Identification of three SNPs in smad4 gene by tetra‐primer ARMS PCR and analysis of their associations with growth traits in gynogenetic populations of Culter alburnus

2020 ◽  
Vol 51 (10) ◽  
pp. 4043-4053
Author(s):  
Meili Chi ◽  
Yongyi Jia ◽  
Junjian Yu ◽  
Jianbo Zheng ◽  
Shili Liu ◽  
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Gene ◽  
2014 ◽  
Vol 546 (2) ◽  
pp. 206-213 ◽  
Author(s):  
Zi-nian Wang ◽  
Mi-jie Li ◽  
Xian-yong Lan ◽  
Ming-xun Li ◽  
Chu-zhao Lei ◽  
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Gene ◽  
2015 ◽  
Vol 559 (2) ◽  
pp. 184-188 ◽  
Author(s):  
Sihuan Zhang ◽  
Yonglong Dang ◽  
Qingfeng Zhang ◽  
Qiaomei Qin ◽  
Chuzhao Lei ◽  
...  


2015 ◽  
Vol 58 (1) ◽  
pp. 165-169
Author(s):  
D. Liu ◽  
Z. Wang ◽  
W. Ma ◽  
Y. Gao ◽  
A. Li ◽  
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Abstract. Nuclear receptor-interacting protein 1 (NRIP1) specifically interacts with the hormone-dependent activation domain AF2 of nuclear receptors to inhibit transcription. Previous work has demonstrated this protein to be a key regulator in modulating transcriptional activity of many transcription factors, some of which are closely related to development and growth. In this study, we have successfully genotyped two newly identified bovine NRIP1 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) (c.605A > G and c.1301G > A) using the T-ARMS-PCR method and validated the accuracy by means of PCR-RFLP assay using 1809 individuals of 9 different cattle breeds. The association analyses results indicated that c.605A > G locus was significantly associated with body weight and average daily gain in Nanyang cattle at 18 months (P < 0.05). Thus it can be inferred that T-ARMS-PCR is a rapid, reliable, and cheap method for SNP genotyping and that c.605A > G polymorphism in bovine NRIP1 is associated with growth traits. These findings will be of benefit for the application of DNA markers related to growth traits in marker-assisted selection (MAS), and will improve the promotion of beef cattle.



Author(s):  
Hayyawi W.A. Al-juthery ◽  
Estabraq Hilal Obaid Al-Maamouri

Investigating the effect of urea and nano-nitrogen fertigation and foliar application of nano B and Mo on growth and yield of potato Solanum tuberosum L. [Rivera-A]. The study was conducted in a private farm located in the Al-Taleah area - Babylon governorate. The experiment consisted of (12) treatments consisting of separated fertigation of nano nitrogen (25% N) and urea (46% N), single treatments of leaf spraying of nano Mo (5%), Nano B (9%), nano-binary combinations (Mo+B) and (U+ Nano Mo), (U+Nano B), Nano (N+Mo), Nano (N+B), and tricombination treatments of (U+Mo+B), Nano (N+Mo+B) additional to the control treatment. Randomize Complete Block Design (RCBD) and one way simple experiment with three replicates. Fertilizers were applied at levels of 40 liters h-1 of Nano-N fertilizer (25% N) and 300 kg h-1 urea fertilizer (46% N). They were sprayed early in the morning after (40) days after planting four times. Two weeks is the period between an application and another according to the recommendation of (1) kg  h-1 nano-fertilizer of (B) and (500) g h-1 of  Mo. Fertilizers were injected and sprayed at (10, 20, 30 and 40)% of the total amount of the fertilizer were applied as the first, second, third and fourth applications, respectively. Some growth traits were tested including the chlorophyll content in the leaves, the total dry vegetative yild, the soft tubers yield, and the biological yield, proteins and ascorbic acid yield compared to the control (spray water only). The results of the Duncan test showed a significant increase in most of the studied traits of nano-tricombination (N+Mo+B) in the fresh tubers yield,  dry vegetative yield  , the biological yield, starch yield ,the total protein and ascorbic yield (37.53, 1.799, 8.138,4.152 , 481.3and 653.8 meg ha-1) respectively .compare to control (21.58 , 0.890, 4.463  ,2.323 , 366.1 and 215.5 meg ha-1) respectively.





1981 ◽  
Vol 52 (2) ◽  
pp. 248-256 ◽  
Author(s):  
E. J. Pollak ◽  
R. L. Quaas


2003 ◽  
Author(s):  
◽  
Martín Carlos Abba

El Virus del Papiloma Humano (VPH) es considerado el principal factor etiológico del cáncer cervical, sin embargo han sido reconocidos múltiples co-factores tales como agentes microbianos, condiciones fisiológicas y genéticas del hospedador que determinarían el desarrollo de esta enfermedad. El objetivo principal del estudio fue evaluar las mutaciones en tres proto-oncogenes (k-ras, c-erbB-2 y c-myc), el polimorfismo en el codón 72 de gen oncosupresor p53 y del sistema HLA-DQA1 en el desarrollo de la carcinogénesis cervical, en función de la infección con el VPH, Virus del Herpes Simplex (VHS) y Chlamydia trachomatis. Se estudiaron 304 muestras cervicales clasificadas histológicamente en: 79 muestras normales (PapI/II), 36 lesiones condilomatosas, 79 lesiones intraepiteliales de bajo grado (LGSIL), 75 lesiones intraepiteliales de células escamosas de alto grado (HGSIL) y 35 carcinomas intraepitelilales de células escamosas (SCC). La detección/tipificación y carga viral del VPH se realizaron por PCR-LIS-SSCP y LS-PCR respectivamente. La detección de las infecciones por VHS y C. trachomatis se realizó por PCR específicas. Las mutaciones en el codón 12 de k-ras se detectaron por ARMS-PCR, mientras que los eventos de amplificación génica en c-erbB-2 y c-myc se analizaron por RG-PCR y LS-PCR. El polimorfismo Arg/Pro en el codón 72 de p53 se estudió por PCR alelo específica y las variantes alélicas del HLA-DQA1 se analizaron por la metodología de hibridación reversa. La prevalencia de la infección por VPH, VHS y C. trachomatis en el grupo control fue del 30%, 21% y 12% respectivamente, las cuales incrementaron significativamente según la severidad de la lesión. Los tipos virales más prevalentes del VPH fueron el tipo 16 (48%) y 6 (33%). Las infecciones con alta carga viral se encontraron particularmente asociadas a la presencia del genoma del VPH 16 y a los HGSIL/SCC. Se registro un incremento significativo en la frecuencia de mutaciones en el codón 12 de k-ras en el estadios histológicos HGSIL (21,3%), la cual se correlacionó con las infecciones con VPH de alto riesgo. Se encontraron diferencias significativas en la amplificación del gen c-erbB-2 en el estadío LGSIL (16,4%) en asociación con los tipos virales de bajo riesgo. Se detectó un incremento en la frecuencia de amplificación para c-myc en los estadios histológicos HGSIL/SCC (34-40%) en correlación con la presencia del genoma del VPH 16. No se observaron diferencias significativas entre las frecuencias genotípicas de p53 y los grupos histológicos, la infección por VPH y el resto de las variables estudiadas. El análisis del polimorfismo en el sistema HLA-DQA1 revelo un incremento significativo en la frecuencia alélica del DQA1*0101 en los LGSIL/condilomas, sugiriendo algún rol predisponente para este tipo de lesiones. La infección por VHS y C. trachomatis podrían ser consideradas como cofactores en el proceso de carcinogénesis cervical, por incrementar el riesgo de desarrollo del cáncer cervical y de las lesiones intraepiteliales de alto grado respectivamente. La activación de los proto-oncogenes estudiados sugeriría mecanismos alternativos a los conocidos por los cuales los tipos virales de alto riesgo carcinogénico podrían determinar la transformación celular.



2008 ◽  
Vol 30 (3) ◽  
pp. 329-332 ◽  
Author(s):  
Hai-Xia MAO
Keyword(s):  


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