scholarly journals Distribución geográfica del mono aullador rojo (Alouatta seniculus) y la fiebre amarilla en Colombia

Biomédica ◽  
2016 ◽  
Vol 36 ◽  
pp. 116 ◽  
Author(s):  
Juan Piedrahita-Cortés ◽  
Diego Soler-Tovar
Keyword(s):  
Alouatta Seniculus ◽  
Global Biodiversity Information Facility ◽  
El Sistema ◽  
Global Biodiversity ◽  
Distribución Geográfica ◽  
Biodiversity Information

<p><strong>Introducción.</strong> Colombia es un país con gran diversidad de primates no humanos, entre los cuales se destaca el mono aullador rojo (<em>Alouatta seniculus</em>) por su distribución y el papel que desempeña en la presentación de la fiebre amarilla.<br /><strong>Objetivo.</strong> Describir la coincidencia geográfica del hábitat del mono aullador rojo y la presencia de fiebre amarilla.<br /><strong>Materiales y métodos.</strong> Se hizo un estudio de carácter descriptivo. Los antecedentes de la fiebre amarilla en Colombia se obtuvieron de los informes y boletines del Instituto Nacional de Salud y del estudio de 2013 de Segura, et al. La presencia de A. seniculus se determinó con base en la plataforma <em>Global Biodiversity Information Facility</em> y el Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia; los mapas se elaboraron con el programa Diva-Gis, y el modelo de nicho ecológico bajo las condiciones actuales, con el programa Maxent.<br /><strong>Resultados.</strong> Los departamentos con mayor presencia de <em>A. seniculus</em> fueron Antioquia, Meta y Casanare; en 69,5 % de los departamentos con antecedentes de notificación de fiebre amarilla también había A. seniculus. El modelo de nicho ecológico evidenció que Antioquia, Bolívar, La Guajira, Magdalena, Meta, Santander, Norte de Santander y Vichada tenían porciones de territorio con un índice de probabilidad cercano a 0,9 (90 %).<br /><strong>Conclusiones.</strong> En 69,5 % de los departamentos con antecedentes de fiebre amarilla se registró la presencia de <em>A. seniculus</em>, lo cual resulta relevante por el papel que los primates no humanos desempeñan como reservorio natural del virus y por su contribución en la presentación de la fiebre amarilla, lo cual les confiere gran utilidad como centinelas.</p>

scholarly journals INVASIONES BIOLÓGICAS EN AGROECOSISTEMAS DE ECUADOR CONTINENTAL: NICHO ECOLÓGICO DE ESPECIES EXÓTICAS Y CULTIVOS AGRÍCOLAS BAJO RIESGO

2021 ◽  
Vol 26 (3) ◽  
pp. 352-364
Author(s):  
Yarelys Ferrer Sanchez ◽  
Wilmer Raúl Jacho-Saa ◽  
Juan Pablo Urdánigo Zambrano ◽  
Fernando Abasolo-Pacheco ◽  
Alexis Herminio Plasencia-Vázquez ◽  
...  
Keyword(s):  
Global Biodiversity Information Facility ◽  
Conium Maculatum ◽  
Global Biodiversity ◽  
Spondias Purpurea ◽  
Distribución Geográfica ◽  
Biodiversity Information

En Ecuador las especies exóticas invasoras (EEI) provocan consecuencias negativas en los aspectos ecológicos, económicos y de seguridad alimentaria. Los agroecosistemas hacen parte de los sectores productivos a nivel mundial, pero son vulnerables a sufrir invasiones biológicas por la constante actividad humana y por el traslado de vegetación, tierra y semillas, por lo que deben ser constantemente monitoreados, pues desempeñan un papel importante en la economía al ser fuente de empleo. El objetivo de esta investigación fue evaluar la influencia potencial de las EEI sobre los agroecosistemas de Ecuador continental a través del modelado del nicho ecológico. Se usó como método de modelación el algoritmo de máxima entropía y se emplearon los registros de presencia de seis especies de plantas y cuatro de insectos en sus regiones nativas y en zonas invadidas a nivel mundial. Los registros provienen de Global Biodiversity Information Facility y de Tropicos. Como variables explicativas se emplearon 19 variables bioclimáticas y seis variables de vegetación. Se obtuvieron los mapas de distribución geográfica potencial, las áreas de superposición de la distribución de las especies y la delimitación de las zonas de mayor riesgo. Se determinó que las condiciones ambientales de las regiones Sierra y Amazónica son idóneas para una posible invasión de seis y siete especies. Además, más del 50 % de la cobertura agropecuaria del país podría ser afectada por las especies Wasmannia rochai, Spondias purpurea L., Lissachatina fulica y Conium maculatum L., siendo los cultivos de ciclo corto los más vulnerables a la invasión por estas especies.

scholarly journals The InBIO Barcoding Initiative Database: DNA barcodes of Portuguese Diptera 01

2020 ◽  
Vol 8 ◽  
Author(s):  
Sonia Ferreira ◽  
Rui Andrade ◽  
Ana Gonçalves ◽  
Pedro Sousa ◽  
Joana Paupério ◽  
...  
Keyword(s):  
Species Level ◽  
Distribution Data ◽  
Dna Barcodes ◽  
Online Database ◽  
Global Biodiversity Information Facility ◽  
Life Data ◽  
Tagus River ◽  
Global Biodiversity ◽  
Biodiversity Information ◽  
Dipteran Species

The InBIO Barcoding Initiative (IBI) Diptera 01 dataset contains records of 203 specimens of Diptera. All specimens have been morphologically identified to species level, and belong to 154 species in total. The species represented in this dataset correspond to about 10% of continental Portugal dipteran species diversity. All specimens were collected north of the Tagus river in Portugal. Sampling took place from 2014 to 2018, and specimens are deposited in the IBI collection at CIBIO, Research Center in Biodiversity and Genetic Resources. This dataset contributes to the knowledge on the DNA barcodes and distribution of 154 species of Diptera from Portugal and is the first of the planned IBI database public releases, which will make available genetic and distribution data for a series of taxa. All specimens have their DNA barcodes made publicly available in the Barcode of Life Data System (BOLD) online database and the distribution dataset can be freely accessed through the Global Biodiversity Information Facility (GBIF).

scholarly journals Using Global Biodiversity Information Facility Occurrence Data for Automated Invasive Alien Species Risk Mapping 

2020 ◽  
Vol 4 ◽  
Author(s):  
Amy Davis ◽  
Tim Adriaens ◽  
Rozemien De Troch ◽  
Peter Desmet ◽  
Quentin Groom ◽  
...  
Keyword(s):  
Alien Species ◽  
Vascular Plants ◽  
Invasive Alien Species ◽  
Risk Assessments ◽  
Sampling Effort ◽  
Global Biodiversity Information Facility ◽  
Global Biodiversity ◽  
Risk Maps ◽  
Species Occurrences ◽  
Biodiversity Information

To support invasive alien species risk assessments, the Tracking Invasive Alien Species (TrIAS) project has developed an automated, open, workflow incorporating state-of-the-art species distribution modelling practices to create risk maps using the open source language R. It is based on Global Biodiversity Information Facility (GBIF) data and openly published environmental data layers characterizing climate and land cover. Our workflow requires only a species name and generates an ensemble of machine-learning algorithms (Random Forest, Boosted Regression Trees, K-Nearest Neighbors and AdaBoost) stacked together as a meta-model to produce the final risk map at 1 km2 resolution (Fig. 1). Risk maps are generated automatically for standard Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) greenhouse gas emission scenarios and are accompanied by maps illustrating the confidence of each individual prediction across space, thus enabling the intuitive visualization and understanding of how the confidence of the model varies across space and scenario (Fig. 2). The effects of sampling bias are accounted for by providing options to: use the sampling effort of the higher taxon the modelled species belongs to (e.g., vascular plants), and to thin species occurrences. use the sampling effort of the higher taxon the modelled species belongs to (e.g., vascular plants), and to thin species occurrences. The risk maps generated by our workflow are defensible and repeatable and provide forecasts of alien species distributions under further climate change scenarios. They can be used to support risk assessments and guide surveillance efforts on alien species in Europe. The detailied modeling framework and code are available on GitHub: https://github.com/trias-project.

Development and Deployment of an Ethnobotanical and Phytochemical Knowledge Database of Malaysia

2013 ◽  
Vol 64 (2) ◽  
Author(s):  
Shakina Mohd Talkah ◽  
Iylia Zulkiflee ◽  
Mohd Shahir Shamsir
Keyword(s):  
Scientific Literature ◽  
Pharmaceutical Compounds ◽  
South East Asia ◽  
Online Database ◽  
Global Biodiversity Information Facility ◽  
Knowledge Database ◽  
Global Biodiversity ◽  
Digital Knowledge ◽  
Biodiversity Information ◽  
Scientific Name

Currently, all the information regarding ethnobotanical, phytochemical and pharmaceutical information of South East Asia are scattered over many different publications, depositories and databases using various digital and analogue formats. Although there are taxonomic databases of medicinal plants, they are not linked to phytochemical and pharmaceutical information which are often resides in scientific literature. We present Phyknome; an ethnobotanical and phytochemical database with more than 22,000 species of ethnoflora of Asia. The creation of this database will enable a biotechnology researcher to seek and identify ethnobotanical information based on a species’ scientific name, description and phytochemical information. It is constructed using a digitization pipeline that allow high throughput digitization of archival data, an automated dataminer to mine for pharmaceutical compounds information and an online database to integrated these information. The main functions include an automated taxonomy, bibliography and API interface with primary databases such as Global Biodiversity Information Facility (GBIF). We believe that Phyknome will contribute to the digital knowledge ecosystem to elevate access and provide tools for ethnobotanical research and contributes to the management, assessment and stewardship of biodiversity. The database is available at http://mapping.fbb.utm.my/phyknome/.

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