Draft genome sequences of KPC-2- and CTX-M-15-producing Klebsiella pneumoniae ST437 isolated from a clinical sample and urban rivers in Sao Paulo, Brazil

2019 ◽  
Vol 16 ◽  
pp. 74-75 ◽  
Author(s):  
Gabriela Rodrigues Francisco ◽  
Maria Fernanda C. Bueno ◽  
Louise Cerdeira ◽  
Nilton Lincopan ◽  
Susan Ienne ◽  
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2018 ◽  
Vol 7 (14) ◽  
Author(s):  
Nikolay V. Volozhantsev ◽  
Angelina A. Kislichkina ◽  
Anastasia I. Lev ◽  
Ekaterina V. Solovieva ◽  
Vera P. Myakinina ◽  
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We report here the genome sequences of 10 Klebsiella pneumoniae strains of capsular type K2 isolated in Russia from patients in an infectious clinical hospital and neurosurgical intensive care unit. The draft genome sizes range from 5.34 to 5.87 Mb and include 5,448 to 6,137 protein-coding sequences.


2014 ◽  
Vol 81 (2) ◽  
pp. 180-185 ◽  
Author(s):  
Lilian Gregory ◽  
Rodolfo Santos Rossi ◽  
João Padilha Gandara Mendes ◽  
Natalie Neuwirt ◽  
Eduardo Carvalho Marques ◽  
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A população de bubalinos estimada no Brasil é de aproximadamente 3 milhões de animais, encontrando-se distribuídos em todos os Estados brasileiros, com crescimento médio anual de 12%. Apesar disso, os trabalhos realizados buscando os avanços na bubalinocultura são escassos. Em função da complexidade etiológica da diarreia em bubalinos e da falta de informações recentes nesta área, o presente estudo teve como objetivo avaliar a ocorrência dos principais agentes bacterianos e parasitários envolvidos na diarreia de bezerros búfalos lactentes, de explorações leiteiras semi-intensivas e intensivas em regiões dos estados de São Paulo e Paraná. De março de 2010 a junho de 2011, foram colhidas 53 amostras para exame coproparasitológico e 46 amostras para o exame bacteriológico de animais com quadro de diarreia nos municípios paulistas de São João da Boa Vista, Dourado, Pirassununga, Registro, Pariquera Açu, Pilar do Sul e uma propriedade no estado do Paraná, município de Santana do Itararé. No exame parasitológico, 45,28% (24) foram positivos para Eimeria spp., 26,42% (14) para Strongyloidea e 1,88 (1) para Toxocara vitulorum. No exame bacteriológico, 97,83%, (45) das amostras foram positivas para E. coli, contudo, somente duas foram consideradas patogênicas (E. coli STEC). Em uma amostra (2,17%) isolou-se Klebsiella pneumoniae; já a presença de Salmonella spp. não foi constatada. Para o presente estudo, a presença de endoparasitas foi bastante relevante, principalmente os casos Eimeria spp., sendo a higiene das instalações e falhas de manejo fatores importantes na ocorrência de diarreia em bezerros búfalos no estado de São Paulo.


Author(s):  
Marcos Paulo Vieira Cunha ◽  
Marta Brito Guimarães ◽  
Yamê Miniero Davies ◽  
Liliane Milanelo ◽  
Terezinha Knöbl

Anualmente o tráfico de animais silvestres retira milhões de aves da natureza. Os cardeais (Paroaria coronata) e cardeais-do-nordeste (Paroaria dominicana) estão incluídos entre as espécies de aves mais traficadas. A microbiota cloacal de passeriformes de vida livre é composta principalmente por bacilos e cocos gram-positivos, já os bacilos gram-negativos predominam em aves de cativeiro. Em situações de estresse e baixa de imunidade as bactérias gram-negativas podem causar infecções oportunistas. O presente trabalho identificou bactérias da microbiota da cloaca de 49 espécimes de P. coronata e P. dominicana apreendidas do tráfico de animais silvestres em São Paulo (SP). Foram isoladas treze espécies de bactérias gram-negativas, incluindo Salmonella spp. e Pseudomonas aeruginosa. A maior frequência de ocorrência foi de Escherichia coli, identificada em 42/49 (85,7%) das amostras fecais. Dentre os isolados de E. coli, 21/42 pertenciam aos grupos filogenéticos B2 e D, relacionados a estirpes patogênicas que causam doença extraintestinal em humanos. Klebsiella pneumoniae foi isolada em 28/49 (57,1%) das amostras. Esses resultados reforçam que as condições estressantes a que esses animais são submetidos em situações de tráfico, incluindo o contato com humanos, podem favorecer a colonização da microbiota cloacal das aves por patógenos, o que representa um risco para a sua reintrodução na natureza considerando-se o possível contato com humanos e outros animais.


2013 ◽  
Vol 1 (1) ◽  
Author(s):  
F. Comandatore ◽  
D. Sassera ◽  
S. Ambretti ◽  
M. P. Landini ◽  
D. Daffonchio ◽  
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2016 ◽  
Vol 4 (6) ◽  
Author(s):  
Balaji Veeraraghavan ◽  
Susmitha K. Perumalla ◽  
Naveen Kumar Devanga Ragupathi ◽  
Agila Kumari Pragasam ◽  
Dhiviya Prabaa Muthuirulandi Sethuvel ◽  
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Resistance to colistin is a major threat that limits therapeutic choices for treating carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae infections. Herein, we report the draft genome sequences of two colistin-resistant K. pneumoniae isolates (BA41763 and B6753). The sequence data indicate that BA41763 and B6753 contain genomes of ~5.9 and 5.7 Mb in size with several plasmids.


Author(s):  
J.A. Ambrosim ◽  
F. S. Almeida ◽  
E. C. Rigobelo ◽  
A. F.P. Castro ◽  
R. P. Schocken Iturrino ◽  
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Des échantillons de fèces prélevés chez 266 veaux de race laitière, provenant de la région au nord de l’Etat de São Paulo, ont été examinés afin d’étudier la fréquence des différents agents entéropathogènes et de déterminer la résistance des souches isolées à plusieurs substances antimicrobiennes. Au total, 127 souches d’Escherichia coli – parmi lesquelles 60 étaient entérotoxigéniques – ont été isolées, ainsi que 23 souches d’Enterobacter cloacae, 18 souches de Klebsiella pneumoniae, 15 souches de Citrobacter freundii, 7 souches de Salmonella avec des sérotypes différents et une souche de Pseudomonas aeruginosa. Trente-six souches positives pour Cryptosporidium sp. ont aussi été identifiées, dont quatre ont été classées sous l’espèce Cryptosporidium parvum. L’association de deux ou plus agents a été rencontrée dans 27 échantillons de fèces diarrhéiques. Parmi les antibiotiques testés, la lincomycine et la pénicilline G ont été ceux contre lesquels Escherichia coli et Salmonella sp. ont présenté une résistance plus importante.


Author(s):  
Marcos Emerson Pinheiro Junqueira ◽  
Alice Cristina Mondin ◽  
Carlos Alberto de Magalhães Lopes

Este trabalho teve por objetivo o estudo da contaminação bacteriana do veneno do ferrão dos bagres Genidens genidens (Valenciennes, 1839); e Cathorops agassizii (Agassiz, 1829) encontrados no Complexo Baia-Estuário de Santos e de São Vicente (Estado de São Paulo). Foram obtidas amostras dos peixes para análises bacteriológicas que constituíam de um grupo de 50 espécimes sendo, 25 Cathorops agassizii e 25 de Genidens genidens. As análises bacteriológicas mostraram que havia contaminação nos ferrões por 13 diferentes linhagens de Enterobacteriaceae, sendo a Klebsiella pneumoniae (26,80%) a bactéria mais freqüente enquanto que as Enterobacter sp e Escherichia coli (16,27%), Serratia marcescens, Serratia sp e Proteus mirabilis (1,16%) apresentaram os mais baixos percentuais de contaminação. Nas amostras que apresentaram Bactérias Gram positivas não foram detectadas espécies de fungos. Enquanto que nas amostras que apresentaram bactérias Gram negativas, foi possível considerar alta contaminação bacteriana representando periculosidade em relação aos aspectos ambientais voltados á saúde pública. Destaca-se ainda que acidentes ocorridos por ferimentos causados em função do ferrão do bagre podem desenvolver significativas infecções secundárias agudas em humanos.


2017 ◽  
Vol 5 (28) ◽  
Author(s):  
Ayda Susana Ortiz-Baez ◽  
Danielle Ferreira Silva ◽  
Daniel Ferreira ◽  
Paolo M. Zanotto

ABSTRACT Dengue virus (DENV) is an arbovirus belonging to the genus Flavivirus, family Flaviviridae. In Brazil, the reemergence and spread of DENV type 4 (DENV-4) across the country were responsible for a significant outbreak in Guarujá, São Paulo, Brazil. Here, we report the first genomic sequences of DENV strains circulating in Guarujá during the 2013 outbreak.


2011 ◽  
Vol 79 (2) ◽  
pp. 182-183 ◽  
Author(s):  
G.H. Pereira ◽  
D.O. Garcia ◽  
M. Mostardeiro ◽  
C.T. Ogassavara ◽  
A.S. Levin

2016 ◽  
Vol 4 (4) ◽  
Author(s):  
Brock A. Arivett ◽  
Dave C. Ream ◽  
Steven E. Fiester ◽  
Destaalem Kidane ◽  
Luis A. Actis

Members of theEscherichia colibacterial family have been grouped as ESKAPE (Enterococcus faecium,Staphylococcus aureus,Klebsiella pneumoniae,Acinetobacter baumannii,Pseudomonas aeruginosa, andEnterobacterspecies) pathogens because of their extensive drug resistance phenotypes and increasing threat to human health. The genomes of six extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producingE. colistrains isolated from wounded military personnel were sequenced and annotated.


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