Απομόνωση και ταυτοποίηση βιοδραστικών δευτερογενών μεταβολιτών από βακτήρια θαλάσσιας προέλευσης

2019 ◽  
Author(s):  
Μαρία Χαριζάνη

Λόγω της ιδιαιτερότητας του θαλάσσιου περιβάλλοντος, τα φυσικά προϊόντα που απομονώνονται από θαλάσσιους οργανισμούς παρουσιάζουν συχνά διαφοροποιημένες χημικές δομές με ευρύ φάσμα βιολογικών δράσεων μέσω εξειδικευμένων μηχανισμών. Στο εμπόριο κυκλοφορούν ήδη αρκετά φαρμακευτικά σκευάσματα με τη δραστική ουσία να είναι θαλάσσιας προέλευσης, ενώ πολλά βρίσκονται σε στάδιο προκλινικών και κλινικών δοκιμών. Ακόμη, τα θαλάσσια φυσικά προϊόντα βρίσκουν εφαρμογή στην κοσμητολογία, στη διατροφή, στη βιοτεχνολογία και στην επιστήμη υλικών. Τα τελευταία χρόνια, οι θαλάσσιοι μικροοργανισμοί παρουσιάζουν ιδιαίτερο ενδιαφέρον, καθώς έχουν αποδειχθεί πλούσιες πηγές νέων βιοδραστικών μορίων με πρωτότυπους ανθρακικούς σκελετούς ή σπάνιες δραστικές ομάδες. Στα πλαίσια της παρούσας διδακτορικής διατριβής μελετήθηκε η χημική σύσταση των οργανικών εκχυλισμάτων που παραλήφθηκαν έπειτα από υγρή καλλιέργεια σε μεγάλη κλίμακα τεσσάρων επιλεγμένων βακτηριακών στελεχών, τα οποία έχουν απομονωθεί από θαλάσσια ιζήματα που συλλέχθηκαν στο Αιγαίο (Μήλος) και το Ιόνιο (Κεφαλονιά και Κέρκυρα) Πέλαγος. Τα εκχυλίσματα υποβλήθηκαν σε σειρά χρωματογραφικών διαχωρισμών με σκοπό την απομόνωση των δευτερογενών μεταβολιτών τους, οι οποίοι ταυτοποιήθηκαν με βάση την ανάλυση των φασματοσκοπικών τους δεδομένων (κυρίως NMR και MS). Συνολικά, απομονώθηκαν 78 διαφορετικοί δευτερογενείς μεταβολίτες, εκ των οποίων μέχρι στιγμής έχουν ταυτοποιηθεί οι 75. Εξ αυτών, οι 12 αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα, ενώ οι 6 απομονώθηκαν για πρώτη φορά από φυσική πηγή. Από το στέλεχος Bacillus endophyticus ΒΙ0327 απομονώθηκαν και ταυτοποιήθηκαν 25 δευτερογενείς μεταβολίτες: (α) εννέα 2,5-δικετοπιπεραζίνες (2,5-DKPs), (β) τρία παράγωγα ινδολίου, (γ) μία ναφθοκινόνη, (δ) δύο τριτερπένια, (ε) οκτώ απλά αρωματικά παράγωγα και (στ) δύο παράγωγα μεθακρυλικού οξέος, εκ των οποίων δύο αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα, ενώ ένας απομονώθηκε πρώτη φορά από φυσική πηγή. Από το στέλεχος Streptomyces althioticus ΒΙ0850 απομονώθηκαν και ταυτοποιήθηκαν 2 δευτερογενείς μεταβολίτες, εκ των οποίων μία 2,5-DKP και μία απλή αζωτούχος ένωση.Από το στέλεχος Streptomyces smyrnaeus ΒΙ0918 απομονώθηκαν και ταυτοποιήθηκαν 44 δευτερογενείς μεταβολίτες: (α) εικοσιτέσσερις 2,5-DKPs, εκ των οποίων μία αποτελεί νέο φυσικό προϊόν, (β) επτά παράγωγα βενζοδιαζεπινών, εκ των οποίων τέσσερα αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα και δύο απομονώθηκαν πρώτη φορά από φυσική πηγή, (γ) ένα παράγωγο ινδολίου, (δ) δύο νουκλεοσιδικά παράγωγα, (ε) δύο άλλες αζωτούχες ενώσεις, εκ των οποίων μία απομονώθηκε πρώτη φορά από φυσική πηγή, (στ) μία απλή θειούχος ένωση, (ζ) δύο παράγωγα βενζοϊκού οξέος, (η) ένα απλό παράγωγο γλυκερόλης, (θ) ένα παράγωγο μεθακρυλικού οξέος, το οποίο αποτελεί νέο φυσικό προϊόν και (ι) τρεις πολυαιθερικοί μεταβολίτες μεγάλου μοριακού βάρους. Από το στέλεχος Bacillus subtilis ΒΙ0980 απομονώθηκαν και ταυτοποιήθηκαν 34 δευτερογενείς μεταβολίτες: (α) δεκαεννέα 2,5-DKPs, εκ των οποίων δύο αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα και μία απομονώθηκε πρώτη φορά από φυσική πηγή, (β) τρία παράγωγα ινδολίου, (γ) ένα νουκλεοσιδικό παράγωγο, (δ) ένα φλαβονοειδές, (ε) πέντε παράγωγα βενζοϊκού οξέος, (στ) τέσσερεις μεταβολίτες διαφορετικών κατηγοριών, εκ των οποίων δύο αποτελούν νέα φυσικά προϊόντα και ένα απομονώθηκε πρώτη φορά από φυσική πηγή και (ζ) ένα παράγωγο μεθακρυλικού οξέος. Η αξιολόγηση της βιολογικής δράσης των μεταβολιτών που έχουν απομονωθεί σε ικανές ποσότητες βρίσκεται επί του παρόντος σε εξέλιξη.

2016 ◽  
pp. 103-112 ◽  
Author(s):  
Alexander Prosekov ◽  
Alexander Prosekov ◽  
Stanislav Sukhikh ◽  
Stanislav Sukhikh ◽  
Mariya Zimina ◽  
...  

During the researches the microorganisms showing antagonistic activity towards the pathogenic microflora were allocated on the surface of vegetables. After the allocated strains' identification for further researches four strains of the microorganisms which are not pathogenic have been selected: Bacillus stratosphericus , Bacillus endophyticus , Bacillus pumilus , Bacillus subtilis . Antagonistic activity of the chosen strains towards the testing cultures on the solid medium was studied by the diffusive method. Isolates show high inhibitory potential against the pathogens causing various human diseases. It should be noted that all isolates except Bacillus stratosphericus show antagonistic activity towards Salmonella enterica from 25 to 38%, while Bacillus stratosphericus does not inhibit the growth of Bacillus stratosphericus . Strains Bacillus stratosphericus , Bacillus endopheticus , Bacillus subtilis inhibit the development of Alcaligenes faecalis (52-54%). Strains Bacillus endophyticus (18%) and Bacillus pumilus (30%) are inhibitors of P. aeruginosa .


Author(s):  
Dwight Anderson ◽  
Charlene Peterson ◽  
Gursaran Notani ◽  
Bernard Reilly

The protein product of cistron 3 of Bacillus subtilis bacteriophage Ø29 is essential for viral DNA synthesis and is covalently bound to the 5’-termini of the Ø29 DNA. When the DNA-protein complex is cleaved with a restriction endonuclease, the protein is bound to the two terminal fragments. The 28,000 dalton protein can be visualized by electron microscopy as a small dot and often is seen only when two ends are in apposition as in multimers or in glutaraldehyde-fixed aggregates. We sought to improve the visibility of these small proteins by use of antibody labeling.


Planta Medica ◽  
2008 ◽  
Vol 74 (09) ◽  
Author(s):  
N Padilla-Montaño ◽  
IL Bazzocchi ◽  
L Moujir

2018 ◽  
Vol 22 (02) ◽  
pp. 82-89
Author(s):  
Friedrich von Rheinbaben ◽  
Oliver Riebe ◽  
Johanna Köhnlein ◽  
Sebastian Werner

ZusammenfassungZentrales Bauteil des Genius® 90 Therapie Systems ist der sogenannte Genius-Tank, dem die frische Dialyseflüssigkeit entnommen und in den die verbrauchte Lösung nach der Dialyse zurückgeführt wird. Daher kommt der sicheren Aufbereitung des Systems eine besondere Bedeutung zu. Hierfür wird ein Aufbereitungsverfahren unter Verwendung von UV-Licht in Kombination mit einem chemischen Desinfektionsmittel angewendet. Ziel der hier beschriebenen Untersuchung war es, die Wirkungsbreite und Wirkungstiefe dieses Aufbereitungsverfahrens unter praxisnahen Phase-3-Bedingungen zu ermitteln. Dazu wurde das Gerät mit Mikroorganismen und Viren künstlich kontaminiert und die Wirkung der einzelnen Verfahrensschritte ermittelt. Im Gegensatz zu der üblichen Vorgehensweise praxisnaher Untersuchungen machen Aufbereitungsverfahren medizinischer Geräte unter Phase-3-Kriterien meist eine neuartige Arbeitsweise erforderlich – im Falle der hier vorgestellten Untersuchung sogar die Konstruktion eines speziellen Geräts zur Platzierung von Keimträgen im Genius-Tank. Im Ergebnis konnte gezeigt werden, dass bereits UV-Licht allein sowie in Kombination mit einem chemischen Desinfektionsmittel unter praxisnahen Bedingungen eine sichere Wirksamkeit gegen Bakterien (Pseudomonas aeruginosa) und bakterielle Sporen (Bacillus subtilis), Schimmelpilze (Aspergillus brasiliensis) und Viren (Murines Parvovirus) besitzt.


Planta Medica ◽  
2007 ◽  
Vol 73 (09) ◽  
Author(s):  
L Moujir ◽  
L de León ◽  
IL Bazzocchi

2020 ◽  
Vol 21 (1) ◽  
pp. 14-19
Author(s):  
Praptiningsih Gamawati Adinurani ◽  
Sri Rahayu ◽  
Nurul Fima Zahroh

Mikroba Bacillus subtilis merupakan agen pengendali hayati mempunyai kelebihan sebagai Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) yaitu dapat berfungsi sebagai biofertilizer, biostimulan, biodekomposer dan bioprotektan. Tujuan penelitian mengetahui potensi B. subtilis dalam merombak bahan organik sebagai usaha meningkatkan ketersediaan bahan organik tanah yang semakin menurun. Penelitian menggunakan Rancangan Petak Terbagi dengan berbagai  bahan organik sebagai petak utama (B0 = tanpa bahan organik, B1 = kotoran ayam,  B2 = kotoran kambing, B3 = kotoran sapi) dan aplikasi B.subtilis sebagai anak petak (A0 = 0 cc/L, A1 = 5cc/L, A2 = 10 cc/L, Pengamatan meliputi variabel tinggi tanaman, indeks luas daun, jumlah buah per tanaman, berat buah per tanaman, dan bahan organik tanah. Data pengamatan  dianalisis ragam  menggunakan  Statistical Product and Service Solutions (SPSS) versi 25 dan dilanjutkan dengan uji Duncan untuk mengetahui signifikansi perbedaan antar perlakuan. Hasil penelitian menunjukkan tidak terdapat interaksi antara bahan organik kotoran ternak dan konsentrasi B. subtilis terhadap semua variabel pengamatan. Potensi B. subtilis sangat baik dalam mendekomposisi bahan organik yang ditunjukkan dengan peningkatan bahan organik, dan hasil terbaik pada kotoran  sapi (B3) dan konsentrasi B. subtilis 15 mL/L masing-masing sebesar 46.47 % dan 34.76 %. Variabel pertumbuhan tidak berbeda nyata kecuali tinggi tanaman dengan pertambahan tinggi paling banyak pada pemberian kotoran kambing sebesar 170.69 %.


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document