Identification of bacteria assimilating formaldehyde in a biological activated carbon filter by means of DNA stable isotope probing and next-generation sequencing

2016 ◽  
Vol 16 (4) ◽  
pp. 915-921 ◽  
Author(s):  
I. Kasuga ◽  
F. Kurisu ◽  
H. Furumai

Ozonation followed by a biological activated carbon (BAC) filter is a common process of advanced water purification. Ozone can generate formaldehyde (FA) as a harmful by-product, while the subsequent BAC filter is efficient at removing FA. FA adsorption is limited on activated carbon because of its hydrophilic property and low molecular weight. Thus, biological degradation by biofilms associated with the BAC is regarded as the primary treatment mechanism for FA. However, little is known about the microorganisms involved in the removal of FA. To identify specific microorganisms assimilating FA in a BAC filter, this study applied DNA stable isotope probing (DNA-SIP) combined with next-generation sequencing (NGS) technology. DNA-SIP with NGS clearly revealed that facultative methylotrophs affiliated within the specific taxonomic groups, such as Hyphomicrobium and Methylibium, were suspected to be the key players in FA removal.

2020 ◽  
Vol 11 (05) ◽  
pp. 232-238
Author(s):  
Marcus Kleber

ZUSAMMENFASSUNGDas kolorektale Karzinom (KRK) ist einer der häufigsten malignen Tumoren in Deutschland. Einer frühzeitigen Diagnostik kommt große Bedeutung zu. Goldstandard ist hier die Koloskopie. Die aktuelle S3-Leitlinie Kolorektales Karzinom empfiehlt zum KRK-Screening den fäkalen okkulten Bluttest. Für das Monitoring von Patienten vor und nach Tumorresektion werden die Messung des Carcinoembryonalen Antigens (CEA) und der Mikrosatellitenstabilität empfohlen. Für die Auswahl der korrekten Chemotherapie scheint derzeit eine Überprüfung des Mutationsstatus, mindestens des KRAS-Gens und des BRAF-Gens, sinnvoll zu sein. Eine Reihe an neuartigen Tumormarkern befindet sich momentan in der Entwicklung, hat jedoch noch nicht die Reife für eine mögliche Anwendung in der Routinediagnostik erreicht. Den schnellsten Weg in die breite Anwendung können Next-Generation-Sequencing-basierte genetische Tests finden.


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