rrna 16s
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Zootaxa ◽  
2021 ◽  
Vol 4974 (3) ◽  
pp. 565-576
Author(s):  
JINXIN LIU ◽  
XIANG XU ◽  
YURI M. MARUSIK ◽  
HAIQIANG YIN

Based on molecular analysis (12S rRNA, 16S rRNA, 18S rRNA and histone H3) and morphological characters, it was found that Ero juhuaensis Xu, Wang & Wang, 1987 is misplaced and belongs to Mimetus Hentz, 1832. A new combination is suggested, Mimetus juhuaensis (Xu et al., 1987) new combination. The male of M. juhuaensis is described for the first time. Detailed descriptions and illustrations of both sexes, as well as a distribution map of all known species of Mimetidae Simon, 1881 from China are provided. 


2020 ◽  
Vol 9 (7) ◽  
pp. e43973667
Author(s):  
Marcela Christofoli ◽  
Christiane Silva Souza ◽  
Thiago Ferreira Costa ◽  
Samantha Leandro de Sousa Andrade Alexandrino ◽  
Priscila Paula de Faria ◽  
...  
Keyword(s):  

Na atualidade, as disbioses, a ruptura da barreira intestinal e a inflamação tornaram-se preocupações da avicultura industrial, uma vez que culminam no comprometimento fisiológico e produtivo das aves. Objetivou-se discutir o papel da microbiota intestinal das aves no desenvolvimento animal, bem como evidenciar os benefícios e/ou prejuízos causados por esses microrganismos. A metodologia adotada foi estudo descritivo, sendo realizada a revisão bibliográfica de trabalhos científicos publicados em diferentes bases indexadas, com recorte temporal das últimas décadas. Verificou-se que o uso do sequenciamento do gene ribossômico do RNA (rRNA) 16S constitui importante ferramenta para identificar e enumerar as bactérias intestinais presentes em aves de produção. No que concerne à composição da microbiota, no intestino delgado encontram-se principalmente os gêneros Lactobacillus, Estreptococcus, Enterococcus, Bifidobacterium, Bacterioides, Clostridium, Fusobacterium e coliformes. No intestino grosso, Lactobacillus, Bacterioides, Proteobacteria, Bacillus, Clostridium e Bifidobacterium. No intestino delgado, as bactérias participam do metabolismo melhorando a absorção de nutrientes, hidrolisam polissacarídeos produzindo ácidos graxos de cadeia curta, que serão absorvidos e participarão de rotas metabólicas importantes no fornecimento de fontes de carbono e energia para as aves. Apesar dos benefícios da microbiota em promover um ambiente intestinal estável, em situações desfavoráveis, tais como no manejo criatório inadequado, pode atuar como agentes patogênicos, produzir metabólitos tóxicos e prejudicar o desempenho produtivo das aves.


2019 ◽  
pp. 20-28
Author(s):  
Claudia Marín Catacora ◽  
Yerson Durán Ramírez ◽  
Pablo Ramírez Roca ◽  
Daladier Castillo Cotrina

En el presente trabajo se ensayó una técnica de degradación biológica del explosivo 2,4,6 trinitrotolueno (TNT) encondiciones in vitro. Se realizó un screening de cepas bacterianas degradadoras de TNT a partir de 18 cepasprovenientes de suelo contaminado con derivados de hidrocarburo y de un sistema de tratamiento de relaves mineros.Se seleccionaron dos cepas: UP1 y 3T412C, identificadas por análisis de la secuencia parcial del gen rRNA 16S como Serratia marcescens UP1 y Klebsiella oxytoca 3T412C con los que se formó un consorcio evaluándose la degradación de 60 mg/1 de TNT en medio Mínimo Modificado con succinato como única fuente de carbono a temperatura ambiente (28 ± 2°C) en  agitación constante a 150 rpm por 72 horas. La concentración de TNT del medio de cultivo fue cuantificada por Cromatografía Líquida de Alta Eficacia (HPLC). El porcentaje de degradación de TNT para Klebsiella oxytoca 3T412C fue 97,87 %, para el consorcio 95,81 % y para Serratia marcescensUPl 42,94 % tras 72 horas de incubación. En conclusión, estos resultados demuestran la presencia de bacterias degradadoras de TNT con potencial para ser empleadas en procesos de biorremediación.


2019 ◽  
Vol 74 (3) ◽  
pp. 207-218
Author(s):  
Gustavo Lucas Costa Valente ◽  
Marcelo Resende de Souza
Keyword(s):  

Leite e seus derivados são alimentos que se destacam pelo elevado teor nutritivo. Essa característica permite que seja encontrada uma grande diversidade de micro-organismos nesses produtos, incluindo aqueles considerados desejáveis e indesejáveis. Associado a isso, um elevado volume de leite tem sido produzido mundialmente, demandando que métodos mais práticos e acurados, como a espectrometria de massa MALDI-TOF, sejam aplicados para avaliação microbiológica de produtos lácteos. Essa metodologia se baseia na ionização e dessorção de proteínas microbianas, que em seguida são aceleradas em um tubo a vácuo. De acordo com o tempo de voo ao longo do tubo das diferentes partículas ionizadas que compunham a amostra, são formados espectros característicos que podem ser comparados aos espectros presentes no banco de dados do aparelho, permitindo uma identificação do micro-organismo. Muitos estudos científicos têm demonstrado que a identificação por MALDI-TOF de distintos micro-organismos isolados de produtos lácteos (leite fluido, queijos e leites fermentados) foi compatível com o resultado obtido por métodos de sequenciamento genético (gene rRNA 16S), que é considerado o padrão-ouro para identificação microbiana. Apesar de ser um método novo e que demanda um considerável investimento para aquisição do aparelho, seu desempenho tem sido satisfatório e promissor. Portanto, há uma grande perspectiva futura para sua utilização de forma mais efetiva na identificação de micro-organismos provenientes de produtos lácteos.


2018 ◽  
Author(s):  
Luc Cornet ◽  
Annick Wilmotte ◽  
Emmanuelle J. Javaux ◽  
Denis Baurain

AbstractObjectivesCyanobacteria are an ancient phylum of prokaryotes that contain the class Oxyphotobacteria, the unique bacterial group able to perform oxygenic photosynthesis. This group has been extensively studied by phylogenomics during the last decade, notably because it is widely accepted that Cyanobacteria were responsible for the spread of photosynthesis to the eukaryotic domain. The aim of this study was to evaluate the fraction of the oxyphotobacterial diversity for which sequenced genomes are available for genomic studies. For this, we built a phylogenomic-constrained SSU rRNA (16S) tree to pinpoint unexploited clusters of Oxyphotobacteria that should be targeted for future genome sequencing, so as to improve our understanding of Oxyphotobacteria evolution.ResultsWe show that only a little fraction the oxyphotobacterial diversity has been sequenced so far. Indeed 31 rRNA clusters on the 60 composing the photosynthetic Cyanobacteria have a fraction of sequenced genomes <1%. This fraction remains low (min = 1%, median = 11.1 %, IQR = 7.3) within the remaining “‘sequenced” clusters that already contain some representative genomes. The “unsequenced” clusters are scattered across the whole Oxyphotobacteria tree, at the exception of very basal clades (G, F, E) and the Oscillatoriales clade (A), which have higher fractions of representative genomes. Yet, the very basal clades still feature some (sub)clusters without any representative genome. This last result is especially important, as these basal clades are prime candidate for plastid emergence.


2016 ◽  
Vol 5 ◽  
pp. S212-S213 ◽  
Author(s):  
Mohammad Varahram ◽  
Parissa Farnia ◽  
Shima Saif ◽  
Mehran Marashian ◽  
Poopak Farnia ◽  
...  

2014 ◽  
Vol 5 (1) ◽  
pp. 223
Author(s):  
Sandra Patricia Montenegro Gómez ◽  
Juan Carlos Menjivar Flóres ◽  
Donald Riascos
Keyword(s):  
Zea Mays ◽  

<p align="left">Se evaluo el efecto de aplicacion de vinaza y potasio sobre la estructura de comunidades bacterianas de maiz dulce (<em>Zea mays</em>) en un Entic dystropept y en un Fluventic haplustoll del Valle de Cauca, Colombia. Se siguio un diseno completamente al azar con cuatro tratamientos y cinco repeticiones: T1 (100% requerimiento de K+ con KCl), T2 (100% requerimiento de K+ con vinaza), T3 (50% requerimiento de K+ con KCl +50% con vinaza) y T4 (25% requerimiento de K+ con KCl +75% con vinaza). Se establecio la relacion entre estructuras de comunidades microbianas y aplicacion de vinaza por el metodo PCR-DGGE de amplicones del gen rRNA 16S. El T1 y T2 del Entic dystropept presento mayor numero de amplicones y el analisis cluster de distancia euclidiana indico que existe similaridad de comunidades bacterianas en estos tratamientos donde tanto la vinaza como KCl fueron aplicados para suplir el 100% de fuente de potasio</p>


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