scholarly journals Draft Genome Sequences of Pantoea agglomerans, Paenibacillus polymyxa, and Pseudomonas sp. Strains, Seed Biogel-Associated Endophytes of Cucumis sativus L. (Cucumber) and Cucumis melo L. (Cantaloupe)

2020 ◽  
Vol 9 (32) ◽  
Author(s):  
Eman M. Khalaf ◽  
Manish N. Raizada
Keyword(s):  
Cucumis Sativus ◽  
Cucumis Melo ◽  
Draft Genome ◽  
Paenibacillus Polymyxa ◽  
Pantoea Agglomerans ◽  
Genome Sequences ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Content Type ◽  
Cucumis Melo L

ABSTRACT We report here the draft genome sequences of strains of Pantoea agglomerans (EKM10T, EKM20T, EKM21T, and EKM22T), Paenibacillus polymyxa (EKM10P and EKM11P), and Pseudomonas sp. strain EKM23D. These microbes were cultured from fresh seed biogels of Cucumis sativus L. (cucumber) and Cucumis melo L. (cantaloupe). The strains suppress the growth of soilborne fungal/oomycete phytopathogens in vitro.

scholarly journals Draft Genome Sequences of Six Strains of Lactococcus lactis (Phylum Firmicutes), Spanning the Seeds of Cucumis sativus L. (Cucumber), Cucumis melo L. (Cantaloupe), and Cucurbita pepo var. turbinate (Acorn Squash)

2020 ◽  
Vol 9 (37) ◽  
Author(s):  
Eman M. Khalaf ◽  
Manish N. Raizada
Keyword(s):  
Cucumis Sativus ◽  
Lactococcus Lactis ◽  
Cucumis Melo ◽  
Cucurbita Pepo ◽  
Draft Genome ◽  
Genome Sequences ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Content Type ◽  
Cucumis Melo L

ABSTRACT We announce the draft genome sequences of six strains of Lactococcus lactis (EKM101L, EKM102L, EKM201L, EKM203L, EKM501L, and EKM502L). These candidate plant probiotics were isolated from surface-sterilized seeds of Cucumis sativus L. (cucumber), Cucumis melo L. (cantaloupe), and Cucurbita pepo var. turbinate (acorn squash). They display beneficial activities, including biocontrol.

scholarly journals Draft Genome Sequences of Seven Strains of Paenibacillus spp. (Phylum Firmicutes) Inhabiting the Seeds of Cucumis melo L. (Cantaloupe) and Exhibiting Plant Probiotic Traits

2020 ◽  
Vol 9 (34) ◽  
Author(s):  
Eman M. Khalaf ◽  
Manish N. Raizada
Keyword(s):  
Cucumis Melo ◽  
Draft Genome ◽  
Suppressive Activity ◽  
Genome Sequences ◽  
Growth Promoting ◽  
Cucumis Melo L

ABSTRACT Here, we report the draft genome sequences of seven Paenibacillus sp. strains (EKM202P, EKM205P, EKM206P, EKM207P, EKM208P, EKM211P, and EKM212P) that were previously isolated from cultivated surface-sterilized seeds of Cucumis melo L. (cantaloupe). These candidate Paenibacillus plant probiotics displayed in vitro growth-promoting traits and suppressive activity against root-associated fungal/oomycete pathogens.

scholarly journals Steroids from Cucumis Melo L. var. Makuwa MAKINO and Cucumis sativus L.

1970 ◽  
Vol 18 (1) ◽  
pp. 213-216 ◽  
Author(s):  
HIROMI TERAUCHI ◽  
SHOJI TAKEMURA ◽  
YOSHIKO KAMIYA ◽  
YOSHIO UENO
Keyword(s):  
Cucumis Sativus ◽  
Cucumis Melo ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Cucumis Melo L

scholarly journals Draft genome sequences of two oriental melons, Cucumis melo L. var. makuwa

2019 ◽  
Vol 6 (1) ◽  
Author(s):  
Ah-Young Shin ◽  
Namjin Koo ◽  
Seungill Kim ◽  
Young Mi Sim ◽  
Doil Choi ◽  
...  
Keyword(s):  
Cucumis Melo ◽  
Draft Genome ◽  
Biological Properties ◽  
Genome Sequences ◽  
Functional Studies ◽  
Oriental Melon ◽  
Horticultural Traits ◽  
Northeast Asian ◽  
Cucumis Melo L ◽  
Reference Genomes

Abstract Oriental melon (Cucumis melo L. var. makuwa) is one of the most important cultivated cucurbits, and is grown widely in Northeast Asian countries. With increasing interest in its biological properties and economic importance, oriental melon has become an attractive model crop for studying various horticultural traits. A previous genome sequence of the melon was constructed from a homozygous double-haploid line. Thus, individual reference genomes are required to perform functional studies and further breeding applications. Here, we report draft genome sequences of two oriental melons, Chang Bougi and SW3. The assembled 344 Mb genome of Chang Bougi was obtained with scaffold N50 1.0 Mb, and 36,235 genes were annotated. The 354 Mb genome of SW3 was assembled with scaffold N50 1.6 Mb, and has 38,173 genes. These newly constructed genomes will enable studies of fruit development, disease resistance, and breeding applications in the oriental melon.

scholarly journals Especies de plantas visitadas por abejas pecoreadoras durante la inducción de polinización en melón.

2009 ◽  
Vol 25 (3) ◽  
Author(s):  
José Luis Reyes-Carrillo ◽  
Frank A. Eischen ◽  
Pedro Cano-Rios ◽  
Rafael Rodríguez-Martínez ◽  
Urbano Nava-Camberos
Keyword(s):  
Apis Mellifera ◽  
Medicago Sativa ◽  
Cucumis Sativus ◽  
Cucumis Melo ◽  
Larrea Tridentata ◽  
Prosopis Juliflora ◽  
Sorghum Vulgare ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Medicago Sativa L ◽  
Cucumis Melo L

El objetivo de la investigación fue determinar, a través de la identificación del polen corbicular, las diferentes especies de plantas que son visitadas por las abejas (Apis mellifera L.) durante la polinización inducida del melón (Cucumis melo L.). El trabajo se llevó a cabo en La Laguna ocalizada en los estados de Coahuila y Durango, México en la primavera del 2003. Durante los primeros 31 días de la floración del melón, un campo de seis hectáreas fue polinizada por 18 colmenas, nueve de las cuales tenía una trampa para captura de polen. El polen fue colectado dos veces por semana, pesado y congelado. Durante el año se colectaron anteras de plantas silvestres y cultivadas en floración alrededor del cultivo y en la región para preservarlas e identificar su polen usando la técnica de acetolisis. El polen corbicular, muestreado los días 5°, 9°, 12°, 20°, 24° y 31° contados a partir del inicio de la aparición de las flores estaminadas, fue procesado y contado en el microscopio óptico. El tamaño del polen fue calculado mediante la fórmula: volumen V=πa2b donde “a” es el eje mayor y “b” el eje menor y multiplicado por el número de granos de polen se obtuvo el volumen total. El polen de melón fue el 8.7 %, 9.8%, 17.6 %, 9.3 %, 28.1% y 83.5% del colectado (en base al número de granos) respectivamente en las fechas de muestreo. El porcentaje del polen de melón en base al volumen fue: 51.6%, 85.0%, 66.6 %, 84.4 %, 68.9% y 95.0% respectivamente. Se concluye que el melón fue la principal planta visitada por las abejas como fuente de polen y que las especies de plantas con mayor número de granos de polen presentes en las muestras como mezquite (Prosopis juliflora (Swartz) DC.), alfalfa (Medicago sativa L.), gobernadora (Larrea tridentata (DC) Cov.), pepino (Cucumis sativus L.), mostacilla (Sysimbrium irio L.) y sorgo (Sorghum vulgare L.) fueron especies visitadas como fuentes suplementarias de polen.

scholarly journals Colonización endofítica del hongo nematófago Pochonia chlamydosporia en cultivos de Solanaceae y Cucurbitaceae

2021 ◽  
pp. 779-789
Author(s):  
Wilson Geobel Ceiro-Catasú ◽  
Jersys Arévalo-Ortega ◽  
Leopoldo Hidalgo-Díaz
Keyword(s):  
Capsicum Annuum ◽  
Cucumis Sativus ◽  
Cucumis Melo ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Pochonia Chlamydosporia ◽  
Capsicum Annuum L ◽  
Cucumis Melo L

Introducción. Las especies fúngicas del género Pochonia son importantes para el manejo de nematodos fitoparásitos. Algunas de ellas colonizan en forma endófita a sus hospedantes vegetales y les proporcionan adaptabilidad, bio-estimulación vegetal e inducción de resistencia; dichas ventajas son esenciales para la selección de cepas a utilizar en el bio-manejo de fitonematodos. Objetivo. Evaluar la colonización endofítica y la bio-estimulación vegetal por las cepas nematófagas IMI SD 187 y 193 de P. chlamydosporia sobre especies hortícolas de las familias Solanaeceae y Cucurbitaceae. Materiales y métodos. El experimento se realizó dentro de invernaderos en el Centro Nacional de Sanidad Agropecuaria, provincia Mayabeque, Cuba. Se utilizaron dos cepas de P. chlamydosporia, denominadas IMI SD 187 y 193, así como tomate (S. lycopersicum) cv. HA 3057, pimiento (Capsicum annuum L.) cv. Grandísimo, pepino (Cucumis sativus L.) cv. INIVIT P 2007 y melón (Cucumis melo L.) cv. Zest F1. En ambas cepas se evaluó la colonización endofítica, del sustrato y de la raíz, así como algunos parámetros del crecimiento de las plantas. Resultados. Las cepas evaluadas colonizaron entre 3 y 16 % el interior de las raíces. La cepa IMI SD 187 colonizó a todas las especies evaluadas, mientras que 193 no pudo colonizar al melón; sin embargo, ambas cepas colonizaron la raíz y el sustrato con valores entre 2x103 y 2x104 UFC g-1, respectivamente. IMI SD 187 alcanzó los mayores valores de bio-estimulación en longitud y masa fresca de las raíces en pimiento. Conclusión. Las dos cepas autóctonas de P. chamydosporia colonizaron a las especies estudiadas y la mayor bio-estimulación del crecimiento se obtuvo con IMI SD 187 en el cultivar de pimiento.

Comparative mapping of ZYMV resistances in cucumber (Cucumis sativus L.) and melon (Cucumis melo L.)

2004 ◽  
Vol 109 (4) ◽  
pp. 707-712 ◽  
Author(s):  
Y. Park ◽  
N. Katzir ◽  
Y. Brotman ◽  
J. King ◽  
F. Bertrand ◽  
...  
Keyword(s):  
Cucumis Sativus ◽  
Comparative Mapping ◽  
Cucumis Melo ◽  
Cucumis Sativus L ◽  
Cucumis Melo L

scholarly journals Draft Genome Sequences of Acinetobacter sp. Strain EKM10A, Enterobacter hormaechei EKM10E, and Enterobacter hormaechei EKM11E (Phylum Proteobacteria) Colonizing the Seed Surface Biogel of Echinocystis lobata (Wild Cucumber)

2020 ◽  
Vol 9 (20) ◽  
Author(s):  
Eman M. Khalaf ◽  
Manish N. Raizada
Keyword(s):  
Draft Genome ◽  
Genome Sequences ◽  
Content Type ◽  
Seed Surface ◽  
Enterobacter Hormaechei ◽  
Acinetobacter Sp ◽  
Echinocystis Lobata

Here, we report the draft genome sequences of Acinetobacter sp. strain EKM10A, Enterobacter hormaechei EKM10E, and Enterobacter hormaechei EKM11E, containing 3,978,352, 4,760,222, and 4,758,163 bp, respectively. These seed biogel-associated endophytes were previously isolated from the seed wash of Echinocystis lobata (wild cucumber) and tested in vitro for antagonism against soilborne fungal/oomycete pathogens.

scholarly journals Whole-Genome Sequences of Pantoea agglomerans BL3, Pseudomonas fluorescens BL, and Pseudomonas stutzeri CM14, Isolated from Hops (Humulus lupulus)

2019 ◽  
Vol 8 (30) ◽  
Author(s):  
Joseph L. Sevigny ◽  
Breana Lloyd ◽  
Catherine McComish ◽  
Alexis Ramsey ◽  
Lori Koziol
Keyword(s):  
Pseudomonas Fluorescens ◽  
Draft Genome ◽  
Pseudomonas Stutzeri ◽  
Humulus Lupulus ◽  
Pantoea Agglomerans ◽  
Whole Genome ◽  
Genome Sequences ◽  
Content Type

Pseudomonas stutzeri CM14, Pseudomonas fluorescens BL, and Pantoea agglomerans BL3 were isolated from Humulus lupulus cones. Here, we present the draft genome sequences of three bacteria that have been associated with hop plants.

scholarly journals Draft Genome Sequences of Pantoea agglomerans Strains BD1274 and BD1212, Isolated from Onion Seeds, Reveal Major Differences in Pathogenicity and Functional Genes

2020 ◽  
Vol 9 (45) ◽  
Author(s):  
Valery M. Moloto ◽  
Teresa Goszczynska ◽  
Ahmed Idris Hassen ◽  
Rian Pierneef ◽  
Teresa Coutinho
Keyword(s):  
Allium Cepa ◽  
Draft Genome ◽  
Pantoea Agglomerans ◽  
Disease Symptom ◽  
Functional Genes ◽  
Comparative Genomic ◽  
Genome Sequences ◽  
Content Type ◽  
Genomic Study ◽  
Comparative Genomic Study

ABSTRACT Pantoea agglomerans strains BD1274 and BD1212 were isolated from Allium cepa seeds. Strain BD1274 induced a disease symptom on a healthy onion, whereas strain BD1212 did not and remains nonpathogenic. A comparative genomic study revealed that the strains differ in their genomic compositions, particularly in the genes that confer pathogenicity.

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