Repetitive Sequence Distribution on Saguinus, Leontocebus and Leontopithecus Tamarins (Platyrrhine, Primates) by Mapping Telomeric (TTAGGG) Motifs and rDNA Loci

Tamarins are a distinct group of small sized New World monkeys with complex phylogenetic relationships and poorly studied cytogenetic traits. In this study, we applied molecular cytogenetic analyses by fluorescence in situ hybridization with probes specific for telomeric sequences and ribosomal DNA loci after DAPI/CMA3 staining on metaphases from five tamarin species, namely Leontocebus fuscicollis, Leontopithecus rosalia, Saguinus geoffroyi, Saguinus mystax and Saguinus oedipus, with the aim to investigate the distribution of repetitive sequences and their possible role in genome evolution. Our analyses revealed that all five examined species show similar karyotypes, 2n = 46, which differ mainly in the morphology of chromosome pairs 16–17 and 19–22, due to the diverse distribution of rDNA loci, the amplification of telomeric-like sequences, the presence of heterochromatic blocks and/or putative chromosomal rearrangements, such as inversions. The differences in cytogenetic traits between species of tamarins are discussed in a comparative phylogenetic framework, and in addition to data from previous studies, we underline synapomorphies and apomorphisms that appeared during the diversification of this group of New World monkeys.

Mamíferos silvestres en plantaciones forestales: ¿Una oportunidad para su conservación?

Las plantaciones forestales son monocultivos que han venido en aumento a nivel mundial. Estos sistemas son menos diversos en comparación con bosques originales, pero pueden aportar a la conservación de la biodiversidad ya que son usadas por muchas especies, incluso algunas amenazadas. Este potencial debe evaluarse en cada localidad. En este trabajo se registró la abundancia relativa y se midió la diversidad verdadera de mamíferos terrestres, arborícolas y voladores, en cinco núcleos forestales de coníferas y de teca en las regiones Andina y Caribe de Colombia, y se comparó con coberturas nativas aledañas. El 78 % y 71 % de los mamíferos presentes en los sitios visitados fueron registrados al interior de las plantaciones de coníferas y teca, respectivamente. Al interior de ambos tipos de plantaciones se encontraron especies amenazadas como Leopardus tigrinus y Saguinus oedipus. Los perfiles de diversidad fueron similares entre bosques y plantaciones en casi todos los grupos. Hubo diferencias significativas solo para los mamíferos terrestres en las plantaciones de coníferas. Se encontraron diferencias en la abundancia relativa entre ambas coberturas para todos los grupos con una tendencia a menor abundancia en las plantaciones, lo cual indica que estas ofrecen un hábitat de menor calidad para los mamíferos silvestres, pero las plantaciones visitadas distan de ser “desiertos verdes” y por el contrario mostraron que son sistemas diversos. La riqueza de especies y la presencia de especies amenazadas son atributos que deben ser incluidos en los planes de manejo forestal y en el diseño del paisaje regional.

Mamíferos del departamento del Atlántico, Colombia

Presentamos el primer listado taxonómico de los mamíferos silvestres del departamento del Atlántico, en la costa Caribe de Colombia. Registramos 92 especies, distribuidas en 11 órdenes, 37 familias y 74 géneros, lo cual representa el 16.5 % de la mastofauna documentada para Colombia. Encontramos tres especies endémicas de Colombia, Cebus versicolor, Saguinus oedipus y Pattonomys semivillosus, 10 especies en alguna categoría nacional de amenaza, 13 especies en alguna catrgoría global y cuatro categorizadas como Datos Insuficientes. La riqueza de mamíferos es baja, comparada con la de otros departamentos del país, pero podría estar subestimada, debido al bajo esfuerzo de muestreo y la falta de exploración en diversas áreas del departamento.

Scent Marks Signal Species, Sex and Reproductive Status in Tamarins (Saguinus spp., Neotropical Primates)

Olfactory communication is an important mediator of social interactions in mammals, thought to provide information about an individual’s identity and current social, reproductive, and health status. In comparison with other taxa such as carnivores and rodents, few studies have examined primate olfactory communication. Tamarins (Callitrichidae) conspicuously deposit odorous secretions, produced by specialized scent glands, in their environment. In this study, we combined behavioral and chemical data on captive cotton-top tamarins, Saguinus oedipus, and bearded emperor tamarins, S. imperator subgrisescens, to examine the role of olfactory communication in the advertisement of species, sex, and reproductive status. We observed no difference in scent-marking behavior between species; however, females marked more frequently than males, and reproductive individuals more than non-reproductive ones. In addition, tamarins predominantly used their anogenital gland when scent-marking, followed by the suprapubic gland. We collected swabs of naturally deposited tamarin anogenital scent marks, and analyzed these samples using headspace gas chromatography-mass spectrometry. Despite a limited sample size, we established differences in tamarin anogenital mark chemical composition between species, sex and reproductive status, and identified 41 compounds. The compounds identified, many of which have been reported in previous work on mammalian semiochemistry, form targets for future bioassay studies to identify semiochemicals. Our non-invasive method for collecting deposited scent marks makes it a promising method for the study of olfactory communication in scent-marking animal species, applicable to field settings and for the study of elusive animals.

Descripción de las unidades fonéticas y sintaxis fonológica del repertorio vocal del tití cabeciblanco (Saguinus oedipus) silvestre

Estudiamos titíes cabeciblancos (Saguinus oedipus, Primates: Callitrichidae) durante más de 100 horas en el municipio de Santa Catalina, Bolívar norte de Colombia. Grabamos 16 horas de sus vocalizaciones, las cuales digitalizamos a 44.1 kHz, utilizando Protools. Analizamos 2617 sonidos con Raven 1.2, con el fin de identificar las unidades fonéticas que conforman el repertorio vocal de esta especie, de acuerdo a los siguientes parámetros acústicos: duración (ms), delta de frecuencia (Hz), pico de frecuencias (Hz), frecuencia de inicio (Hz) y cantidad de armónicos de cada unidad fonética. Para describir el repertorio vocal, clasificamos los fonemas en 11 grupos, según su forma. Con el análisis de los intervalos de confianza de los parámetros acústicos, identificamos 49 sonidos diferentes. Mediante el ensamblaje de las unidades fonéticas, se identificaron 14 vocalizaciones diferentes. Los sonidos emitidos por el tití cabeciblanco fueron de corta duración (X= 0.0215 s). La frecuencia de inicio más baja registrada fue de 322.7 Hz y la más alta de 13 956.5 Hz. El delta de frecuencias osciló entre 113.8 y 13 652.2 Hz., y el pico de frecuencias de 0 a 10 077.6 Hz. El 37.4 % de los sonidos emitidos por los titíes cabeciblancos carecen de armónicos y el 62.6 % restante presentan entre uno y doce armónicos.

Inventario de mamíferos medianos y grandes en la reserva los Titíes de San Juan, Montes de María, Bolívar, Colombia

Reportamos el inventario de mamíferos medianos y grandes para la Reserva Nacional de la Sociedad Civil Los Titíes de San Juan en el departamento de Bolívar. Se registraron un total de ocho ordenes, 18 familias y 22 especies, de los cuales dos se encuentran en peligro de extinción Saguinus oedipus y Ateles fusciceps. Resaltamos la presencia y más reciente registro fotográfico de Galictis vittata. Se destaca la importancia de establecer áreas protegidas que provean conectividad con fragmentos de bosques y protección de especies amenazadas.

Five novel bifidobacterial species isolated from faeces of primates in two Czech zoos: Bifidobacterium erythrocebi sp. nov., Bifidobacterium moraviense sp. nov., Bifidobacterium oedipodis sp. nov., Bifidobacterium olomucense sp. nov. and Bifidobacterium panos sp. nov.

Five Bifidobacterium strains, VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T, were isolated from chimpanzee (Pan troglodytes), cotton-top tamarin (Saguinus oedipus), Goeldi’s marmoset (Callimico goeldii), moustached tamarin (Saguinus mystax) and patas monkey (Erythrocebus patas), respectively, which were kept in two Czech zoos. These strains were isolated from faecal samples and were Gram-positive, non-motile, non-sporulating, anaerobic and fructose-6-phosphate phosphoketolase-positive. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA revealed close relatedness between VB23T and Bifidobacterium angulatum LMG 11039T (96.0 %), VB24T and Bifidobacterium pullorum subsp. pullorum DSM 20433T (96.1 %), VB25T and Bifidobacterium goeldii LMG 30939T (96.5 %), VB26T and Bifidobacterium imperatoris LMG 30297T (98.1 %), and VB31T and B . angulatum LMG 11039T (99.40 %). Internal transcribed spacer profiling revealed that VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T had highest similarity to Bifidobacterium breve LMG 13208T (77.2 %), Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697T (85.8 %), Bifidobacterium biavatii DSM 23969T (76.9 %), B. breve LMG 13208T (81.2 %) and B. angulatum LMG 11039T (88.2 %), respectively. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA–DNA hybridization (dDDH) analyses with their closest neighbours supported the independent phylogenetic positions of the strains with values between 86.3 and 94.3 % for ANI and 25.8 and 54.9 % for dDDH. These genomic and phylogenetic analyses suggested that the evaluated strains were novel Bifidobacterium species named Bifidobacterium erythrocebi sp. nov. (VB31T=DSM 109960T=CCUG 73843T), Bifidobacterium moraviense sp. nov. (VB25T=DSM 109958T=CCUG 73842T), Bifidobacterium oedipodis sp. nov. (VB24T=DSM 109957T=CCUG 73932T), Bifidobacterium olomucense sp. nov. (VB26T=DSM 109959T=CCUG 73845T) and Bifidobacterium panos sp. nov. (VB23T=DSM 109963T=CCUG 73840T).