Whole Genome Sequencing of Procyonids Reveals Distinct Demographic Histories in Kinkajou (Potos Flavus) and Northern Raccoon (Procyon Lotor)

Here we present the initial comparison of the nuclear genomes of the North American raccoon (Procyon lotor) and the kinkajou (Potos flavus) based on draft assemblies. These two species encompass almost 21 million years of evolutionary history within Procyonidae. Since assemblies greatly impact downstream results such as gene prediction and annotation, we tested three de novo assembly strategies (implemented in ALLPATHS-LG, MaSuRCA, and Platanus), some of which are optimized for highly heterozygous genomes. We discovered significant variation in contig and scaffold N50 and L50 statistics and genome completeness depending on the de novo assembler used. We compared the performance of these three assembly algorithms in hopes that this study will aid others looking to improve the quality of existing draft genome assemblies even without additional sequence data. We also estimate the demographic histories of raccoons and kinkajous using the Pairwise Sequentially Markovian Coalescent (PSMC) and discuss the variation in population sizes with respect to climatic change during the Pleistocene, as well as aspects of their ecology and taxonomy. Our goal is to achieve a better understanding of the evolutionary history of procyonids and to create robust genomic resources for future studies regarding adaptive divergence and selection.

Estudio ultrasonográfico de los órganos abdominales de la chosna (Potos flavus) mantenido en cautiverio (Lima, Perú)

El objetivo de la investigación fue realizar la evaluación ultrasonográfica de los órganos abdominales de la chosna (Potos flavus). Se evaluaron los siete individuos adultos (2 machos y 5 hembras) del zoológico “Buen Pastor” (Los Olivos, Lima). Se empleó un ecógrafo con transductor convexo de 4-9 MHz para evaluar la topografía, forma, márgenes, ecotextura, y ecogenecidad de los órganos abdominales. El bazo posee una cabeza medianamente más gruesa que el cuerpo y cola. El hígado presentó una ecogenicidad media, isoecogénico con relación al riñón e hipoecogénico con relación al bazo. El riñón derecho se encontró ligeramente más craneal que el izquierdo, presentó una corteza renal de ecogenicidad media, una médula ligeramente hiperecogénica con relación a la corteza y una relación corteza médula 2:1. La pared vesical presentó una ecotextura heterogénea con paredes pobremente definidas. Las características ecográficas de los órganos abdominales (hígado, vesícula biliar, vejiga y estómago) de P. flavus presentaron similitud con lo descrito en felinos domésticos y silvestres, así como con el coatí (Nasua nasua). Sin embargo, el bazo y riñón presentan características ecográficas propias de esta especie. Las características ecográficas del útero presentaron semejanza con las descritas en N. nasua.

Uso de cajas-nido por la guacamaya roja (Ara macao) en la región de Los Tuxtlas, Veracruz

Los nidos artificiales son una herramienta de gran potencial para recuperar poblaciones silvestres, pero han tenido respuesta variable por parte de los psitácidos. En 2014, se inició la reintroducción de la guacamaya roja, una especie en peligro de extinción, en Los Tuxtlas, Veracruz, México. Actualmente cuenta con 120 guacamayas libres que forman una nueva población silvestre. En el presente estudio exploramos la colocación de nidos artificiales como sitios de anidación para esta población reintroducida. Colocamos 17 cajas-nido de diferentes materiales, cubiertas con diversos aditivos para evitar la competencia con abejas, éstas las monitoreamos durante un total de 1496 horas en 11 meses de muestreo. Seis cajas nido tuvieron presencia constante de guacamayas, dos de ellas contenían largos trozos de viruta desprendidos con su pico, y plumas pectorales pequeñas, y otra tuvo la puesta de un huevo de guacamaya, acompañada también de plumas pectorales y timoneras. Dos de las cajas no fueron accesibles a las guacamayas por la invasión y establecimiento de colmenas de Apis mellifera, y otra fue visitada por un depredador (Potos flavus). Las cajas-nido visitadas por guacamayas se encontraban instaladas en árboles de las especies Ficus insípida y Sapium lateriflorum a una altura promedio de 20 m, con una vista periférica libre del 71.7% en los nidos ocupados. El aditivo empleado para ahuyentar abejas y el material de la caja-nido no mostraron diferencias marcadas en relación con su ocupación, aunque hay indicios de que la visibilidad periférica, la conectividad de la caja-nido y la altura en el árbol pueden ser factores para la visitación de las cajas-nido por la guacamaya roja, debido a la posible ventaja de poder vigilar el acceso de depredadores potenciales al nido, las pruebas no fueron significativas.

NUEVOS REGISTROS DE LA MARTUCHA Potos flavus (PROCYONIDAE) EN LAS TIERRAS BAJAS DE TABASCO, MÉXICO

ResumenSe reportan tres nuevos avistamientos de la martucha (Potos flavus), en el Municipio de Comalcalco, Tabasco. Se registró a una hembra y un macho en un agroecosistema de cacao (Theobroma cacao) de la localidad de Sargento López 3ª sección y un macho en la ciudad de Tecolutilla. Con estos registros e información bibliográfica se hizo un mapa de la distribución de la especie en el Tabasco. Además, se reporta el uso de las martuchas como alimento y mascota. Esta información es útil para la conservación para la especie en el estado, considerando que se encuentra bajo un estatus de protección especial por la norma oficial mexicana NOM-059-SEMARNAT-2018.Palabras clave: Comalcalco, martucha, México, nuevo registro, Potos flavus, Procyonidae, Tabasco.AbstractThree new sightings of the Martucha (Potos flavus) are reported in the Municipality of Comalcalco, Tabasco. A female and a male were registered in a cocoa agroecosystem (Theobroma cacao) in the town of Sargento López, 3rd. section and a male in the city of Tecolutilla. With these records and bibliographic information, a map of the distribution of the species in Tabasco was made. In addition, the use of hammerheads as food and pet is reported. This information is useful for conservation for the species in the state, considering that it is under a special protection status by the official Mexican standard NOM-059-SEMARNAT-2018.Key words: Comalcalco, martucha, Mexico, new record, Potos flavus, Procyonidae, Tabasco.