Pre-Processing of Affymetrix Gene Chip Microarray Data

2010 ◽  
Vol 5 (4) ◽  
pp. 270-279
Author(s):  
Ahmed R. Hasan ◽  
John E. Pattison ◽  
Alex Hariz
2002 ◽  
Vol 34 (7) ◽  
pp. A11 ◽  
Author(s):  
Jian Wang ◽  
Lawrence Gelbert ◽  
Chad D. Geringer ◽  
Todd ◽  
G. Cook ◽  
...  

2002 ◽  
Vol 16 (3) ◽  
pp. 409-413 ◽  
Author(s):  
Simon J. Evans ◽  
Nicole A. Datson ◽  
Mohamed Kabbaj ◽  
Robert C. Thompson ◽  
Erno Vreugdenhil ◽  
...  

2020 ◽  
Vol 16 (6) ◽  
Author(s):  
Adilis Rodrigues da Silva ◽  
Andressa De Solza Fernandes ◽  
Viviane Paraboni Fiorin ◽  
Tuane Zeppenfeld ◽  
Guilherme Brum França ◽  
...  

O câncer manifesta-se a partir de uma transmutação genética, ou seja, uma modificação no DNA que passa a transmitir informações erradas para o desenvolvimento de suas atividades, ocorrendo assim em genes especiais nomeados como proto-oncogenes. A leucemia é um dos cânceres mais conhecidos e acometem os glóbulos brancos que perdem suas funções e passam a se multiplicar descontroladamente. No entanto a terapia gênica, ainda experimental, busca substituir o gene defeituoso, pelo gene normal. O uso terapêutico de inibidores da tirosino quinase (mesilato de imatinibe), reduz significativamente a progressão da doença e elimina os principais sintomas da fase crônica da leucemia, aumentando assim a expectativa de vida. Os objetivos deste trabalho são analisar a expressão diferencial que estão relacionadas ao desenvolvimento da leucemia mediante a sua evolução ou tratamento usando Imatinibe. Os estudos foram realizados em linhagens celulares submetidos por análises de microarranjos de amostras de Leucemia Mielóide Aguda Bialélica e Leucemia Mielóide Crônica.  Foram utilizadas microarranjos da Affymetrix Gene Chip HU133 de células de Leucemia Mieloide extraídos do banco de dados Gene Expression Omnibus. Dentre os resultados obtidos o gene FCAR atua no sistema imune de pacientes com Leucemia, ele é um receptor da glicoproteína transmembrana presente, genes dessa família são usados em imunoterapia usando células T, diferencialmente expresso e está atuando na ativação do sistema imunológico no tratamento da Leucemia Mielóide Aguda. Com isso é possível utilizar as ferramentas de análise de expressão gênica como meio para localizar genes diferencialmente expressos e assim determinar novas terapias gênicas.


Author(s):  
Giovanni Coppola ◽  
Kellen Winden ◽  
Genevieve Konopka ◽  
Fuying Gao ◽  
Daniel Geschwind

2020 ◽  
Author(s):  
Shahan Mamoor

Non-small cell lung adenocarcinoma (NSCLC) is a leading cause of death in the United States and worldwide (1, 2). We mined published microarray data (3, 4, 5) to discover genes associated with NSCLC. We identified significant differential expression of the tyrosine kinase TEK in tumors from patients with NSCLC. TEK may be of relevance to the initiation, progression or maintenance of non-small cell lung cancers.


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