Exemplar Abstract for Bacillus paralicheniformis Dunlap et al. 2015.

2003 ◽  
Author(s):  
Charles Thomas Parker ◽  
George M Garrity
2021 ◽  
Vol 11 (1) ◽  
Author(s):  
Soad A. Abdelgalil ◽  
Nadia A. Soliman ◽  
Gaber A. Abo-Zaid ◽  
Yasser R. Abdel-Fattah

AbstractTo meet the present and forecasted market demand, bacterial alkaline phosphatase (ALP) production must be increased through innovative and efficient production strategies. Using sugarcane molasses and biogenic apatite as low-cost and easily available raw materials, this work demonstrates the scalability of ALP production from a newfound Bacillus paralicheniformis strain APSO isolated from a black liquor sample. Mathematical experimental designs including sequential Plackett–Burman followed by rotatable central composite designs were employed to select and optimize the concentrations of the statistically significant media components, which were determined to be molasses, (NH4)2NO3, and KCl. Batch cultivation in a 7-L stirred-tank bioreactor under uncontrolled pH conditions using the optimized medium resulted in a significant increase in both the volumetric and specific productivities of ALP; the alkaline phosphatase throughput 6650.9 U L−1, and µ = 0.0943 h−1; respectively, were obtained after 8 h that, ameliorated more than 20.96, 70.12 and 94 folds compared to basal media, PBD, and RCCD; respectively. However, neither the increased cell growth nor enhanced productivity of ALP was present under the pH-controlled batch cultivation. Overall, this work presents novel strategies for the statistical optimization and scaling up of bacterial ALP production using biogenic apatite.


2018 ◽  
Vol 66 (49) ◽  
pp. 13011-13019 ◽  
Author(s):  
Qingtao Liu ◽  
Xinhui Yao ◽  
Qixing Liang ◽  
Jianghua Li ◽  
Fang Fang ◽  
...  

Nova Scientia ◽  
2020 ◽  
Vol 12 (24) ◽  
Author(s):  
Jonathan Rojas Padilla ◽  
Luis Abraham Chaparro Encinas ◽  
Rosa Icela Robles Montoya ◽  
Sergio De los Santos Villalobos

Introducción: Las rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (RPCV) son un grupo de bacterias rizosféricas con la habilidad de promover el crecimiento y la salud de las plantas, y restaurar la fertilidad del suelo. El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la promoción del crecimiento en el cultivo de trigo (Triticum turgidum L. subsp. durum) por la co-inoculación de cepas nativas del género Bacillus aisladas del Valle del Yaqui, México, para su potencial uso como inoculante microbiano.Método: Tres cepas bacterias obtenidas de la Colección de Microorganismos Edáficos y Endófitos Nativos (COLMENA), aisladas del cultivo de trigo en el Valle del Yaqui, fueron estudiadas. Primeramente, se realizó la identificación molecular de las cepas mediante la secuenciación del gen 16S RNAr, mediante la plataforma Sanger. Además, las cepas bacterianas fueron caracterizadas metabólicamente mediante actividades funcionales asociadas a la promoción del crecimiento vegetal (producción de indoles, solubilización de fósforo insoluble, y producción de sideróforos). Finalmente, el impacto de la inoculación de estas cepas individualmente, y en consorcios fue determinado utilizando el cultivo de trigo (Triticum turgidum L subsp. durum) como planta modelo, simulando las condiciones edafo-climáticas del Valle del Yaqui. Las variables morfométricas medidas fueron la longitud aérea y de raíz, peso seco aéreo y de raíz, e índice de biovolumen.Resultados: Las cepas TRQ8, TRQ65 y TE3T fueron afiliadas taxonómicamente a Bacillus megaterium, Bacillus paralicheniformis y Bacillus cabrialesii, respectivamente; dicha clasificación fue soportada por sus características macro-microscópica como: su forma bacilar y tinción Gram positiva, que son características propias de este género bacteriano. Las cepas en estudio tuvieron la capacidad de producir indoles, siendo B. paralicheniformis TRQ65 quien presentó mayor producción con 39.29 µg/mL. Mientras que en la prueba de solubilización de fósforo insoluble las 3 cepas mostraron la capacidad en un rango de índice de solubilización de 1.37 a 1.43; finalmente, solamente la cepa B. megaterium TRQ8 mostró un índice de producción de sideróforos de 8.17. La inoculación del consorcio B. megaterium TRQ8 + B. paralicheniformis TRQ65 mostró los mayores incrementos en las 5 variables medidas en la planta, diferencia significativa (p<0.05) vs. el tratamiento no inoculado, la longitud aérea y radical mostró un incremento de 6 y 10% respectivamente, mientras que la biomasa seca aérea aumentó 60% y la biomasa seca radicular se incrementó en 82%. El índice de biovolumen se incrementó en 18% por la inoculación de dicho consorcio bacteriano.Discusión o Conclusión: Las cepas estudiadas presentan características de promoción de crecimiento in vitro e in vivo. Sin embargo, la co-inoculación de B. megaterium TRQ8 y B. paralicheniformis TRQ65 incrementó su capacidad de promoción del crecimiento en plantas de trigo. Por lo cual, los mecanismos asociados a dicho efecto, así como sus funciones ecológicas e interacción con los factores bióticos y abióticos de los agro-sistemas deben ser estudiadas para su validación en diferentes agroecosistemas, antes de su utilización extensiva como un inoculante microbiano.


2019 ◽  
Vol 86 (1) ◽  
pp. 153-161 ◽  
Author(s):  
Di Zhao ◽  
Shangong Wu ◽  
Wenwen Feng ◽  
Ivan Jakovlić ◽  
Ngoc Tuan Tran ◽  
...  

2017 ◽  
Vol 5 (25) ◽  
Author(s):  
Yun Wang ◽  
Hu Liu ◽  
Kai Liu ◽  
Chengqiang Wang ◽  
Hailin Ma ◽  
...  

ABSTRACT Bacillus paralicheniformis MDJK30 was isolated from the rhizosphere of a peony. It could control the pathogen of peony root rot. Here, we report the complete genome sequence of B. paralicheniformis MDJK30. Eleven secondary metabolism gene clusters were predicted.


2017 ◽  
Vol 5 (43) ◽  
Author(s):  
Jong-Hoon Lee ◽  
Do-Won Jeong

ABSTRACT Bacillus paralicheniformis 14DA11, exhibiting resistance to clindamycin and erythromycin, was isolated from a Korean fermented soybean food product. The complete genome of strain 14DA11 includes genes that potentially contribute to the antibiotic resistance.


Biotecnia ◽  
2019 ◽  
Vol 21 (3) ◽  
pp. 100-107
Author(s):  
Bernanrdo Espinosa-Palomeque ◽  
Pedro Cano-Ríos ◽  
Lilia Salas-Pérez ◽  
José Luis García-Hernández ◽  
Pablo PreciadoRangel ◽  
...  

El objetivo del presente estudio fue evaluar dos rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal [RPCV (Bacillus paralicheniformis y Pseudomonas lini)] inoculadas individual y co-inoculadas con dos concentraciones de solución nutritiva (SN) 75 y 100 % sobre la productividad y calidad de tomate en invernadero. Se compararon ocho tratamientos: T1= B. paralicheniformis + SN 75 %, T2= P. lini + SN 75 %, T3= co-inoculante + SN 75 %, T4= sin RPCV + SN 75 %, T5= B. paralicheniformis + SN 100 %, T6= P. lini + SN 100 %, T7= co-inoculante + SN 100 % y T8= sin RPCV + SN 100 %. El experimento se estableció en un diseño bloques al azar con 12 repeticiones. Los resultados indicaron que con el tratamiento T1 se obtuvieron los mayores valores para el rendimiento (2.09 kg/planta). El tratamiento T3 incrementó la capacidad antioxidante (46.19 µM ETrolox/100 g peso fresco) de los frutos con relación a los tratamientos sin RPCV (T4 y T8). El uso de RPCV puede ser una alternativa sostenible que permite disminuir la fertilización para mejorar la calidad sin disminuir el rendimiento de fruto, además de mitigar los efectos adversos de los fertilizantes inorgánicos en los sistemas de producción del cultivo de tomate.


2021 ◽  
Vol 21 (1) ◽  
Author(s):  
Siham Fatani ◽  
Yoshimoto Saito ◽  
Mohammed Alarawi ◽  
Takashi Gojobori ◽  
Katsuhiko Mineta

Abstract Background Cellulolytic microorganisms are considered a key player in the degradation of plant biomass in various environments. These microorganisms can be isolated from various environments, such as soils, the insect gut, the mammalian rumen and oceans. The Red Sea exhibits a unique environment in terms of presenting a high seawater temperature, high salinity, low nutrient levels and high biodiversity. However, there is little information regarding cellulase genes in the Red Sea environment. This study aimed to examine whether the Red Sea can be a resource for the bioprospecting of microbial cellulases by isolating cellulase-producing microorganisms from the Red Sea environment and characterizing cellulase genes. Results Three bacterial strains were successfully isolated from the plankton fraction and the surface of seagrass. The isolated strains were identified as Bacillus paralicheniformis and showed strong cellulase activity. These results suggested that these three isolates secreted active cellulases. By whole genome sequencing, we found 10 cellulase genes from the three isolates. We compared the expression of these cellulase genes under cellulase-inducing and non-inducing conditions and found that most of the cellulase genes were generally upregulated during cellulolysis in the isolates. Our operon structure analysis also showed that cellulase genes form operons with genes involved in various kinds of cellular reactions, such as protein metabolism, which suggests the existence of crosstalk between cellulolysis and other metabolic pathways in the bacterial isolates. These results suggest that multiple cellulases are playing important roles in cellulolysis. Conclusions Our study reports the isolation and characterization of cellulase-producing bacteria from the Red Sea. Our whole-genome sequencing classified our three isolates as Bacillus paralicheniformis, and we revealed the presence of ten cellulase orthologues in each of three isolates’ genomes. Our comparative expression analysis also identified that most of the cellulase genes were upregulated under the inducing conditions in general. Although cellulases have been roughly classified into three enzyme groups of beta-glucosidase, endo-β-1,4-glucanase and exoglucanase, these findings suggest the importance to consider microbial cellulolysis as a more complex reaction with various kinds of cellulase enzymes.


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