ĐA HÌNH ĐƠN NUCLEOTIDE RS2856718 CỦA GEN HLA-DQ TRÊN BỆNH NHÂN UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN

Mạc Thị Tịnh; Nguyễn Trọng Tuệ; Hồ Cẩm Tú; Nguyễn Hoàng Việt; Nguyễn Thu Thúy

doi:10.51298/vmj.v508i2.1610

ĐA HÌNH ĐƠN NUCLEOTIDE RS2856718 CỦA GEN HLA-DQ TRÊN BỆNH NHÂN UNG THƯ BIỂU MÔ TẾ BÀO GAN

Tạp chí Y học Việt Nam ◽

10.51298/vmj.v508i2.1610 ◽

2022 ◽

Vol 508 (2) ◽

Author(s):

Mạc Thị Tịnh ◽

Nguyễn Trọng Tuệ ◽

Hồ Cẩm Tú ◽

Nguyễn Hoàng Việt ◽

Nguyễn Thu Thúy

Keyword(s):

Rt Pcr ◽

Hla Dq

Ung thư gan nguyên phát là bệnh ung thư phổ biến và có tỉ lệ tử vong cao. Gen HLA-DQ mã hóa các chuỗi polypeptid của phân tử MHC lớp II tham gia hoạt hóa tế bào trình diện kháng nguyên trong đáp ứng miễn dịch. Đa hình đơn nucleotide (SNP) rs2856718 của gen HLA-DQ có thể liên quan tới nhiễm virus viêm gan B mãn tính và nguy cơ ung thư biểu mô tế bào gan. Nghiên cứu này được thực hiện nhằm mục tiêu xác định sự phân bố của SNP rs2856718, đồng thời đánh giá mối liên quan giữa SNP này với nguy cơ mắc ung thư biểu mô tế bào gan. Kỹ thuật RT-PCR được sử dụng để xác định kiểu gen SNP rs2856718 trên 93 bệnh nhân ung thư biểu mô tế bào gan và 93 người khỏe mạnh. Kết quả đã xác định được tỷ lệ kiểu gen GG, AG, AA ở nhóm bệnh là 39,8%, 46,2%, 14% và nhóm chứng là 30,1%, 53,8%, 16,1%. Chưa tìm thấy mối liên quan giữa SNP rs2856718 với nguy cơ ung thư biểu mô tế bào gan cũng như với một số yếu tố nguy cơ khác.

Download Full-text

Detection of Nucleic Acids in Cells or Tissue Sections Using In situ Polymerase Chain Reaction (PCR)

Proceedings, annual meeting, Electron Microscopy Society of America ◽

10.1017/s0424820100162545 ◽

1996 ◽

Vol 54 ◽

pp. 16-17

Author(s):

J. R. Hully ◽

K. R. Luehrsen ◽

K. Aoyagi ◽

C. Shoemaker ◽

R. Abramson

Keyword(s):

Nucleic Acids ◽

Viral Infections ◽

Anatomical Location ◽

Rt Pcr ◽

Reverse Transcription Pcr ◽

Cellular Source ◽

Gene Transcripts ◽

Initial Description ◽

In Cells

The development of PCR technology has greatly accelerated medical research at the genetic and molecular levels. Until recently, the inherent sensitivity of this technique has been limited to isolated preparations of nucleic acids which lack or at best have limited morphological information. With the obvious exception of cell lines, traditional PCR or reverse transcription-PCR (RT-PCR) cannot identify the cellular source of the amplified product. In contrast, in situ hybridization (ISH) by definition, defines the anatomical location of a gene and/or it’s product. However, this technique lacks the sensitivity of PCR and cannot routinely detect less than 10 to 20 copies per cell. Consequently, the localization of rare transcripts, latent viral infections, foreign or altered genes cannot be identified by this technique. In situ PCR or in situ RT-PCR is a combination of the two techniques, exploiting the sensitivity of PCR and the anatomical definition provided by ISH. Since it’s initial description considerable advances have been made in the application of in situ PCR, improvements in protocols, and the development of hardware dedicated to in situ PCR using conventional microscope slides. Our understanding of the importance of viral latency or viral burden in regards to HIV, HPV, and KSHV infections has benefited from this technique, enabling detection of single viral copies in cells or tissue otherwise thought to be normal. Clearly, this technique will be useful tool in pathobiology especially carcinogenesis, gene therapy and manipulations, the study of rare gene transcripts, and forensics.

Download Full-text