Особенности раннего онтогенеза анабаса Anabas testudineus (Anabantidae), связанные с динамикой плавучести

2019 ◽  
Vol 59 (5) ◽  
pp. 579-589
Author(s):  
К. Ф. Дзержинский ◽  
Д. Д. Зворыкин ◽  
С. В. Будаев
Keyword(s):  
Anabas Testudineus

ẢNH HƯỞNG CỦA ĐỘ MẶN ĐẾN QUÁ TRÌNH ƯƠNG CÁ RÔ ĐẦU VUÔNG (Anabas testudineus Bloch, 1792)

2015 ◽  
Vol 104 (5) ◽  
Author(s):  
Trần Nguyên Ngọc ◽  
Lê Văn Dân
Keyword(s):  
Anabas Testudineus

Nghiên cứu được tiến hành trên cá Rô đầu vuông ở Trung tâm giống thủy sản nước ngọt cấp I – Thừa Thiên Huế với mục tiêu xác định ảnh hưởng của các nồng độ muối khác nhau đến quá trình ương từ đó có thể chủ động cung cấp nguồn giống cá Rô đầu vuông có khả năng phát triển bình thường trong môi trường rộng muối, góp phần đưa loài cá này trở thành đối tượng nuôi nước lợ, làm đa dạng hóa đối tượng nuôi ở vùng nước lợ đầm phá tỉnh Thừa Thiên Huế. Thí nghiệm được bố trí ngẫu nhiên hoàn toàn gồm 8 nghiệm thức có nồng  độ muối là 0‰, 3‰, 5‰, 7‰, 9‰, 11‰, 13‰, 15‰ với 3 lần lặp lại. Kết quả cho thấy, độ mặn ảnh hưởng đến quá trình ương của cá Rô đầu vuông, trong đó ở mức độ mặn 0‰ và 5‰ , cho tỷ lệ sống và tốc độ sinh trưởng cao nhất. Đặc biệt ở mức đô mặn 5‰  đạt kết quả tối ưu sau 30 ngay ương và có sự sai khác thống kê (P <0,05) so với các mức độ mặn 3‰, 7‰, 9‰, 11‰, 13‰, 15‰. Các yếu tố môi trường đều nằm trong khoảng giới hạn, thích hợp cho sự sinh trưởng và phát triển cá Rô đầu vuông. Từ khóa: Cá Rô đầu vuông, độ mặn, tỷ lệ sống, tốc độ sinh trưởng

scholarly journals Isolation and characterization of two virulent Aeromonads associated with haemorrhagic septicaemia and tail-rot disease in farmed climbing perch Anabas testudineus

2021 ◽  
Vol 11 (1) ◽  
Author(s):  
Abhishek Mazumder ◽  
Hrishikesh Choudhury ◽  
Abhinit Dey ◽  
Dandadhar Sarma
Keyword(s):  
Natural Infection ◽  
Winter Season ◽  
Pcr Amplification ◽  
Body Parts ◽  
Anabas Testudineus ◽  
Climbing Perch ◽  
Isolation And Characterization ◽  
Biochemical Characterisation ◽  
Rot Disease

AbstractDiseased Anabas testudineus exhibiting signs of tail-rot and ulcerations on body were collected from a fish farm in Assam, India during the winter season (November 2018 to January 2019). Swabs from the infected body parts were streaked on sterilized nutrient agar. Two dominant bacterial colonies were obtained, which were then isolated and labelled as AM-31 and AM-05. Standard biochemical characterisation and 16S rRNA and rpoB gene sequencing identified AM-31 isolate as Aeromonas hydrophila and AM-05 as Aeromonas jandaei. Symptoms similar to that of natural infection were observed on re-infecting both bacteria to disease-free A. testudineus, which confirmed their virulence. LC50 was determined at 1.3 × 104 (A. hydrophila) and 2.5 × 104 (A. jandaei) CFU per fish in intraperitoneal injection. Further, PCR amplification of specific genes responsible for virulence (aerolysin and enterotoxin) confirmed pathogenicity of both bacteria. Histopathology of kidney and liver in the experimentally-infected fishes revealed haemorrhage, tubular degeneration and vacuolation. Antibiotic profiles were also assessed for both bacteria. To the best of our knowledge, the present work is a first report on the mortality of farmed climbing perch naturally-infected by A. hydrophila as well as A. jandaei, with no records of pathogenicity of the latter in this fish.

scholarly journals Fast and efficient Rmap assembly using the Bi-labelled de Bruijn graph

2021 ◽  
Vol 16 (1) ◽  
Author(s):  
Kingshuk Mukherjee ◽  
Massimiliano Rossi ◽  
Leena Salmela ◽  
Christina Boucher
Keyword(s):  
Single Molecule ◽  
De Bruijn Graph ◽  
Anabas Testudineus ◽  
E Coli ◽  
Genome Wide ◽  
A Genome ◽  
De Bruijn ◽  
Optical Maps ◽  
Definition Of ◽  
Numeric Representation

AbstractGenome wide optical maps are high resolution restriction maps that give a unique numeric representation to a genome. They are produced by assembling hundreds of thousands of single molecule optical maps, which are called Rmaps. Unfortunately, there are very few choices for assembling Rmap data. There exists only one publicly-available non-proprietary method for assembly and one proprietary software that is available via an executable. Furthermore, the publicly-available method, by Valouev et al. (Proc Natl Acad Sci USA 103(43):15770–15775, 2006), follows the overlap-layout-consensus (OLC) paradigm, and therefore, is unable to scale for relatively large genomes. The algorithm behind the proprietary method, Bionano Genomics’ Solve, is largely unknown. In this paper, we extend the definition of bi-labels in the paired de Bruijn graph to the context of optical mapping data, and present the first de Bruijn graph based method for Rmap assembly. We implement our approach, which we refer to as rmapper, and compare its performance against the assembler of Valouev et al. (Proc Natl Acad Sci USA 103(43):15770–15775, 2006) and Solve by Bionano Genomics on data from three genomes: E. coli, human, and climbing perch fish (Anabas Testudineus). Our method was able to successfully run on all three genomes. The method of Valouev et al. (Proc Natl Acad Sci USA 103(43):15770–15775, 2006) only successfully ran on E. coli. Moreover, on the human genome rmapper was at least 130 times faster than Bionano Solve, used five times less memory and produced the highest genome fraction with zero mis-assemblies. Our software, rmapper is written in C++ and is publicly available under GNU General Public License at https://github.com/kingufl/Rmapper.

Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document