scholarly journals Ιχνηλασιμότητα πληθυσμών ιριδίζουσας πέστροφας Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) στην Ελλάδα

2018 ◽  
Author(s):  
Πέτρος Μαρτσικάλης
Keyword(s):  
Oncorhynchus Mykiss ◽  
High Performance ◽  
Linear Models ◽  
Fragment Length Polymorphism ◽  
Principal Component ◽  
Reversed Phase ◽  
Canonical Variate ◽  
Rp Hplc ◽  
Variate Analysis ◽  
Polymerase Chain

Για την επίτευξη της ιχνηλασιμότητας των πληθυσμών ιριδίζουσας πέστροφας Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) στην Ελλάδα υιοθετήθηκε μια διαθεματική προσέγγιση, η οποία ως αλληλένδετους πυλώνες της περιελάμβανε α) την πληθυσμιακή γενετική μελέτη στο μιτοχονδριακό DNA των ιχθύων, β) την ταυτοποίηση και ποσοτικοποίηση των ελεύθερων αμινοξέων στο μυϊκό ιστό των ιχθύων και γ) τη γεωμετρική μορφομετρία του σώματος των ιχθύων, εκφράζοντας ένα αντιπροσωπευτικό δείγμα των εντατικών εκτροφών της ελληνικής επικράτειας. Η ιριδίζουσα πέστροφα αποτελεί μη γηγενές είδος των ευρωπαϊκών εσωτερικών υδάτων. Εξαιτίας όμως του γεγονότος ότι παρουσιάζει αξιοσημείωτα πλεονεκτήματα, όπως είναι η ταχεία αύξηση και η προσαρμοστικότητά της σε ποικίλα ενδιαιτήματα υπό διαφορετικές συνθήκες, εξελίχθηκε σε κυρίαρχο εντατικά εκτρεφόμενο είδος στα εσωτερικά ύδατα της Ελλάδας. Παρά τη σημαντική οικονομική σημασία της, υφίσταται παντελής έλλειψη πληθυσμιακών γενετικών μελετών αναφορικά με την προέλευση των αθρόων εισαγωγών γόνου που έλαβαν χώρα τις προηγούμενες δεκαετίες στον κλάδο της ελληνικής πεστροφοκαλλιέργειας. Για τη διενέργεια της πληθυσμιακής γενετικής μελέτης πραγματοποιήθηκε πέψη τμημάτων του μιτοχονδριακού DNA (mtDNA) που ενισχύθηκαν με την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (Polymerase Chain Reaction-PCR) με τη χρήση περιοριστικών ενζύμων (Restriction Fragment Length Polymorphism-RFLP). Τα τμήματα-στόχοι του mtDNA που πολλαπλασιάστηκαν με την τεχνική της PCR ήταν ολόκληρη η περιοχή του βρόχου εκτόπισης, τα tRNA γονίδια της προλίνης και της θρεονίνης, το κυτόχρωμα β, τα γονίδια ND-5 και ND-6 και τμήμα των γονιδίων ATPάση VI και κυτόχρωμα c οξειδάσης 3 (COIII) περιλαμβάνοντας περισσότερα από 5.500 ζεύγη βάσεων DNA από τα περίπου 16.600 ζεύγη βάσεων που απαρτίζουν το συνολικό mtDNA της ιριδίζουσας πέστροφας. Η ανάλυση της πληθυσμιακής δομής αποκάλυψε ότι οι απλότυποι διακρίνονται σε δύο κεντρικούς κλάδους. Η συνύπαρξη απλότυπων και από τους δύο κλάδους σε όλους τους πληθυσμούς ενδέχεται να υποδηλώνει την ύπαρξη κοινής γονιδιακής δεξαμενής. Επίσης, η συνολική γενετική ποικιλότητα οφειλόταν σε σημαντικό βαθμό στην ύπαρξη ποικιλότητας ενδοπληθυσμιακά παρά στην ύπαρξη ποικιλότητας ανάμεσα στους πληθυσμούς. Το ποσοστό γενετικής ποικιλότητας ανάμεσα στους πληθυσμούς σε σύγκριση με τη συνολική παρατηρούμενη ποικιλότητα αντανακλά την πανμιξία δύο αρχικών πληθυσμών (γενεών), υπογραμμίζοντας την ύπαρξη μια κοινής δεξαμενής γονιδίων σε όλες τις εντατικές εκτροφές ιριδίζουσας πέστροφας στην Ελλάδα. Αυτό το γεγονός ενισχύεται και από το δίκτυο απλότυπων που δημιουργήθηκε και αποκάλυψε την ύπαρξη δύο αρχικών κλάδων σε όλο το φάσμα των εντατικών εκτροφών. Παράλληλα, η ταυτοποίηση και ποσοτικοποίηση των ελεύθερων αμινοξέων στο μυϊκό ιστό των ιχθύων διενεργήθηκε με τη χρήση Αντίστροφης Φάσης - Υγρής Χρωματογραφίας Υψηλής Απόδοσης (Reversed Phase – High Performance Liquid Chromatography, RP-HPLC). Τα εξεταζόμενα δείγματα παρουσίασαν διαφορετικά προφίλ ελεύθερων αμινοξέων ανάλογα με τη γεωγραφική τους προέλευση. Η Ανάλυση Κύριων Συνιστωσών (Principal Component Analysis – PCA) αποκάλυψε τον σαφή διαχωρισμό των πληθυσμών μεταξύ ανατολικής και δυτικής Ελλάδας, ο οποίος ενδέχεται να οφείλεται στην ύπαρξη διακυμάνσεων στις κλιματικές συνθήκες που επικρατούν και επηρεάζουν καταλυτικά τους αβιοτικούς παράγοντες κάθε εντατικής εκτροφής. Η γεωμετρική μορφομετρία του σώματος των ιχθύων κατέδειξε την ύπαρξη σημαντικών διαφορών μεταξύ των πληθυσμών διαφορετικής προέλευσης. Η Ανάλυση Κανονικών Μεταβλητών (Canonical Variate Analysis – CVA) διέκρινε τους πληθυσμούς σε δύο ομάδες παρουσιάζοντας σε πολύ μεγάλο βαθμό ομοιότητες με τη διενεργηθείσα πληθυσμιακή γενετική μελέτη. Η διεξαγωγή των Γενικών Γραμμικών Μοντέλων (General Linear Models – GLM) δεν επέδειξε συσχέτιση των απλότυπων και της διατροφής με το σχήμα του σώματος των ιχθύων. Εντούτοις, το σχήμα του σώματος των ιχθύων παρουσίασε σημαντική συσχέτιση με τη γεωγραφική προέλευση, τη θερμοκρασία νερού, τις γεωλογικο-χημικο-κλιματικές ζώνες, την ιστιδίνη και την αργινίνη. Επομένως, η παρατηρούμενη μορφολογική διαφοροποίηση δύναται να οφείλεται στις διαφορές των αβιοτικών παραγόντων που υφίστανται μεταξύ αυτών των ζωνών όντας το αποτέλεσμα του φαινομένου της φαινοτυπικής πλαστικότητας.Συμπερασματικά, οι αβιοτικοί παράγοντες και οι συνθήκες εκτροφής διαδραματίζουν τον κυρίαρχο ρόλο σε σύγκριση με την προέλευση του γόνου. Η παρούσα διαθεματική προσέγγιση αποτελεί ένα πολύτιμο και χρήσιμο εργαλείο στην αποτελεσματική ιχνηλασιμότητα των εντατικά εκτρεφόμενων πληθυσμών ιριδίζουσας πέστροφας, έχοντας καθοριστική συνεισφορά και προάγοντας την έρευνα σε τομείς, όπως η περιβαλλοντική ανάλυση κινδύνων για την αξιολόγηση ενδεχόμενων οικολογικών επιπτώσεων που στοχεύουν στην επίτευξη της αειφορικής διαχείρισης των ιχθυοκαλλιεργειών.

scholarly journals Protein-Based Fingerprint Analysis for the Identification of Ranae Oviductus Using RP-HPLC

Molecules ◽  
2019 ◽  
Vol 24 (9) ◽  
pp. 1687 ◽  
Author(s):  
Yuanshuai Gan ◽  
Yao Xiao ◽  
Shihan Wang ◽  
Hongye Guo ◽  
Min Liu ◽  
...  
Keyword(s):  
Clustering Analysis ◽  
High Performance ◽  
Principal Component ◽  
Reversed Phase ◽  
Ultrapure Water ◽  
Fingerprint Analysis ◽  
Rp Hplc ◽  
Significant Difference ◽  
Array Detection ◽  
Counterfeit Products

This work demonstrated a method combining reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC) with chemometrics analysis to identify the authenticity of Ranae Oviductus. The fingerprint chromatograms of the Ranae Oviductus protein were established through an Agilent Zorbax 300SB-C8 column and diode array detection at 215 nm, using 0.085% TFA (v/v) in acetonitrile (A) and 0.1% TFA in ultrapure water (B) as mobile phase. The similarity was in the range of 0.779–0.980. The fingerprint chromatogram of Ranae Oviductus showed a significant difference with counterfeit products. Hierarchical clustering analysis (HCA) and principal component analysis (PCA) successfully identified Ranae Oviductus from the samples. These results indicated that the method established in this work was reliable.

scholarly journals Determination of Phenolic Compounds in Wines

2012 ◽  
Vol 1 (1) ◽  
Author(s):  
Charalampos Proestos ◽  
Athanasios Bakogiannis ◽  
Michael Komaitis
Keyword(s):  
Phenolic Compounds ◽  
High Performance ◽  
Principal Component ◽  
Natural Antioxidants ◽  
Reversed Phase ◽  
Red Wines ◽  
Rp Hplc ◽  
Production Area ◽  
Phenolic Substances

Wine contains natural antioxidants such as phenolic compounds also known as bioactive compounds. Samples of commercially available Greek wines were analyzed in order to determine this phenolic content. For the analysis, Reversed Phase-High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) coupled with a multiwavelength Ultraviolet/visible (UV/vis) detector was used. The most abundant phenolic substances detected were (+)-catechin (13.5-72.4 mg L-1 ), gallic acid (0.40-99.47 mg L-1) and caffeic acid (0.87-33.48 mg L-1). The principal component analysis (PCA) technique was used to study differentiation among wines according to their production area. Red wines contained more phenolic substances than white ones. Differences of the phenolic composition in wines of the same cultivar were investigated too.

scholarly journals Determination of Phenolic Compounds in Wines

2012 ◽  
Vol 1 (1) ◽  
Author(s):  
Charalampos Proestos ◽  
Athanasios Bakogiannis ◽  
Michael Komaitis
Keyword(s):  
Phenolic Compounds ◽  
High Performance ◽  
Principal Component ◽  
Natural Antioxidants ◽  
Reversed Phase ◽  
Red Wines ◽  
Rp Hplc ◽  
Production Area ◽  
Phenolic Substances

Wine contains natural antioxidants such as phenolic compounds also known as bioactive compounds. Samples of commercially available Greek wines were analyzed in order to determine this phenolic content. For the analysis, Reversed Phase-High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC) coupled with a multiwavelength Ultraviolet/visible (UV/vis) detector was used. The most abundant phenolic substances detected were (+)-catechin (13.5-72.4 mg L-1 ), gallic acid (0.40-99.47 mg L-1) and caffeic acid (0.87-33.48 mg L-1). The principal component analysis (PCA) technique was used to study differentiation among wines according to their production area. Red wines contained more phenolic substances than white ones. Differences of the phenolic composition in wines of the same cultivar were investigated too.

scholarly journals Development and validation of RP-HPLC method for estimation of brexpiprazole in its bulk and tablet dosage form using Quality by Design approach

2021 ◽  
Vol 7 (1) ◽  
Author(s):  
Amol S. Jagdale ◽  
Nilesh S. Pendbhaje ◽  
Rupali V. Nirmal ◽  
Poonam M. Bachhav ◽  
Dayandeo B. Sumbre
Keyword(s):  
Flow Rate ◽  
High Performance ◽  
Reversed Phase ◽  
Hplc Method ◽  
Control Analysis ◽  
Uv Detector ◽  
Mobile Phase Flow Rate ◽  
Rp Hplc ◽  
Quality By Design Approach ◽  
Bulk Drug

Abstract Background A new, sensitive, suitable, clear, accurate, and robust reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC) method for the determination of brexpiprazole in bulk drug and tablet formulation was developed and validated in this research. Surface methodology was used to optimize the data, with a three-level Box-Behnken design. Methanol concentration in the mobile phase, flow rate, and pH were chosen as the three variables. The separation was performed using an HPLC method with a UV detector and Openlab EZchrom program, as well as a Water spherisorb C18 column (100 mm × 4.6; 5m). Acetonitrile was pumped at a flow rate of 1.0 mL/min with a 10 mM phosphate buffer balanced to a pH of 2.50.05 by diluted OPA (65:35% v/v) and detected at 216 nm. Result The developed RP-HPLC method yielded a suitable retention time for brexpiprazole of 4.22 min, which was optimized using the Design Expert-12 software. The linearity of the established method was verified with a correlation coefficient (r2) of 0.999 over the concentration range of 5.05–75.75 g/mL. For API and formulation, the percent assay was 99.46% and 100.91%, respectively. The percentage RSD for the method’s precision was found to be less than 2.0%. The percentage recoveries were discovered to be between 99.38 and 101.07%. 0.64 μg/mL and 1.95 μg/mL were found to be the LOD and LOQ, respectively. Conclusion The developed and validated RP-HPLC system takes less time and can be used in the industry for routine quality control/analysis of bulk drug and marketed brexpiprazole products. Graphical abstract

SELECTION OF COLUMN AND OPERATING CONDITIONS FOR REVERSED-PHASE HIGH-PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY OF PROTEINS IN CANADIAN WHEAT

1985 ◽  
Vol 65 (2) ◽  
pp. 285-298 ◽  
Author(s):  
J. E. KRUGER ◽  
B. A. MARCHYLO
Keyword(s):  
High Performance Liquid Chromatography ◽  
Liquid Chromatography ◽  
High Performance ◽  
Storage Proteins ◽  
Sodium Dodecyl ◽  
Reversed Phase ◽  
Operating Conditions ◽  
Protein Patterns ◽  
Optimal Separation ◽  
Rp Hplc

Chromatographic conditions were optimized and three commercially available columns were evaluated for separation of alcohol-soluble storage proteins of Neepawa wheat using reversed-phase high-performance liquid chromatography (RP-HPLC). Optimal separation was achieved using an extracting solution of 50% 1-propanol, 1% acetic acid, and 4% dithiothreitol and an HPLC elution time of 105 min at a flow rate of 1.0 mL/min. HPLC columns evaluated (SynChropak RP-P, Ultrapore RPSC and Aquapore RP-300) varied in selectivity and resolution. The column providing the greatest versatility was Aquapore RP-300 available in cartridge form. Sodium dodecyl sulfate gradient-gel electrophoresis analysis of protein peaks resolved by RP-HPLC indicated that many of the eluted peaks contained more than one protein species. Chromatographic protein patterns obtained for Neepawa wheat grown at different locations and in different years were qualitatively the same.Key words: Protein, high-performance liquid chromatography, wheat

Standardisation of Artemisia annua using Reversed Phase High Performance Liquid Chromatography (RP-HPLC).

2010 ◽  
Vol 2 (7) ◽  
pp. 142-147
Author(s):  
O. Amos Abolaji ◽  
M. Ubana Eteng ◽  
E. Patrick Ebong ◽  
Andi Brisibe ◽  
Ahmed Shakil ◽  
...  
Keyword(s):  
High Performance Liquid Chromatography ◽  
Liquid Chromatography ◽  
High Performance ◽  
Artemisia Annua ◽  
Reversed Phase ◽  
Rp Hplc

scholarly journals RP-HPLC measurement and quantitative structure - property relationship analysis of the n-octanol - water partitioning coefficients of selected metabolites of polybrominated diphenyl ethers

2008 ◽  
Vol 5 (5) ◽  
pp. 332 ◽  
Author(s):  
Yijun Yu ◽  
Weihua Yang ◽  
Zishen Gao ◽  
Michael H. W. Lam ◽  
Xiaohua Liu ◽  
...  
Keyword(s):  
Polybrominated Diphenyl Ethers ◽  
High Performance ◽  
Reversed Phase ◽  
Retention Indices ◽  
Quantitative Structure ◽  
Structure Property ◽  
Rp Hplc ◽  
Structure Property Relationship ◽  
Water Partitioning ◽  
Log Kow

Environmental context. Polybrominated diphenyl ethers (PBDEs) are ubiquitous environmental contaminants and numerous studies have demonstrated a marked increase in the levels of PBDEs in human biological tissues and fluids, especially breast milk. How PBDEs are transported through the environment, taken up by biota, transported across membranes, and metabolised depends strongly on such fundamental properties as lipophilicity (log KOW). However, very little data on log KOW exist for PBDEs. In the present paper, the authors determine PBDE metabolites’ log KOW using reversed-phase high performance liquid chromatography, as recommended by the Organisation for Economic Co-operation and Development and US Environmental Protection Agency, along with quantitative structure–property relationships. Abstract. n-Octanol–water partitioning coefficient (log KOW) values of selected hydroxylated and methoxylated polybrominated diphenyl ether metabolites were measured for the first time by reversed-phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) using a C18 stationary phase with a water/methanol mixture as a mobile phase. The retention parameters, log kw (extrapolated retention indices) and k′ (gradient retention indices) were calibrated to log KOW by a set of calibration standards. For the PBDE metabolites investigated, extrapolated retention indices from isocratic elution seem to be more reliable and their RP-HPLC-derived log KOW values were found to range from 4.63 to 7.67. Some commonly available software, including ClogP, KowWin, AclogP, MlogP, AlogP, MilogP, and XlogP, was used to estimate the log KOW values of the analytes. Significant correlations were obtained between the RP-HPLC-derived log KOW and the software-computed log KOW, with squared correlation coefficients (R2) ranging from 0.793 to 0.922, but the difference between them was also significant. Then a quantitative structure–property relationship model based on topological descriptors was established and showed good reliability and predictive power for the estimation of RP-HPLC-derived log KOW values of PBDE metabolites. It was applied to estimate the log KOW values of some PBDE metabolites that are commercially available or have appeared in the literature. Lastly, factor analysis was carried out using the theoretical linear salvation/free-energy relationships, which indicated the average polarisability (α) and the most negative atomic partial Mulliken charge in the molecule (q–) were the most important parameters affecting their partition between n-octanol and water, supporting the factorisation of log KOW in bulk and electronic terms.

BIO ANALYTICAL METHOD DEVELOPMENT AND VALIDATION FOR SIMULANEOUS ESTIMATION OF NITAZOXANIDE AND OFLOXACIN IN HUMAN PLASMA BY RP-HPLC

INDIAN DRUGS ◽  
2021 ◽  
Vol 57 (10) ◽  
pp. 47-57
Keyword(s):  
Human Plasma ◽  
High Performance ◽  
Method Development ◽  
Reversed Phase ◽  
Chromatography Method ◽  
Rp Hplc ◽  
Method Development And Validation ◽  
Liquid Chromatography Method ◽  
Development And Validation ◽  
Lower Limits

An isocratic Reversed-Phase High Performance Liquid Chromatography method has been developed for rapid and simultaneous separation and estimation of two antibiotics, namely, nitazoxanide and ofloxacin, in human plasma. Separation was carried out on Altima C8 (150 x 4.6 mm, 5µ) column using a mobile phase of 0.1% ortho phosphoric acid: acetonitrile (50:50, V/V) at 260 nm. The retention time of nitazoxanide and ofloxacin was noted to be 4.850 and 7.949 min, respectively. The average % recovery for nitazoxanide and ofloxacin were 98.012 % and 94.176 %, respectively and reproducibility was found to be satisfactory. The linearity was investigated in the concentration range of 0.02-2 µg/ml (r2=0.9996) for nitazoxanide and 0.008-0.8 µg/ml (r2=0.9998) for ofloxacin. The lower limits of quantification were 0.0196 µg/ml and 0.0079 µg/ml for nitazoxanide and ofloxacin, respectively, which reach the level of both drugs possibly found in human plasma. The proposed method can be applied for etermination of nitazoxanide and ofloxacin from dosage forms during pharmacokinetic study.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document