scholarly journals Development of genic and genomic microsatellites in Gleditsia triacanthos L. (Fabaceae) using Illumina sequencing

2017 ◽  
Vol 0 (0) ◽  
Author(s):  
Yawen Wu ◽  
Ruhua Zhang ◽  
Margaret Staton ◽  
Scott E. Schlarbaum ◽  
Mark V. Coggeshall ◽  
...  
2013 ◽  
Vol 1 (12) ◽  
pp. 1300050 ◽  
Author(s):  
Sandra A. Owusu ◽  
Margaret Staton ◽  
Tara N. Jennings ◽  
Scott Schlarbaum ◽  
Mark V. Coggeshall ◽  
...  

2015 ◽  
Vol 4 (1) ◽  
pp. 2 ◽  
Author(s):  
Chien-Chih Chen ◽  
Yi Xu ◽  
Tao Xu ◽  
Margaret Staton ◽  
Garrick Stott ◽  
...  

2019 ◽  
pp. 1-23
Author(s):  
А.В. Семенютина ◽  
С.Е. Лазарев ◽  
К.А. Мельник

Представители родовых комплексов Robinia (Робиния), Gleditsia (Гледичия) относятся к экономически важным и перспективным, для деградированных ландшафтов засушливого региона, видам растений. Несмотря на это до последнего времени отсутствуют сведения по многим видам этих родовых комплексов, связанные с вопросами экологических основ семеноведения и их репродуктивной способности в условиях светлокаштановых почв Волгоградской области. Все это направлено на выявление и расширение перспективных ареалов культивирования для лесомелиорации и озеленения населенных пунктов. Цель исследований изучение репродуктивной способности представителей родовых комплексов Robinia (Робиния), Gleditsia (Гледичия) в коллекциях ФНЦ агроэкологии РАН и выявление особенностей их селекционного семеноведения для лесомелиорации и озеленения населенных пунктов в сухостепных условиях. Объектами исследований являлись виды и формы рода Robinia: R. viscosa Vent. R. neomexicana Gray. R. pseudoacacia L. R. neomexicana х pseudoacacia, и Gleditsia (G. triacanthos L., G. triacanthos L. f. inermis, G. caspica Desf, G. texana Sarg., G. aquatica, G. japonica, G. caspica, G. sinensis), произрастающие в кластерных участках коллекций ФНЦ агроэкологии РАН, кадастр 34:34:000000:122, 34:34:060061:10. Разработка основ селекционного семеноведения базируется на изучении репродуктивных особенностей выделенных для целевого использования собственных биоресурсов с учетом возможностей всестороннего изучения генеративных качеств и оценки биологического потенциала. Выявлено, что стабильность плодоношения фиксируется через несколько лет после вступления в генеративную фазу: у Robinia и Gleditsia 67 лет. Первое цветение у Gleditsia triacanthos и G. texana, G. aquatica наблюдалось в возрасте 5 лет, G. japonica 6, G. caspica и G. sinensis 8 лет. Завязываемость плодов зависит не только от возраста растения, но и от погодных условий во время цветения. На семенную продуктивность влияет количество выпавших осадков и сумма активных температур в период созревания плодов. Формирование более крупных плодов и семян наблюдается в возрасте до 15 лет. В результате исследований (20172019 гг.) выявлено влияние лимитирующих факторов на биологический потенциал цветения, плодоношения и семенную продуктивность для определения ареалов их культивирования. Representatives of generic systems Robinia, Gleditsia are economically important and promising for degraded arid landscapes of the region, types of plants. Despite this, until recently, there is no information on many types of these generic complexes related to the environmental foundations of seed and their reproductive capacity in light chestnut soils of the Volgograd region. All this is aimed at identifying and expanding promising areas of cultivation for forest reclamation and greening of settlements. The aim of the research is to study the reproductive capacity of representatives of ancestral complexes Robinia, Gleditsia in the collections of the Federal scientific center for Agroecology Russian Academy of Sciences and the identifying features of their selection of seed for forest reclamation and landscaping of settlements in the dry steppe conditions. The objects of research were species and forms of the genus Robinia: R. viscosa Vent. R. neomexicana Gray. R. pseudoacacia L. R. neomexicana x pseudoacacia and Gleditsia (G. triacanthos L., G. triacanthos L. f. inermis, G. caspica Desf, G. texana Sarg., G. aquatica, G. japonica, G. caspica, G. sinensis), growing in the cluster areas of collections of FSC Agroecology RAS, cadastre 34:34:000000:122, 34:34:060061:10. The development of the principles of seed breeding is based on the study of reproductive characteristics of the allocated for the targeted use of their own bioresources, taking into account the possibilities of a comprehensive study of generative qualities and assessment of biological potential. It was found that the stability of fruiting is fixed a few years after entering the generative phase: Robinia and Gleditsia 67 years. The first flowering in Gleditsia triacanthos and G. texana, G. aquatica was observed at the age of 5 years, G. japonica 6, G. caspica and G. sinensis 8 years. Fruit setability depends not only on the age of the plant, but also on weather conditions during flowering. Seed productivity is affected by the amount of precipitation and the amount of active temperatures during the ripening period. The formation of larger fruits and seeds is observed in the age of 15 years. As a result of studies (20172019), the influence of limiting factors on the biological potential of flowering, fruiting and seed production to determine the areas of their cultivation was revealed.


2021 ◽  
Vol 5 (1) ◽  
Author(s):  
Aoife J. McHugh ◽  
Min Yap ◽  
Fiona Crispie ◽  
Conor Feehily ◽  
Colin Hill ◽  
...  

AbstractEfficient and accurate identification of microorganisms throughout the food chain can potentially allow the identification of sources of contamination and the timely implementation of control measures. High throughput DNA sequencing represents a potential means through which microbial monitoring can be enhanced. While Illumina sequencing platforms are most typically used, newer portable platforms, such as the Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION, offer the potential for rapid analysis of food chain microbiomes. Initial assessment of the ability of rapid MinION-based sequencing to identify microbes within a simple mock metagenomic mixture is performed. Subsequently, we compare the performance of both ONT and Illumina sequencing for environmental monitoring of an active food processing facility. Overall, ONT MinION sequencing provides accurate classification to species level, comparable to Illumina-derived outputs. However, while the MinION-based approach provides a means of easy library preparations and portability, the high concentrations of DNA needed is a limiting factor.


Data in Brief ◽  
2021 ◽  
Vol 35 ◽  
pp. 106852
Author(s):  
Felix D. Guerrero ◽  
Noushin Ghaffari ◽  
Kylie G. Bendele ◽  
Richard P. Metz ◽  
C. Michael Dickens ◽  
...  

Gene ◽  
2008 ◽  
Vol 408 (1-2) ◽  
pp. 124-132 ◽  
Author(s):  
Juan A. Subirana ◽  
Xavier Messeguer

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document