Species composition and distribution of some phytoplankton in Myeik Archipelago, Southern Myanmar

The species composition and distribution of some phytoplankton, the primary producer in the food chain of fish and shrimp, was studied from water samples that collected at surface layer of 20 stations in the Myeik Archipelago, Southern Myanmar from 2010 to 2018. A total of 144 species comprised of 123 species of diatoms and 21 species of dinoflagellate were recorded in the Myeik Archipelago. Among them, the most number 93 species of phytoplankton was recorded in Done Pale Aw Station however the lowest 26 species found in Le' Al' Thal Tan Station. The common representative species were ten diatoms species such as Chaetoceros curvisetus, Ditylum sol, Lauderia annulata, Nitzschia longissima, Odotella sinensis, Pleurosigma normanii, Pseudo Nitzschia seriata, Rhizosolenia setigera, Thalassionema nitzschioides and T. frauenfeldii and then one of dinoflagellate, Ceratium furca. Moreover, the percentage of diatom (87%) was higher than the dinoflagellate (13%) during the study period. The temperature 25-30°C and salinity 4-34‰ was found in the Myeik Archipelago during the study period.

Late Holocene precipitation variability recorded in the sediments of Reloncaví Fjord (41°S, 72°W), Chile

We present reconstructions of late Holocene changes in the source of organic matter and siliceous export production in the Relocanví Fjord (41°S, 72°W), Northern Chilean Patagonia, based on organic carbon content, δ13Corg, N/C ratio, diatom assemblages and biogenic silica contents from three sediment cores. The age models are based on a combination of 210Pb profiles, AMS 14C dating, and on the first occurrence of the diatom Rhizosolenia setigera f. pungens, as a stratigraphic marker in the fjords. The cores span the last 300 to 700 yr. Diatoms dominate the siliceous assemblages in the three cores (98% on average). Our results suggest that precipitation seasonality in the region of Reloncaví was high in CE 1300–1400 and CE 1700–1850, with a clear decreasing trend since CE 1850. The latter trend is in agreement with instrumental records and tree-ring reconstructions. These fluctuations seem to be associated with the Southern Annular Mode (SAM).

Kelimpahan dan komposisi fitoplankton di perairan Teluk Kodek Pemenang Lombok Utara

Abstrak. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kelimpahan dan komposisi fitoplankton di Teluk Kodek Pemenang Lombok Utara. Penelitian ini menggunakan metode survey pada 4 stasiun di perairan Teluk Kodek pada Bulan Agustus 2012 dan analisa fitoplankton dilakukan di Laboratorium Perikanan Program Studi Budidaya Perairan Universitas Mataram. Hasil penelitian menunjukkan bahwa kelimpahan fitoplankton di perairan Teluk Kodek pada bulan Agustus 2012 adalah 6557 ind/l. Tercatat 20 spesies fitoplankton yang ditemukan yang dikelompokkan menjadi dua kelompok besar yaitu diatom dan dinoflagelata. Kelompok diatom terdiri 11 spesies, yaitu; Guinardia flaccida, Rhizosolenia setigera, Navicula sp., Chaetoceros sp., Thalassionema nitzschioides, Pleurosigma normanii, Planktoniella sol, Pseudo-nitzchia brasiliana, Lauderia annulata, Socphanopysis palmeriana, Oscillatoria sp., sedangkan dari kelompok dinoflagelata terdiri dari 9 spesies, yaitu; Pyrocytis noutiluca, Dinophysis cudate., Prorocentrum lima, Alexandrium tamarence, Ceratium fusus, C. incisum, C. boehmii, Torodium teredo and Odontella sinensis. Indeks keragaman phytoplankton Teluk Kodek adalah 0,1307 dan masuk kategori keanekaragaman rendah, sedangkan indek keseragaman diperoleh nilai 0,207 dan masuk kategori keseragaman rendah. Nilai tersebut menunjukkan bahwa komunitas fitoplankton di perairan Teluk Kodek pada Bulan Agustus 2012 tidak stabil.Kata Kunci: Diatom; Dinoflagelata; Keanekaragaman; Budidaya Laut.

Isolation and Characterization of a Single-Stranded RNA Virus Infecting the Bloom-Forming Diatom Chaetoceros socialis

ABSTRACT Diatoms are very significant primary producers in the world's oceans. Various environmental factors affect the depletion of diatom populations. The importance of viruses as a potential mortality source has recently been recognized. We isolated and characterized a new diatom virus (Chaetoceros socialis f. radians RNA virus [CsfrRNAV]) causing the lysis of the bloom-forming species Chaetoceros socialis Lauder f. radians (Schütt) Proschkina-Lavrenko. The virus infectious to C. socialis f. radians was isolated from water samples collected in Hiroshima Bay. Here we show the physiology, morphology, and genome characteristics of the virus clone. Virions were 22 nm in diameter and accumulated in the cytoplasm of the host cells. The latent period and the burst size were estimated to be <48 h and 66 infectious units per host cell, respectively. CsfrRNAV harbors a single-stranded RNA (ssRNA) genome and encodes at least three polypeptides of 32.0, 28.5, and 25.0 kDa. Sequencing analysis shows the length of the genome is 9,467 bases, excluding a poly(A) tail. The monophyly of CsfrRNAV and other diatom-infecting RNA viruses, Rhizosolenia setigera RNA virus and Chaetoceros tenuissimus RNA virus, was strongly supported by phylogenetic analysis based on the amino acid sequence of the RNA-dependent RNA polymerase domains. This suggested a new ssRNA virus family, Bacillariornaviridae. This discovery of CsfrRNAV may aid in further understanding the ecological dynamics of the C. socialis f. radians population in nature and the relationships between ssRNA diatom viruses and their hosts.

Siliceous microfossil record of late Holocene oceanography and climate along the west coast of Vancouver Island, British Columbia (Canada)

Diatoms, silicoflagellates, and biogenic silica (BSi) were analyzed from two piston cores recovered from Effingham Inlet, British Columbia. Relatively productive marine conditions from 4850 to 4000 cal yr BP were followed by a transition to the modern ocean–climate regime marked by a decreased siliceous microfossil production since 2800 cal yr BP. This change in the northeast Pacific climate was characterized by an apparent cooling associated with higher rainfall and lower light levels. The reduced abundance of most spring–summer bloom diatom taxa (Skeletonema–Thalassiosira–Chaetoceros) was coupled with a decreased abundance of diatoms normally associated with incursions of offshore water into coastal inlets. This pattern reflected a weaker summer upwelling along Vancouver Island associated with the insolation-related increase in the strength of the Aleutian Low and a weakened North Pacific High. After ca. 2800 cal yr BP, diatom assemblages also indicated more frequent periods of relatively low spring–summer surface water salinity and a disruption of the typical bloom sequence, indicative of increased climatic variability. A period of warmer and drier climate conditions and possibly increased coastal upwelling offshore occurred ca. 1450–1050 cal yr BP. The most recent 500 yr are marked by reduced diatom production and the appearance of three distinct diatom biomarkers in the stratigraphic record (Rhizosolenia setigera ca. AD 1940; Minidiscus chilensis ca. AD 1860; Thalassionema nitzschioides morphotype A, ca. AD 1550). The oceanographic changes recorded in Effingham Inlet are correlative with other marine and terrestrial paleoenvironmental records in the northeast Pacific Ocean.

Diatomeas de ambientes costeros de la provincia de Buenos Aires

Diatomeas de ambientes costeros de la Provincia de Buenos Aires. Análisis taxonómico de los géneros que incluyen especies productoras de floraciones algales nocivas. Muchas especies de microalgas en general y de diatomeas en particular, están implicadas en la producción de floraciones algales nocivas. Además de las especies de diatomeas productoras de ácido domoico, la literatura reporta casos de severas pérdidas económicas para la acuicultura, pesquerías y turismo, debidas a floraciones de especies nocivas de diatomeas no toxígenas. El presente trabajo de Tesis doctoral tiene como objetivos estudiar desde el punto de vista taxonómico, nomenclatural y distribucional las especies y variedades halladas en el área norte del litoral marítimo de la Provincia de Buenos Aires que pertenecen a los géneros Thalassiosira, Rhizosolenia sensu lato, Coscinodiscus, Chaetoceros, Cerataulina, Leptocylindrus, Ceratoneis y Asterionellopsis, algunas de cuyas especies han sido citadas como productoras de eventos nocivos no toxígenos en otras áreas geográficas, determinar cuáles de ellas fueron productoras de floraciones en el área de estudio y buscar relaciones entre floraciones detectadas y eventos nocivos registrados. El material sobre el cual se llevó a cabo el estudio fue colectado en ocho estaciones de muestreo ubicadas en el litoral costero de la Provincia de Buenos Aires, entre los paralelos 36º20’ y 37°20’ Lat. S. La frecuencia de muestreo fue estacional en el período octubre 1994-octubre 1996, bimestral entre octubre 1996-enero 1999 y mensual entre octubre 1999-octubre de 2000. Las muestras cualitativas fueron tomadas en la parte superficial de la columna de agua, entre los 0 y 5 metros de profundidad, con red de plancton de 30 µm de apertura de malla, fijadas con formol al 4%, posteriormente tratadas por los métodos convencionales para destrucción de materia orgánica y montadas para su observación con microscopio óptico y microscopio electrónico de barrido. Las muestras sin tratar, las tratadas y los preparados permanentes correlativamente rotulados, fueron incorporados a la Colección de Diatomeas Argentinas, depositada en el Departamento Científico Ficología de la Facultad de Ciencias Naturales y Museo, UNLP, bajo los números LPC 4250 al 4449 y 4485 al 4495. Setenta taxa fueron determinados, descriptos, discutidos, ilustrados y comparados con los taxa más allegados. Thalassiosira fryxelliae Sar & Sunesen es una especie nueva para la ciencia, Chaetoceros filiferus Karsten es citada por primera vez para el Océano Atlántico Sudoccidental, Rhizosolenia hyalina Ostenfeld y Cerataulina dentata Hasle son citadas por primera vez para Argentina y Thalassiosira frenguelliopsis Fryxell & Johansen, T. gracilis var. gracilis (Karsten) Hustedt, T. mala Takano, T. minima Gaarder y Leptocylindrus minimus Gran son citadas por primera vez para la costa bonaerense. En el caso de los otros sesenta y un taxa estudiados, sólo veinte (la mayoría de ellos pertenecientes al género Thalassiosira) han sido previamente analizados con microscopio electrónico sobre material proveniente de ésta y otras áreas de Argentina, mientras que los reportes de los restantes han sido realizados en base a observaciones llevadas a cabo con microscopio óptico, con algún análisis morfológico o solamente en listas de especies. Dado que en muchos de estos casos la morfología a nivel de microscopía óptica es insuficiente para realizar determinaciones fehacientes, nuestros resultados permiten confirmar la presencia de dichos taxa para el área y aportan nueva información ultraestructural sobre muchos de ellos. Sólo ocho especies y dos variedades pertenecientes a los géneros a que nos abocamos en este trabajo: Coscinodiscus radiatus Ehrenberg, Thalassiosira eccentrica (Erhenberg) Cleve, T. hendeyi Hasle & Fryxell, T. angulata (Gregory) Hasle, T. Nodulolineata (Hendey) Hasle & Fryxell, T. oestrupii var. venrickae Fryxell & Hasle, Asterionellopsis glacialis (Castracane) Round, Thalassiosira punctigera (Castracane) Hasle, Coscinodiscus perforatus Ehrenberg y C. jonesianus var. commutata (Grunow) Hustedt, fueron halladas en todos los muestreos o en alrededor del 90% de ellos, es decir, son componentes habituales, a veces abundantes o dominantes, del plancton del área de estudio. Los taxa potencialmente nocivos encontrados fueron Coscinodiscus wailesii Gran & Angst, C. concinnus Wm. Smith, Rhizosolenia setigera Brightwell f. setigera, R. Setigera f. pungens (Cleve-Euler) Brunel, Proboscia alata (Brightwell) Sundström, Pseudosolenia calcar-avis (Schultze) Sundström, Thalassiosira anguste-lineata (Schmidt) Fryxell & Hasle, T. curviseriata Takano, T. fryxelliae, T. mala, T. minima, T. minuscula Krasske, T. rotula Meunier, T. simonsenii Hasle & Fryxell, T. proschkinae Makarova, Chaetoceros danicus Cleve, Ch. socialis Lauder, Ch. debilis Cleve, Ch. lorenzianus Grunow, Asterionellopsis glacialis, Cerataulina pelagica (Cleve) Hendey, Ceratoneis closterium Ehrenberg y Leptocylindrus minimus. De todos ellos, Asterionellopsis glacialis fue la única especie que produjo floraciones nocivas en la costa bonaerense que afectaron al turismo durante los meses de verano. Coscinodiscus wailesii, Rhizosolenia setigera f. setigera, R. setigera f. pungens y Pseudosolenia calcar-avis, fueron ocasionalmente abundantes en el plancton del área, a pesar de lo cual no han estado relacionados con eventos nocivos.