scholarly journals Fibrinogen Baltimore I: polymerization defect associated with a gamma 292Gly----Val (GGC----GTC) mutation

Blood ◽  
1990 ◽  
Vol 76 (11) ◽  
pp. 2279-2283 ◽  
Author(s):  
S Bantia ◽  
SM Mane ◽  
WR Bell ◽  
CV Dang

Fibrinogen Baltimore I is one of the very first congenital abnormal fibrinogens reported over several decades ago; however, the molecular defect of this dysfibrinogen has eluded identification. In fact, several reports misidentified the functional defect of Baltimore I, which has impaired fibrin monomer polymerization. Reversed-phase high- performance liquid chromatography analysis of lysyl endopeptidase digest of the purified Baltimore I gamma-chain showed an abnormal peptide not found in the co-existing normal gamma-chain of this heterozygote. Amino acid sequencing of this peptide indicated that gamma-chain Gly292 is replaced by valine. This observation was confirmed, and the genetic defect was determined by direct nucleotide sequencing of a polymerase chain reaction product containing codon gamma 292, which is mutated: GGC----GTC. The molecular defect of Fibrinogen Baltimore I lies in a region of the gamma-chain required for fibrin polymerization, suggesting that the integrity of gamma Gly292 is critical for fibrin assembly.

Blood ◽  
1990 ◽  
Vol 76 (11) ◽  
pp. 2279-2283 ◽  
Author(s):  
S Bantia ◽  
SM Mane ◽  
WR Bell ◽  
CV Dang

Abstract Fibrinogen Baltimore I is one of the very first congenital abnormal fibrinogens reported over several decades ago; however, the molecular defect of this dysfibrinogen has eluded identification. In fact, several reports misidentified the functional defect of Baltimore I, which has impaired fibrin monomer polymerization. Reversed-phase high- performance liquid chromatography analysis of lysyl endopeptidase digest of the purified Baltimore I gamma-chain showed an abnormal peptide not found in the co-existing normal gamma-chain of this heterozygote. Amino acid sequencing of this peptide indicated that gamma-chain Gly292 is replaced by valine. This observation was confirmed, and the genetic defect was determined by direct nucleotide sequencing of a polymerase chain reaction product containing codon gamma 292, which is mutated: GGC----GTC. The molecular defect of Fibrinogen Baltimore I lies in a region of the gamma-chain required for fibrin polymerization, suggesting that the integrity of gamma Gly292 is critical for fibrin assembly.


2020 ◽  
Vol 15 (11) ◽  
pp. 1934578X2097350
Author(s):  
Yanan Gai ◽  
Nannan Yang ◽  
Jian Chen

P-glycoprotein (P-gp) inhibition conduces to improving the ability of chemicals to cross through blood-brain barrier (BBB). The hook-bearing branch of Uncaria is used as a traditional herbal medicine for the treatment of hypertension, headache, stroke, and Alzheimer’s disease in recent years. In this study, the inhibitory effects of 8 alkaloids sourced from Uncaria plants on P-gp were evaluated. Meanwhile, the content of 8 alkaloids in 8 Chinese Uncaria species was quantified simultaneously by high-performance liquid chromatography analysis. Western blotting, real-time quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, and flow cytometry were used to evaluate the P-gp levels in MCF-7/adriamycin-resistant (ADR) cells. It was shown that hirsuteine and hirsutine, selected from 8 candidate alkaloids, could remarkably suppressed P-gp level and function in MCF-7/ADR cells when using Verapamil as positive control. By tracking their chemical distribution in 8 Chinese Uncaria species, we found that hirsuteine and hirsutine were much more abundant in Uncaria rhynchophylla and Uncaria hirsuta than in any other 6 species. And a chemical content profile of these alkaloids was plotted within 8 Chinese species.


2018 ◽  
Author(s):  
Πέτρος Μαρτσικάλης

Για την επίτευξη της ιχνηλασιμότητας των πληθυσμών ιριδίζουσας πέστροφας Oncorhynchus mykiss (Walbaum, 1792) στην Ελλάδα υιοθετήθηκε μια διαθεματική προσέγγιση, η οποία ως αλληλένδετους πυλώνες της περιελάμβανε α) την πληθυσμιακή γενετική μελέτη στο μιτοχονδριακό DNA των ιχθύων, β) την ταυτοποίηση και ποσοτικοποίηση των ελεύθερων αμινοξέων στο μυϊκό ιστό των ιχθύων και γ) τη γεωμετρική μορφομετρία του σώματος των ιχθύων, εκφράζοντας ένα αντιπροσωπευτικό δείγμα των εντατικών εκτροφών της ελληνικής επικράτειας. Η ιριδίζουσα πέστροφα αποτελεί μη γηγενές είδος των ευρωπαϊκών εσωτερικών υδάτων. Εξαιτίας όμως του γεγονότος ότι παρουσιάζει αξιοσημείωτα πλεονεκτήματα, όπως είναι η ταχεία αύξηση και η προσαρμοστικότητά της σε ποικίλα ενδιαιτήματα υπό διαφορετικές συνθήκες, εξελίχθηκε σε κυρίαρχο εντατικά εκτρεφόμενο είδος στα εσωτερικά ύδατα της Ελλάδας. Παρά τη σημαντική οικονομική σημασία της, υφίσταται παντελής έλλειψη πληθυσμιακών γενετικών μελετών αναφορικά με την προέλευση των αθρόων εισαγωγών γόνου που έλαβαν χώρα τις προηγούμενες δεκαετίες στον κλάδο της ελληνικής πεστροφοκαλλιέργειας. Για τη διενέργεια της πληθυσμιακής γενετικής μελέτης πραγματοποιήθηκε πέψη τμημάτων του μιτοχονδριακού DNA (mtDNA) που ενισχύθηκαν με την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (Polymerase Chain Reaction-PCR) με τη χρήση περιοριστικών ενζύμων (Restriction Fragment Length Polymorphism-RFLP). Τα τμήματα-στόχοι του mtDNA που πολλαπλασιάστηκαν με την τεχνική της PCR ήταν ολόκληρη η περιοχή του βρόχου εκτόπισης, τα tRNA γονίδια της προλίνης και της θρεονίνης, το κυτόχρωμα β, τα γονίδια ND-5 και ND-6 και τμήμα των γονιδίων ATPάση VI και κυτόχρωμα c οξειδάσης 3 (COIII) περιλαμβάνοντας περισσότερα από 5.500 ζεύγη βάσεων DNA από τα περίπου 16.600 ζεύγη βάσεων που απαρτίζουν το συνολικό mtDNA της ιριδίζουσας πέστροφας. Η ανάλυση της πληθυσμιακής δομής αποκάλυψε ότι οι απλότυποι διακρίνονται σε δύο κεντρικούς κλάδους. Η συνύπαρξη απλότυπων και από τους δύο κλάδους σε όλους τους πληθυσμούς ενδέχεται να υποδηλώνει την ύπαρξη κοινής γονιδιακής δεξαμενής. Επίσης, η συνολική γενετική ποικιλότητα οφειλόταν σε σημαντικό βαθμό στην ύπαρξη ποικιλότητας ενδοπληθυσμιακά παρά στην ύπαρξη ποικιλότητας ανάμεσα στους πληθυσμούς. Το ποσοστό γενετικής ποικιλότητας ανάμεσα στους πληθυσμούς σε σύγκριση με τη συνολική παρατηρούμενη ποικιλότητα αντανακλά την πανμιξία δύο αρχικών πληθυσμών (γενεών), υπογραμμίζοντας την ύπαρξη μια κοινής δεξαμενής γονιδίων σε όλες τις εντατικές εκτροφές ιριδίζουσας πέστροφας στην Ελλάδα. Αυτό το γεγονός ενισχύεται και από το δίκτυο απλότυπων που δημιουργήθηκε και αποκάλυψε την ύπαρξη δύο αρχικών κλάδων σε όλο το φάσμα των εντατικών εκτροφών. Παράλληλα, η ταυτοποίηση και ποσοτικοποίηση των ελεύθερων αμινοξέων στο μυϊκό ιστό των ιχθύων διενεργήθηκε με τη χρήση Αντίστροφης Φάσης - Υγρής Χρωματογραφίας Υψηλής Απόδοσης (Reversed Phase – High Performance Liquid Chromatography, RP-HPLC). Τα εξεταζόμενα δείγματα παρουσίασαν διαφορετικά προφίλ ελεύθερων αμινοξέων ανάλογα με τη γεωγραφική τους προέλευση. Η Ανάλυση Κύριων Συνιστωσών (Principal Component Analysis – PCA) αποκάλυψε τον σαφή διαχωρισμό των πληθυσμών μεταξύ ανατολικής και δυτικής Ελλάδας, ο οποίος ενδέχεται να οφείλεται στην ύπαρξη διακυμάνσεων στις κλιματικές συνθήκες που επικρατούν και επηρεάζουν καταλυτικά τους αβιοτικούς παράγοντες κάθε εντατικής εκτροφής. Η γεωμετρική μορφομετρία του σώματος των ιχθύων κατέδειξε την ύπαρξη σημαντικών διαφορών μεταξύ των πληθυσμών διαφορετικής προέλευσης. Η Ανάλυση Κανονικών Μεταβλητών (Canonical Variate Analysis – CVA) διέκρινε τους πληθυσμούς σε δύο ομάδες παρουσιάζοντας σε πολύ μεγάλο βαθμό ομοιότητες με τη διενεργηθείσα πληθυσμιακή γενετική μελέτη. Η διεξαγωγή των Γενικών Γραμμικών Μοντέλων (General Linear Models – GLM) δεν επέδειξε συσχέτιση των απλότυπων και της διατροφής με το σχήμα του σώματος των ιχθύων. Εντούτοις, το σχήμα του σώματος των ιχθύων παρουσίασε σημαντική συσχέτιση με τη γεωγραφική προέλευση, τη θερμοκρασία νερού, τις γεωλογικο-χημικο-κλιματικές ζώνες, την ιστιδίνη και την αργινίνη. Επομένως, η παρατηρούμενη μορφολογική διαφοροποίηση δύναται να οφείλεται στις διαφορές των αβιοτικών παραγόντων που υφίστανται μεταξύ αυτών των ζωνών όντας το αποτέλεσμα του φαινομένου της φαινοτυπικής πλαστικότητας.Συμπερασματικά, οι αβιοτικοί παράγοντες και οι συνθήκες εκτροφής διαδραματίζουν τον κυρίαρχο ρόλο σε σύγκριση με την προέλευση του γόνου. Η παρούσα διαθεματική προσέγγιση αποτελεί ένα πολύτιμο και χρήσιμο εργαλείο στην αποτελεσματική ιχνηλασιμότητα των εντατικά εκτρεφόμενων πληθυσμών ιριδίζουσας πέστροφας, έχοντας καθοριστική συνεισφορά και προάγοντας την έρευνα σε τομείς, όπως η περιβαλλοντική ανάλυση κινδύνων για την αξιολόγηση ενδεχόμενων οικολογικών επιπτώσεων που στοχεύουν στην επίτευξη της αειφορικής διαχείρισης των ιχθυοκαλλιεργειών.


Blood ◽  
1990 ◽  
Vol 75 (8) ◽  
pp. 1659-1663 ◽  
Author(s):  
S Bantia ◽  
WR Bell ◽  
CV Dang

Fibrinogen Baltimore III, a congenital abnormal fibrinogen with impaired fibrin monomer polymerization, displays a normal gamma-chain and a gamma-variant that has an apparently lower relative molecular weight (mol wt) than normal on sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Reverse phase high-performance liquid chromatography (HPLC) analysis of the lysyl endopeptidase digest of the purified gamma-chains of fibrinogen Baltimore III revealed the presence of a peptide that is not found in the digest of the normal fibrinogen gamma-chain. Amino acid sequence analysis of this peptide indicated that the gamma-chain residue 308, asparagine, is replaced by isoleucine. Concanavalin A bound both normal and variant gamma-chains of fibrinogen Baltimore III, indicating that the carbohydrate moiety is not altered and is not responsible for the increase in electrophoretic mobility of the Baltimore III gamma-chain. This study suggests that the integrity of gamma Asn308 is critical for fibrin monomer polymerization, since alteration to either a basic (fibrinogen Kyoto I, Asn----Lys) or hydrophobic (Asn----Ile) residue results in significantly delayed polymerization of fibrinogen to fibrin.


2002 ◽  
Vol 958 (1-2) ◽  
pp. 167-182 ◽  
Author(s):  
Martin Gilar ◽  
Kenneth J. Fountain ◽  
Yeva Budman ◽  
Uwe D. Neue ◽  
Kurt R. Yardley ◽  
...  

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document