Detecção molecular e análise filogenética da sequência parcial do gene da proteína do capsídeo do vírus da faixa das nervuras do morangueiro

O morango cultivado (Fragaria x ananassa Duch. (Rosaceae) é um híbrido originado pelo cruzamento das espécies americanas Fragaria chiloensis e Fragaria virginiana e pertence à família Rosaceae. O morangueiro possui reprodução vegetativa e, por isso, é comum o acúmulo de viroses e outras doenças de difícil controle. Uma das quatro viroses mais importantes na cultura do morango é causada pelo vírus da faixa das nervuras (Strawberry vein banding virus – SVBV), que é transmitido no campo por afídeos, de maneira semipersistente. Para melhorar o conhecimento genômico, são recomendadas técnicas moleculares e a classificação de isolados de SVBV. Um dos determinantes primários da transmissibilidade e especificidade por afídeos é a proteína do capsídeo, que possui importância crítica para o estabelecimento da infecção. Neste trabalho, foi sequenciada parcialmente a proteína do capsídeo do gene do SVBV de um isolado alemão, inoculado em morangueiros e mantido em casa de vegetação no Brasil, por mais de dez anos. Foi realizada a análise filogenética comparando as sequências contidas no GenBank com o objetivo de elucidar as relações evolutivas nesta espécie. As análises filogenéticas mostraram que a sequência do isolado está mais próxima dos isolados dos EUA e Egito. Estes resultados contribuem para a melhor elucidação dos mecanismos de evolução do vírus e do patossistema em questão.

Sequencing a Strawberry Germplasm Collection Reveals New Viral Genetic Diversity and the Basis for New RT-qPCR Assays

Viruses are considered of major importance in strawberry (Fragaria × ananassa Duchesne) production given their negative impact on plant vigor and growth. Strawberry accessions from the National Clonal Germplasm Repository were screened for viruses using high throughput sequencing (HTS). Analyses of sequence information from 45 plants identified multiple variants of 14 known viruses, comprising strawberry mottle virus (SMoV), beet pseudo yellows virus (BPYV), strawberry pallidosis-associated virus (SPaV), tomato ringspot virus (ToRSV), strawberry mild yellow edge virus (SMYEV), strawberry vein banding virus (SVBV), strawberry crinkle virus (SCV), strawberry polerovirus 1 (SPV-1), apple mosaic virus (ApMV), strawberry chlorotic fleck virus (SCFaV), strawberry crinivirus 4 (SCrV-4), strawberry crinivirus 3 (SCrV-3), Fragaria chiloensis latent virus (FClLV) and Fragaria chiloensis cryptic virus (FCCV). Genetic diversity of sequenced virus isolates was investigated via sequence homology analysis, and partial-genome sequences were deposited into GenBank. To confirm the HTS results and expand the detection of strawberry viruses, new reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) assays were designed for the above-listed viruses. Further in silico and in vitro validation of the new diagnostic assays indicated high efficiency and reliability. Thus, the occurrence of different viruses, including divergent variants, among the strawberries was verified. This is the first viral metagenomic survey in strawberry, additionally, this study describes the design and validation of multiple RT-qPCR assays for strawberry viruses, which represent important detection tools for clean plant programs.

Actividad antimicrobiana del extracto hidroalcohólico de Calendula officinalis L.

La búsqueda de productos naturales, con determinadas funciones como aditivos alimentarios, son de gran interés investigativo por su proyección industrial. Por esta razón, el presente documento muestra los resultados de un estudio exploratorio sobre la actividad antibacteriana de un extracto hidroalcohólico de Calendula officinalis L., el cual se caracterizó mediante análisis fitoquímico, espectroscopía Infrarroja-Attenuated Total Reflection (IR-ATR), y cromatografía de gases acoplada a masas (CG-MS). El poder antimicrobiano se determinó sobre Pseudomona aeruginosa, Staphyloccocus aureus, y Candida albicans. Finalmente, se realizó una aplicación sobre fresa (Fragaria chiloensis L.), con el fin de observar el efecto sobre la vida útil del fruto, esto en las condiciones ambientales de temperatura 20 °C y humedad relativa 70%. Los resultados muestran que el extracto hidroalcohólico es una mezcla de diversos compuestos químicos, con buenas propiedades como biocompuestos activos. Finalmente se evidencia la presencia de taninos, carotenoides y compuestos fenólicos, entre otros, los cuales, de acuerdo con el estudio de actividad antimicrobiana, mejoraron la vida útil de la F. chiloensis.

Możliwości poprawy jakości owoców truskawki metodą hybrydyzacji wewnątrz- i międzygatunkowej w obrębie rodzaju Fragaria

Prace badawcze nad poszerzaniem zmienności genetycznej u truskawki na świecie ukierunkowane są głównie na poprawę zewnętrznej i wewnętrznej jakości owoców. Celem podjętych w Instytucie Ogrodnictwa badań było określenie możliwości zwiększenia zawartości substancji bioaktywnych (przede wszystkim polifenoli, antocyjanów oraz kwasów organicznych) w owocach truskawki metodą hodowli konwencjonalnej. Na podstawie dwuletniej oceny fenotypowej spośród 6097 siewek, otrzymanych w wyniku krzyżowań wewnątrz- i międzygatunkowych w obrębie rodzaju Fragaria, wyselekcjonowano 90 wartościowych genotypów. W roku 2019 genotypy te oceniono pod względem plonu, masy, atrakcyjności i jędrności owoców, a także zawartości w owocach ekstraktu, związków fenolowych, antocyjanów i kwasu askorbinowego. Stwierdzono, że największe, najbardziej atrakcyjne i jędrne owoce wytworzyły klony T-201536-16 i T-201536-08 (‘Clery’ × ‘Grandarosa’), T-201514-04 i T-201514-05 (‘Candiss’ × ‘Panvik’) oraz T-201560-07 (‘Onda’ × ‘Panvik’). Największą zawartością ekstraktu odznaczały się owoce genotypów T-201536-16 i T-201536-09 (‘Clery’ × ‘Grandarosa’). Najwięcej związków fenolowych zawierały owoce klonów T-201501-02 (‘Alba’ × ‘Grandarosa’), T-201512-04 (‘Camarosa’ × ‘Panvik’) oraz T-201567-01 (‘Patty’ × ‘Panvik’), zaś antocyjanów - owoce klonów T-201514-08 (‘Candiss’ × ‘Panvik’), T-201508-01 (‘Alice’ × ‘Matis’), T-201517-05 (‘Chandler’ × ‘Matis’) oraz T-201580-01 (Fragaria chiloensis Del Norte × ‘Elsanta’). Najbardziej bogate w kwas askorbinowy były owoce klonów T-201526-05 (‘Cigaline’ × ‘Grandarosa’), T-201501-03 (‘Alba’ × ‘Grandarosa’), T-201536-15 (‘Clery’ × ‘Grandarosa’) oraz T-201567-01 (‘Patty’ × ‘Panvik’). Najwyższą łączną zawartością wszystkich analizowanych związków bioaktywnych w owocach odznaczały się klony T-201514-08 (‘Candiss’ × ‘Panvik’), T-201517-05 (‘Chandler’ × ‘Matis’) oraz T-201567-04 (‘Patty’ × ‘Panvik’).