Rapid detection of loss of heterozygosity of chromosome 17p by polymerase chain reaction-based variable number of tandem repeat analysis and detection of single-strand conformation polymorphism of intragenic p53 polymorphisms

1994 ◽  
Vol 424 (4) ◽  
Author(s):  
B. Dockhorn-Dworniczak ◽  
C. Poremba ◽  
R. Dantcheva ◽  
A. St�cker ◽  
E. Br�mmelkamp ◽  
...  
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Tandem Repeat ◽  
Rapid Detection ◽  
Single Strand Conformation Polymorphism ◽  
Variable Number ◽  
Chain Reaction ◽  
Repeat Analysis ◽  
Polymerase Chain ◽  
Conformation Polymorphism ◽  
P53 Polymorphisms

scholarly journals Επιδημιολογική και εργαστηριακή διερεύνηση του κοκκύτη στα παιδιά

2019 ◽  
Author(s):  
Ευαγγελία Πετρίδου
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Real Time ◽  
Tandem Repeat ◽  
Variable Number Tandem Repeat ◽  
Variable Number ◽  
Chain Reaction ◽  
Repeat Analysis ◽  
Mlva Type ◽  
Promotor Region ◽  
Polymerase Chain

ΠΕΡΙΛΗΨΗ Ο κοκκύτης είναι μια εξαιρετικά μεταδοτική λοίμωξη του αναπνευστικού, η οποία οφείλεται κυρίως στην B. pertussis. Παρά τη μακροχρόνια εφαρμογή προγραμμάτων εμβολιασμού στις αναπτυγμένες χώρες, η λοίμωξη από B. pertussis έχει αναζωπυρωθεί από τις αρχές του 21ου αιώνα. Πιθανά αίτια για την εν λόγω επανεμφάνιση αποτελούν η βελτίωση της επιτήρησης και της διάγνωσης της λοίμωξης, η φθίνουσα ανοσία, η ποικίλη αποτελεσματικότητα των ακυτταρικών εμβολίων, αλλά και η προσαρμογή του βακτηριδίου στην επαγόμενη από το εμβόλιο ανοσία. Σκοπός: Σκοπός της μελέτης ήταν η διερεύνηση της επιδημιολογικής συμπεριφοράς του κοκκύτη καθώς και η μοριακή τυποποίηση της B. pertussis με σύγχρονες τεχνικές στην πενταετία 2010 - 2015, χρονική περίοδο όπου ο εμβολιασμός στη χώρα μας για τη νόσο ήταν υποχρεωτικός και η εμβολιαστική κάλυψη υψηλή. Ασθενείς - Μέθοδοι: Η διάγνωση και η μοριακή τυποποίηση της B. pertussis έγινε σε ρινοφαρυγγικά δείγματα παιδιών, που νοσηλεύτηκαν στο Γενικό Νοσοκομείο Παίδων ‘Η Αγία Σοφία’ κατά την περίοδο 2010 - 2015. Με την real - time Polymerase Chain Reaction (PCR) ανιχνεύθηκαν οι DNA στόχοι IS481 / IS1001 / recA των B. pertussis / parapertussis / holmesii αντίστοιχα. Ο πολυμορφισμός της B. pertussis μελετήθηκε με multi - locus variable number tandem repeat analysis (MLVA) και με sequence - based typing της toxin promotor region (ptP) σε DNA θετικών δειγμάτων. Αποτελέσματα: Από τα 1150 δείγματα στα οποία διενεργήθηκε PCR, 300 ήταν θετικά για B. pertussis, 32 για B. parapertussis, ενώ κανένα δεν ήταν θετικό για B. holmesii. Το 88% των θετικών περιπτώσεων για B. pertussis ήταν νεογνά μικρότερα του ενός έτους και μόνο 12% ήταν μεταξύ 1 - 14 ετών. Η πλειονότητα των παιδιών ελληνικής εθνικότητας ήταν μικρότερα των 2 μηνών, μην έχοντας φτάσει την ηλικία εμβολιασμού, όπως ορίζεται από το Εθνικό Σύστημα Δημόσιας Υγείας της χώρας μας. Οι μειονότητες των Roma και των μεταναστών αντιπροσωπεύουν ένα μικρό ποσοστό του πληθυσμού της χώρας μας αλλά αποτέλεσαν το 50% του εξετασθέντος πληθυσμού της μελέτης μας. Και οι δύο ομάδες χαρακτηρίζονταν από χαμηλό δείκτη εμβολιαστικής κάλυψης. Ένα ολοκληρωμένο MLVA προφίλ έδωσαν 66 από τα 153 δείγματα που αναλύθηκαν. Ο B. pertussis MLVA type 27 (MT27) (n = 55/66) ήταν ο κυρίαρχος γενετικός τύπος. Το αλλήλιο ptP3 βρέθηκε σε όλα τα δείγματα που εξετάστηκαν με ptP sequencing (n = 25). Συμπεράσματα: H B. pertussis προσβάλλει με μεγάλη συχνότητα ηλικιακές και πληθυσμιακές ομάδες που είναι εμβολιαστικά ακάλυπτες. Oι ομάδες αυτές ήταν ανεμβολίαστα νεογνά < 2 μηνών καθώς και παιδιά Roma και μεταναστών, πιθανώς λόγω έλλειψης εμβολιασμού και χαμηλών κοινωνικοοικονομικών συνθηκών διαβίωσης. Κατά την περίοδο 2010 - 2015, δεν ανιχνεύθηκε καμία περίπτωση B. holmesii. Ο B. pertussis MT27 σε συνδυασμό με τον ptP3 γονότυπο είναι ο κυρίαρχος κλώνος που απαντάται μεταξύ νοσηλευόμενων Ελλήνων, Roma και μεταναστών. Τα αποτελέσματα αυτά είναι παρόμοια με άλλων χωρών που κάνουν χρήση του ακυτταρικού εμβολίου. Η γενετική ποικιλομορφία του μικροβίου είναι μικρή, λόγω της επιλεκτικής πίεσης που ασκούν σε αυτό τα ακυτταρικά εμβόλια, σε συνδυασμό με την υψηλή εμβολιαστική κάλυψη.

Rapid identification of the common apo E isoform genotype using polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP)

1994 ◽  
Vol 8 (1) ◽  
pp. 51-54 ◽  
Author(s):  
Ryoji Aozaki ◽  
Ryuji Kawaguchi ◽  
Utako Ogasa ◽  
Kazumasa Hikiji ◽  
Nobuhiko Kubo ◽  
...  
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Single Strand Conformation Polymorphism ◽  
Rapid Identification ◽  
Single Strand ◽  
Chain Reaction ◽  
Apo E ◽  
The Common ◽  
Polymerase Chain ◽  
Conformation Polymorphism

DNA-Based Typing of Human Platelet Antigen Systems by Polymerase Chain Reaction- Single-Strand Conformation Polymorphism Method

Vox Sanguinis ◽  
1995 ◽  
Vol 69 (4) ◽  
pp. 347-351
Author(s):  
Koki Fujiwara ◽  
Katsushi Tokunaga ◽  
Kazumi Isa ◽  
Masaki Miyamoto ◽  
Li Wang ◽  
...  
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Human Platelet ◽  
Single Strand Conformation Polymorphism ◽  
Single Strand ◽  
Chain Reaction ◽  
Platelet Antigen ◽  
Human Platelet Antigen ◽  
Polymerase Chain ◽  
Conformation Polymorphism

A963G single nucleotide variant of BMP15 is not common bio-marker for fecundity in goat

2016 ◽  
Author(s):  
Guang-Xin E ◽  
Yong-Fu Huang ◽  
Jian-Ning He ◽  
Wei-Wei Ni ◽  
Yong-Ju Zhao
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Single Strand Conformation Polymorphism ◽  
Single Nucleotide Variant ◽  
Chain Reaction ◽  
Single Nucleotide ◽  
Exon 2 ◽  
Morphogenetic Protein ◽  
Polymerase Chain ◽  
Bone Morphogenetic Protein 15 ◽  
Conformation Polymorphism

Bone morphogenetic protein 15 (BMP15) is crucial factor for ovulation as well as for increasing litter size. In the present investigation efforts had been carried out to assess the genetic variations in Exon 2 region of BMP15 in goat, using polymerase chain reaction single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP) sequencing methods and cooperated frequency distribution to discuss its possibility of related fecundity. Across the 144samples from six breeds were identified in the A963G location of BMP15 using PCR-SSCP and sequences technology. A963A genotype was the most frequent (85.4%) and G963G was the least frequent with a frequency of 4.2% and A963G is 10.4%. It revealed non significant different between high and low fecundity breed. Therefore, this single nucleotide variant is not common Bio-Marker for fecundity in Goat.

scholarly journals A fluorescence-based polymerase chain reaction-linked single-strand conformation polymorphism (F-PCR-SSCP) assay for the identification of Fasciola spp.

2010 ◽  
Vol 108 (6) ◽  
pp. 1513-1517 ◽  
Author(s):  
Samer Alasaad ◽  
Ramón C. Soriguer ◽  
Marawan Abu-Madi ◽  
Ahmed El Behairy ◽  
Pablo Díez Baños ◽  
...  
Keyword(s):  
Polymerase Chain Reaction ◽  
Single Strand Conformation Polymorphism ◽  
Single Strand ◽  
Chain Reaction ◽  
Polymerase Chain ◽  
Fasciola Spp ◽  
Conformation Polymorphism
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document