Estimating target strength of young chum salmon (Oncorhynchus keta)

Although chum salmon (Oncorhynchus keta) is an important fishery resource in Japan, acoustic methods cannot be applied to biomass estimation because the target strength (TS) is unknown. This study clarified the TS for each fork length (FL: 5.5–33.5 cm) of young chum salmon inhabiting the Japanese coastal area to the Bering Sea by measuring free-swimming fish. The size dependences of the TS values were TSmean = 20 log10 FL – 68.0, for both 38 and 120 kHz. This facilitated the estimation of biomass of young salmon using acoustic methods.

Genome assembly, transcriptome and SNP database for chum salmon (Oncorhynchus keta)

Chum salmon (Oncorhynchus keta) is the species with the widest geographic range of the anadromous Pacific salmonids,. Chum salmon is the second largest of the Pacific salmon, behind Chinook salmon, and considered the most plentiful Pacific salmon by overall biomass. This species is of significant commercial and economic importance: on average the commercial chum salmon fishery has the second highest processed value of the Pacific salmon within British Columbia. The aim of this work was to establish genomic baseline resources for this species. Our first step to accomplish this goal was to generate a chum salmon reference genome assembly from a doubled-haploid chum salmon. Gene annotation of this genome was facilitated by an extensive RNA-seq database we were able to create from multiple tissues. Range-wide resequencing of chum salmon genomes allowed us to categorize genome-wide geographic variation, which in turn reinforced the idea that genetic differentiation was best described on a regional, rather than at a stock-specific, level. Within British Columbia, chum salmon regional groupings were described at the conservation unit (CU) level, and there may be substructure within particular CUs. Genome wide associations of phenotypic sex to SNP genetic markers identified two clear peaks, a very strong peak on Linkage Group 15, and another on Linkage Group 3. With these new resources, we were better able to characterize the sex-determining region and gain further insights into sex determination in chum salmon and the general biology of this species.

Trace element composition of the Southwestern Sakhalin Chum Salmon

The study is devoted to the microelement composition of organs and tissues of chum salmon (Oncorhynchus keta), which came for spawning in September 2018 in the r. Lovetskaya on the southwestern coast of Sakhalin. Samples of organs and tissues of fish, prepared in Sakhalin, were frozen and delivered to Vladivostok for chemical analysis. Trace elements were determined from acid mineralizates by atomic absorption on a Shimadzu AA 6800. It was found that the content of microelements indicating anthropogenic impact on the environment (Zn, Cu and Ni) in the Sea of Japan chum was significantly higher than the content of those in the Okhotsk Sea fish. So, for example, the amount of zinc in the muscles of the Sea of Japan chum salmon was 2.5 times higher than in those of the Sea of Okhotsk fish. In the liver, the effect was even greater - the difference between the content of this element in the Sea of Japan and the Sea of Okhotsk reached 19 times. At the same time, in the organs and tissues of the Okhotsk chum salmon, which crossed the impact geochemical zone in the Kuril-Kamchatka region at least twice during its life cycle, the content of lead and cadmium, witnesses of underwater and surface volcanism in the Kuril straits, prevailed. The content of lead in the muscles of chum salmon from r. Raidovaya was 4 times more than in the muscles of chum salmon from the river. Lovetskaya; in the liver, the difference was 5 times.

Сравнение микроэлементного состава кеты Oncorhynchus keta Walbaum, 1792 из Японского и Охотского морей

Определено содержание микроэлементов (железа, цинка, меди, никеля, свинца и кадмия) в наиболее востребованном на потребительском рынке виде тихоокеанских лососей — кете Oncorhynchus keta, являющейся в российских водах вторым по объёму вылова объектом (после горбуши O. gorbuscha). Концентрации металлов в органах и тканях рыб (мышечная ткань, печень, гонады) определены атомно-абсорбционным методом на спектрофотометре Shimadzu AA-6800 на пламенном и беспламенном атомизаторах из минерализатов проб, полученных при разложении навесок концентрированной HNO3 марки ОСЧ в комплексе MARS 6, с использованием стандартных образцов с известными концентрациями. Статистическая обработка данных выполнена в программе SPSS Statistics 21. Половозрелые особи кеты (по 5 экз. самцов и самок в каждом месте сбора) отобраны осенью 2018 г. в садках-накопителях лососевых рыбоводных заводов на реках Фирсовка (юго-восток Сахалина, зал. Терпения) и Рейдовая (о-в Итуруп, Курильские острова), а также в октябре 2019 г. в садках для выдерживания производителей на р. Пойма (юго-запад Приморья, Японское море). От всех особей отдельно взяты пробы мышечной ткани, печени и гонад. Определяемые элементы чётко разделились по величинам концентраций на две группы в зависимости от места сбора проб: Cd и Pb преобладали в органах и тканях кеты из Сахалино-Курильского региона Охотского моря, а Fe, Zn, Cu и Ni — в япономорских рыбах. Причиной контрастного распределения тяжёлых металлов в органах и тканях рыб являются, очевидно, геохимические условия среды, формируемые в акваториях нагула и миграционных путей лососей. Если в практически замкнутом Японском море, слабо связанном с Тихим океаном малочисленными мелководными проливами, водная среда находится под сильным воздействием антропогенных, техногенных и терригенных факторов (хозяйственно-бытовых и промышленных стоков, поверхностных смывов с прибрежных территорий, сжигания судами углеводородного топлива), то в Сахалино-Курильском бассейне она испытывает влияние природных явлений — надводного и подводного вулканизма и поствулканизма Курильских островов, а также апвеллингов, выносящих из глубин Курило-Камчатской впадины в поверхностный слой практически весь набор химических элементов периодической системы Д. И. Менделеева. При этом Pb, обладающий высокой способностью к сорбции, задерживается на любых взвешенных частицах (как живых, так и неживых) и поступает в организмы рыб с пищей. Распределение микроэлементов по органам и тканям кеты существенно различается: в мышечной ткани зарегистрированы наименьшие концентрации металлов независимо от мéста вылова, а печень характеризуется повышенными уровнями всех, кроме Ni, металлов, причём в печени япономорских рыб определены самые высокие концентрации Fe, Zn и Cu. Для распределения металлов в гонадах рыб характерна своя специфика, особенно ярко проявившаяся в приморских лососях. Так, в гонадах самок преобладали как Fe, так и Zn, но особенно Cu: концентрация меди в гонадах самок кеты из р. Пойма была такой же, как в печени. Гонады самок япономорской кеты имели наибольшие концентрации Ni, хотя гонады самцов тоже отличались высоким, пусть и очень изменчивым, содержанием этого элемента. Что касается Pb и Cd, наиболее токсичных и контролируемых санитарными службами элементов (их количество по техническим причинам нам удалось определить только в охотоморских рыбах), то в их распределении по органам и тканям отмечена хорошо известная картина: максимальная концентрация выявлена в печени рыб. При этом содержание Pb превосходило санитарную норму лишь в отдельных особях, пришедших на нерест в р. Фирсовка на юго-востоке Сахалина; по Cd превышение ПДК в печени всех сахалинских рыб составляло 2,5–4,0 раза, а для всех курильских рыб — 2,1–5,0 раз.

Indigenous sex-selective salmon harvesting demonstrates pre-contact marine resource management in Burrard Inlet, British Columbia, Canada

To gain insight into pre-contact Coast Salish fishing practices, we used new palaeogenetic analytical techniques to assign sex identifications to salmonid bones from four archaeological sites in Burrard Inlet (Tsleil-Waut), British Columbia, Canada, dating between about 2300–1000 BP (ca. 400 BCE–CE 1200). Our results indicate that male chum salmon (Oncorhynchus keta) were preferentially targeted at two of the four sampled archaeological sites. Because a single male salmon can mate with several females, selectively harvesting male salmon can increase a fishery’s maximum sustainable harvest. We suggest such selective harvesting of visually distinctive male spawning chum salmon was a common practice, most effectively undertaken at wooden weirs spanning small salmon rivers and streams. We argue that this selective harvesting of males is indicative of an ancient and probably geographically widespread practice for ensuring sustainable salmon populations. The archaeological data presented here confirms earlier ethnographic accounts describing the selective harvest of male salmon.