F/P values for the diagnosis of COVID-19 versus bacterial pneumonia. Results Of 218 patients with COVID-19 and 17 with bacterial pneumonia, COVID-19 patients were younger (56 vs 66 years, p=0.04), male (66% vs 24%, p=0.009), had higher BMI (31 vs 27 kg/m2, p=0.03), and similar rates of HTN (59% vs 45%, p=0.3) and DM (32% vs 18%, p=0.2). The median F/P ratio was significantly higher in patients with COVID-19 (3195 vs 860, p=0.0003, Figure 1). An F/P ratio cut-off of ≥ 1250 generated a sensitivity of 78% and a specificity of 59% to correctly classify a COVID-19 case (Figure 2). When adjusted for age, gender, BMI, DM, and HTN, a ratio ≥ of 1250 was associated with significantly greater odds of COVID-19 versus bacterial pneumonia (OR: 4.9, CI: 1.5, 16.1, p=0.009). Figure 1. Ferritin to Procalcitonin Ratios of patients with COVID-19 and patients with Bacterial Pneumonia (controls). Figure 2. Receiver Operating Characteristic Analysis of Ferritin to Procalcitonin Ratio Cut-off Values Predicting COVID-19 Diagnosis. Conclusion We observed an elevated F/P ratio in patients with COVID-19 compared to those with bacterial pneumonia. A F/P ratio ≥ 1250 provides a clinically relevant increase in pre-test probability of COVID-19. Prospective studies evaluating the discriminatory characteristics of F/P ratio in larger cohorts is warranted. Disclosures All Authors: No reported disclosures

Η ανοσιακή απάντηση στον CMV σε ανοσοκατασταλμένους ασθενείς

2018 ◽  
Author(s):  
Μπίλιω Παούρη
Keyword(s):  
Receiver Operating Characteristic ◽  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Cumulative Incidence ◽  
Operating Characteristic ◽  
Receiver Operating

Η αλλογενής μεταμόσχευση αρχέγονων αιμοποιητικών κυττάρων (ΜΑΑΚ) αποτελεί σωτήρια θεραπεία για την πλειονότητα των παιδιών που πάσχουν από κακοήθεις και μη κακοήθεις αιματολογικές παθήσεις. Ωστόσο, οι παιδιατρικοί μεταμοσχευμένοι ασθενείς βρίσκονται σε υψηλό κίνδυνο νόσου από επανενεργοποίηση του CMV. Αυτό είναι αποτέλεσμα τόσο του ανώριμου ανοσοποιητικού τους συστήματος όσο και της κατασταλτικής θεραπείας που ακολουθεί την μεταμόσχευση. Πράγματι η CMV λοίμωξη μπορεί όχι μόνο να προκαλέσει σοβαρή νόσο με προσβολή πολλών οργάνων όπως αμφιβληστροειδοπάθεια, γαστρεντερίτιδα, εγκεφαλίτιδα, ηπατίτιδα, πνευμονίτιδα, μυοκαρδίτιδα αλλά και επιπλοκές όπως βακτηριακές και μυκητιασικές λοιμώξεις, απόρριψη μοσχεύματος και νόσο μοσχεύματος έναντι ξενιστή (GVHD). Μελέτες που έχουν γίνει κυρίως σε ενήλικες μεταμοσχευμένους ασθενείς έδειξαν ότι η αποκατάσταση της ειδικής για τον CMV Τ-κυτταρικής ανοσίας σχετίζεται με τον έλεγχο και την προστασία έναντι του ιού. Επομένως μετρώντας την ανοσιακή απάντηση στον CMV των ασθενών θα μπορούμε να υπολογίσουμε τον κίνδυνο για CMV λοίμωξη και να εφαρμόσουμε εξατομικευμένες στρατηγικές διαχείρισης. Στην παρούσα φάση υπάρχουν διαθέσιμες ανοσολογικές δοκιμασίες για την παρακολούθηση της ειδικής για τον CMV ανοσιακής απάντησης. Όμως, είναι ακριβές, δεν είναι ευρέως διαθέσιμες, συχνά απαιτούν εξειδικευμένο εργαστηριακό εξοπλισμό και δεν είναι προτυποποιημένες.Για το λόγο αυτό, μελετήσαμε προοπτικά την χρησιμότητα στην κλινική πράξη της παρακολούθησης της ειδικής για τον CMV ανοσιακής απάντησης με τη δοκιμασία QuantiFERON-CMV (QIAGEN®), στην πρόβλεψη ιαιμίας από CMV σε παιδιά με ΜΑΑΚ. Στη μελέτη συμμετείχαν 37 παιδιά που έλαβαν αλλογενή ΜΑΑΚ τη διετία 3/2010-6/2012. Η ανίχνευση της ιαιμίας από CMV γινόταν εβδομαδιαία με real time PCR . Η παρακολούθηση της ανοσιακής αποκατάστασης γινόταν με τη δοκιμασία QuantiFERON-CMV προ μεταμόσχευσης, νωρίς μετά την μεταμόσχευση, στις 30, 90,180, 270 και 360 ημέρες μετά την μεταμόσχευση. Η επίπτωση της ιαιμίας από CMV ήταν 51% (19/37) με τα μισά επεισόδια να συμβαίνουν μέσα στις ≤30 μέρες από τη μεταμόσχευση. Δεκαπέντε ασθενείς παρουσίασαν σταθερή ειδική ανοσία στον CMV σε μέσο χρόνο 82 ημερών. Η αθροιστική επίπτωση (cumulative incidence) της επανενεργοποίησης του CMV στους ασθενείς που ανέπτυξαν ειδική ανοσία ήταν χαμηλότερη σε σχέση με αυτούς που δεν ανέπτυξαν (15% έναντι 53%; p=0.023). Για την εκτίμηση της προβλεπτικής αξίας της μεθόδου στην εμφάνιση ιαιμίας από CMV έγινε στατιστική ανάλυση ROC (receiver operating characteristic) όπου ανέδειξε περιοχή κάτω από την καμπύλη 0.725. Συμπερασματικά, σε αυτή την κοορτή, η θετική QuantiFERON-CMV συσχετίστηκε με χαμηλό κίνδυνο υποτροπής CMV ιαιμίας, αντανακλώντας σαφώς την αποκατάσταση της κυτταρικής ανοσίας για τον CMV. Η μέθοδος αυτή αποδείχθηκε αξιόλογη στην αναγνώριση παιδιατρικών ασθενών ΜΑΑΚ σε υψηλό κίνδυνο για CMV ιαιμία. Ως εκ τούτου θα μπορούσε να ενισχύσει την καθιερωμένη επιτήρηση και την διαστρωμάτωση του κινδύνου για τον CMV μετά την μεταμόσχευση. Κατά συνέπεια, οι ασθενείς με εδραιωμένη ανοσιακή απάντηση στον CMV βάσει της μεθόδου θα μπορούσαν να υποβάλλονται σε λιγότερο εντατικά σχήματα παρακολούθησης και εξατομικευμένα προγράμματα προφυλακτικής αγωγής.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document