A CysB-regulated and σ54-dependent regulator, SfnR, is essential for dimethyl sulfone metabolism of Pseudomonas putida strain DS1

Microbiology ◽  
2003 ◽  
Vol 149 (4) ◽  
pp. 991-1000 ◽  
Author(s):  
Takayuki Endoh ◽  
Hiroshi Habe ◽  
Takako Yoshida ◽  
Hideaki Nojiri ◽  
Toshio Omori
2008 ◽  
Vol 190 (13) ◽  
pp. 4521-4531 ◽  
Author(s):  
Atsushi Kouzuma ◽  
Takayuki Endoh ◽  
Toshio Omori ◽  
Hideaki Nojiri ◽  
Hisakazu Yamane ◽  
...  

ABSTRACT Pseudomonas putida DS1 is able to utilize dimethyl sulfone as a sulfur source. Expression of the sfnFG operon responsible for dimethyl sulfone oxygenation is directly regulated by a σ54-dependent transcriptional activator, SfnR, which is encoded within the sfnECR operon. We investigated the transcription mechanism for the sulfate starvation-induced expression of these sfn operons. Using an in vivo transcription assay and in vitro DNA-binding experiments, we revealed that SfnR negatively regulates the expression of sfnECR by binding to the downstream region of the transcription start point. Additionally, we demonstrated that a LysR-type transcriptional regulator, CysB, directly activates the expression of sfnECR by binding to its upstream region. CysB is a master regulator that controls the sulfate starvation response of the sfn operons, as is the case for the sulfonate utilization genes of Escherichia coli, although CysBDS1 appeared to differ from that of E. coli CysB in terms of the effect of O-acetylserine on DNA-binding ability. Furthermore, we investigated what effector molecules repress the expression of sfnFG and sfnECR in vivo by using the disruptants of the sulfate assimilatory genes cysNC and cysI. The measurements of mRNA levels of the sfn operons in these gene disruptants suggested that the expression of sfnFG is repressed by sulfate itself while the expression of sfnECR is repressed by the downstream metabolites in the sulfate assimilatory pathway, such as sulfide and cysteine. These results indicate that SfnR plays a role independent of CysB in the sulfate starvation-induced expression of the sfn operons.


2004 ◽  
Vol 53 (3-4) ◽  
pp. 367-376 ◽  
Author(s):  
A. A. Khalif ◽  
H. Abdorhim ◽  
Hosam E. H. T. Bayoumi ◽  
Anna Füzy ◽  
Mihály Kecskés

Üvegházi körülmények között savanyú barna erdotalajban nevelt fehér here (Trifolium repens L.) növények rizoszférájának sókezelés hatására bekövetkezo változását ellenoriztük. Megvizsgáltuk a különbözo sókoncentrációknak (0, 0,2, 0,4, 0,6 és 0,8 tömeg %) a baktériumnépesség összetételére és a különbözo talajenzimek aktivitására gyakorolt hatását.  Megállapítottuk, hogy a talaj sótartalma közvetlenül befolyásolta a rizoszférában található fluoreszkáló pszeudomonaszok csíraszámát. A legsurubb populáció a 0,2% NaCl-ot tartalmazó talajban volt mérheto, ahol a fluoreszkáló pszeudomonaszok között a Pseudomonas putida és a P. fluorescens fordultak elo a legnagyobb számban. A pszeudomonaszok ily módon jól tolerálják a talaj magas NaCl-tartalmát, és gyökérkolonizáló tevékenységet képesek kifejteni a magas NaCl-tartalmú talajban is. A sókoncentráció növelésével kezdetben (a 0,2-0,4%-os tartományban) jelentosen növekedett a dehidrogenáz, kataláz, és ureáz enzimek aktivitása. A proteáz enzimek aktivitásmaximuma a 0,1-0,2% NaCl-koncentráció tartományba esett. A 0,4%-nál magasabb koncentrációkban a kontrollhoz hasonló mértékure csökkent mind a négy enzim aktivitása, és a baktériumok száma is. A foszfatáz- és a b-glükozidáz-tevékenység viszont a NaCl-dózis növelése következtében a koncentrációval arányosan, jelentosen csökkent a kontrollhoz viszonyítva.  Feltételezésünk szerint az enzimaktivitások változását is a sókezelés hatására bekövetkezo mikrobióta összetételének megváltozása okozta.


2003 ◽  
Author(s):  
Charles Thomas Parker ◽  
Dorothea Taylor ◽  
George M Garrity
Keyword(s):  

2020 ◽  
Vol 13 (2) ◽  
pp. 83-92 ◽  
Author(s):  
A. Adam

SummaryEnhancement of the resistance level in plants by rhizobacteria has been proven in several pathosystems. This study investigated the ability of four rhizobacteria strains (Pseudomonas putida BTP1 and Bacillus subtilis Bs2500, Bs2504 and Bs2508) to promote the growth in three barley genotypes and protect them against Cochliobolus sativus. Our results demonstrated that all tested rhizobacteria strains had a protective effect on barley genotypes Arabi Abiad, Banteng and WI2291. However, P. putida BTP1 and B. subtilis Bs2508 strains were the most effective as they reduced disease incidence by 53 and 38% (mean effect), respectively. On the other hand, there were significant differences among the rhizobacteria-treated genotypes on plant growth parameters, such as wet weight, dry weight, plant height and number of leaves. Pseudomonas putida BTP1 strain was the most effective as it significantly increased plant growth by 15-32%. In addition, the susceptible genotypes Arabi Abiad and WI2291 were the most responsive to rhizobacteria. This means that these genotypes have a high potential for increase of their resistance against the pathogen and enhancement of plant growth after the application of rhizobacteria. Consequently, barley seed treatment with the tested rhizobacteria could be considered as an effective biocontrol method against C. sativus.


Author(s):  
Nguyễn Thỵ Đan Huyền ◽  
Lê Thanh Long ◽  
Trần Thị Thu Hà ◽  
Nguyễn Cao Cường ◽  
Nguyễn Hiền Trang
Keyword(s):  

Chủng T1 phân lập từ các mẫu ngô nếp NK66 nhiễm nấm mốc tự nhiên được sử dụng để nghiên cứu khả năng kháng nấm của dịch chiết vi khuẩn Pseudomonas putida 199B. Đặc điểm hình thái của chủng T1 đã được quan sát đại thể (màu sắc, hình dáng, kích thước khuẩn lạc) trên môi trường PDA và vi thể (hình dáng bào tử) trên kính hiển vi kết hợp so sánh với loài Aspergilus flavus đối chứng. Kết quả phân tích trình tự gen mã hóa 28S rRNA của chủng T1 cho thấy sự tương đồng trình tự cao với các trình tự tương ứng của loài Aspergilus flavus trên ngân hàng gen. Kết quả khảo sát ảnh hưởng của dịch chiết vi khuẩn P. putida lên sự phát triển của nấm A.  flavus gây bệnh trên hạt ngô sau thu hoạch và bảo quản ở điều kiện in vitro cho thấy, ở nồng độ P. putida 24% đã ức chế 74,50% sự phát triển đường kính tản nấm sau 10 ngày nuôi cấy, ức chế 79,63% sự hình thành sinh khối sợi nấm sau 7 ngày nuôi cấy. Ở điều kiện in vivo, sự nảy mầm của hạt giống ngô sau 30 ngày được tạo màng bao sinh học bằng dịch chiết vi khuẩn P. putida nồng độ 18% đạt 97,91%, tỉ lệ hạt nhiễm nấm mốc giảm còn 20% so với 72% ở mẫu đối chứng.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document