scholarly journals A Medicago truncatula H+-pyrophosphatase gene, MtVP1, improves sucrose accumulation and anthocyanin biosynthesis in potato (Solanum tuberosum L.)

2014 ◽  
Vol 13 (2) ◽  
pp. 3615-3626 ◽  
Author(s):  
J.W. Wang ◽  
H.Q. Wang ◽  
W.W. Xiang ◽  
T.Y. Chai
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Medicago Truncatula ◽  
Anthocyanin Biosynthesis ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Sucrose Accumulation

scholarly journals The WD40 Gene Family in Potato (Solanum Tuberosum L.): Genome-Wide Analysis and Identification of Anthocyanin and Drought-Related WD40s

Agronomy ◽  
2020 ◽  
Vol 10 (3) ◽  
pp. 401
Author(s):  
Zhen Liu ◽  
Yuhui Liu ◽  
Jeffrey A. Coulter ◽  
Baoyun Shen ◽  
Yuanming Li ◽  
...  
Keyword(s):  
Abiotic Stress ◽  
Solanum Tuberosum ◽  
Gene Family ◽  
Stress Responses ◽  
Anthocyanin Biosynthesis ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Interaction Network ◽  
Purifying Selection ◽  
Rna Seq ◽  
Specific Expression

WD40 proteins, also known as WD40 domain proteins, constitute a large gene family in eukaryotes and play multiple roles in cellular processes. However, systematic identification and analysis of WD40 proteins have not yet been reported in potato (Solanum tuberosum L.). In the present study, 178 potato WD40 (StWD40) genes were identified and their distribution on chromosomes, gene structure, and conserved motifs were assessed. According to their structural and phylogenetic protein features, these 178 StWD40 genes were classified into 14 clusters and 10 subfamilies. Collinearity analysis showed that segmental duplication events played a major role in the expansion of the StWD40 gene family. Synteny analysis indicated that 45 and 23 pairs of StWD40 genes were orthologous to Arabidopsis and wheat (Triticum aestivum), respectively, and that these gene pairs evolved under strong purifying selection. RNA-seq data from different tissues and abiotic stresses revealed tissue-specific expression and abiotic stress-responsive StWD40 genes in doubled monoploid potato (DM). Furthermore, we further analyzed the WD40 genes might be involved in anthocyanin biosynthesis and drought stress in tetraploid potato cultivars based on RNA-seq data. In addition, a protein interaction network of two homologs of Arabidopsis TTG1, which is involved in anthocyanin biosynthesis, was constructed to identify proteins that might be related to anthocyanin biosynthesis. The result showed that there were 112 pairs of proteins interacting with TTG1, with 27 being differentially expressed in pigmented tissues. This study indicates that WD40 proteins in potato might be related to anthocyanin biosynthesis and abiotic stress responses.

scholarly journals Genome-Wide Identification and Analysis of the NF-Y Gene Family in Potato (Solanum tuberosum L.)

2021 ◽  
Vol 12 ◽  
Author(s):  
Zhen Liu ◽  
Yuanming Li ◽  
Jinyong Zhu ◽  
Wenjing Ma ◽  
Zhitao Li ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Gene Family ◽  
Anthocyanin Biosynthesis ◽  
Expression Profiles ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Abiotic Stress Tolerance ◽  
Maturation Stage ◽  
Rna Seq ◽  
Potato Genome ◽  
Potato Genome Sequencing Consortium

Nuclear factor Y (NF-Y) is a ubiquitous transcription factor in eukaryotes, which is composed of three subunits (NF-YA, NF-YB, and NF-YC). NF-Y has been identified as a key regulator of multiple pathways in plants. Although the NF-Y gene family has been identified in many plants, it has not been reported in potato (Solanum tuberosum). In the present study, a total of 41 NF-Y proteins in potato (StNF-Ys) were identified, including 10 StNF-YA, 22 StNF-YB, and nine StNF-YC subunits, and their distribution on chromosomes, gene structure, and conserved motif was analyzed. A synteny analysis indicated that 14 and 38 pairs of StNF-Y genes were orthologous to Arabidopsis and tomato (Solanum lycopersicum), respectively, and these gene pairs evolved under strong purifying selection. In addition, we analyzed the expression profiles of NF-Y genes in different tissues of double haploid (DM) potato, as well as under abiotic stresses and hormone treatments by RNA-seq downloaded from the Potato Genome Sequencing Consortium (PGSC) database. Furthermore, we performed RNA-seq on white, red, and purple tuber skin and flesh of three potato cultivars at the tuber maturation stage to identify genes that might be involved in anthocyanin biosynthesis. These results provide valuable information for improved understanding of StNF-Y gene family and further functional analysis of StNF-Y genes in fruit development, abiotic stress tolerance, and anthocyanin biosynthesis in potato.

Situación económica y social de la población de San José del Carmen, San Cristóbal de las Casas, Chiapas

2019 ◽  
Vol 12 (4) ◽  
Author(s):  
Pedro Cadena-Iñiguez ◽  
Eileen Salinas-Cruz ◽  
Jesús Martínez-Sánchez ◽  
Mariano Morales-Guerra ◽  
Romualdo Vásquez-Ortiz ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Theobroma Cacao ◽  
Zea Mays L ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
San Jose ◽  
Phaseolus Vulgaris L ◽  
Las Casas ◽  
Vicia Faba L ◽  
Las Mujeres ◽  
Theobroma Cacao L

Objetivo: Establecer una línea base como fundamento para la intervención e inducción de innovaciones a través de escuelas de campo y planes de negocios. Diseño/metodología/aproximación: El estudio se desarrolló en San José del Carmen, San Cristóbal de Las Casas, Chiapas, México. Se elaboró una encuesta como instrumento para recabar en campo información de familias de la localidad con la finalidad de conocer su situación actual. La localidad de trabajo se eligió utilizando como criterio las poblaciones que se encuentran dentro de Cruzada Nacional contra el hambre y en la clasificación de la pobreza extrema Resultados: La localidad de San José del Carmen es considerada como de alta marginación, la población es bilingüe, su principal lengua es el Tzotzil, el nivel de estudios promedio es hasta el tercer año de primaria, las principales actividades productivas son la siembra de maíz (Zea mays L.), frijol (Phaseolus vulgaris L.), papa (Solanum tuberosum L.) y haba (Vicia faba L.) que son utilizadas principalmente para autoconsumo.  No cuentan con agua potable ya que su sistema es a través de la recaudación de agua de lluvia o a través de un jagüey. Sus principales actividades económicas son la albañilería por parte de los hombres, y venta de productos, tales como el pozol (bebida energética a base de maíz y cacao (Theobroma cacao L.), tostadas y algunos vegetales por parte de las mujeres. Las tostadas son producidas en forma artesanal con un proceso de doble nixtamalización y vendida en bolsas de 20 tostadas cada una, a un costo de MX$10.00 en los mercados de San Cristóbal de las Casas, una a dos veces por semana alrededor de 40 bolsas por día de venta. Limitaciones del estudio/implicaciones: La afiliación zapatista de alguno de los pobladores y el hecho de que algunos habitantes no hablen español, fueron factores que limitaron desarrollar al 100% el estudio; sin embargo, se considera que se tienen los elementos necesarios para establecer la línea base de la situación de San José del Carmen. Conclusiones: El diagnóstico servirá como una herramienta para establecer una intervención a través de innovaciones y planes de negocios en la comunidad de estudio. Los pobladores cuentan con herramientas necesarias para obtener nuevos conocimientos que ayuden a un desarrollo de su producción. El idioma no deberá de ser una limitante para ello.

ALLELE DIVERSITY FOR ACID VACUOLAR INVERTASE GENE Pain-1 FRAGMENT IN POTATO (Solanum tuberosum L.) VARIETIES AND LINES

2018 ◽  
Vol 53 (1) ◽  
pp. 132-139
Author(s):  
M.A. Slugina ◽  
◽  
E.O. Shmelkova ◽  
A.A. Meleshin ◽  
E.Z. Kochieva ◽  
...  
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Vacuolar Invertase ◽  
Invertase Gene

Respon Pemberian Aspirin dan Kinetin Terhadap Pembentukan Umbi Mikro Kentang (Solanum tuberosum L.) Secara In Vitro

2017 ◽  
Author(s):  
Yunita Prameswari ◽  
FNU Djenal ◽  
FNU Damanhuri
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L

Kebutuhan kentang yang semakin tinggi menyebabkan permintaan semakin meningkat. Rendahnya produksi kentang mengakibatkan berbagai upaya untuk peningkatan produksi terus dilakukan. Penggunaan metode kultur jaringan yaitu metode untuk mengisolasi bagian tanaman seperti protoplasma, sel, sekelompok sel, jaringan dan organ dalam kondisi aseptik, sehingga dapat diperbanyak dan beregenerasi menjadi tanaman utuh dapat dijadikan alternatif pemenuhan kebutuhan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kecepatan pembentukan umbi mikro kentang (Solanum Tuberosum L.) varietas granola kembang secarain vitro dengan menggunakan dua faktor dan 3 kali ulangan. Faktor pertama yaitu aspirin dengan tiga taraf (5,10,15) ppm. Faktor kedua yaitu kinetin dalam tiga taraf (8,10,12) ppm. Penelitian menggunakan seluruh propagul kentang yang berumur 30 hari setelah subkultur dan data yang didapat dianalisis menggunakan ANOVA. Hasil penelitian menunjukan bahwa interaksi aspirin dan kinetin tidak berpengaruh terhadap jumlah akar, kedinian umbi, dan bobot umbi. Interaksi perlakuan terbaik bagi pembentukan tunas yaitu A2K1 aspirin 10 ppm dan kinetin 8 ppm sedangkan Interaksi perlakuan terbaik pada parameter jumlah umbi yaituA3K2 aspirin 15 ppm dan kinetin 10.

Влияние заражения клубней кольцевой гнилью и обработки монойодацетатом натрия совместно с прогреванием на хранение картофеля

2015 ◽  
pp. 12-15
Author(s):  
Алла Иннокентьевна Перфильева ◽  
Е. В. Рымарева ◽  
Е. Г. Рихванов
Keyword(s):  
Solanum Tuberosum ◽  
Solanum Tuberosum L ◽  
Clavibacter Michiganensis

В статье обсуждается влияние на проращивание клубней монойодацетата натрия (МИА) совместно с прогреванием (45 °C, 1 ч) в качестве потенциального агента для борьбы с Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus (Cms) перед закладкой картофеля на хранение. В работе использованы клубни картофеля (Solanum tuberosum L.) сорта Лукьяновский. В эксперименте присутствовало четыре варианта обработки клубней, в каждом варианте было 30 клубней. После проведенных обработок клубни помещали в условия овощехранилища на 8 месяцев. Весной подсчитывали количество ростков, измеряли длину проростков у клубней и проводили клубневой анализ. Полученные результаты статистически обрабатывали с использованием пакета программ Excel. Показано, что заражение клубней Cms снижало способность клубней к прорастанию. Обработка МИА и прогревание здоровых клубней картофеля перед закладкой на хранение подавляло прорастание клубней, что полезно для продовольственного картофеля. Результаты клубневого анализа показали, что прогревание снижало общее количество больных клубней примерно на 39 %, клубни были менее поражены кольцевой и бурой гнилями. Обработка МИА также способствовала снижению количества клубней, пораженных бурой и кольцевой гнилями. Обработка клубней МИА совместно с прогреванием снижала общее количество больных клубней, пораженных проволочником и пустотелых, кольцевой и сухой гнилями, а также паршой. Обработка МИА и прогреванием инфицированных клубней картофеля перед закладкой на хранение снимала подавляющий эффект бактерий на прорастание. Полученный результат актуален для обработки семенного картофеля, так как кольцевая гниль является латентным заболеванием.

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