scholarly journals Search for genomic regions associated with potato starch granules morphology of Solanum tuberosum L.

2019 ◽  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Potato Starch ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Starch Granules ◽  
Genomic Regions

scholarly journals Genomic regions of Solanum tuberosum L. associated with the tuber eye depth

2020 ◽  
Vol 24 (5) ◽  
pp. 465-473
Author(s):  
I. V. Totsky ◽  
I. V. Rozanova ◽  
A. D. Safonova ◽  
A. S. Batov ◽  
Yu. A. Gureeva ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Snp Markers ◽  
Potato Genome ◽  
Potato Species ◽  
Area 5 ◽  
High Level ◽  
Genomic Regions ◽  
Academy Of Sciences ◽  
Eye Depth

Potato (Solanum tuberosum L.) is one of the most important food crops in the world. The genome of this potato species is autotetraploid and has a high level of heterozygosity, also this potato species is a cross-pollinated plant. These characteristics complicate the genetic analysis and breeding process. The tuber’s eye depth is an important trait that affects the suitability of potato varieties for processing. Potato breeding for this trait is based on phenotypic assessment. Identification of the loci that control tuber eye depth would allow diagnostic markers for the marker-assisted selection to be created. The aim of this study is to search for loci associated with the eye depth by analyzing Solanum tuberosum varieties from the GenAgro collection of the Institute of Cytology and Genetics of the Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, genotyped using the Illumina 22K SNP potato array DNA chip. The 24 significant markers associated with the “eye depth” trait were identified using 15,214 SNP markers genotyped with the Illumina 22K SNP potato array chip and the general linear model (GLM) taking into account the population structure. Data obtained showed the presence of SNPs in four genomic regions: on chromosome 4 (1 marker in the 3.92 Mb area), 5 (1 marker in the 4.67 Mb area) and 10 (1 marker in the 4.87 Mb area and 21 markers in the region between 48.1–48.9 Mb). The results of localization in the region 48.1–48.9 Mb of chromosome 10 correspond to previously published studies, the remaining three regions were detected for the first time. DNA sections containing SNPs linked to the tuber’s eye depth were studied in the SolTub_3.0 potato genome assembly (https:// plants.ensembl.org/). KASP markers were developed based on the data obtained. It will be possible to screen the breeding material and to breed the varieties more effectively using current markers associated with a shallow tuber’s eye depth.

Changes in the surface morphology of starch granules of the cultivated potato,Solanum tuberosum L. during storage

1993 ◽  
Vol 36 (2) ◽  
pp. 119-125 ◽  
Author(s):  
J. E. Cottrell ◽  
C. M. Duffus ◽  
G. R. Mackay ◽  
M. J. Allison
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Surface Morphology ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Starch Granules ◽  
Cultivated Potato

An Electron Diffraction Study on Litnerized Potato Starch

1990 ◽  
Vol 48 (1) ◽  
pp. 580-581
Author(s):  
Jean-Claude Jésior ◽  
Roger Vuong ◽  
Henri Chanzy
Keyword(s):  
Electron Microscope ◽  
Electron Diffraction ◽  
Signal To Noise Ratio ◽  
Potato Starch ◽  
Image Intensifier ◽  
Electron Diffraction Study ◽  
Starch Granules ◽  
X Ray ◽  
Individual Grains ◽  
Diamond Knife

Starch is arranged in a crystalline manner within its storage granules and should thus give sharp X-ray diagrams. Unfortunately most of the common starch granules have sizes between 1 and 100μm, making them too small for an X-ray study on individual grains. There is only one instance where an oriented X-ray diagram could be obtained on one sector of an individual giant starch granule. Despite their small size, starch granules are still too thick to be studied by electron diffraction with a transmission electron microscope. The only reported study on starch ultrastructure using electron diffraction on frozen hydrated material was made on small fragments. The present study has been realized on thin sectioned granules previously litnerized to improve the signal to noise ratio.Potato starch was hydrolyzed for 10 days in 2.2N HCl at 35°C, dialyzed against water until neutrality and embedded in Nanoplast. Sectioning was achieved with a commercially available low-angle “35°” diamond knife (Diatome) after a very carefull trimming and a pre-sectioning with a classical “45°” diamond knife. Sections obtained at a final sectioning angle of 42.2° (compared with the usual 55-60°) and at a nominal thickness of 900Å were collected on a Formvar-carbon coated grid. The exact location of the starch granules in their sections was recorded by optical microscopy on a Zeiss Universal polarizing microscope (Fig. 1a). After rehydration at a relative humidity of 95% for 24 hours they were mounted on a Philips cryoholder and quench frozen in liquid nitrogen before being inserted under frozen conditions in a Philips EM 400T electron microscope equipped with a Gatan anticontaminator and a Lhesa image intensifier.

Situación económica y social de la población de San José del Carmen, San Cristóbal de las Casas, Chiapas

2019 ◽  
Vol 12 (4) ◽  
Author(s):  
Pedro Cadena-Iñiguez ◽  
Eileen Salinas-Cruz ◽  
Jesús Martínez-Sánchez ◽  
Mariano Morales-Guerra ◽  
Romualdo Vásquez-Ortiz ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Theobroma Cacao ◽  
Zea Mays L ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
San Jose ◽  
Phaseolus Vulgaris L ◽  
Las Casas ◽  
Vicia Faba L ◽  
Las Mujeres ◽  
Theobroma Cacao L

Objetivo: Establecer una línea base como fundamento para la intervención e inducción de innovaciones a través de escuelas de campo y planes de negocios. Diseño/metodología/aproximación: El estudio se desarrolló en San José del Carmen, San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México. Se elaboró una encuesta como instrumento para recabar en campo información de familias de la localidad con la finalidad de conocer su situación actual. La localidad de trabajo se eligió utilizando como criterio las poblaciones que se encuentran dentro de Cruzada Nacional contra el hambre y en la clasificación de la pobreza extrema Resultados: La localidad de San José del Carmen es considerada como de alta marginación, la población es bilingüe, su principal lengua es el Tzotzil, el nivel de estudios promedio es hasta el tercer año de primaria, las principales actividades productivas son la siembra de maíz (Zea mays L.), frijol (Phaseolus vulgaris L.), papa (Solanum tuberosum L.) y haba (Vicia faba L.) que son utilizadas principalmente para autoconsumo.  No cuentan con agua potable ya que su sistema es a través de la recaudación de agua de lluvia o a través de un jagüey. Sus principales actividades económicas son la albañilería por parte de los hombres, y venta de productos, tales como el pozol (bebida energética a base de maíz y cacao (Theobroma cacao L.), tostadas y algunos vegetales por parte de las mujeres. Las tostadas son producidas en forma artesanal con un proceso de doble nixtamalización y vendida en bolsas de 20 tostadas cada una, a un costo de MX$10.00 en los mercados de San Cristóbal de las Casas, una a dos veces por semana alrededor de 40 bolsas por día de venta. Limitaciones del estudio/implicaciones: La afiliación zapatista de alguno de los pobladores y el hecho de que algunos habitantes no hablen español, fueron factores que limitaron desarrollar al 100% el estudio; sin embargo, se considera que se tienen los elementos necesarios para establecer la línea base de la situación de San José del Carmen. Conclusiones: El diagnóstico servirá como una herramienta para establecer una intervención a través de innovaciones y planes de negocios en la comunidad de estudio. Los pobladores cuentan con herramientas necesarias para obtener nuevos conocimientos que ayuden a un desarrollo de su producción. El idioma no deberá de ser una limitante para ello.

ALLELE DIVERSITY FOR ACID VACUOLAR INVERTASE GENE Pain-1 FRAGMENT IN POTATO (Solanum tuberosum L.) VARIETIES AND LINES

2018 ◽  
Vol 53 (1) ◽  
pp. 132-139
Author(s):  
M.A. Slugina ◽  
◽  
E.O. Shmelkova ◽  
A.A. Meleshin ◽  
E.Z. Kochieva ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Vacuolar Invertase ◽  
Invertase Gene

Respon Pemberian Aspirin dan Kinetin Terhadap Pembentukan Umbi Mikro Kentang (Solanum tuberosum L.) Secara In Vitro

2017 ◽  
Author(s):  
Yunita Prameswari ◽  
FNU Djenal ◽  
FNU Damanhuri
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L

Kebutuhan kentang yang semakin tinggi menyebabkan permintaan semakin meningkat. Rendahnya produksi kentang mengakibatkan berbagai upaya untuk peningkatan produksi terus dilakukan. Penggunaan metode kultur jaringan yaitu metode untuk mengisolasi bagian tanaman seperti protoplasma, sel, sekelompok sel, jaringan dan organ dalam kondisi aseptik, sehingga dapat diperbanyak dan beregenerasi menjadi tanaman utuh dapat dijadikan alternatif pemenuhan kebutuhan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kecepatan pembentukan umbi mikro kentang (Solanum Tuberosum L.) varietas granola kembang secarain vitro dengan menggunakan dua faktor dan 3 kali ulangan. Faktor pertama yaitu aspirin dengan tiga taraf (5,10,15) ppm. Faktor kedua yaitu kinetin dalam tiga taraf (8,10,12) ppm. Penelitian menggunakan seluruh propagul kentang yang berumur 30 hari setelah subkultur dan data yang didapat dianalisis menggunakan ANOVA. Hasil penelitian menunjukan bahwa interaksi aspirin dan kinetin tidak berpengaruh terhadap jumlah akar, kedinian umbi, dan bobot umbi. Interaksi perlakuan terbaik bagi pembentukan tunas yaitu A2K1 aspirin 10 ppm dan kinetin 8 ppm sedangkan Interaksi perlakuan terbaik pada parameter jumlah umbi yaituA3K2 aspirin 15 ppm dan kinetin 10.

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