scholarly journals Antimicrobial Resistance, FlaA Sequencing, and Phylogenetic Analysis of Campylobacter Isolates from Broiler Chicken Flocks in Greece

2021 ◽  
Vol 8 (5) ◽  
pp. 68
Author(s):  
George Natsos ◽  
Niki K. Mouttotou ◽  
Emmanouil Magiorkinis ◽  
Anastasios Ioannidis ◽  
Maria Magana ◽  
...  
Keyword(s):  
Antimicrobial Resistance ◽  
Molecular Epidemiology ◽  
High Resistance ◽  
Phylogenetic Trees ◽  
Human Infection ◽  
Poultry Meat ◽  
Thermophilic Campylobacter ◽  
Resistance Patterns ◽  
Human Campylobacteriosis ◽  
Campylobacter Spp

Human campylobacteriosis caused by thermophilic Campylobacter species is the most commonly reported foodborne zoonosis. Consumption of contaminated poultry meat is regarded as the main source of human infection. This study was undertaken to determine the antimicrobial susceptibility and the molecular epidemiology of 205 Campylobacter isolates derived from Greek flocks slaughtered in three different slaughterhouses over a 14-month period. A total of 98.5% of the isolates were resistant to at least one antimicrobial agent. In terms of multidrug resistance, 11.7% of isolates were resistant to three or more groups of antimicrobials. Extremely high resistance to fluoroquinolones (89%), very high resistance to tetracycline (69%), and low resistance to macrolides (7%) were detected. FlaA sequencing was performed for the subtyping of 64 C. jejuni and 58 C. coli isolates. No prevalence of a specific flaA type was observed, indicating the genetic diversity of the isolates, while some flaA types were found to share similar antimicrobial resistance patterns. Phylogenetic trees were constructed using the neighbor-joining method. Seven clusters of the C. jejuni phylogenetic tree and three clusters of the C. coli tree were considered significant with bootstrap values >75%. Some isolates clustered together were originated from the same or adjacent farms, indicating transmission via personnel or shared equipment. These results are important and help further the understanding of the molecular epidemiology and antimicrobial resistance of Campylobacter spp. derived from poultry in Greece.

scholarly journals Seasonal variability of thermophilic Campylobacter spp. in raw milk sold by automatic vending machines in Lombardy

2016 ◽  
Vol 5 (3) ◽  
Author(s):  
Barbara Bertasi ◽  
Marina Nadia Losio ◽  
Paolo Daminelli ◽  
Guido Finazzi ◽  
Andrea Serraino ◽  
...  
Keyword(s):  
Raw Milk ◽  
Human Infection ◽  
Seasonal Trend ◽  
Fecal Shedding ◽  
Vending Machines ◽  
Thermophilic Campylobacter ◽  
Wide Range ◽  
Significant Difference ◽  
Human Campylobacteriosis ◽  
Campylobacter Spp

In temperate climates, a seasonal trend was observed in the incidence of human campylobacteriosis cases, with peaks reported in spring and autumn in some countries, or in summer in others; a similar trend was observed in <em>Campylobacter</em> spp. dairy cattle fecal shedding, suggesting that cattle may play a role in the seasonal peak of human infection. The objectives of this study were to assess if a seasonal trend in thermophilic <em>Campylobacter</em> spp. contamination of raw milk exists and to evaluate a possible relation between this and the increase of human campylobacteriosis incidence in summer months. The results showed a mean prevalence of 1.6% of milk samples positive for thermophilic <em>Campylobacter</em> spp. with a wide range in different months during the three years considered of 0.0-3.1%. The statistical analysis showed a significant difference (P&lt;0.01) of the prevalence of positive samples for thermophilic <em>Campylobacter</em> spp. between warmer and cooler months (2.3% <em>vs</em> 0.6%). The evidence of a seasonal trend in thermophilic <em>Campylobacter</em> spp. contamination of raw milk sold for direct consumption, with an increase of the prevalence in warmer months, may represent one of the possible links between seasonal trend in cattle fecal shedding and seasonal trend in human campylobacteriosis.

scholarly journals Campylobacter jejuni from Canine and Bovine Cases of Campylobacteriosis Express High Antimicrobial Resistance Rates against (Fluoro)quinolones and Tetracyclines

Pathogens ◽  
2020 ◽  
Vol 9 (9) ◽  
pp. 691
Author(s):  
Sarah Moser ◽  
Helena Seth-Smith ◽  
Adrian Egli ◽  
Sonja Kittl ◽  
Gudrun Overesch
Keyword(s):  
Veterinary Medicine ◽  
Antimicrobial Resistance ◽  
Treatment Options ◽  
Tetracycline Resistance ◽  
Antimicrobial Treatment ◽  
Human Infection ◽  
Quinolone Resistance ◽  
European Program ◽  
Resistance Rates ◽  
Human Campylobacteriosis

Campylobacter (C.) spp. from poultry is the main source of foodborne human campylobacteriosis, but diseased pets and cattle shedding Campylobacter spp. may contribute sporadically as a source of human infection. As fluoroquinolones are one of the drugs of choice for the treatment of severe human campylobacteriosis, the resistance rates of C. jejuni and C. coli from poultry against antibiotics, including fluoroquinolones, are monitored within the European program on antimicrobial resistance (AMR) in livestock. However, much less is published on the AMR rates of C.jejuni and C. coli from pets and cattle. Therefore, C. jejuni and C. coli isolated from diseased animals were tested phenotypically for AMR, and associated AMR genes or mutations were identified by whole genome sequencing. High rates of resistance to (fluoro)quinolones (41%) and tetracyclines (61.1%) were found in C. jejuni (n = 29/66). (Fluoro)quinolone resistance was associated with the known point mutation in the quinolone resistance-determining region (QRDR) of gyrA, and tetracycline resistance was mostly caused by the tet(O) gene. These high rates of resistance, especially to critically important antibiotics in C. jejuni and C. coli, are worrisome not only in veterinary medicine. Efforts to preserve the efficacy of important antimicrobial treatment options in human and veterinary medicine have to be strengthened in the future.

Isolation and Identification of Campylobacter spp. from Poultry and Poultry By-Products in Tunisia by Conventional Culture Method and Multiplex Real-Time PCR

2017 ◽  
Vol 80 (10) ◽  
pp. 1623-1627 ◽  
Author(s):  
Hela Jribi ◽  
Hanen Sellami ◽  
Siala Mariam ◽  
Salma Smaoui ◽  
Asma Ghorbel ◽  
...  
Keyword(s):  
Real Time ◽  
Real Time Pcr ◽  
Poultry Meat ◽  
Culture Methods ◽  
Isolation And Identification ◽  
Conventional Culture ◽  
Multiplex Pcr Assay ◽  
Thermophilic Campylobacter ◽  
By Products ◽  
Campylobacter Spp

ABSTRACT Thermophilic Campylobacter spp. are one of the primary causes of bacterial human diarrhea. The consumption of poultry meats, by-products, or both is suspected to be a major cause of human campylobacteriosis. The aims of this study were to determine the prevalence of thermophilic Campylobacter spp. in fresh poultry meat and poultry by-products by conventional culture methods and to confirm Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolates by using the multiplex PCR assay. Two hundred fifty fresh poultry samples were collected from a variety of supermarkets and slaughterhouses located in Sfax, Tunisia, including chicken (n =149) and turkey (n =101). The samples were analyzed using conventional microbiological examinations according to the 2006 International Organization for Standardization method (ISO 10272-1) for Campylobacter spp. Concurrently, a real-time PCR was used for identification of C. jejuni and C. coli. Of the 250 samples of poultry meat and poultry by-products, 25.6% (n = 64) were contaminated with Campylobacter spp. The highest prevalence of Campylobacter spp. was found in chicken meat (26.8%) followed by turkey meat (23.7%). Among the different products, poultry breasts showed the highest contamination (36.6%) followed by poultry by-products (30%), poultry wings (28%) and poultry legs (26%) showed the lowest contamination, and no contamination was found on neck skin. Of the 64 thermophilic Campylobacter isolates, C. jejuni (59.7%) was the most frequently isolated species and 10.9% of the isolates were identified as C. coli. All of the 64 Campylobacter isolates identified by the conventional culture methods were further confirmed by PCR. The seasonal peak of Campylobacter spp. contamination was in the warm seasons (spring and summer). The study concluded that high proportions of poultry meat and poultry by-products marketed in Tunisia are contaminated by Campylobacter spp. Furthermore, to ensure food safety, poultry meats must be properly cooked before consuming.

scholarly journals Antimicrobial resistance and molecular epidemiology of Campylobacter spp. isolated from broiler flocks in southern Greece

2021 ◽  
Author(s):  
Γεώργιος Νάτσος
Keyword(s):  
Antimicrobial Resistance ◽  
Molecular Epidemiology ◽  
Southern Greece ◽  
Campylobacter Spp

Μια διατμηματική μελέτη πραγματοποιήθηκε για να υπολογιστεί ο επιπολασμός και οι παράγοντες επικινδυνότητας της μόλυνσης των σμηνών κρεοπαραγωγής και των σφαγίων τους με Campylobacter spp. στα πτηνοσφαγεία της Ελλάδας. Επιπλέον, ελέγχθηκε η αντιμικροβιακή αντοχή των απομονωθέντων στελεχών Campylobacter από το περιεχόμενο των τυφλών εντέρων και του δέρματος του λαιμού σε 7 αντιμικροβιακούς παράγοντες (ναλιδιξικό οξύ, σιπροφλοξασίνη, ερυθρομυκίνη, τετρακυκλίνη, γενταμυκίνη, στρεπτομυκίνη και αμπικιλλίνη). Τέλος, πραγματοποιήθηκε αλληλούχιση του γoνιδίου flaA για την υποτυποποίηση 62 στελεχών C. jejuni και 58 στελεχών C. coli και κατασκευάστηκαν φυλογενετικά δέντρα χρησιμοποιώντας τη μέθοδο σύνδεσης γειτόνων για να μελετηθούν οι εξελικτικές τους σχέσεις.Για μια περίοδο 14 μηνών, πραγματοποιήθηκε σειρά δειγματοληψιών 10 τυφλών εντέρων και 5 δερμάτων λαιμού από σφάγια ορνιθίων κρεοπαραγωγής για κάθε μία από τις 142 παρτίδες που σφάχτηκαν σε 3 διαφορετικά σφαγεία. Ακολούθησε συλλογή πληροφοριών σχετικά με τους πιθανούς παράγοντες επικινδυνότητας για τη μόλυνση των ορνιθίων κρεοπαραγωγής με Campylobacter ύστερα από συνέντευξη που έλαβε χώρα στις πτηνοτροφικές μονάδες από τις οποίες προέρχονταν τα πουλερικά με τη χρήση ειδικά σχεδιασμένου ερωτηματολογίου, και αυτά τα δεδομένα συσχετίστηκαν με την παρουσία Campylobacter στα σμήνη κρεοπαραγωγής και τις διαφορές στα χαρακτηριστικά των εκτροφών και τις διαχειριστικές πρακτικές που ακολουθούνταν.Aπομονώθηκαν Campylobacter spp. από το 73.94% των τυφλών (95% ΔΕ 65.92-80.94) και το 70.42% των δερμάτων λαιμού (95% ΔΕ 62.19-77.78), αντίστοιχα. Βρέθηκε στατιστικώς σημαντική συσχέτιση (p < 0.001) μεταξύ της παρουσίας των Campylobacter spp. στα τυφλά και τη μόλυνση του δέρματος των σφαγίων, υποδεικνύοντας τη διάδοση του μικροοργανισμού στο δέρμα των σφαγίων κατά τη διαδικασία της σφαγής. Δύο διαφορετικά είδη Campylobacter (C. jejuni, C. coli) ανακτήθηκαν, ενώ το C. coli ήταν το επικρατέστερο είδος που εντοπίστηκε τόσο στα τυφλά όσο και στα δείγματα δέρματος λαιμού.Μια πολλαπλή ανάλυση παλινδρόμησης έδειξε ότι η απολύμανση των υποστατικών από μη εξειδικευμένο προσωπικό (OR 1⁄4 = 3.983) αποτελεί στατιστικώς σημαντικό παράγοντα επικινδυνότητας (p < 0.05) , ενώ η χρήση αχύρου ως στρωμνή (OR 1⁄4 = 0.170) και το κλείσιμο των παραθύρων κατά τη διάρκεια του υγειονομικού κενού μεταξύ των παραγωγικών κύκλων (OR 1⁄4 = 0.396) αποτελούν στατιστικώς σημαντικούς προστατευτικούς παράγοντες (p < 0.05) για τη μόλυνση των σμηνών κρεοπαραγωγής με Campylobacter.Συνολικά 98.5% των απομονωθέντων στελεχών βρέθηκαν ανθεκτικοί σε τουλάχιστον έναν αντιμικροβιακό παράγοντα. Όσον αφορά την πολυανθεκτικότητα, 11.7% των στελεχών βρέθηκαν ανθεκτικά σε τρεις ή περισσότερες ομάδες αντιμικροβιακών. Ανιχνεύθηκε εξαιρετικά υψηλή αντοχή στις φλουοροκινολόνες (89%), πολύ υψηλή αντοχή στην τετρακυκλίνη (69%) και χαμηλή αντοχή στα μακρολίδια (7%).Δεν παρατηρήθηκε επικράτηση συγκεκριμένου τύπου flaA, γεγονός που υποδεικνύει τη γενετική ποικιλομορφία των απομονωθέντων στελεχών, ενώ ορισμένοι τύποι flaA βρέθηκαν να παρουσιάζουν παρόμοιο προφίλ αντιμικροβιακής αντοχής. Επτά ομάδες (clusters) στο φυλογενετικό δέντρο των C. jejuni και τρεις ομάδες στο δέντρο των C. coli θεωρήθηκαν στατιστικώς σημαντικές με τιμές bootstrap > 75%. Ορισμένα στελέχη που ομαδοποιήθηκαν μαζί βρέθηκε ότι προέρχονταν από την ίδια ή παρακείμενες εκτροφές, γεγονός που υποδεικνύει μετάδοση μέσω του εργατικού προσωπικού της εκτροφής ή του κοινόχρηστου εξοπλισμού. Τα αποτελέσματα αυτά είναι σημαντικά και βοηθούν στην περαιτέρω κατανόηση της μοριακής επιδημιολογίας και της αντιμικροβιακής αντοχής των Campylobacter spp. που προέρχονται από την πτηνοτροφία στην Ελλάδα.

Antimicrobial Resistance of Campylobacter spp. Causing Human Infection in Australia: An International Comparison

2020 ◽  
Author(s):  
Rhiannon L. Wallace ◽  
Dieter Bulach ◽  
Angus McLure ◽  
Liana Varrone ◽  
Amy V. Jennison ◽  
...  
Keyword(s):  
Antimicrobial Resistance ◽  
International Comparison ◽  
Human Infection ◽  
Campylobacter Spp
Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document