Análisis bioinformático de la proteasa ClpP de Streptococcus mutans asociada a la formación de caries dental humana
<p>Objetivo: Realizar el análisis bioinformático de la proteasa ClpP de Streptococcus mutans relacionada con su tolerancia al estrés químico durante la formación de caries dental humana. Material y métodos: Para llevar a<br />cabo este análisis se ha empleado la secuencia aminoacídica de la proteasa ClpP de S. mutans cepa UA159 obtenida a partir de la base de datos del GenBank (código de accesión Q8DST7.1), la cual fue utilizada para la determinación de sus parámetros bioquímicos, dominios conservados, predicción de estructuras secundarias y modelamiento por homología, empleando las herramientas bioinformáticas ProtParam, Prosite, PHD Secondary Structure Prediction y SWISS-MODEL, respectivamente. La visualización de modelos tridimensionales se realizó empleando PyMol. Resultados: La proteasa ClpP de S. mutans es una molécula ácida y de mediano peso molecular y además presenta dos dominios altamente conservados relacionados con endopeptidasas bacterianas. A partir de la predicción de su estructura tridimensional, la proteasa ClpP presenta<br />una conformación tetradecamérica similar a un anillo, por el cual pasarían las proteínas bacterianas que necesiten ser procesadas. Conclusión: La proteasa ClpP de S. mutans resulta importante para el proceso infectivo de esta bacteria lo cual permitirá generar una variedad de estrategias para la inhibición de la<br />colonización de la cavidad bucal.</p>