scholarly journals On zeroes in sign and signed rank tests

Author(s):  
Rajarshi Dey ◽  
Justin Manjourides ◽  
Ronald H Randles

When zeroes (or ties within pairs) occur in data being analyzed with a sign test or a signed rank test, nonparametric methods textbooks and software consistently recommend that the zeroes be deleted and the data analyzed as though zeroes did not exist. This advice is not consistent with the objectives of the majority of applications. In most settings a better approach would be to view the tests as testing hypotheses about a population median. There are relatively simple p-values available that are consistent with this viewpoint of the tests. These methods produce tests with good properties for testing a different (often more appropriate) set of hypotheses than those addressed by tests that delete the zeroes.

Author(s):  
Mei-Ling Ting Lee ◽  
Robert J Gray ◽  
Harry Björkbacka ◽  
Mason W Freeman

Gene expression data from microarray experiments have been studied using several statistical models. Significance Analysis of Microarrays (SAM), for example, has proved to be useful in analyzing microarray data. In the spirit of the SAM procedures, we develop permutation based rank-tests for generalized Wilcoxon ranksum test for two-group comparisons of replicated microarray data. Also, for microarray experiments with randomized block design, we consider generalized signed rank test. The statistical analysis software package is written in R and is freely available in a package.


Biometrika ◽  
2020 ◽  
Author(s):  
S R Howard ◽  
S D Pimentel

Summary A sensitivity analysis in an observational study tests whether the qualitative conclusions of an analysis would change if we were to allow for the possibility of limited bias due to confounding. The design sensitivity of a hypothesis test quantifies the asymptotic performance of the test in a sensitivity analysis against a particular alternative. We propose a new, nonasymptotic, distribution-free test, the uniform general signed rank test, for observational studies with paired data, and examine its performance under Rosenbaum’s sensitivity analysis model. Our test can be viewed as adaptively choosing from among a large underlying family of signed rank tests, and we show that the uniform test achieves design sensitivity equal to the maximum design sensitivity over the underlying family of signed rank tests. Our test thus achieves superior design sensitivity, indicating it will perform well in sensitivity analyses on large samples. We support this conclusion with simulations and a data example, showing that the advantages of our test extend to moderate sample sizes as well.


2020 ◽  
Vol 10 (1) ◽  
Author(s):  
Shane Chanpimol ◽  
Kimberly Benson ◽  
Heidi Maloni ◽  
Susan Conroy ◽  
Mitchell Wallin

Abstract Background Physical rehabilitation services are an important component of treatment for persons with multiple sclerosis (PwMS) to improve and maintain physical mobility. However, PwMS often have significant barriers to outpatient physical therapy (PT) services including mobility deficits and lack of transportation. The integration of exercise gaming (exergaming) and telehealth into clinical PT practices may overcome these barriers. The overarching purpose of this pilot study was to evaluate the acceptability and effects of an individualized telePT intervention using exergaming. Methods Ten individuals with multiple sclerosis (MS) completed a 12-week exergaming (Jintronix®) telerehabilitation intervention. In order to measure the acceptability of the telerehabilitation intervention, adherence was measured through the tablet-based rehabilitation software and each participant completed a satisfaction questionnaire. Clinical outcome measures were assessed at baseline and post-intervention. To evaluate the efficacy of this intervention, the following measures of physical function and fatigue were included; the Short Physical Performance Battery (SPPB), 25-Foot Walk (25FW), Modified Fatigue Impact Scale (MFIS), Multiple Sclerosis Walking Scale-12 (MSWS), and the 2-Minute Walk Test (2MWT). Clinical outcomes were analyzed using the Sign test and Wilcoxon signed rank test. All other data were evaluated using descriptive statistics. Results After the intervention, participants demonstrated significant improvements in ambulation speed during the 25FW (p = 0.04) and ambulation distance during the 2MWT (p = 0.002). Statistically significant increases of SPPB total score (p = .04) and sub-scores were also found. Participants did not demonstrate significant changes in the MFIS (p = 0.31) or MSWS-12 (p = 0.06) after the intervention. Participants had a 58.3% adherence rate during the intervention and performed their exercise program an average of 2.5 times per week. All participants reported that they were either ‘satisfied or ‘very satisfied’ with their telerehabilitation experience, would use telerehabilitation again, and would recommend telerehabilitation to others. Conclusion This individualized telerehabilitation intervention which integrates exergaming and clinical video teleconferencing is acceptable to patients and may offer a viable alternative to traditional PT for PwMS. Trial registration NCT03655431, retrospectively registered on August 31st, 2018.


2017 ◽  
Author(s):  
Ιωάννης Γεραμάς

Σκοπός μελέτης. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι η αξιολόγηση της ακουστικής ανίχνευσης και αντίληψης των βαρήκοων - κωφών ασθενών μετά την κοχλιακή εμφύτευση.Υλικό και μέθοδος. Στην παρούσα μελέτη εξετάστηκαν 123 τυχαιοποιημένοι ασθενείς (57 άνδρες και 66 γυναίκες ηλικίας από 6 μέχρι και 82 ετών) οι οποίοι χωρίστηκαν σε 4 κατηγορίες:Κατηγορία I: ενήλικες μεταγλωσσικά βαρήκοοι - κωφοί Κατηγορία II: παιδιά σχολικής ηλικίας από 6 έως 16 ετώνΚατηγορία III: παιδιά σχολικής ηλικίας από 6 έως 16 ετών με συνοδά νευρολογικά προβλήματαΚατηγορία IV: ενήλικες προγλωσσικά βαρήκοοι - κωφοί, που υποβλήθηκαν σε κοχλιακή εμφύτευση αργότερα, οι οποίοι πριν το χειρουργείο χρησιμοποιούσαν κάποιο ακουστικό βοήθημα, κάνοντας χρήση του προφορικού λόγου Όλοι οι εξεταζόμενοι είχαν υποβληθεί σε κοχλιακή εμφύτευση τουλάχιστον δύο χρόνια πριν από την ημερομηνία εξέτασης τόσο στο Κέντρο Κοχλιακών Εμφυτεύσεων της Β’ ΩΡΛ Πανεπιστημιακής Κλινικής του Νοσοκομείου “ΑΤΤΙΚΟΝ” όσο και στην Α’ Πανεπιστημιακή ΩΡΛ Κλινική του Νοσοκομείου “ΑΧΕΠΑ”. Για τη διεξαγωγή των μετρήσεων στην παρούσα μελέτη χρησιμοποιήσαμε την τονική ακοομετρία ελευθέρου πεδίου, τη δοκιμασία διάκρισης δισύλλαβων λέξεων / προτάσεων της ομιλητικής ακοομετρίας στην ελληνική γλώσσα (με τη χρήση ψηφιακού δίσκου και ζωντανά με τη βοήθεια λογοθεραπευτή) σε ένταση ακρόασης 65 dB HL. Για την καταγραφή της πραγματικής συνεισφοράς του κοχλιακού εμφυτεύματος στην καθημερινή ζωή των ασθενών μας μετά το χειρουργείο, χρησιμοποιήσαμε τα ειδικά ερωτηματολόγια CAP test (Categories of Auditory Performance) και GBI test (Glasgow Benefit Inventory). Αποτελέσματα. Στην κατηγορία Ι εξετάσαμε 29 ασθενείς. Ο μέσος όρος ανίχνευσης του ήχου στο τονικό ακοόγραμμα ελευθέρου πεδίου ήταν 26 dB HL και το ποσοστό διάκρισης λέξεων / προτάσεων στη δοκιμασία της ομιλητικής ακοομετρίας ήταν 87,72% / 82,55% (όταν τα σενάρια δίνονταν από τον ψηφιακό δίσκο) και 95,66% / 95,45% (όταν εκφωνούνταν ζωντανά από τη λογοθεραπεύτρια της ομάδας). Ομοίως οι μετρήσεις CAP μετά το χειρουργείο είχαν βελτιωθεί σημαντικά (Wilcoxon signed rank test, p - value < 0.001) από το επίπεδο ΙΙ στο επίπεδο VII όπως και o δείκτης οφέλους της Γλασκόβης (+47,88).Στην κατηγορία ΙΙ εξετάσαμε συνολικά 60 ασθενείς. Ο μέσος όρος ανίχνευσης του ήχου ήταν 21dB HL και το ποσοστό επιτυχίας στη διάκριση λέξεων / προτάσεων: 88% / 84,88% και 94,5% / 92,1%. αντίστοιχα. Οι μετρήσεις CAP μετά το χειρουργείο εμφάνισαν και αυτές σημαντική βελτίωση (Wilcoxon signed rank test, p - value < 0.001) από το επίπεδο Ι στο επίπεδο VII όπως και ο δείκτης οφέλους της Γλασκόβης (+51,47).Στην κατηγορία ΙΙΙ εξετάσαμε 20 ασθενείς. Ο μέσος όρος ανίχνευσης του ήχου 24dB HL και το ποσοστό διάκρισης των λέξεων / προτάσεων: 56,6% / 48,8% και 70,35% / 55,95% αντίστοιχα. Οι μετρήσεις CAP (Wilcoxon signed rank test, p - value < 0.001) μετά το χειρουργείο εμφάνισαν σημαντική βελτίωση από το επίπεδο 0 στο επίπεδο V όπως και o δείκτης οφέλους της Γλασκόβης (+41,52).Στην κατηγορία IV εξετάσαμε 14 ασθενείς. Ο μέσος όρος ανίχνευσης του ήχου 26dB HL και ποσοστό διάκρισης των λέξεων / προτάσεων: 45,14% / 33,64% και 60,57% / 51,29% αντίστοιχα. Οι μετρήσεις CAP (paired samples t-test, p - value < 0.001) μετά το χειρουργείο είχαν βελτιωθεί από το επίπεδο ΙI στο επίπεδο VI ενώ o δείκτης οφέλους της Γλασκόβης (GBI test) μετά τη χειρουργική επέμβαση παρουσίασε και αυτός θετική μεταβολή (+44,63).ΣυμπέρασμαΤο συμπέρασμα που προκύπτει από την παρούσα μελέτη αφορά τη σημαντική βελτίωση των όλων των κατηγοριών των εξεταζόμενων (σε επίπεδο σημαντικότητας 5%) τόσο στη δοκιμασία του τονικού ακοογράμματος ελευθέρου πεδίου (p-values < 0.001, τιμές ακοομετρικού διαγράμματος > 90 dB HL πριν από το χειρουργείο) όσο και στη δοκιμασία της ομιλητικής ακοομετρίας (p-values < 0.001, ποσοστό ακουστικής διάκρισης < 40% πριν από το χειρουργείο). Την καλύτερη διάκριση της ομιλίας φαίνεται να εμφανίζουν τα παιδιά της κατηγορίας ΙΙ μαζί με τους ενήλικες της κατηγορίας Ι (καθώς τα αντίστοιχα p values ήταν μικρότερα από 0,05). Αντίθετα οι εξεταζόμενοι της κατηγορίας ΙΙΙ και IV δεν είχαν ανάλογα αποτελέσματα (p-value = 0.000 < 0.05). Αυτό μπορεί να ερμηνευτεί από το γεγονός ότι οι μεν ασθενείς της κατηγορίας IV συνέχισαν να χρησιμοποιούν μετά το χειρουργείο τη νοηματική γλωσσά, ενώ οι ασθενείς της κατηγορίας ΙΙΙ είχαν καθυστερημένη λεκτική πρόοδο λόγω των συνοδών νευρολογικών προβλημάτων. Εντούτοις από το ερωτηματολόγιο CAP test (p-values < 0.001) προκύπτει ότι η ακουστική ικανότητα των κωφών ασθενών που συμμετείχαν στην μελέτη μας, ανεξαρτήτου κατηγορίας, παρουσίασε σημαντική βελτίωση μετά το χειρουργείο του κοχλιακού εμφυτεύματος. Όλοι οι παραπάνω εξεταζόμενοι επίσης επιβεβαίωσαν τη θετική επίδραση της επέμβασης στην ποιότητα της ζωής τους (p-value = 0.183 > 0.05), σύμφωνα με το ερωτηματολόγιο GBI test


2016 ◽  
Vol 67 (2) ◽  
Author(s):  
R.W. Dal Negro ◽  
C. Micheletto ◽  
S. Tognella ◽  
C. Turati ◽  
R. Bisato ◽  
...  

Background and Aim. Subjects with airway obstruction are strongly recommended to monitor their lung function, which is particularly variable in asthma. Unlike PEFR, other personal measurements (such as FEV1) are still difficult to perform. PIKO-1 is the first electronic device for both PEFR and FEV1 personal check, but its precision has not yet been assessed. The aim of this study was to compare PEFR and FEV1 values from PIKO-1 and from a conventional spirometer in subjects with airway obstruction. Methods. In total, 352 subjects (217 men; 47.6 ± 19.0 years; 72.6 ± 15.0 kg; 168.1 ± 11.9 cm) performed sequential measurements using a PIKO-1 device and a spirometer. Wilcoxon signed-rank test and sign test were used as statistical tests. Results. Mean FEV1 values from the spirometer and PIKO-1, respectively, were 2.9 L ± 1.1 and 3.0 L ± 1.1, and mean PEFR values were 466.1 L/min ± 164.5 SD and 426.3 L/min ± 151.6 SD. PIKO-1 proved to overestimate FEV1 values by 4% (p&lt;0.0001) and to underestimate PEFR values by 8% (p&lt;0.000) systematically. Conclusions. The precision of both PIKO-1 measurements (such as FEV1 and PEFR) have been assessed. PEFR and FEV1 measures should be reset by two different constants. Nevertheless, PIKO-1 is a suitable and reliable device for the personal monitoring of obstructive patients in real life.


Stroke ◽  
2016 ◽  
Vol 47 (suppl_1) ◽  
Author(s):  
Akie Kobayashi ◽  
Takako Ichihara ◽  
Ayako Tamura

Background and Purpose: Patients with stroke often stop medication for the prevention. Medication behavior is mainly composed the medication compliance and understanding of the medication. The purpose of this study was to assess change in the medication behavior during one year after initial stroke, and to identify the correlation between medication compliance and understanding of the medication in patients with mild ischemic stroke. Methods: Thirty-one patients with initial mild ischemic stroke were prospectively recruited. Two types of self-reported questionnaires (Medication compliance questionnaires, Understanding of medication questionnaires) were applied at admission (baseline) and 1 year after stroke respectively. Understanding of medication questionnaires contained 4 factors; “motivation”, “capacity”, “understanding” and “drug cost” for the medication. Change in the medication was analyzed by Wilcoxon signed rank test. The correlation between the medication compliance and understanding of medication were analyzed by Spearman’s rank correlation. The p-values<0.05 were considered statistically significant. Results: Among the patients who agreed to participate in this study, 71% were males and 29% were females, with the average age of 66.0±8.4. Lacunar was the most common type of stroke among those patients. Their scores of medication compliance at 1 year after stroke were significantly increased (p<0.01) compared to those in the baseline. Their scores of understanding of medication“the drug cost burden” were also significantly increased (p<0.05).At baseline, there was significant correlation between medication compliance and understanding of medication“hassle for taking medicine”(ρ=0.464,p<0.01 ),“simple medication ” (ρ=0.528,p<0.01 ).At 1 year after stroke, there was significant correlation between medication compliance and understanding of medication“hassle for taking medicine” (ρ=0.381,p<0.05). Conclusions: These data suggest that the estimation of drug cost and hassle for medication primarily affects the medication compliance. Nurses need to focus on not only the medication compliance but also the motion and cognitive function.


2019 ◽  
Vol 34 (9) ◽  
pp. 2122-2150 ◽  
Author(s):  
Przemyslaw Grzegorzewski ◽  
Martyna Śpiewak

2004 ◽  
Vol 8 (4) ◽  
pp. 235-246 ◽  
Author(s):  
Michelle K. McDougall ◽  
Glen D. Rayner

This paper studies the effect of the normal distribution assumption on the power and size of the sign test, Wilcoxon's signed rank test and the t-test when used in one-sample location problems. Power functions for these tests under various skewness and kurtosis conditions are produced for several sample sizes from simulated data using the g-and-k distribution of MacGillivray and Cannon [5].


Sign in / Sign up

Export Citation Format

Share Document