scholarly journals Bacterial transcription factor binding site inference as the basis for the study of plant-microbial interactions

2020 ◽  
Author(s):  
Ye. A. Nikolaichik
Keyword(s):  
Transcription Factor ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Microbial Interactions ◽  
Regulatory Sequences ◽  
Factor Binding Site ◽  
Regulatory Interactions ◽  
Bacterial Transcription ◽  
Genome Wide ◽  
Silico Analysis

Genome-wide in silico analysis of bacterial regulatory sequences reveals new regulatory interactions, is generally accessible and should become the standard in the study of plant-microbial interactions.

Integrative In Silico Analysis of Genome-Wide DNA Methylation Profiles in Schizophrenia

2020 ◽  
Vol 70 (11) ◽  
pp. 1887-1893
Author(s):  
Diego A. Forero ◽  
Yeimy González-Giraldo
Keyword(s):  
Dna Methylation ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Genome Wide ◽  
Silico Analysis

scholarly journals IN SILICO ANALYSIS OF THE Dof TRANSCRIPTION FACTOR FAMILY IN Coffea canephora

2018 ◽  
Vol 14 (4) ◽  
pp. 99-111
Author(s):  
Vinícius Garcia ◽  
Alessandra Ferreira Ribas ◽  
Luiz Gonzaga Esteves Vieira ◽  
Tiago Benedito dos Santos
Keyword(s):  
Transcription Factor ◽  
Dna Binding ◽  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Coffea Canephora ◽  
Transcription Factor Family ◽  
Dof Transcription Factor ◽  
Silico Analysis

A família Dof(DNA-binding with One Finger) é um grupo de fatores de transcrição que desempenham papéis importantes no crescimento, desenvolvimento e na resposta das plantas aos estresses bióticos e abióticos. Os genes Dofforam identificados e caracterizados em várias espécies de plantas;entretanto até o presente momento não há informações sobre esses genes em café. No presente estudo foram identificados 24 membros da família Dofno genoma de C. canephoradepositados no banco de dados Coffee Genome Hub. Análises sistemáticas de bioinformática foram realizadas para caracterizar os genes DofemC. canephora, incluindo a análise desequênciasgenômicas, domínios proteicos conservados, localizações subcelulares, relações filogenéticas e perfis de expressão gênica em diferentes tecidos. Os resultados obtidos fornecem uma melhor compreensãosobre a família dos genes CcDofpermitindo projetar experimentos futuros para caracterização molecular dessesgenes no cafeeiro.

scholarly journals Genome-Wide Identification and in Silico Analysis of Poplar Peptide Deformylases

2012 ◽  
Vol 13 (4) ◽  
pp. 5112-5124 ◽  
Author(s):  
Chang-Cai Liu ◽  
Bao-Guang Liu ◽  
Zhi-Wei Yang ◽  
Chun-Ming Li ◽  
Bai-Chen Wang ◽  
...  
Keyword(s):  
In Silico ◽  
In Silico Analysis ◽  
Genome Wide ◽  
Silico Analysis
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