scholarly journals Whole Genome Sequencing for the Retrospective Investigation of an Outbreak of Salmonella Typhimurium DT 8

Author(s):  
Philip M Ashton ◽  
Tansy Peters ◽  
Linda Ameh ◽  
Ralph McAleer ◽  
Stewart Petrie ◽  
...  
2018 ◽  
Vol 15 (5) ◽  
pp. 285-292 ◽  
Author(s):  
Laura Ford ◽  
Qinning Wang ◽  
Russell Stafford ◽  
Kelly-Anne Ressler ◽  
Sophie Norton ◽  
...  

PLoS ONE ◽  
2018 ◽  
Vol 13 (8) ◽  
pp. e0201882 ◽  
Author(s):  
Fernanda Almeida ◽  
Amanda Aparecida Seribelli ◽  
Marta Inês Cazentini Medeiros ◽  
Dália dos Prazeres Rodrigues ◽  
Alessandro de MelloVarani ◽  
...  

Biomédica ◽  
2020 ◽  
Vol 40 (4) ◽  
pp. 722-733
Author(s):  
Paloma Cuenca-Arias ◽  
Lucy Angeline Montaño ◽  
José Miguel Villarreal ◽  
Magdalena Wiesner

Introducción. La variante monofásica (1,4,[5],12:i:-) de Salmonella Typhimurium ocupa los primeros lugares en los programas de vigilancia de Salmonella a nivel mundial. En Colombia, Salmonella enterica variante monofásica alcanza el cuarto lugar en cuanto a los aislamientos clínicos recuperados por medio de la vigilancia por laboratorio del Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud, pero se desconoce si dichos aislamientos están relacionados con la variante monofásica de Typhimurium que circula a nivel global, y con sus características genéticas y fenotípicas.Objetivo. Caracterizar los aislamientos de Salmonella monofásica recuperados en Colombia entre el 2015 y el 2018 por el Grupo de Microbiología del Instituto Nacional de Salud.Materiales y métodos. Se analizaron 286 aislamientos clínicos de Salmonella enterica variante monofásica mediante PCR o secuenciación del genoma completo (Whole Genome Sequencing, WGS) para confirmar si correspondían a Salmonella Typhimurium variante monofásica, en tanto que, en 54 aislamientos, se determinó la estructura genética del operón que codifica la segunda fase flagelar y, en 23, se evaluó la motilidad, el crecimiento y la expresión de las proteínas de membrana externa.Resultados. El 61 % (n=174) de los aislamientos de Salmonella monofásica correspondió a Salmonella Typhimurium serovar monofásico. El 64,8 % (n=35/54) se relacionó con el clon europeo-español y, el 13 % (n=7/54), con el estadounidense. En dos aislamientos de orina se encontró una diferencia significativa en la motilidad y el crecimiento, así como ausencia de la porina OmpD en medio mínimo M9.Conclusiones. En el periodo de estudio, circuló en Colombia la variante monofásica de Salmonella Typhimurium relacionada con el clon europeo-español, y se registró ausencia total del operón fljAB. Los resultados evidenciaron cambios fenotípicos en los aislamientos provenientes de muestras de orina que sugieren adaptación en procesos invasivos.


2018 ◽  
Author(s):  
Mark Stevenson ◽  
Alistair T Pagnamenta ◽  
Heather G Mack ◽  
Judith A Savige ◽  
Kate E Lines ◽  
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2016 ◽  
Vol 94 (suppl_5) ◽  
pp. 146-146
Author(s):  
D. M. Bickhart ◽  
L. Xu ◽  
J. L. Hutchison ◽  
J. B. Cole ◽  
D. J. Null ◽  
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