scholarly journals PCR-Based Genomic Deletion Analysis of RD-Regions in the Identification of Mycobacteria Isolated from Adverse Events Following BCG Vaccination or TB Suspected Cases

2014 ◽  
Vol 63 (3) ◽  
pp. 359-362 ◽  
Author(s):  
KATARZYNA KRYSZTOPA-GRZYBOWSKA ◽  
SYLWIA BRZEZIŃSKA ◽  
EWA AUGUSTYNOWICZ-KOPEĆ ◽  
EWA AUGUSTYNOWICZ ◽  
ANNA LUTYŃSKA
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Early Diagnosis ◽  
Adverse Events ◽  
Multiplex Pcr ◽  
Mycobacterium Bovis ◽  
Early Identification ◽  
Clinical Samples ◽  
Mycobacterial Species ◽  
Surveillance Studies ◽  
Pcr Multiplex

Early identification of mycobacterial species is crucial for early diagnosis. PCR-multiplex method performed on randomly chosen 54 mycobacteria isolates originating from clinical samples was found to be an inexpensive, quick and reliable alternative for commercially available diagnostics tests. Although the results of gene probes identification performed by NTLDR were generally consistent with multiplex PCR, two mixed Mycobacterium bovis BCG/Mycobacterium tuberculosis infections and a single misdiagnosis of M. tuberculosis with M. bovis were found. The routine application of multiplex-PCR has the potential to make diagnostics surveillance studies feasible.

Rapid differentiation of Mycobacterium bovis and Mycobacterium tuberculosis based on a 12.7-kb fragment by a single tube multiplex-PCR

2005 ◽  
Vol 109 (3-4) ◽  
pp. 211-216 ◽  
Author(s):  
C.S. Bakshi ◽  
D.H. Shah ◽  
Rishendra Verma ◽  
R.K. Singh ◽  
Meenakshi Malik
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Multiplex Pcr ◽  
Mycobacterium Bovis ◽  
Single Tube

scholarly journals Multiplex-PCR for differentiation of Mycobacterium bovis from Mycobacterium tuberculosis complex

2014 ◽  
Vol 45 (3) ◽  
pp. 841-843 ◽  
Author(s):  
F.L.E. Spositto ◽  
P.A.Z. Campanerut ◽  
L.D. Ghiraldi ◽  
C.Q.F. Leite ◽  
M.H. Hirata ◽  
...  
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Multiplex Pcr ◽  
Mycobacterium Bovis ◽  
Mycobacterium Tuberculosis Complex ◽  
Tuberculosis Complex

scholarly journals Five Years’ Evaluation of the BD ProbeTec System for the Direct Molecular Detection of Mycobacterium tuberculosis Complex in Respiratory and Nonrespiratory Clinical Samples

2015 ◽  
Vol 64 (4) ◽  
pp. 391-394 ◽  
Author(s):  
Can Bicmen ◽  
Onur Karaman ◽  
Ayriz T. Gunduz ◽  
Onur F. Erer ◽  
Meral Coskun ◽  
...  
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Early Diagnosis ◽  
Molecular Detection ◽  
Mycobacterium Tuberculosis Complex ◽  
Clinical Samples ◽  
Tuberculosis Complex ◽  
Predictive Values ◽  
Smear Negative ◽  
Sensitivity Specificity ◽  
Culture Negative

In this study, Mycobacterium tuberculosis complex was detected by BD ProbeTec ET system in 4716 respiratory and 167 nonrespiratory samples [mostly (98%) smear negative]. Sensitivity, specificity, positive and negative predictive values were 81.8%, 98.3, 85.1 and 97.9 for respiratory and 100%, 96.2, 64.7 and 100, for nonrespiratory samples, respectively. Among 149 (3.1%) ProbeTec DTB positive and culture negative samples, 72 (65 respiratory and seven nonrespiratory) (48.3%) were recovered from the patients who were evaluated as having TB infection. The system has been found as useful in early diagnosis of tuberculosis infection in association with the clinical, radiological and histopathological findings.

scholarly journals Evaluation of Sensitivity of Multiplex PCR for Detection of Mycobacterium tuberculosis and Pneumocystis jirovecii in Clinical Samples

2010 ◽  
Vol 48 (9) ◽  
pp. 3165-3168 ◽  
Author(s):  
S. Boondireke ◽  
M. Mungthin ◽  
P. Tan-ariya ◽  
P. Boonyongsunchai ◽  
T. Naaglor ◽  
...  
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Multiplex Pcr ◽  
Pneumocystis Jirovecii ◽  
Clinical Samples

scholarly journals Diferenciação de micobactérias por PCR multiplex

2009 ◽  
Vol 42 (6) ◽  
pp. 716-722 ◽  
Author(s):  
Diogo da Rocha Poroca ◽  
Andrea Santos Lima ◽  
Juliana Falcão de Araújo Lima ◽  
Heidi Lacerda Alves da Cruz ◽  
Rosana de Albuquerque Montenegro ◽  
...  
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Mycobacterium Bovis ◽  
Mycobacterium Avium ◽  
Mycobacterium Smegmatis ◽  
Pcr Multiplex

O trabalho visou à otimização de um método baseado na reação em cadeia da polimerase multiplex - para diferenciação de micobactérias de interesse para a saúde pública. A PCR Multiplex baseou-se na amplificação simultânea do genehsp65, presente em todo gênero Mycobacterium, do gene dnaJ, presente apenas em Mycobacterium tuberculosis e Mycobacterium avium e da sequência de inserção IS6110 presente no complexo Mycobacterium tuberculosis, gerando amplicons de 165pb, 365pb e 541pb, respectivamente. O limite de detecção foi de 1fg para o alvo hsp65, 100pg para o dnaJ e 0,1fg para o IS6110. A PCR multiplex detectou até 100pg de DNA de Mycobacterium tuberculosis. O sistema demonstrou ser específico e sensível na detecção de Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis, Mycobacterium avium e Mycobacterium smegmatis. Os resultados obtidos utilizando cepas de referência demonstraram que a PCR multiplex pode ser uma ferramenta rápida, sensível e específica na diferenciação de micobactérias.

scholarly journals Identificação e genotipagem de Mycobacterium bovis em bovinos positivos no teste intradérmico para tuberculose em Mato Grosso do Sul

2015 ◽  
Vol 35 (2) ◽  
pp. 141-147 ◽  
Author(s):  
Daniela de O. Cazola ◽  
Klaudia dos S.G. Jorge ◽  
Martín J. Zumárraga ◽  
Antônio F. Souza-Filho ◽  
Flábio R. Araújo ◽  
...  
Keyword(s):  
Mycobacterium Tuberculosis ◽  
Mycobacterium Bovis ◽  
Mato Grosso ◽  
Pcr Multiplex ◽  
Mato Grosso Do Sul ◽  
Mycobacterium Spp

Neste estudo, realizou-se genotipagem de isolados de Mycobacterium bovis, provenientes de amostras de tecidos de bovinos positivos no teste cervical comparativo (TCC) para tuberculose em Mato Grosso do Sul, por meio da técnica de spoligotyping. Tecidos de 13 bovinos positivos, oriundos de diferentes municípios do estado, foram cultivados em meio de Stonebrink. As colônias resultantes foram submetidas à coloração de Ziehl-Neelsen e todos os isolados apresentaram características tintoriais de BAAR. Os 13 isolados de BAAR foram identificados por PCR multiplex (mPCR). O gene hsp65 foi alvo para identificação de Mycobacterium spp, a sequência de inserção IS6110 foi alvo para identificação de complexo Mycobacterium tuberculosis (CMT) e a região rvd1rv2031c foi explorada para detecção de M. bovis. Os isolados micobacterianos foram genotipados pela técnica de spoligotyping. Dos 13 bovinos, sete tinham pelo menos uma lesão sugestiva de tuberculose em linfonodos retrofaríngeos, parotídeos e pulmonares ou no pulmão, e em seis não foram encontradas lesões visíveis sugestivas da doença. Na mPCR, 11/13 (84,6%) isolados foram positivos para Mycobacterium spp; 8/13 (61,5%) positivos para CMT e 7/13 (53,8%) positivos para M. bovis. Com base no spoligotyping, oito isolados de BAAR foram agrupados dentro de três diferentes agrupamentos de genótipos e uma amostra remanescente apresentou perfil único, sendo quatro isolados com padrão de espoligotipo SB0121, dois SB1145, dois SB0881 e um SB0140. A técnica de spoligotyping demonstrou que há diversidade genética entre os espoligotipos presentes no estado de Mato Grosso do Sul, embora predomine o perfil SB0121

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