Potensi Bakteri Asal Bambu dalam Memproduksi Asam Indol Asetat (IAA)

2021 ◽  
Vol 5 (1) ◽  
pp. 72-80
Author(s):  
Maisya Zahra Al Banna ◽  
Widiastini Arifuddin
Keyword(s):  
Bacillus Cereus ◽  
Stenotrophomonas Maltophilia

Bambu dikenal sebagai memiliki kemampuan adaptif yang tinggi dalam mentoleransi perubahan ataupun cekaman lingkungan. Mikroorganisme lokal pada beberapa bagian tanaman bambu telah banyak dilaporkan dapat dimanfaatkan sebagai pupuk organik dan biokompos, namun potensi bakteri asal tanaman bambu sebagai penghasil IAA belum banyak dilaporkan. Dalam penelitian ini dilakukan isolasi bakteri rizosfer dan endofit yang berasal dari enam jenis bambu berbeda. Sampel bambu diperoleh dari kawasan hutan bambu Stasiun Mengkendek Tana Toraja. Isolat bakteri rizosfer diperoleh dari daerah sekitar perakaran tanaman bambu, sedangkan isolat bakteri endofit diperoleh dari jaringan segar akar dan rebung bambu. Dalam penelitian ini diperoleh 6 isolat bakteri rizosfer dan 12 isolat bakteri endofit. Seluruh isolat diidentifikasi bentuk sel, tipe Gram, uji biokimia, serta diukur kemampuannya dalam memproduksi IAA. Dari 18 isolat, diperoleh 12 isolat penghasil IAA. Isolat bakteri endofit mendominasi perolehan isolat penghasil IAA. Dari hasil identifikasi 16S diketahui isolat K12 memiliki kemiripan dengan Bacillus cereus dan mampu menghasilkan IAA sebesar 1.301 mg L-1, sedangkan isolat K14 memiliki kemiripan dengan Stenotrophomonas maltophilia dengan kemampuan menghasilkan IAA sebesar 2.737 mg L-1. Hasil rekonstruksi pohon filogeni menunjukkan isolat K12 memiliki kemiripan pasangan basa dengan Bacillus weidmannii, dan isolat K14 memiliki kekerabatan dengan kelompok Stenotrophomonas sp.

scholarly journals Sensitivity of Aeromonas hydrophila carbapenemase to delta3-cephems: comparative study with other metallo-beta-lactamases.

1997 ◽  
Vol 41 (4) ◽  
pp. 866-868 ◽  
Author(s):  
A Felici ◽  
M Perilli ◽  
N Franceschini ◽  
G M Rossolini ◽  
M Galleni ◽  
...  
Keyword(s):  
Comparative Study ◽  
Bacillus Cereus ◽  
Aeromonas Hydrophila ◽  
Stenotrophomonas Maltophilia ◽  
Cephalosporin C ◽  
Beta Lactamase ◽  
Beta Lactamases

Ceftriaxone and ceftriaxone S-oxide behaved as inactivators against the metallo-beta-lactamase of Aeromonas hydrophila AE036 and as substrates for the zinc beta-lactamase produced by Bacillus cereus (569/H/9) and Stenotrophomonas maltophilia ULA 511. Moreover, RO 09-1428, a catechol-cephalosporin, was not recognized by the A. hydrophila enzyme. Panipenem, cephalosporin C, cephalosporin C-gamma-lactone, and loracarbef were substrates for the three studied beta-lactamases.

scholarly journals Growth Optimization of Glyphosate-based Herbicides Utilizing Bacteria isolated from Lotic Water of Ogini Stream, Nigeria

2021 ◽  
Vol 2 (6) ◽  
pp. 1-5
Author(s):  
R. E. Aso ◽  
C. Hammuel ◽  
M. Daji ◽  
J. Briska
Keyword(s):  
Bacillus Cereus ◽  
Incubation Time ◽  
Stenotrophomonas Maltophilia ◽  
Incubation Temperature ◽  
High Capacity ◽  
Enterobacter Aerogenes ◽  
Culture Conditions ◽  
Catabolic Genes ◽  
Degrading Bacteria ◽  
Initial Ph

Glyphosate-based herbicides are often used for the control of weeds grown on agricultural fields or farms. Different health problems have been reported to be associated with the use of glyphosate-based herbicides mainly due to their toxicity level. Thus, finding glyphosate utilizing microorganisms to remediate the glyphosate-based herbicides in the environment is crucial. The culture conditions for maximum utilization of glyphosate by bacterial isolates, Stenotrophomonas maltophilia, Bacillus cereus and Enterobacter aerogenes previously isolated from Ugini stream close to corn fields treated with glyphosate-based herbicide at Ofagbe, Delta State, Nigeria were optimized using mineral salt medium containing glyphosate as carbon source. The varied culture parameters assessed were temperature (30, 37 and 40 oC), pH (5, 6, 7, 8 and 9), initial glyphosate concentration (1, 3, 5, 7 and 9 g/L) and incubation time (2-14 days). Optical density (OD) at 560 nm of the culture was used to estimate cell growth or cell load of the glyphosate utilizing bacteria strains at every 2 days for 14 days. The following optimal conditions were determined: initial pH 9.0, incubation temperature 30 °C, initial concentration of glyphosate (1g/L) and incubation time of 12 days. Of the isolates on the medium containing the herbicide as sole carbon and energy source, Bacillus cereus showed the highest growth level (OD average, 0.127, pH average, 6.26. This was followed by Stenotrophomonas maltophilia (OD average = 0.114, pH average = 6.44) and Enterobacter aerogenes (OD average = 0.100, pH average, 6.56). At the increased of glyphosate in the medium there was decreased in growth of the bacteria. Bacillus cereus, Stenotrophomonas maltophilia and Enterobacter aerogenes indicated a high capacity to be able to degrade glyphosate. It is therefore concluded that the bacteria employed in this research can be recommended for bioremediation of environments contaminated with this chemical and further research should conducted to ascertain the catabolic genes present in these individual glyphosate degrading bacteria.

scholarly journals Selection of microorganisms and preparation of inoculants with potential applications in the remediation of soil contaminated with hexazinone

2021 ◽  
Vol 51 (6) ◽  
Author(s):  
Vanessa Silva Santos ◽  
Paula Fabiane Martins ◽  
Lucélia Borgo ◽  
Paula Sperotto Alberto Faria ◽  
Cintia Faria da Silva ◽  
...  
Keyword(s):  
Bacillus Cereus ◽  
Stenotrophomonas Maltophilia ◽  
Bacillus Pumilus ◽  
Phosphate Solubilization ◽  
Main Route ◽  
Sustainable Technologies ◽  
Potential Applications ◽  
Selection Of Microorganisms ◽  
Remediation Of Soil ◽  
Selection Of

ABSTRACT: The excessive use of agrochemicals negatively impacts the environment, making the development of sustainable technologies for the reduction of contaminants in soil necessary. Hexazinone is the herbicide most used for sugarcane crops and persists in the environment. Moreover, its main route of degradation in the soil is through microorganisms. Therefore, six microorganisms were selected that presented growth in the presence of the herbicide; SCR1 - Microbacterium arborescens; SCR2 - Bacillus pumilus; SCM3 - Stenotrophomonas maltophilia; SCM4 - Bacillus cereus; SCM5A - M. arborescens; and SCM5B - B. safensis. A test was performed to evaluate the ability of each lineage in phosphate solubilization. For the Ca3(PO4)2 solubilization test, the strains that showed the best results were B. pumilus and S. maltophilia. Subsequently, the inoculants were prepared and the concentrations after plating were 2.71 × 109 CFU mL-1 for B. pumilus, 1.02 × 109 CFU mL-1 for S. maltophilia, and 1.14 × 1010 CFU mL-1 for a combination of the two strains. These were satisfactory values for use as inoculants.

scholarly journals Identification of a Series of Tricyclic Natural Products as Potent Broad-Spectrum Inhibitors of Metallo-β-Lactamases

2002 ◽  
Vol 46 (6) ◽  
pp. 1880-1886 ◽  
Author(s):  
David J. Payne ◽  
Juan Antonio Hueso-Rodríguez ◽  
Helen Boyd ◽  
Néstor O. Concha ◽  
Cheryl A. Janson ◽  
...  
Keyword(s):  
Bacillus Cereus ◽  
Natural Product ◽  
Active Site ◽  
Inhibitory Activity ◽  
Stenotrophomonas Maltophilia ◽  
Inhibitory Concentration ◽  
Converting Enzyme ◽  
Closed Conformation ◽  
Polar Interactions

ABSTRACT This work describes the discovery and characterization of a novel series of tricyclic natural product-derived metallo-β-lactamase inhibitors. Natural product screening of the Bacillus cereus II enzyme identified an extract from a strain of Chaetomium funicola with inhibitory activity against metallo-β-lactamases. SB236050, SB238569, and SB236049 were successfully extracted and purified from this extract. The most active of these compounds was SB238569, which possessed Ki values of 79, 17, and 3.4 μM for the Bacillus cereus II, Pseudomonas aeruginosa IMP-1, and Bacteroides fragilis CfiA metallo-β-lactamases, respectively, yet none of the compounds exhibited any inhibitory activity against the Stenotrophomonas maltophilia L-1 metallo-β-lactamase (50% inhibitory concentration > 1,000 μM). The lack of activity against angiotensin-converting enzyme and serine β-lactamases demonstrated the selective nature of these compounds. The crystal structure of SB236050 complexed in the active site of CfiA has been obtained to a resolution of 2.5 Å. SB236050 exhibits key polar interactions with Lys184, Asn193, and His162 and a stacking interaction with the indole ring of Trp49 in the flap, which is in the closed conformation over the active site groove. SB236050 and SB238569 also demonstrate good antibacterial synergy with meropenem. Eight micrograms of SB236050 per ml gave rise to an eightfold drop in the MIC of meropenem for two clinical isolates of B. fragilis producing CfiA, making these strains sensitive to meropenem (MIC ≤ 4 μg/ml). Consequently, this series of metallo-β-lactamase inhibitors exhibit the most promising antibacterial synergy activity so far observed against organisms producing metallo-β-lactamases.

Mikrobacsoportok herbicid-szennyvíz kombinációkkal szembeni érzékenységének vizsgálata modellkísérletben

2004 ◽  
Vol 53 (3-4) ◽  
pp. 331-342 ◽  
Author(s):  
P. Ildikó Angerer ◽  
László Ködöböcz ◽  
Borbála Biró
Keyword(s):  
Bacillus Cereus

Laboratóriumi tenyészedényes, talajinkubációs modellkísérletben tanulmányoztuk a mezogazdasági termesztés során a talajokat potenciálisan éro néhány mesterséges környezeti tényezo - az élovilágra idegen xenobiotikum-koncent-ráció (80% klór-szulfuron-tartalmú herbicid, Glean) és egy ipari melléktermék (Dunaferr kokszolói szennyvíze) - hatását a talaj mikrobiális közösségeire. A kísérletben beállított négy herbiciddózis (0,001, 0,01, 1 és 10 mg·kg-1 talaj) a mezogazdasági gyakorlatban alkalmazott koncentráció 1-, 10-, 1000- és 10000-szeresét reprezentálta. A három mintasorozat egyikét a klór-szulfuron négyféle koncentrációjával, a másikat a Dunaferr kokszolói szennyvizével, a harmadik sorozatot pedig a herbicid és szennyvíz kombinációjával kezeltük.  A kezeléseket követoen a tenyészedényeket három hétig inkubáltuk (28 oC, a szabadföldi vízkapacitás 60%-os értékén tartva). Rendszeres mintavételekkel elemeztük néhány, a talajtermékenység szempontjából fontos mikrobacsoport számszeru alakulását. Az összes heterotrof csíraszám, a szabadon élo nitrogén-kötok, a sugárgombák és a spóraképzok egy fajcsoportja, a Bacillus cereus var. mycoides kitenyésztésére szelektív, Nutrient, Kongóvörös Ashby és Arginin-glicerin agar-lemezeket alkalmaztunk. A mikrobaszámokat általunk módosított eljárással talajhígítási sorozatból állapítottuk meg és a telepképzo egységek számát 1 g száraz talajra konvertáltuk. Az átlagadatok log10-transzformált adatait ábrázoltuk, a varianciaanalízis eredményeként jelentkezo szignifikáns (P0,5%) értékeket is jelöltük. Az inkubáció során bizonyítást nyert, hogy a kitenyésztheto mikrobacsoportok érzékenysége különbözo az adott herbicid- és szennyvízadagokkal szemben. Az anyagok közötti interakció az egyes komponensek külön-külön kimutatott hatását módosíthatja, ami a vizsgálati körülmények között a kokszolói szennyvíz toxikus cián-, rodanid- és fenoltartalma miatt a kitenyésztheto mikrobaszám további csökkenésében nyilvánult meg. Legérzékenyebb mikrobacsoportnak - a korábbi eredményekkel megegyezoen - a nitrogénköto baktériumok bizonyultak. A sugárgombák és a kitenyésztett Bacillus faj csíraszámát        ugyanakkor a herbicid 0,01 mg·kg-1 mennyiségei serkentették, amely hatás a sugárgombáknál az ipari szennyvízzel való kombinációkban is fennmaradt. A mikrobacsoportok eltéro érzékenysége miatt a vizsgált talaj mikrobaközös-ségeinek az összetétele és esetleges aktivitása is módosult.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document