PCR and PCR-RFLP genotyping of Staphylococcus aureus coagulase gene: convenience compared to pulse-field gel electrophoresis

2016 ◽  
Vol 25 (5) ◽  
pp. 1061-1064 ◽  
Author(s):  
Zoubida Chadi Dendani ◽  
Pierre Bezille ◽  
Marie-Anne Arcangioli
Keyword(s):  
Staphylococcus Aureus ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis ◽  
Pcr Rflp

scholarly journals The Prevalence of Virulence Determinants and Antibiotic Resistance Patterns in Methicillin—Resistant Staphylococcus aureus in a Nursing Home in Poland

Pathogens ◽  
2021 ◽  
Vol 10 (4) ◽  
pp. 427
Author(s):  
Martyna Kasela ◽  
Agnieszka Grzegorczyk ◽  
Bożena Nowakowicz-Dębek ◽  
Anna Malm
Keyword(s):  
Staphylococcus Aureus ◽  
Methicillin Resistant Staphylococcus Aureus ◽  
Variable Number Tandem Repeat ◽  
Multidrug Resistant ◽  
Variable Number ◽  
Pulse Field ◽  
Virulence Determinants ◽  
Gene Encoding ◽  
Methicillin Resistant ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis

Nursing homes (NH) contribute to the regional spread of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA). Moreover, residents are vulnerable to the colonization and subsequent infection of MRSA etiology. We aimed at investigating the molecular and phenotypic characteristics of 21 MRSA collected from the residents and personnel in an NH (Lublin, Poland) during 2018. All MRSA were screened for 20 genes encoding virulence determinants (sea-see, eta, etb, tst, lukS-F-PV, eno, cna, ebpS, fib, bbp, fnbA, fnbB, icaADBC) and for resistance to 18 antimicrobials. To establish the relatedness and clonal complexes of MRSA in NH we applied multiple-locus variable-number tandem-repeat fingerprinting (MLVF), pulse field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence typing (MLST) and staphylococcal cassette chromosome mec (SCCmec) typing. We identified four sequence types (ST) among two clonal complexes (CC): ST (CC22) known as EMRSA-15 as well as three novel STs—ST6295 (CC8), ST6293 (CC8) and ST6294. All tested MRSA were negative for sec, eta, etb, lukS-F-PV, bbp and ebpS genes. The most prevalent gene encoding toxin was sed (52.4%; n = 11/21), and adhesins were eno and fnbA (100%). Only 9.5% (n = 2/21) of MRSA were classified as multidrug-resistant. The emergence of novel MRSA with a unique virulence and the presence of epidemic clone EMRSA-15 creates challenges for controlling the spread of MRSA in NH.

scholarly journals A simple and ranid method for preparing yeast chromosomes for Pulse Field Gel Electrophoresis

1987 ◽  
Vol 15 (16) ◽  
pp. 6749-6749 ◽  
Author(s):  
Michel Bellis ◽  
Michel Pagès ◽  
Gérard Roizès
Keyword(s):  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis

scholarly journals Chromosomal transformation in Saccharomyces cerevisiae with DNA isolated by pulse field gel electrophoresis.

1990 ◽  
Vol 54 (6) ◽  
pp. 1499-1504 ◽  
Author(s):  
Kuniyasu GOTO ◽  
Tohru MOTOYOSHI ◽  
Gakuzo TAMURA ◽  
Takaji OBATA ◽  
Shodo HARA
Keyword(s):  
Saccharomyces Cerevisiae ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis

scholarly journals Molecular Typing of Klebsiella pneumoniae Isolated from Medical Centers in Kermanshah Using Pulse Field Gel Electrophoresis

2019 ◽  
Vol In Press (In Press) ◽  
Author(s):  
Azam Elahi ◽  
Alisha Akya ◽  
Roya Chegene Lorestani ◽  
Keyghobad Ghadiri ◽  
Shokofe Baakhshii
Keyword(s):  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Molecular Typing ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis ◽  
Medical Centers

scholarly journals Optimization of Pulse-Field Gel Electrophoresis for Subtyping of Klebsiella pneumoniae

2013 ◽  
Vol 10 (7) ◽  
pp. 2720-2731 ◽  
Author(s):  
Hui Han ◽  
Haijian Zhou ◽  
Haishan Li ◽  
Yuan Gao ◽  
Zhi Lu ◽  
...  
Keyword(s):  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis

Κλινική σημασία του αποικισμού του εντέρου με στελέχη Klebsiella pneumoniae που παράγουν καρβαπενεμάσες σε ασθενείς της μονάδας εντατικής θεραπείας

2019 ◽  
Author(s):  
Κωνσταντίνα Κοντοπούλου
Keyword(s):  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Pulse Field ◽  
Diagnostic Systems ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis ◽  
Vitek 2

Σκοπός: Η ανάδειξη της κλινικής σημασίας αποικισμού του ορθού με στελέχη Klebsiella pneumoniae ανθεκτικών στις καρβαπενέμες (CRKP), με την εφαρμογή μοριακών μεθόδων στα στελέχη CRKP που απομονώθηκαν από το ορθό και το αίμα ασθενών της Μονάδας Εντατικής Θεραπείας.Υλικό – μέθοδοι: Πρόκειται για προοπτική μελέτη η οποία διεξήχθη στο Γ.Ν.Θ. «Γ.ΓΕΝΝΗΜΑΤΑΣ» κατά την διάρκεια μιας τριετίας (2011-2014). Το υλικό αποτέλεσαν 498 ασθενείς οι οποίοι νοσηλεύτηκαν το συγκεκριμένο διάστημα στην Μονάδα Εντατικής Θεραπείας. Διενεργήθηκε μονοπαραγοντική και πολυπαραγοντική ανάλυση πιθανών παραγόντων κινδύνου αποικισμού και επακόλουθης σηψαιμίας με CRKP στελέχη. Η συλλογή των επιχρισμάτων ορθού γίνονταν την ημέρα εισαγωγής και στη συνέχεια δύο φορές την εβδομάδα μέχρι την έξοδό του ασθενούς απ΄ την Μ.Ε.Θ (Θάνατος ή μεταφορά σε άλλη κλινική). Καλλιέργειες αίματος λαμβάνονταν από τους ασθενείς με κλινική υποψία σηψαιμίας σε φιαλίδια BACTEC Plus Aerobic/F, Plus Anaerobic/F and Mycosis IC/F,τα οποία επωάζονταν στο αυτοματοποιημένο σύστημα BACTEC 9120 (BD Diagnostic Systems, Sparks, MD, USA). Στα δείγματα ορθού γίνονταν έλεγχος για την ύπαρξη CRKP, με επίστρωση των δειγμάτων σε χρωμοάγαρ (chromIDCARBAprototypemedium –bioMérieux). Η ταυτοποίηση κι ο έλεγχος ευαισθησίας στους αντιμικροβιακούς παράγοντες των στελεχών CRKP ορθού και αίματος έγινε με το αυτοματοποιημένο σύστημα VITEK 2 (bioMerieux, Marcy l'Etoile, France). Σε όλα τα υποτιθέμενα απομονωμένα στελέχη CRKP, οι καρβαπενεμάσες ανιχνεύθηκαν με φαινοτυπικά τεστ (φαινυλοβορονικό οξύ και EDTA) και επιβεβαιώθηκαν με μοριακές τεχνικές PCR για γονίδια KPC, IMP και VIM, NDM και ΟΧΑ-48. Η γενετική συγγένεια στελεχών ορθού και αίματος ελέγχθηκε με ηλεκτροφόρηση παλλόμενου ηλεκτρικού πεδίου (PFGE-pulse-field gel electrophoresis) και MLST(multilocussequencetyping). Αποτελέσματα: Από το σύνολο των ασθενών, 226 αποικίστηκαν στο ορθό με στελέχη CRKP,48 από τους οποίους ανέπτυξαν σηψαιμία από αντίστοιχα στελέχη. Η διάρκεια παραμονής στη ΜΕΘ, η αναλογία ασθενών/νοσηλευτή και η προηγούμενη χρήση αντιμικροβιακών παραγόντων με αντιαναερόβια δράση, συσχετίστηκαν με τον αποικισμό οθού.Κανένας συγκεκριμένος παράγοντας δεν συσχετίστηκε με την επακόλουθη εμφάνιση σηψαιμίας.Το γονίδιο blaKPC-2 ανιχνεύθηκε σε όλα τα εξεταζόμενα στελέχη (48 ορθού και 48 αίματος) και όλα ανήκαν στον κλώνο ST-258. Με βάση τα αποτελέσματα της ηλεκτροφόρησης, τα στελέχη του αίματος ήταν γενετικά όμοια με τα αντίστοιχα του ορθού για κάθε ασθενή. Συμπεράσματα: Η μελέτη υποστηρίζει την ισχυρή συσχέτιση μεταξύ αποικισμού και σηψαιμίας, δεδομένου ότι 48 ασθενείς εμφάνισαν λοίμωξη με τα ίδια στελέχη CRKP που είχαν αποικιστεί. Ο περιορισμός της χορήγησης αντιμικροβιακών παραγόντων με αντιαναερόβια δράση, η μείωση της διάρκειας παραμονής στην ΜΕΘ και η διατήρηση ενός χαμηλού λόγου ασθενών/νοσηλευτή, είναι πιθανές στρατηγικές για τον περιορισμό του αποικισμού του ορθού με CRKP στελέχη και την μείωση της διασποράς των στελεχών αυτών.

scholarly journals In vivo selection of porin-deficient mutants of Klebsiella pneumoniae with increased resistance to cefoxitin and expanded-spectrum-cephalosporins.

1996 ◽  
Vol 40 (2) ◽  
pp. 342-348 ◽  
Author(s):  
L Martínez-Martínez ◽  
S Hernández-Allés ◽  
S Albertí ◽  
J M Tomás ◽  
V J Benedi ◽  
...  
Keyword(s):  
Klebsiella Pneumoniae ◽  
Gel Electrophoresis ◽  
Dna Analysis ◽  
Pulse Field ◽  
Transfer Resistance ◽  
Beta Lactamases ◽  
Pulse Field Gel Electrophoresis ◽  
Gene Coding ◽  
Selection Of

Four Klebsiella pneumoniae isolates (LB1, LB2, LB3, and LB4) with increased antimicrobial resistance were obtained from the same patient. The four isolates were indistinguishable in biotype, plasmid content, lipopolysaccharide, and DNA analysis by pulse-field gel electrophoresis. Isolate LB1 made TEM-1 and SHV-1 beta-lactamases. Isolates LB2, LB3, and LB4 produced SHV-5 in addition to TEM-1 and SHV-1. MICs of cefoxitin, ceftazidime, and cefotaxime against LB1 were 4, 1, and 0.06 micrograms/ml, respectively. MICs of ceftazidime against K. pneumoniae LB2, LB3, and LB4 were > 256 micrograms/ml, and those of cefotaxime were 2, 4, and 64 micrograms/ml, respectively. MICs of cefoxitin against K. pneumoniae LB2 and LB3 were 4 micrograms/ml, but that against K. pneumoniae LB4 was 128 micrgrams/ml. K. pneumoniae LB4 could transfer resistance to ceftazidime and cefotaxime, but not that to cefoxitin, to Escherichia coli. Isolate LB4 and cefoxitin-resistant laboratory mutants lacked an outer membrane protein of about 35 kDa whose molecular mass, mode of isolation, resistance to proteases, and reaction with a porin-specific antiserum suggested that it was a porin. MICs of cefoxitin and cefotaxime reverted to 4 and 2 micrograms/ml, respectively, when isolate LB4 was transformed with a gene coding for the K. pneumoniae porin OmpK36. We conclude that the increased resistance to cefoxitin and expanded-spectrum cephalosporins of isolate LB4 was due to loss of a porin channel for antibiotic uptake.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document